More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0463 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_0463  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 
132 aa  273  5e-73  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000512984  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2024  Rhodanese domain protein  68.97 
 
 
131 aa  174  4e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2860  Rhodanese domain protein  64.81 
 
 
129 aa  149  2e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0775  Rhodanese domain protein  48.6 
 
 
124 aa  124  6e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.61343 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0487  Rhodanese domain protein  50.48 
 
 
134 aa  124  6e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0154  rhodanese domain-containing protein  54.08 
 
 
113 aa  122  2e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0112  rhodanese domain protein  54.95 
 
 
104 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00002113  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0533  rhodanese-like protein  49.5 
 
 
124 aa  103  8e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000000298777  normal  0.316081 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1271  rhodanese-like protein  44.23 
 
 
138 aa  101  3e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1280  rhodanese-like protein  41.84 
 
 
170 aa  86.3  1e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.678095 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  39.39 
 
 
220 aa  79.7  0.00000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  43.56 
 
 
145 aa  79.7  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3847  Rhodanese domain protein  38.74 
 
 
129 aa  77.8  0.00000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.323646  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0398  phage shock protein E, putative  42.05 
 
 
118 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3931  Rhodanese domain protein  37.86 
 
 
129 aa  73.9  0.0000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0175301 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1937  rhodanese domain-containing protein  40 
 
 
269 aa  73.9  0.0000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0286726  hitchhiker  0.00000000917613 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2629  Rhodanese domain protein  41.58 
 
 
216 aa  73.6  0.0000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.770931  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4224  rhodanese domain-containing protein  39.78 
 
 
125 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3122  rhodanese-like protein  39.77 
 
 
127 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2644  Rhodanese domain protein  38.38 
 
 
102 aa  68.6  0.00000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00713239  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0428  Rhodanese domain protein  35.56 
 
 
116 aa  66.2  0.0000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000514418  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2630  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 
112 aa  65.1  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1705  Rhodanese domain protein  38.32 
 
 
185 aa  64.7  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000174118 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3577  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  42.68 
 
 
390 aa  64.7  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.127521  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3514  hypothetical protein  34.91 
 
 
107 aa  63.9  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.308602  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2080  rhodanese-like protein  34.62 
 
 
108 aa  63.9  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.218119  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3735  rhodanese domain-containing protein  40.96 
 
 
113 aa  63.9  0.0000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00254792 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3362  rhodanese-like protein  35.58 
 
 
108 aa  63.9  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00352544 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0103  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  33.7 
 
 
565 aa  62.8  0.000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000211886  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3493  UBA/THIF-type NAD/FAD binding, MoeZ/MoeB fmaily protein  35.19 
 
 
390 aa  62.8  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4512  rhodanese domain-containing protein  34 
 
 
111 aa  63.2  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3646  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  41.46 
 
 
390 aa  62.8  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3607  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  41.46 
 
 
387 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.156981  normal  0.010154 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0949  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.76 
 
 
383 aa  61.2  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2633  Rhodanese domain protein  34.12 
 
 
123 aa  60.8  0.000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.728751  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3313  beta-lactamase domain-containing protein  37.5 
 
 
356 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.412228  normal  0.175146 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0149  rhodanese domain-containing protein  37.5 
 
 
116 aa  60.8  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0127705 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0736  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase, class I  37.97 
 
 
554 aa  60.5  0.000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0670  NADH dehydrogenase  37.97 
 
 
554 aa  60.5  0.000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0774  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase, class I  37.97 
 
 
554 aa  60.5  0.000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0611  rhodanese-like protein  34.31 
 
 
141 aa  60.5  0.000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2223  Rhodanese domain protein  33.65 
 
 
108 aa  60.1  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0684  NADH dehydrogenase  37.97 
 
 
554 aa  60.1  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1649  hypothetical protein  34.29 
 
 
173 aa  59.7  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.616423  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1502  rhodanese domain-containing protein  34.65 
 
 
113 aa  59.7  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.184229  normal  0.558017 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4191  beta-lactamase domain protein  36.9 
 
 
357 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0163085 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0868  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase, class I  37.97 
 
 
554 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000120121 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0020  Rhodanese domain-containing protein  39.08 
 
 
119 aa  59.7  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.529293  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2631  Rhodanese domain protein  37.08 
 
 
480 aa  58.9  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2218  rhodanese domain protein  37.35 
 
 
118 aa  58.9  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.314079  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1785  Rhodanese domain protein  34.91 
 
 
277 aa  58.9  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6622  hydroxyacylglutathione hydrolase  36.25 
 
 
357 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1113  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  29.82 
 
 
254 aa  59.3  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1199  rhodanese domain-containing protein  34.02 
 
 
282 aa  58.9  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0177216  hitchhiker  0.00286909 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5389  beta-lactamase-like  37.5 
 
 
356 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4814  beta-lactamase domain-containing protein  36.25 
 
 
356 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.116566  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5472  beta-lactamase domain-containing protein  37.5 
 
 
356 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.541734  normal  0.389446 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0935  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase, class I  36.71 
 
 
554 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000203969  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0182  Beta-lactamase-like  36.25 
 
 
356 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.237116 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3913  rhodanese-like protein  32.04 
 
 
132 aa  57.8  0.00000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.103396  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1559  rhodanese-like protein  31.31 
 
 
142 aa  57.8  0.00000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0146795  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1246  Rhodanese domain protein  39.24 
 
 
130 aa  58.2  0.00000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000851542  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1543  Rhodanese domain protein  32.04 
 
 
138 aa  57.8  0.00000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.973949  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1642  rhodanese domain-containing protein  29.89 
 
 
103 aa  57.8  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0743  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  35.37 
 
 
392 aa  57.8  0.00000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.754392  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4797  beta-lactamase domain-containing protein  37.5 
 
 
356 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.303253  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5022  rhodanese domain-containing protein  32.65 
 
 
111 aa  57.4  0.00000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00635764 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1160  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  37.14 
 
 
480 aa  57.4  0.00000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.284227  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1308  Rhodanese domain protein  36.14 
 
 
271 aa  57  0.00000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.197822  normal  0.0310663 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5355  beta-lactamase domain-containing protein  35 
 
 
356 aa  57  0.00000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2817  rhodanese domain-containing protein  36.36 
 
 
116 aa  57  0.00000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0255311  normal  0.567823 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2044  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 
114 aa  57  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0750  rhodanese-like protein  34.94 
 
 
107 aa  56.2  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0573  rhodanese-like protein  32.97 
 
 
109 aa  56.2  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000000000146252  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2274  rhodanese-related sulfurtransferase  39.47 
 
 
280 aa  56.6  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000200812  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2891  Rhodanese domain protein  43.42 
 
 
98 aa  56.2  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2103  rhodanese-like protein  31.73 
 
 
108 aa  56.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.588432 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2282  rhodanese/sulfurtransferase-like protein  38.75 
 
 
109 aa  56.2  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.595015  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  35.06 
 
 
189 aa  56.6  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1392  rhodanese-like domain-containing protein  30 
 
 
144 aa  55.8  0.0000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3482  rhodanese-related sulfurtransferase-like protein  35.29 
 
 
147 aa  56.2  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1146  Rhodanese domain protein  35.71 
 
 
137 aa  55.8  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0154905  hitchhiker  0.0000789559 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0744  rhodanese domain-containing protein  34.29 
 
 
133 aa  55.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.547874 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1695  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.55 
 
 
393 aa  55.5  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.294225  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1680  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.96 
 
 
395 aa  55.8  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.683784  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1499  rhodanese-like protein  33.98 
 
 
111 aa  55.5  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2710  rhodanese-like protein  33.73 
 
 
107 aa  55.8  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0406  rhodanese domain-containing protein  35.44 
 
 
278 aa  55.5  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.932253 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0564  Rhodanese domain protein  40.79 
 
 
98 aa  55.8  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000375905  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0213  Rhodanese domain protein  32.29 
 
 
109 aa  55.5  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0828  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase, class I  34.18 
 
 
554 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0919827  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3494  Rhodanese domain protein  37.5 
 
 
112 aa  55.1  0.0000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2890  SirA family protein  35.9 
 
 
189 aa  54.7  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1201  rhodanese domain-containing protein  27.52 
 
 
148 aa  54.7  0.0000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.069675  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0383  beta-lactamase domain protein  34 
 
 
471 aa  54.7  0.0000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3957  beta-lactamase domain-containing protein  34 
 
 
489 aa  54.7  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.381216 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1149  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 
121 aa  54.3  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000462843  hitchhiker  0.00000263083 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2536  rhodanese domain-containing protein  35.63 
 
 
145 aa  54.3  0.0000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1792  rhodanese-like protein  32.98 
 
 
177 aa  54.3  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2027  rhodanese domain-containing protein  36.47 
 
 
112 aa  54.3  0.0000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.168756  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>