More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0959 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0959  Rhodanese domain protein  100 
 
 
107 aa  221  3e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3678  hypothetical protein  97.2 
 
 
107 aa  216  1e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.233085 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2247  rhodanese domain-containing protein  89.72 
 
 
107 aa  203  5e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.256006  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4015  rhodanese-related sulfurtransferase  79.44 
 
 
107 aa  179  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0179275  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0881  rhodanese domain-containing protein  78.5 
 
 
107 aa  178  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.691799 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0799  rhodanese domain-containing protein  79.44 
 
 
107 aa  178  2e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0432  rhodanese-like protein  78.5 
 
 
107 aa  178  2e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0788  rhodanese domain-containing protein  79.44 
 
 
107 aa  178  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.677785  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0911  rhodanese domain-containing protein  78.5 
 
 
107 aa  178  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.174972  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1506  rhodanese-like domain-containing protein  79.44 
 
 
107 aa  176  8e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.207517  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3064  rhodanese domain-containing protein  76.64 
 
 
107 aa  174  4e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3125  rhodanese-like domain-containing protein  76.64 
 
 
107 aa  174  4e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2568  rhodanese-like domain-containing protein  76.64 
 
 
107 aa  174  4e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3100  rhodanese domain-containing protein  76.64 
 
 
109 aa  174  4e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2045  rhodanese-like domain-containing protein  76.64 
 
 
107 aa  174  4e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.550294  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2480  rhodanese domain-containing protein  76.64 
 
 
107 aa  173  8e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2174  rhodanese-like domain-containing protein  75.7 
 
 
107 aa  169  9e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0735  rhodanese-like domain-containing protein  75.7 
 
 
107 aa  169  9e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0750  rhodanese-like protein  62.62 
 
 
107 aa  152  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2710  rhodanese-like protein  64.49 
 
 
107 aa  146  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0696  hypothetical protein  58.18 
 
 
110 aa  130  5e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.014224  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3925  rhodanese-like protein  51.4 
 
 
107 aa  127  5.0000000000000004e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0646  Rhodanese domain protein  54.55 
 
 
110 aa  124  5e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.126659 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0605  Rhodanese domain protein  55.45 
 
 
110 aa  124  6e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.415478  normal  0.72873 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3458  Rhodanese domain protein  53.27 
 
 
107 aa  123  7e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3722  Rhodanese domain protein  59.22 
 
 
112 aa  122  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0484  rhodanese-related sulfurtransferase  52.34 
 
 
107 aa  120  7e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1665  rhodanese-like protein  60.78 
 
 
120 aa  116  9e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.937901 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1041  Rhodanese domain protein  53.27 
 
 
106 aa  114  6e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2603  rhodanese-like protein  55.77 
 
 
113 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1742  rhodanese-like domain-containing protein  53.27 
 
 
106 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.112615  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1127  rhodanese domain-containing protein  58.95 
 
 
121 aa  108  2.0000000000000002e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2817  rhodanese domain-containing protein  50.47 
 
 
116 aa  107  4.0000000000000004e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0255311  normal  0.567823 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1836  Rhodanese domain protein  50.49 
 
 
112 aa  106  9.000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.324614  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2027  rhodanese domain-containing protein  50.49 
 
 
112 aa  106  9.000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.168756  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1035  Rhodanese domain protein  46.73 
 
 
106 aa  104  3e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3957  rhodanese domain-containing protein  50.94 
 
 
115 aa  104  5e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.998099  normal  0.190366 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1695  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  49.06 
 
 
393 aa  102  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.294225  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2282  rhodanese/sulfurtransferase-like protein  53.49 
 
 
109 aa  100  6e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.595015  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2438  rhodanese domain-containing protein  53.26 
 
 
114 aa  100  7e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.517598 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2696  rhodanese-like protein  47.66 
 
 
105 aa  99.4  1e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3531  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  49.46 
 
 
377 aa  99.8  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.522613  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2351  rhodanese domain-containing protein  48.54 
 
 
111 aa  97.1  7e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0743  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  50.59 
 
 
392 aa  90.1  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.754392  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1680  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  49.44 
 
 
395 aa  89.7  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.683784  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0949  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  45.71 
 
 
383 aa  89  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0203  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  47.13 
 
 
375 aa  88.6  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.357554  normal  0.334206 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1132  rhodanese domain-containing protein  42.34 
 
 
119 aa  87.8  4e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.237662  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1662  rhodanese-like protein  41.44 
 
 
119 aa  83.2  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0528375  normal  0.0957797 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0723  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  44.23 
 
 
383 aa  82.8  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5122  Rhodanese domain protein  41.57 
 
 
116 aa  81.6  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.572476  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1161  Rhodanese domain protein  40.74 
 
 
115 aa  80.9  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1073  ThiF/MoeZ/MoeB domain/rhodanese-like domain-containing protein  39.25 
 
 
368 aa  79.7  0.00000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0941  molybdopterin biosynthesis MoeB protein  39.25 
 
 
368 aa  79.7  0.00000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.217219  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3463  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  43.02 
 
 
379 aa  79.3  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.838901  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02700  Molybdopterin biosynthesis protein, MoeB  41.35 
 
 
377 aa  78.6  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2634  NADH oxidase/rhodanese-related sulfurtransferase  42.7 
 
 
105 aa  78.6  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0713  rhodanese-like protein  40.74 
 
 
120 aa  77.4  0.00000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.082726  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1246  Rhodanese domain protein  43.62 
 
 
130 aa  77.4  0.00000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000851542  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  45.68 
 
 
145 aa  77.4  0.00000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0318  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  42.31 
 
 
383 aa  77  0.00000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.139087 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6576  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  41.57 
 
 
348 aa  76.3  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2697  rhodanese domain-containing protein  50 
 
 
107 aa  76.6  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.431269  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2852  Rhodanese domain-containing protein  39.77 
 
 
113 aa  75.5  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0615  rhodanese-like protein  43.82 
 
 
114 aa  75.9  0.0000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.442702 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0214  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.38 
 
 
361 aa  75.9  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1937  rhodanese domain-containing protein  45.68 
 
 
269 aa  75.9  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0286726  hitchhiker  0.00000000917613 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0902  Rhodanese domain protein  41.57 
 
 
119 aa  75.1  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0876  Rhodanese domain protein  41.57 
 
 
119 aa  75.1  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0994  hypothetical protein  40.18 
 
 
390 aa  75.5  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000186232  normal  0.0867734 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0296  hypothetical protein  42.31 
 
 
377 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01801  rhodanese-like protein  40.18 
 
 
117 aa  75.1  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0504917  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2630  Rhodanese domain protein  41.18 
 
 
112 aa  75.1  0.0000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0573  rhodanese-like protein  39.08 
 
 
109 aa  73.9  0.0000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000000000146252  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1757  rhodanese domain-containing protein  45.35 
 
 
134 aa  73.6  0.0000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0421554  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2416  rhodanese-like protein  41.07 
 
 
118 aa  73.6  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0922  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  42.35 
 
 
390 aa  73.2  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698196  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2633  Rhodanese domain protein  38.75 
 
 
123 aa  72.4  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.728751  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1280  rhodanese-like protein  44.74 
 
 
170 aa  72.4  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.678095 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2982  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  45.45 
 
 
392 aa  72.8  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0428  Rhodanese domain protein  40.91 
 
 
116 aa  71.6  0.000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000514418  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1496  glutaredoxin-like protein  43.82 
 
 
308 aa  71.6  0.000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.353854  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8385  molybdopterin/thiamine biosynthesis family protein  42.53 
 
 
393 aa  71.2  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250903  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06750  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  45.98 
 
 
398 aa  71.2  0.000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1556  glutaredoxin-like protein  43.82 
 
 
308 aa  71.6  0.000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1769  hypothetical protein  41 
 
 
423 aa  71.2  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.549048  normal  0.774559 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3803  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  38.68 
 
 
390 aa  70.9  0.000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.209325  normal  0.526883 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0281  Rhodanese domain protein  43.37 
 
 
108 aa  70.5  0.000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.161319 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2891  Rhodanese domain protein  43.04 
 
 
98 aa  70.1  0.000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2112  rhodanese domain-containing protein  42.71 
 
 
114 aa  70.1  0.000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0658185  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0020  Rhodanese domain-containing protein  41.46 
 
 
119 aa  69.7  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.529293  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1570  rhodanese-like domain-containing protein  38.04 
 
 
127 aa  70.1  0.00000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0718  UBA/THIF-type NAD/FAD-binding protein  37.5 
 
 
390 aa  70.1  0.00000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2218  rhodanese domain protein  45.33 
 
 
118 aa  69.7  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.314079  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2356  Rhodanese domain protein  32.04 
 
 
124 aa  69.7  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3176  beta-lactamase domain protein  39.76 
 
 
461 aa  69.3  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00491395  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0158  hypothetical protein  37.96 
 
 
391 aa  68.9  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3760  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  43.68 
 
 
393 aa  69.3  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.62685  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2900  rhodanese domain-containing protein  34.57 
 
 
127 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.423457  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02371  rhodanese-like protein  37.84 
 
 
118 aa  68.9  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>