More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000724 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_000724  phage shock protein E  100 
 
 		 116 aa  242  9.999999999999999e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06606  hypothetical protein  73.28 
 
 		 116 aa  186  1e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0039  phage shock protein E  52.53 
 
 		 123 aa  123  9e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1056  putative rhodanese-related sulfurtransferase  49.02 
 
 		 116 aa  120  7e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.218606  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1612  rhodanese domain-containing protein  43.97 
 
 		 132 aa  110  5e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0487868  hitchhiker  0.00165935 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2613  rhodanese domain-containing protein  48.15 
 
 		 131 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.492032  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2442  rhodanese domain-containing protein  42.61 
 
 		 127 aa  107  5e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0138247  unclonable  0.00000228725 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2184  phage shock protein E  44.35 
 
 		 129 aa  103  6e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0017776  hitchhiker  0.00888717 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2691  rhodanese domain-containing protein  44.74 
 
 		 125 aa  103  7e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1444  rhodanese domain-containing protein  47.42 
 
 		 132 aa  100  6e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000545636  hitchhiker  0.00000000189127 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1391  rhodanese domain-containing protein  46.08 
 
 		 132 aa  99  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000425573  hitchhiker  0.000000000236853 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1456  rhodanese domain-containing protein  46.08 
 
 		 132 aa  99  2e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00260172  hitchhiker  0.000336538 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3040  rhodanese domain-containing protein  44.07 
 
 		 128 aa  97.8  5e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00420401  normal  0.0677639 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2476  rhodanese domain-containing protein  43.48 
 
 		 112 aa  97.1  7e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000491835  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3105  phage shock protein E  44.33 
 
 		 132 aa  95.9  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2872  rhodanese domain-containing protein  47.19 
 
 		 143 aa  94.7  3e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0499006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2797  rhodanese domain-containing protein  47.19 
 
 		 138 aa  94.7  3e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000100597  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0308  rhodanese domain-containing protein  47.06 
 
 		 106 aa  92.8  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000185007  hitchhiker  0.0000000893128 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1581  Rhodanese domain protein  46.07 
 
 		 138 aa  93.2  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0432262  hitchhiker  0.00000000099869 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2777  rhodanese domain-containing protein  44.33 
 
 		 138 aa  92  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000237337  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0320  rhodanese domain-containing protein  44.09 
 
 		 107 aa  87.4  6e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000759321  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0322  rhodanese domain-containing protein  44.09 
 
 		 107 aa  87.4  6e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000003033  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0327  Rhodanese domain protein  44.09 
 
 		 107 aa  86.7  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000000770666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3528  rhodanese domain-containing protein  45.16 
 
 		 112 aa  85.9  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000546152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0326  rhodanese domain-containing protein  43.01 
 
 		 107 aa  85.9  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000194442  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4394  phage shock protein E  43.01 
 
 		 108 aa  85.1  3e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0323  rhodanese domain-containing protein  41.94 
 
 		 107 aa  84  7e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000826672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3701  rhodanese domain-containing protein  41.94 
 
 		 107 aa  83.6  9e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000331812  normal  0.261644 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0318  rhodanese domain-containing protein  41.94 
 
 		 107 aa  83.6  9e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000262088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3397  phage shock protein E  40 
 
 		 105 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.127834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3904  rhodanese domain-containing protein  43.68 
 
 		 108 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000089939  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2652  rhodanese-like protein  49.33 
 
 		 130 aa  81.6  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1410  rhodanese-like protein  42.86 
 
 		 136 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000874287  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  46.67 
 
 		 123 aa  80.5  0.000000000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2742  Rhodanese domain protein  46.67 
 
 		 130 aa  78.2  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2837  Rhodanese domain protein  46.67 
 
 		 130 aa  78.6  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0114953  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1570  rhodanese-like domain-containing protein  35.14 
 
 		 127 aa  77.8  0.00000000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0153  coenzyme A disulfide reductase, putative  45.45 
 
 		 565 aa  77  0.00000000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  45.57 
 
 		 220 aa  76.6  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0573  rhodanese-like protein  43.04 
 
 		 109 aa  75.9  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000000000146252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2644  Rhodanese domain protein  47.83 
 
 		 102 aa  75.9  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00713239  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1280  rhodanese-like protein  38.75 
 
 		 170 aa  75.1  0.0000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.678095 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0262  Rhodanese domain protein  42.68 
 
 		 145 aa  73.6  0.0000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2629  Rhodanese domain protein  43.42 
 
 		 216 aa  73.6  0.0000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.770931  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1869  rhodanese domain-containing protein  41.56 
 
 		 117 aa  73.2  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000584453  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2684  Rhodanese domain protein  40.24 
 
 		 101 aa  73.2  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.245912  normal  0.288607 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0022  Rhodanese domain-containing protein  39.24 
 
 		 122 aa  73.2  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2356  Rhodanese domain protein  42.47 
 
 		 124 aa  72.4  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0263  Rhodanese domain protein  45.57 
 
 		 116 aa  72.8  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1246  Rhodanese domain protein  42.17 
 
 		 130 aa  72.8  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000851542  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2623  Rhodanese domain protein  35.29 
 
 		 151 aa  72  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1837  rhodanese domain-containing protein  42.5 
 
 		 150 aa  72.4  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1561  rhodanese domain-containing protein  41.25 
 
 		 188 aa  72  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.229111 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0218  Rhodanese domain protein  42.47 
 
 		 124 aa  72  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1605  Rhodanese domain protein  42.35 
 
 		 147 aa  70.9  0.000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.501134  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2090  Rhodanese domain protein  45.07 
 
 		 137 aa  70.5  0.000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.147548  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2405  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  41.56 
 
 		 562 aa  70.5  0.000000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.692685  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1557  rhodanese domain-containing protein  37.78 
 
 		 150 aa  70.5  0.000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.031347  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  35.9 
 
 		 145 aa  69.3  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0728  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  42.11 
 
 		 566 aa  69.7  0.00000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0715  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  42.11 
 
 		 566 aa  70.1  0.00000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4064  rhodanese domain-containing protein  38.36 
 
 		 127 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.585247  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1212  rhodanese domain-containing protein  42.42 
 
 		 197 aa  68.9  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.998746  normal  0.0818549 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2630  Rhodanese domain protein  37 
 
 		 112 aa  68.9  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4285  rhodanese-like domain-containing protein  36.99 
 
 		 127 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4112  rhodanese-like domain-containing protein  36.99 
 
 		 127 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3953  rhodanese-related sulfurtransferase  36.99 
 
 		 127 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3963  rhodanese-related sulfurtransferase  36.99 
 
 		 127 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2633  Rhodanese domain protein  42.31 
 
 		 123 aa  68.6  0.00000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.728751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4340  rhodanese-like domain protein  36.99 
 
 		 127 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4432  rhodanese-like domain-containing protein  36.99 
 
 		 127 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  41.03 
 
 		 189 aa  68.6  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4229  rhodanese-like domain protein  36.99 
 
 		 127 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1464  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  38.46 
 
 		 104 aa  68.2  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.176791  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1646  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  38.46 
 
 		 104 aa  68.2  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000604972 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1872  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  38.46 
 
 		 103 aa  68.2  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0100112 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1122  rhodanese-like protein  36.36 
 
 		 141 aa  67.8  0.00000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1810  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  38.46 
 
 		 104 aa  67.8  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000312161 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1811  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  38.46 
 
 		 104 aa  68.2  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.197401 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1937  rhodanese domain-containing protein  35.9 
 
 		 269 aa  67.8  0.00000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0286726  hitchhiker  0.00000000917613 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2832  rhodanese domain-containing protein  36.59 
 
 		 109 aa  67.4  0.00000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0018114 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1146  Rhodanese domain protein  43.06 
 
 		 137 aa  67.8  0.00000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0154905  hitchhiker  0.0000789559 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2891  Rhodanese domain protein  40 
 
 		 98 aa  67.4  0.00000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0690  rhodanese domain-containing protein  40.51 
 
 		 98 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.623453  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2852  Rhodanese domain-containing protein  36.89 
 
 		 113 aa  67  0.00000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0916  rhodanese-like protein  44.59 
 
 		 98 aa  67  0.00000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0001684  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0020  Rhodanese domain-containing protein  32.41 
 
 		 119 aa  67  0.00000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.529293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2900  rhodanese domain-containing protein  36.99 
 
 		 127 aa  67.4  0.00000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.423457  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0061  Rhodanese domain protein  42.25 
 
 		 277 aa  67.4  0.00000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1559  rhodanese-like protein  30.77 
 
 		 142 aa  67  0.00000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0146795  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3559  thioredoxin  40.74 
 
 		 229 aa  67  0.00000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.254418 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3148  putative phage shock protein E  35.04 
 
 		 133 aa  67  0.00000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0870  rhodanese domain-containing protein  41.43 
 
 		 98 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0611  rhodanese-like protein  38.18 
 
 		 141 aa  66.6  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1950  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  35.9 
 
 		 104 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0541  hypothetical protein  36.84 
 
 		 598 aa  66.6  0.0000000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.360191  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4320  rhodanese-like domain protein  35.62 
 
 		 127 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1149  Rhodanese domain protein  47.89 
 
 		 121 aa  66.6  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000462843  hitchhiker  0.00000263083 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2890  SirA family protein  35.63 
 
 		 189 aa  66.6  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0913  rhodanese-like domain protein  35.62 
 
 		 127 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.130078  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>