More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0112 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_0112  rhodanese domain protein  100 
 
 		 104 aa  215  2e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00002113  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0487  Rhodanese domain protein  63.46 
 
 		 134 aa  145  2.0000000000000003e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2024  Rhodanese domain protein  62.77 
 
 		 131 aa  132  1.9999999999999998e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0154  rhodanese domain-containing protein  60.58 
 
 		 113 aa  132  1.9999999999999998e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2860  Rhodanese domain protein  64.04 
 
 		 129 aa  124  5e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0775  Rhodanese domain protein  51.92 
 
 		 124 aa  124  5e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.61343 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1271  rhodanese-like protein  51.92 
 
 		 138 aa  121  3e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0463  rhodanese domain-containing protein  54.95 
 
 		 132 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000512984  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0533  rhodanese-like protein  53.66 
 
 		 124 aa  102  2e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000000298777  normal  0.316081 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1280  rhodanese-like protein  40 
 
 		 170 aa  75.1  0.0000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.678095 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  41.18 
 
 		 145 aa  70.5  0.000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  38.64 
 
 		 220 aa  69.7  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3913  rhodanese-like protein  43.02 
 
 		 132 aa  67.8  0.00000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.103396  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3735  rhodanese domain-containing protein  39.76 
 
 		 113 aa  67.8  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00254792 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3847  Rhodanese domain protein  46.88 
 
 		 129 aa  67  0.00000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.323646  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1937  rhodanese domain-containing protein  40 
 
 		 269 aa  66.6  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0286726  hitchhiker  0.00000000917613 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2633  Rhodanese domain protein  40.48 
 
 		 123 aa  66.2  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.728751  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3931  Rhodanese domain protein  45.31 
 
 		 129 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0175301 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2080  rhodanese-like protein  35.29 
 
 		 108 aa  63.9  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.218119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2218  rhodanese domain protein  40.96 
 
 		 118 aa  63.9  0.0000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.314079  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1502  rhodanese domain-containing protein  38.55 
 
 		 113 aa  63.9  0.0000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.184229  normal  0.558017 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0949  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  41.46 
 
 		 383 aa  63.9  0.0000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3122  rhodanese-like protein  39.76 
 
 		 127 aa  63.2  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3362  rhodanese-like protein  36.47 
 
 		 108 aa  62.8  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00352544 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2629  Rhodanese domain protein  39.56 
 
 		 216 aa  60.8  0.000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.770931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2103  rhodanese-like protein  35.29 
 
 		 108 aa  61.2  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.588432 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6622  hydroxyacylglutathione hydrolase  36.9 
 
 		 357 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3514  hypothetical protein  34.12 
 
 		 107 aa  60.8  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.308602  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0398  phage shock protein E, putative  38.82 
 
 		 118 aa  59.3  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4502  rhodanese domain protein  43.42 
 
 		 106 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000125485 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1499  rhodanese-like protein  35.29 
 
 		 111 aa  58.9  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  36.78 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2223  Rhodanese domain protein  34.12 
 
 		 108 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1146  Rhodanese domain protein  33.73 
 
 		 137 aa  58.5  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0154905  hitchhiker  0.0000789559 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0692  rhodanese domain-containing protein  33.7 
 
 		 149 aa  58.5  0.00000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0564  Rhodanese domain protein  39.47 
 
 		 98 aa  58.5  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000375905  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0020  Rhodanese domain-containing protein  37.65 
 
 		 119 aa  58.2  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.529293  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0676  rhodanese-like domain-containing protein  43.42 
 
 		 98 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0874  rhodanese domain family protein  43.42 
 
 		 98 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000677114 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2630  Rhodanese domain protein  35.29 
 
 		 112 aa  57.8  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0742  hypothetical protein  43.42 
 
 		 98 aa  57.8  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0690  rhodanese-like domain-containing protein  43.42 
 
 		 98 aa  57.8  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0702079  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5389  beta-lactamase-like  40 
 
 		 356 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1680  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.29 
 
 		 395 aa  57.8  0.00000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.683784  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5472  beta-lactamase domain-containing protein  40 
 
 		 356 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.541734  normal  0.389446 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2399  rhodanese-like protein  36.05 
 
 		 138 aa  57.4  0.00000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1642  rhodanese domain-containing protein  32.93 
 
 		 103 aa  57.8  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1149  Rhodanese domain protein  34.12 
 
 		 121 aa  57.4  0.00000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000462843  hitchhiker  0.00000263083 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0149  rhodanese domain-containing protein  38.1 
 
 		 116 aa  57.4  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0127705 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0428  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 		 116 aa  57.4  0.00000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000514418  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4797  beta-lactamase domain-containing protein  40 
 
 		 356 aa  57  0.00000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.303253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0182  Beta-lactamase-like  38.75 
 
 		 356 aa  57  0.00000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.237116 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3607  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.08 
 
 		 387 aa  57  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.156981  normal  0.010154 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5022  rhodanese domain-containing protein  34.04 
 
 		 111 aa  57  0.00000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635764 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4814  beta-lactamase domain-containing protein  37.5 
 
 		 356 aa  57  0.00000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.116566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4512  rhodanese domain-containing protein  34.83 
 
 		 111 aa  57  0.00000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0573  rhodanese-like protein  35.71 
 
 		 109 aa  56.6  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000000000146252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1792  rhodanese-like protein  35.29 
 
 		 177 aa  56.2  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2282  rhodanese/sulfurtransferase-like protein  36.71 
 
 		 109 aa  56.2  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.595015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2644  Rhodanese domain protein  35.53 
 
 		 102 aa  56.6  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00713239  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0870  rhodanese domain-containing protein  40.79 
 
 		 98 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3313  beta-lactamase domain-containing protein  35 
 
 		 356 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.412228  normal  0.175146 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3577  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.36 
 
 		 390 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.127521  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0318  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.64 
 
 		 383 aa  55.8  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.139087 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4224  rhodanese domain-containing protein  33.73 
 
 		 125 aa  56.2  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3803  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  38.64 
 
 		 390 aa  56.2  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.209325  normal  0.526883 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5355  beta-lactamase domain-containing protein  36.25 
 
 		 356 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3285  rhodanese domain-containing protein  33.72 
 
 		 141 aa  56.2  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0690  rhodanese domain-containing protein  40.79 
 
 		 98 aa  55.1  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.623453  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3493  UBA/THIF-type NAD/FAD binding, MoeZ/MoeB fmaily protein  35.23 
 
 		 390 aa  55.1  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2913  beta-lactamase domain protein  35.71 
 
 		 469 aa  55.5  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4191  beta-lactamase domain protein  34.52 
 
 		 357 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0163085 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3646  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.71 
 
 		 390 aa  55.1  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1246  Rhodanese domain protein  38.16 
 
 		 130 aa  54.7  0.0000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000851542  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2696  rhodanese-like protein  33.72 
 
 		 105 aa  54.7  0.0000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1816  hypothetical protein  40.7 
 
 		 99 aa  54.3  0.0000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0723  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.59 
 
 		 383 aa  54.3  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0959  Rhodanese domain protein  32.53 
 
 		 107 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0206  Rhodanese domain protein  36.9 
 
 		 98 aa  54.3  0.0000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1073  ThiF/MoeZ/MoeB domain/rhodanese-like domain-containing protein  36.71 
 
 		 368 aa  54.3  0.0000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0941  molybdopterin biosynthesis MoeB protein  36.71 
 
 		 368 aa  54.3  0.0000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.217219  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1695  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.65 
 
 		 393 aa  54.3  0.0000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.294225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1239  rhodanese-like protein  32.94 
 
 		 137 aa  54.3  0.0000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.549266  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2631  Rhodanese domain protein  33.68 
 
 		 480 aa  53.9  0.0000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2852  Rhodanese domain-containing protein  34.12 
 
 		 113 aa  53.9  0.0000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2274  rhodanese-related sulfurtransferase  36.36 
 
 		 280 aa  53.9  0.0000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000200812  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3957  rhodanese domain-containing protein  32.93 
 
 		 115 aa  53.5  0.0000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.998099  normal  0.190366 
 
 
-
 
NC_002936  DET1392  rhodanese-like domain-containing protein  30.23 
 
 		 144 aa  52.8  0.000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1817  hypothetical protein  40.7 
 
 		 99 aa  53.1  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0750  rhodanese-like protein  34.94 
 
 		 107 aa  53.5  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2338  beta-lactamase domain-containing protein  31.76 
 
 		 478 aa  53.1  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.415527  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0022  Rhodanese domain-containing protein  34.15 
 
 		 122 aa  53.1  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1543  Rhodanese domain protein  33.72 
 
 		 138 aa  53.5  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.973949  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1199  rhodanese domain-containing protein  30.26 
 
 		 282 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0177216  hitchhiker  0.00286909 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2737  rhodanese domain-containing protein  35.71 
 
 		 125 aa  53.1  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.909386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1906  Rhodanese domain protein  34.15 
 
 		 105 aa  52.4  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000236409  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0280  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.47 
 
 		 567 aa  52.4  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.10297  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2723  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 		 476 aa  52.4  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00124827  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3678  hypothetical protein  31.33 
 
 		 107 aa  52.8  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.233085 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0922  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  36.36 
 
 		 390 aa  52.8  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698196  normal  0.682712 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>