More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_1127 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_1127  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 		 121 aa  249  1e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1665  rhodanese-like protein  79.34 
 
 		 120 aa  194  3e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.937901 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3722  Rhodanese domain protein  57.85 
 
 		 112 aa  131  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3957  rhodanese domain-containing protein  54.55 
 
 		 115 aa  131  3e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.998099  normal  0.190366 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2603  rhodanese-like protein  52.89 
 
 		 113 aa  123  7e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2351  rhodanese domain-containing protein  54.55 
 
 		 111 aa  123  1e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1836  Rhodanese domain protein  52.89 
 
 		 112 aa  121  4e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.324614  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2027  rhodanese domain-containing protein  52.89 
 
 		 112 aa  121  4e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.168756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2817  rhodanese domain-containing protein  52.42 
 
 		 116 aa  120  6e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0255311  normal  0.567823 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1506  rhodanese-like domain-containing protein  54.24 
 
 		 107 aa  114  3e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.207517  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2480  rhodanese domain-containing protein  54.24 
 
 		 107 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3100  rhodanese domain-containing protein  52.54 
 
 		 109 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2568  rhodanese-like domain-containing protein  52.54 
 
 		 107 aa  110  5e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3125  rhodanese-like domain-containing protein  52.54 
 
 		 107 aa  110  5e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2045  rhodanese-like domain-containing protein  52.54 
 
 		 107 aa  110  5e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.550294  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3064  rhodanese domain-containing protein  52.54 
 
 		 107 aa  110  5e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0881  rhodanese domain-containing protein  51.69 
 
 		 107 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.691799 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0432  rhodanese-like protein  51.69 
 
 		 107 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0911  rhodanese domain-containing protein  51.69 
 
 		 107 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.174972  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0750  rhodanese-like protein  47.01 
 
 		 107 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0959  Rhodanese domain protein  58.95 
 
 		 107 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0799  rhodanese domain-containing protein  50.85 
 
 		 107 aa  108  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0788  rhodanese domain-containing protein  50.85 
 
 		 107 aa  108  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.677785  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4015  rhodanese-related sulfurtransferase  56.84 
 
 		 107 aa  107  6e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0179275  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3678  hypothetical protein  57.89 
 
 		 107 aa  106  9.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.233085 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2174  rhodanese-like domain-containing protein  51.69 
 
 		 107 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0735  rhodanese-like domain-containing protein  51.69 
 
 		 107 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2247  rhodanese domain-containing protein  55.79 
 
 		 107 aa  104  5e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.256006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2710  rhodanese-like protein  49.48 
 
 		 107 aa  95.1  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2438  rhodanese domain-containing protein  52.63 
 
 		 114 aa  95.1  3e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.517598 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1041  Rhodanese domain protein  51.58 
 
 		 106 aa  92  2e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1035  Rhodanese domain protein  44.92 
 
 		 106 aa  90.9  6e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0696  hypothetical protein  46.28 
 
 		 110 aa  90.5  8e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.014224  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1742  rhodanese-like domain-containing protein  44.92 
 
 		 106 aa  89.7  1e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.112615  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0646  Rhodanese domain protein  44.63 
 
 		 110 aa  87  8e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.126659 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1695  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  45.3 
 
 		 393 aa  86.3  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.294225  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0605  Rhodanese domain protein  43.8 
 
 		 110 aa  85.1  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.415478  normal  0.72873 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3925  rhodanese-like protein  43.16 
 
 		 107 aa  85.1  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2696  rhodanese-like protein  43.22 
 
 		 105 aa  84.3  6e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3531  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  46.81 
 
 		 377 aa  83.2  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.522613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2282  rhodanese/sulfurtransferase-like protein  44.68 
 
 		 109 aa  82.8  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.595015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1680  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  45.26 
 
 		 395 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.683784  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3458  Rhodanese domain protein  43.16 
 
 		 107 aa  80.9  0.000000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0484  rhodanese-related sulfurtransferase  38.66 
 
 		 107 aa  78.2  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0902  Rhodanese domain protein  35.83 
 
 		 119 aa  77  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0876  Rhodanese domain protein  35.83 
 
 		 119 aa  77  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0203  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.25 
 
 		 375 aa  75.1  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.357554  normal  0.334206 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0615  rhodanese-like protein  39.34 
 
 		 114 aa  73.2  0.000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.442702 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1161  Rhodanese domain protein  38.71 
 
 		 115 aa  72  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2112  rhodanese domain-containing protein  42.59 
 
 		 114 aa  71.6  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0658185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5122  Rhodanese domain protein  36.67 
 
 		 116 aa  71.2  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.572476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0214  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40.86 
 
 		 361 aa  70.9  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1530  rhodanese-like  40.62 
 
 		 118 aa  70.5  0.000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.251959  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02371  rhodanese-like protein  40.62 
 
 		 118 aa  70.5  0.000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1757  rhodanese domain-containing protein  43.52 
 
 		 134 aa  69.7  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0421554  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3494  Rhodanese domain protein  37.29 
 
 		 112 aa  70.1  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2096  rhodanese-like protein  41.35 
 
 		 117 aa  70.1  0.00000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0428  Rhodanese domain protein  35.85 
 
 		 116 aa  70.1  0.00000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000514418  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1496  glutaredoxin-like protein  40.43 
 
 		 308 aa  68.6  0.00000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.353854  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0743  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  43.01 
 
 		 392 aa  68.9  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.754392  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1556  glutaredoxin-like protein  40.43 
 
 		 308 aa  68.6  0.00000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16081  rhodanese-like protein  36.13 
 
 		 117 aa  67  0.00000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1132  rhodanese domain-containing protein  38.71 
 
 		 119 aa  66.6  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.237662  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2697  rhodanese domain-containing protein  41.49 
 
 		 107 aa  66.6  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.431269  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0713  rhodanese-like protein  38.38 
 
 		 120 aa  66.6  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.082726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2416  rhodanese-like protein  40.62 
 
 		 118 aa  65.1  0.0000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3886  glutaredoxin-like protein  35.83 
 
 		 308 aa  63.9  0.0000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01801  rhodanese-like protein  36.36 
 
 		 117 aa  63.9  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0504917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01811  rhodanese-like protein  31.36 
 
 		 116 aa  63.5  0.0000000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.353327  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02424  putative glutaredoxin-like protein, putative  41.49 
 
 		 308 aa  63.2  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0941  molybdopterin biosynthesis MoeB protein  31.4 
 
 		 368 aa  61.2  0.000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.217219  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1073  ThiF/MoeZ/MoeB domain/rhodanese-like domain-containing protein  31.4 
 
 		 368 aa  61.2  0.000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1662  rhodanese-like protein  36.56 
 
 		 119 aa  61.6  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0528375  normal  0.0957797 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1246  Rhodanese domain protein  40.96 
 
 		 130 aa  61.2  0.000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000851542  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01831  rhodanese-like protein  31.67 
 
 		 116 aa  60.8  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0949  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.05 
 
 		 383 aa  60.1  0.000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0165  rhodanese-like protein  30.83 
 
 		 118 aa  60.1  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0119337  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3463  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.3 
 
 		 379 aa  59.7  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.838901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  38.82 
 
 		 145 aa  59.3  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01921  rhodanese-like protein  32.99 
 
 		 116 aa  58.2  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0158  hypothetical protein  34.17 
 
 		 391 aa  57.8  0.00000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2892  Rhodanese domain protein  37.04 
 
 		 121 aa  57.8  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0922  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  37.89 
 
 		 390 aa  57.4  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698196  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0563  Rhodanese domain protein  35.37 
 
 		 121 aa  57  0.00000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000600861  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2218  rhodanese domain protein  38.14 
 
 		 118 aa  57  0.00000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.314079  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3386  hypothetical protein  34.17 
 
 		 387 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0847115 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0744  rhodanese domain-containing protein  37.78 
 
 		 133 aa  56.2  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.547874 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1937  rhodanese domain-containing protein  38.82 
 
 		 269 aa  56.6  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0286726  hitchhiker  0.00000000917613 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3370  glutaredoxin-like protein  47.46 
 
 		 308 aa  55.5  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.616165 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1769  hypothetical protein  38.3 
 
 		 423 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.549048  normal  0.774559 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01150  Rhodanese-related sulfurtransferase  38.54 
 
 		 107 aa  55.8  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1280  rhodanese-like protein  40 
 
 		 170 aa  55.5  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.678095 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0020  Rhodanese domain-containing protein  38.95 
 
 		 119 aa  55.5  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.529293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0994  hypothetical protein  39.36 
 
 		 390 aa  55.1  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000186232  normal  0.0867734 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3607  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.91 
 
 		 387 aa  54.3  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.156981  normal  0.010154 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0390  rhodanese-like protein  38 
 
 		 378 aa  54.3  0.0000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5312  beta-lactamase-like protein  35.71 
 
 		 459 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3646  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.89 
 
 		 390 aa  54.7  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5691  beta-lactamase domain-containing protein  35.71 
 
 		 459 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0723  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.79 
 
 		 383 aa  54.7  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>