More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A0750 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A0750  rhodanese-like protein  100 
 
 
107 aa  222  1e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2710  rhodanese-like protein  76.64 
 
 
107 aa  173  8e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0696  hypothetical protein  73.64 
 
 
110 aa  157  4e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.014224  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0605  Rhodanese domain protein  70.91 
 
 
110 aa  152  2e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.415478  normal  0.72873 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0959  Rhodanese domain protein  62.62 
 
 
107 aa  152  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3678  hypothetical protein  62.62 
 
 
107 aa  150  7e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.233085 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0646  Rhodanese domain protein  69.09 
 
 
110 aa  148  2e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.126659 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0881  rhodanese domain-containing protein  58.88 
 
 
107 aa  147  3e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.691799 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0432  rhodanese-like protein  58.88 
 
 
107 aa  147  3e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0911  rhodanese domain-containing protein  58.88 
 
 
107 aa  147  3e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.174972  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2480  rhodanese domain-containing protein  59.81 
 
 
107 aa  147  6e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2247  rhodanese domain-containing protein  61.68 
 
 
107 aa  146  9e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.256006  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4015  rhodanese-related sulfurtransferase  57.94 
 
 
107 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0179275  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2045  rhodanese-like domain-containing protein  57.94 
 
 
107 aa  144  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.550294  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3125  rhodanese-like domain-containing protein  57.94 
 
 
107 aa  144  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0799  rhodanese domain-containing protein  57.94 
 
 
107 aa  144  3e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1506  rhodanese-like domain-containing protein  58.88 
 
 
107 aa  145  3e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.207517  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0788  rhodanese domain-containing protein  57.94 
 
 
107 aa  144  3e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.677785  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3064  rhodanese domain-containing protein  57.94 
 
 
107 aa  144  3e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2568  rhodanese-like domain-containing protein  57.94 
 
 
107 aa  144  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3100  rhodanese domain-containing protein  57.94 
 
 
109 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3925  rhodanese-like protein  58.88 
 
 
107 aa  142  1e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2174  rhodanese-like domain-containing protein  57.01 
 
 
107 aa  140  5e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0735  rhodanese-like domain-containing protein  57.01 
 
 
107 aa  140  5e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3458  Rhodanese domain protein  59.81 
 
 
107 aa  134  4e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3722  Rhodanese domain protein  54.63 
 
 
112 aa  125  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1742  rhodanese-like domain-containing protein  56.84 
 
 
106 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.112615  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0484  rhodanese-related sulfurtransferase  49.53 
 
 
107 aa  115  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2696  rhodanese-like protein  54.21 
 
 
105 aa  116  9.999999999999999e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1041  Rhodanese domain protein  55.14 
 
 
106 aa  116  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1665  rhodanese-like protein  50 
 
 
120 aa  115  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.937901 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2817  rhodanese domain-containing protein  44.64 
 
 
116 aa  114  3e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0255311  normal  0.567823 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2603  rhodanese-like protein  49.54 
 
 
113 aa  114  3e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1836  Rhodanese domain protein  46.3 
 
 
112 aa  114  6e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.324614  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2027  rhodanese domain-containing protein  46.3 
 
 
112 aa  114  6e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.168756  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1035  Rhodanese domain protein  50.47 
 
 
106 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1127  rhodanese domain-containing protein  47.01 
 
 
121 aa  108  2.0000000000000002e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2351  rhodanese domain-containing protein  47.22 
 
 
111 aa  108  3e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1695  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  46.23 
 
 
393 aa  105  2e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.294225  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3957  rhodanese domain-containing protein  47.75 
 
 
115 aa  105  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.998099  normal  0.190366 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3531  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  46.24 
 
 
377 aa  103  7e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.522613  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2282  rhodanese/sulfurtransferase-like protein  47.12 
 
 
109 aa  102  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.595015  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2438  rhodanese domain-containing protein  52.69 
 
 
114 aa  99.8  1e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.517598 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0949  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  44.76 
 
 
383 aa  94.7  3e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0723  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  41.35 
 
 
383 aa  91.3  4e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0203  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  47.73 
 
 
375 aa  91.3  4e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.357554  normal  0.334206 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0296  hypothetical protein  46.15 
 
 
377 aa  89  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0318  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  42.31 
 
 
383 aa  88.2  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.139087 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0214  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  41.58 
 
 
361 aa  84.7  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0941  molybdopterin biosynthesis MoeB protein  39.42 
 
 
368 aa  84.7  4e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.217219  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1073  ThiF/MoeZ/MoeB domain/rhodanese-like domain-containing protein  39.42 
 
 
368 aa  84.7  4e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02700  Molybdopterin biosynthesis protein, MoeB  40.38 
 
 
377 aa  82.8  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2416  rhodanese-like protein  41.07 
 
 
118 aa  82.4  0.000000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1132  rhodanese domain-containing protein  38.89 
 
 
119 aa  81.6  0.000000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.237662  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02371  rhodanese-like protein  38.18 
 
 
118 aa  79.7  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1530  rhodanese-like  38.6 
 
 
118 aa  79.3  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.251959  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1680  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40 
 
 
395 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.683784  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3494  Rhodanese domain protein  40.2 
 
 
112 aa  78.6  0.00000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1138  rhodanese domain-containing protein  51.81 
 
 
113 aa  78.6  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.0000773759  normal  0.329269 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5669  rhodanese domain-containing protein  49.4 
 
 
113 aa  77.8  0.00000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.192192  hitchhiker  0.00438713 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1246  Rhodanese domain protein  41.94 
 
 
130 aa  77.8  0.00000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000851542  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  42.67 
 
 
145 aa  77.4  0.00000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2022  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  40.38 
 
 
386 aa  76.6  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.236297 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5122  Rhodanese domain protein  38.2 
 
 
116 aa  76.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.572476  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0743  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  40 
 
 
392 aa  76.3  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.754392  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1161  Rhodanese domain protein  35.58 
 
 
115 aa  75.9  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2892  Rhodanese domain protein  38.36 
 
 
121 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0922  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  43.53 
 
 
390 aa  75.1  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698196  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1937  rhodanese domain-containing protein  42.67 
 
 
269 aa  73.6  0.0000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0286726  hitchhiker  0.00000000917613 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3803  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  40.19 
 
 
390 aa  73.6  0.0000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.209325  normal  0.526883 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0876  Rhodanese domain protein  36.36 
 
 
119 aa  73.2  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0902  Rhodanese domain protein  36.36 
 
 
119 aa  73.2  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3463  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40.7 
 
 
379 aa  72.8  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.838901  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5422  rhodanese domain-containing protein  41.41 
 
 
116 aa  72.8  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.500506  normal  0.598915 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5042  rhodanese-like protein  41.41 
 
 
116 aa  72.8  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.982785  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2630  Rhodanese domain protein  44 
 
 
112 aa  73.2  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5130  rhodanese domain-containing protein  41.41 
 
 
116 aa  72.8  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.183608  normal  0.915775 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0615  rhodanese-like protein  37.14 
 
 
114 aa  71.6  0.000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.442702 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0713  rhodanese-like protein  32.41 
 
 
120 aa  71.6  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.082726  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1662  rhodanese-like protein  33.33 
 
 
119 aa  71.2  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0528375  normal  0.0957797 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0869  rhodanese-like domain-containing protein  32.26 
 
 
119 aa  70.9  0.000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0563  Rhodanese domain protein  36.49 
 
 
121 aa  70.9  0.000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000600861  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0689  rhodanese domain-containing protein  33.68 
 
 
120 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2891  Rhodanese domain protein  36.63 
 
 
98 aa  70.9  0.000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0281  Rhodanese domain protein  45.68 
 
 
108 aa  70.9  0.000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.161319 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2697  rhodanese domain-containing protein  41.86 
 
 
107 aa  70.5  0.000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.431269  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0667  Rhodanese domain protein  34.95 
 
 
104 aa  70.1  0.000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1757  rhodanese domain-containing protein  38 
 
 
134 aa  69.7  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0421554  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0833  rhodanese-like domain protein  31.58 
 
 
119 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00574407  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0573  rhodanese-like protein  38.37 
 
 
109 aa  70.1  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000000000146252  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2852  Rhodanese domain-containing protein  38.64 
 
 
113 aa  69.7  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5022  rhodanese domain-containing protein  42.68 
 
 
111 aa  69.7  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00635764 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0428  Rhodanese domain protein  37.36 
 
 
116 aa  69.7  0.00000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000514418  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0020  Rhodanese domain-containing protein  41.77 
 
 
119 aa  69.7  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.529293  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2982  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.5 
 
 
392 aa  68.9  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0094  rhodanese-like protein  42.86 
 
 
110 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2112  rhodanese domain-containing protein  37 
 
 
114 aa  68.9  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0658185  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01801  rhodanese-like protein  35.45 
 
 
117 aa  68.9  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0504917  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16081  rhodanese-like protein  34.21 
 
 
117 aa  68.9  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3510  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  45.98 
 
 
395 aa  68.6  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>