More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_4016 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_4016  thiosulfate sulfurtransferase  100 
 
 		 109 aa  225  1e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0398  thiosulfate sulfurtransferase  78.18 
 
 		 110 aa  183  6e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0432  thiosulfate sulfurtransferase  78.18 
 
 		 110 aa  183  6e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.822865  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4804  thiosulfate sulfurtransferase  76.15 
 
 		 109 aa  182  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.598839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5138  thiosulfate sulfurtransferase  77.06 
 
 		 109 aa  180  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.945855  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46860  thiosulfate sulfurtransferase  77.57 
 
 		 112 aa  177  4e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0429  thiosulfate sulfurtransferase  76.36 
 
 		 110 aa  177  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0835156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0733  thiosulfate sulfurtransferase  73.58 
 
 		 110 aa  172  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07690  thiosulfate sulfurtransferase  73.58 
 
 		 110 aa  172  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0582831 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4630  thiosulfate sulfurtransferase  72.64 
 
 		 106 aa  170  5.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.432848 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0548  rhodanese-like domain protein  72.64 
 
 		 106 aa  169  1e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4128  Thiosulfate sulfurtransferase  54.37 
 
 		 107 aa  120  5e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.801099  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3931  Thiosulfate sulfurtransferase  53.4 
 
 		 107 aa  119  9.999999999999999e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0289  thiosulfate sulfurtransferase  51.85 
 
 		 108 aa  117  6e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0289  Thiosulfate sulfurtransferase  51.89 
 
 		 106 aa  117  7e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3705  thiosulfate sulfurtransferase  51.85 
 
 		 108 aa  117  7.999999999999999e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.155763 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4733  thiosulfate sulfurtransferase  51.85 
 
 		 108 aa  116  7.999999999999999e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03276  thiosulfate sulfurtransferase  51.85 
 
 		 108 aa  115  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.757846  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0289  Rhodanese domain protein  51.85 
 
 		 108 aa  115  9.999999999999999e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03228  hypothetical protein  51.85 
 
 		 108 aa  115  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.801313  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3622  thiosulfate sulfurtransferase  51.85 
 
 		 108 aa  115  9.999999999999999e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3901  thiosulfate sulfurtransferase  51.85 
 
 		 108 aa  115  9.999999999999999e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0122  thiosulfate sulfurtransferase  58.25 
 
 		 108 aa  115  1.9999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0229  Thiosulfate sulfurtransferase  49.06 
 
 		 106 aa  115  3e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.369653  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3807  thiosulfate sulfurtransferase  51.85 
 
 		 108 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0063  thiosulfate sulfurtransferase  54.46 
 
 		 106 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3726  thiosulfate sulfurtransferase  49.07 
 
 		 108 aa  111  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3995  thiosulfate sulfurtransferase  50.49 
 
 		 109 aa  111  4.0000000000000004e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0159  thiosulfate sulfurtransferase  50.49 
 
 		 109 aa  111  4.0000000000000004e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3755  thiosulfate sulfurtransferase  50.49 
 
 		 109 aa  111  4.0000000000000004e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3834  thiosulfate sulfurtransferase  49.04 
 
 		 110 aa  110  5e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0925193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4638  thiosulfate sulfurtransferase  50.96 
 
 		 108 aa  109  1.0000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3833  thiosulfate sulfurtransferase  48.15 
 
 		 108 aa  109  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.851697 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3895  thiosulfate sulfurtransferase  48.15 
 
 		 108 aa  109  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3940  rhodanese domain-containing protein  55.67 
 
 		 102 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00983264  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3717  thiosulfate sulfurtransferase  48.15 
 
 		 108 aa  109  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3792  thiosulfate sulfurtransferase  48.15 
 
 		 108 aa  109  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.332585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4342  rhodanese domain-containing protein  53.12 
 
 		 101 aa  106  9.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00306912  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4287  Rhodanese domain protein  53.12 
 
 		 101 aa  106  9.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.137948  hitchhiker  0.000000372785 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0056  rhodanese domain-containing protein  53.12 
 
 		 101 aa  106  9.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000464911  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4482  rhodanese domain-containing protein  53.12 
 
 		 101 aa  106  9.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0767225  normal  0.0196392 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002142  thiosulfate sulfurtransferase GlpE  51.96 
 
 		 106 aa  106  1e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000271125  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3903  rhodanese domain-containing protein  53.12 
 
 		 123 aa  105  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00219695  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2416  thiosulfate sulfurtransferase  50.94 
 
 		 106 aa  105  2e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000293751  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0096  glpE protein  52.04 
 
 		 103 aa  105  2e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00139877  normal  0.0140048 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3902  rhodanese domain-containing protein  54.17 
 
 		 101 aa  105  3e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000421055  normal  0.492067 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2899  thiosulfate sulfurtransferase  48.11 
 
 		 107 aa  104  4e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.105523  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4106  rhodanese domain-containing protein  53.61 
 
 		 101 aa  103  5e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000617215  normal  0.479241 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4672  glpE protein  54.17 
 
 		 101 aa  103  6e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3994  rhodanese domain-containing protein  52.58 
 
 		 101 aa  103  7e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000232889  normal  0.0196861 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00276  thiosulfate sulfurtransferase  50.98 
 
 		 106 aa  103  8e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3711  rhodanese domain-containing protein  55.1 
 
 		 101 aa  102  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00389658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0099  rhodanese domain-containing protein  54.08 
 
 		 102 aa  101  3e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.973774  normal  0.0985137 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0063  rhodanese domain-containing protein  51.02 
 
 		 102 aa  101  4e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00465337  unclonable  0.0000000104645 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0923  rhodanese-like protein  58.75 
 
 		 110 aa  100  7e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0562249  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1048  rhodanese domain-containing protein  45.19 
 
 		 106 aa  99.4  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00818929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0105  rhodanese domain-containing protein  52.58 
 
 		 102 aa  99  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.294035  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3617  rhodanese-like protein  50.52 
 
 		 102 aa  97.1  8e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000690475  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0701  thiosulfate sulfurtransferase GlpE  45.1 
 
 		 107 aa  92.8  1e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  3.6297700000000005e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0337  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase (rhodanese)  43.88 
 
 		 100 aa  88.6  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00068  glpE protein  47.12 
 
 		 103 aa  87.8  5e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0160  thiosulfate sulfurtransferase  43.81 
 
 		 158 aa  86.7  1e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.460236  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0469  rhodanese domain-containing protein  36.04 
 
 		 272 aa  85.1  3e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.596122 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0470  rhodanese domain-containing protein  42.71 
 
 		 656 aa  83.6  8e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.468272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1502  ankyrin repeat protein/rhodanese-like domain protein  39.62 
 
 		 260 aa  82.4  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1220  Rhodanese domain protein  39.62 
 
 		 260 aa  82.4  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000562605 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0147  rhodanese domain-containing protein  38.46 
 
 		 263 aa  82.4  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.102174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2170  putative thiosulfate sulfurtransferase  43.04 
 
 		 245 aa  76.6  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2117  rhodanese-like domain/ankyrin repeat-containing protein  42.86 
 
 		 254 aa  75.9  0.0000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  33.66 
 
 		 220 aa  72  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1844  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.76 
 
 		 393 aa  70.9  0.000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2723  beta-lactamase domain protein  33.67 
 
 		 476 aa  70.1  0.000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00124827  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2044  Rhodanese domain protein  38.04 
 
 		 114 aa  68.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1199  rhodanese domain-containing protein  38.04 
 
 		 282 aa  68.2  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0177216  hitchhiker  0.00286909 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0061  Rhodanese domain protein  38.16 
 
 		 277 aa  67.4  0.00000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2536  rhodanese domain-containing protein  37 
 
 		 145 aa  67.4  0.00000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0744  rhodanese domain-containing protein  36.84 
 
 		 133 aa  66.2  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.547874 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2630  Rhodanese domain protein  38.95 
 
 		 112 aa  65.9  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1246  Rhodanese domain protein  36 
 
 		 130 aa  65.9  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000851542  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0406  rhodanese domain-containing protein  35.05 
 
 		 278 aa  65.5  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.932253 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0134  Rhodanese domain protein  36.08 
 
 		 145 aa  65.1  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.410653 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3835  rhodanese domain-containing protein  37.63 
 
 		 113 aa  64.7  0.0000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0717  rhodanese domain-containing protein  35.79 
 
 		 144 aa  64.3  0.0000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2629  Rhodanese domain protein  35.11 
 
 		 216 aa  64.3  0.0000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.770931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1642  rhodanese domain-containing protein  34.15 
 
 		 103 aa  63.2  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2654  hypothetical protein  32.29 
 
 		 116 aa  63.2  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.173279  normal  0.613191 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0020  Rhodanese domain-containing protein  39.78 
 
 		 119 aa  63.2  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.529293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0258  Rhodanese domain protein  32.98 
 
 		 124 aa  62.4  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4291  rhodanese-like protein  36 
 
 		 130 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.144766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3886  glutaredoxin-like protein  29.52 
 
 		 308 aa  62.4  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2261  rhodanese domain-containing protein  32.63 
 
 		 279 aa  62  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2117  Rhodanese domain protein  31.25 
 
 		 116 aa  61.6  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4102  Rhodanese domain protein  32.95 
 
 		 138 aa  61.6  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25625  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4022  rhodanese-like protein  38.71 
 
 		 102 aa  62  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.203152  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0378  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 		 284 aa  61.6  0.000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.656719  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2356  Rhodanese domain protein  35.53 
 
 		 124 aa  61.2  0.000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3925  rhodanese-like protein  32.29 
 
 		 107 aa  61.6  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2561  rhodanese-like protein  37.33 
 
 		 288 aa  61.6  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.900675  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2633  Rhodanese domain protein  31.58 
 
 		 123 aa  61.6  0.000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.728751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0218  Rhodanese domain protein  35.53 
 
 		 124 aa  60.8  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>