More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_2024 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_2024  Rhodanese domain protein  100 
 
 		 131 aa  268  1e-71  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0463  rhodanese domain-containing protein  66.67 
 
 		 132 aa  189  1e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000512984  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2860  Rhodanese domain protein  74.31 
 
 		 129 aa  170  7.999999999999999e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0112  rhodanese domain protein  58.65 
 
 		 104 aa  133  7.000000000000001e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00002113  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0487  Rhodanese domain protein  52.73 
 
 		 134 aa  133  9e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0154  rhodanese domain-containing protein  57.58 
 
 		 113 aa  128  3e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0775  Rhodanese domain protein  46.36 
 
 		 124 aa  119  9.999999999999999e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.61343 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1271  rhodanese-like protein  50.96 
 
 		 138 aa  119  9.999999999999999e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0533  rhodanese-like protein  49.02 
 
 		 124 aa  108  3e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000000298777  normal  0.316081 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1280  rhodanese-like protein  42.86 
 
 		 170 aa  87.8  4e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.678095 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2629  Rhodanese domain protein  44.9 
 
 		 216 aa  79.7  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.770931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  43.53 
 
 		 145 aa  74.7  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  37.37 
 
 		 220 aa  72.8  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1937  rhodanese domain-containing protein  38.61 
 
 		 269 aa  69.7  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0286726  hitchhiker  0.00000000917613 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3847  Rhodanese domain protein  39.42 
 
 		 129 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.323646  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0398  phage shock protein E, putative  40.91 
 
 		 118 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4224  rhodanese domain-containing protein  40.86 
 
 		 125 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3735  rhodanese domain-containing protein  34.65 
 
 		 113 aa  68.2  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00254792 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3913  rhodanese-like protein  36.84 
 
 		 132 aa  67.4  0.00000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.103396  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3122  rhodanese-like protein  42.05 
 
 		 127 aa  67.4  0.00000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4512  rhodanese domain-containing protein  35.35 
 
 		 111 aa  66.6  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3931  Rhodanese domain protein  37.5 
 
 		 129 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0175301 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0149  rhodanese domain-containing protein  40.66 
 
 		 116 aa  65.1  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0127705 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1502  rhodanese domain-containing protein  33.66 
 
 		 113 aa  64.7  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.184229  normal  0.558017 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3514  hypothetical protein  36.17 
 
 		 107 aa  64.7  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.308602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2080  rhodanese-like protein  35.11 
 
 		 108 aa  63.9  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.218119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0093  Rhodanese domain protein  39.22 
 
 		 112 aa  63.5  0.0000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3362  rhodanese-like protein  36.17 
 
 		 108 aa  63.5  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00352544 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0573  rhodanese-like protein  37.36 
 
 		 109 aa  62.8  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000000000146252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5022  rhodanese domain-containing protein  35.05 
 
 		 111 aa  62  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635764 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0182  Beta-lactamase-like  41.25 
 
 		 356 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.237116 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2103  rhodanese-like protein  34.78 
 
 		 108 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.588432 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5389  beta-lactamase-like  42.5 
 
 		 356 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4814  beta-lactamase domain-containing protein  40 
 
 		 356 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.116566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5472  beta-lactamase domain-containing protein  42.5 
 
 		 356 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.541734  normal  0.389446 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4797  beta-lactamase domain-containing protein  42.5 
 
 		 356 aa  62  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.303253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3313  beta-lactamase domain-containing protein  38.75 
 
 		 356 aa  62  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.412228  normal  0.175146 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2223  Rhodanese domain protein  35.11 
 
 		 108 aa  61.6  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0074  Rhodanese domain protein  39.78 
 
 		 115 aa  62  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0103  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  33.7 
 
 		 565 aa  61.6  0.000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000211886  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2631  Rhodanese domain protein  38 
 
 		 480 aa  60.8  0.000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5355  beta-lactamase domain-containing protein  38.75 
 
 		 356 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1160  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  39.22 
 
 		 480 aa  60.8  0.000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.284227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4204  hypothetical protein  50.77 
 
 		 105 aa  60.5  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4191  beta-lactamase domain protein  38.75 
 
 		 357 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0163085 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0935  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase, class I  37.97 
 
 		 554 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000203969  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6622  hydroxyacylglutathione hydrolase  37.5 
 
 		 357 aa  59.3  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0428  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 		 116 aa  59.7  0.00000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000514418  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2644  Rhodanese domain protein  40.79 
 
 		 102 aa  58.9  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00713239  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0736  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase, class I  36.71 
 
 		 554 aa  58.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0670  NADH dehydrogenase  36.71 
 
 		 554 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0774  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase, class I  36.71 
 
 		 554 aa  58.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0611  rhodanese-like protein  35.19 
 
 		 141 aa  58.2  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0949  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.14 
 
 		 383 aa  58.5  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1705  Rhodanese domain protein  34.12 
 
 		 185 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000174118 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3957  rhodanese domain-containing protein  40 
 
 		 115 aa  58.2  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.998099  normal  0.190366 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0684  NADH dehydrogenase  36.71 
 
 		 554 aa  58.2  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0213  Rhodanese domain protein  31.31 
 
 		 109 aa  57.8  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0250  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.15 
 
 		 564 aa  58.2  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1499  rhodanese-like protein  33.7 
 
 		 111 aa  58.2  0.00000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2630  Rhodanese domain protein  31.31 
 
 		 112 aa  58.2  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0868  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase, class I  36.71 
 
 		 554 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000120121 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0383  beta-lactamase domain protein  35.64 
 
 		 471 aa  57.8  0.00000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1642  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 		 103 aa  57.4  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1146  Rhodanese domain protein  35.23 
 
 		 137 aa  57.4  0.00000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0154905  hitchhiker  0.0000789559 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2633  Rhodanese domain protein  34.12 
 
 		 123 aa  57.4  0.00000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.728751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4077  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.48 
 
 		 548 aa  56.6  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000142725  normal  0.651918 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1680  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.04 
 
 		 395 aa  56.6  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.683784  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0039  phage shock protein E  38.46 
 
 		 123 aa  56.6  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0020  Rhodanese domain-containing protein  36.46 
 
 		 119 aa  56.6  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.529293  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1253  rhodanese domain-containing protein  35.63 
 
 		 153 aa  56.6  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000299854 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0828  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase, class I  35.44 
 
 		 554 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0919827  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0124  Rhodanese-related sulfurtransferase-like protein  34 
 
 		 110 aa  56.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.112087  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5264  Rhodanese domain protein  35.87 
 
 		 110 aa  56.2  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3058  rhodanese-like  35 
 
 		 110 aa  55.5  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1239  rhodanese-like protein  31.52 
 
 		 137 aa  55.5  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.549266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2282  rhodanese/sulfurtransferase-like protein  38.27 
 
 		 109 aa  55.5  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.595015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2613  rhodanese domain-containing protein  43.42 
 
 		 131 aa  55.5  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.492032  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00932  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  32.67 
 
 		 379 aa  55.1  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06090  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  32.67 
 
 		 379 aa  55.1  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1666  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  33.03 
 
 		 378 aa  55.1  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.28085  normal  0.198345 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3482  rhodanese-related sulfurtransferase-like protein  34.78 
 
 		 147 aa  55.1  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2890  SirA family protein  35.44 
 
 		 189 aa  55.1  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1695  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.35 
 
 		 393 aa  55.1  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.294225  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0022  Rhodanese domain-containing protein  32.14 
 
 		 122 aa  55.5  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0744  rhodanese domain-containing protein  35.24 
 
 		 133 aa  55.1  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.547874 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 		 142 aa  54.7  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1559  rhodanese-like protein  33.33 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0146795  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2849  beta-lactamase domain-containing protein  33.02 
 
 		 480 aa  54.7  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3040  rhodanese domain-containing protein  37.5 
 
 		 128 aa  54.7  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00420401  normal  0.0677639 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1246  Rhodanese domain protein  38.27 
 
 		 130 aa  54.3  0.0000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000851542  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2710  rhodanese-like protein  36.14 
 
 		 107 aa  54.3  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1149  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 		 121 aa  54.3  0.0000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000462843  hitchhiker  0.00000263083 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3458  Rhodanese domain protein  37.5 
 
 		 107 aa  54.3  0.0000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0320  Rhodanese domain protein  34.34 
 
 		 103 aa  53.9  0.0000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000962456  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2696  rhodanese-like protein  35 
 
 		 105 aa  53.9  0.0000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06606  hypothetical protein  33.78 
 
 		 116 aa  53.9  0.0000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0280  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.47 
 
 		 567 aa  53.5  0.0000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.10297  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0564  Rhodanese domain protein  39.47 
 
 		 98 aa  53.5  0.0000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000375905  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1138  rhodanese domain-containing protein  32.04 
 
 		 113 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.0000773759  normal  0.329269 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>