More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_2817 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_2817  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 
116 aa  235  1e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0255311  normal  0.567823 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1836  Rhodanese domain protein  71.55 
 
 
112 aa  169  1e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.324614  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2027  rhodanese domain-containing protein  71.55 
 
 
112 aa  169  1e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.168756  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2351  rhodanese domain-containing protein  68.97 
 
 
111 aa  159  1e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2603  rhodanese-like protein  60.34 
 
 
113 aa  149  2e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3957  rhodanese domain-containing protein  61.02 
 
 
115 aa  148  3e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.998099  normal  0.190366 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3722  Rhodanese domain protein  63.79 
 
 
112 aa  144  4.0000000000000006e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1665  rhodanese-like protein  56.1 
 
 
120 aa  127  4.0000000000000003e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.937901 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1127  rhodanese domain-containing protein  52.42 
 
 
121 aa  120  6e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0881  rhodanese domain-containing protein  50.89 
 
 
107 aa  115  3e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.691799 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0750  rhodanese-like protein  44.64 
 
 
107 aa  114  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0432  rhodanese-like protein  50.89 
 
 
107 aa  115  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0911  rhodanese domain-containing protein  50.89 
 
 
107 aa  115  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.174972  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1506  rhodanese-like domain-containing protein  51.38 
 
 
107 aa  114  5e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.207517  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2480  rhodanese domain-containing protein  50 
 
 
107 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2568  rhodanese-like domain-containing protein  51.38 
 
 
107 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3100  rhodanese domain-containing protein  51.38 
 
 
109 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3064  rhodanese domain-containing protein  51.38 
 
 
107 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3125  rhodanese-like domain-containing protein  51.38 
 
 
107 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2045  rhodanese-like domain-containing protein  51.38 
 
 
107 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.550294  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4015  rhodanese-related sulfurtransferase  50.46 
 
 
107 aa  111  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0179275  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0799  rhodanese domain-containing protein  50.46 
 
 
107 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0788  rhodanese domain-containing protein  50.46 
 
 
107 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.677785  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2710  rhodanese-like protein  47.22 
 
 
107 aa  108  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0959  Rhodanese domain protein  50.47 
 
 
107 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0735  rhodanese-like domain-containing protein  50.46 
 
 
107 aa  107  6e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2174  rhodanese-like domain-containing protein  50.46 
 
 
107 aa  107  6e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3678  hypothetical protein  49.53 
 
 
107 aa  105  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.233085 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2247  rhodanese domain-containing protein  47.66 
 
 
107 aa  102  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.256006  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3925  rhodanese-like protein  41.74 
 
 
107 aa  97.8  4e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2438  rhodanese domain-containing protein  48.15 
 
 
114 aa  95.5  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.517598 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1742  rhodanese-like domain-containing protein  50 
 
 
106 aa  94  6e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.112615  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0484  rhodanese-related sulfurtransferase  41.74 
 
 
107 aa  94  6e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2282  rhodanese/sulfurtransferase-like protein  49.46 
 
 
109 aa  94  7e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.595015  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3458  Rhodanese domain protein  44.68 
 
 
107 aa  92.8  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2696  rhodanese-like protein  42.48 
 
 
105 aa  89  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1041  Rhodanese domain protein  43.62 
 
 
106 aa  88.2  4e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0696  hypothetical protein  41.53 
 
 
110 aa  87.8  5e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.014224  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3531  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  47.31 
 
 
377 aa  87.8  5e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.522613  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1695  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  43.81 
 
 
393 aa  86.7  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.294225  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1035  Rhodanese domain protein  38.05 
 
 
106 aa  85.9  2e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0203  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.8 
 
 
375 aa  82  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.357554  normal  0.334206 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0949  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.51 
 
 
383 aa  80.9  0.000000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1680  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  42.42 
 
 
395 aa  80.1  0.000000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.683784  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0646  Rhodanese domain protein  36.44 
 
 
110 aa  79.3  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.126659 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0605  Rhodanese domain protein  37.29 
 
 
110 aa  80.1  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.415478  normal  0.72873 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0743  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  42.39 
 
 
392 aa  75.9  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.754392  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0214  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40.37 
 
 
361 aa  73.9  0.0000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0428  Rhodanese domain protein  33.63 
 
 
116 aa  73.6  0.000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000514418  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0723  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.93 
 
 
383 aa  73.2  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0318  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.93 
 
 
383 aa  71.2  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.139087 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1246  Rhodanese domain protein  41.46 
 
 
130 aa  68.9  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000851542  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1556  glutaredoxin-like protein  41.51 
 
 
308 aa  68.6  0.00000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1496  glutaredoxin-like protein  41.51 
 
 
308 aa  68.6  0.00000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.353854  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3494  Rhodanese domain protein  39.39 
 
 
112 aa  67.8  0.00000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3886  glutaredoxin-like protein  41.3 
 
 
308 aa  67.4  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5422  rhodanese domain-containing protein  40 
 
 
116 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.500506  normal  0.598915 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1757  rhodanese domain-containing protein  38.46 
 
 
134 aa  66.6  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0421554  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5042  rhodanese-like protein  40 
 
 
116 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.982785  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5130  rhodanese domain-containing protein  40 
 
 
116 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.183608  normal  0.915775 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0563  Rhodanese domain protein  37.04 
 
 
121 aa  64.7  0.0000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000600861  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2697  rhodanese domain-containing protein  38 
 
 
107 aa  63.9  0.0000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.431269  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01801  rhodanese-like protein  35.71 
 
 
117 aa  63.9  0.0000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0504917  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1530  rhodanese-like  32.2 
 
 
118 aa  63.5  0.0000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.251959  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1830  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 
459 aa  62.8  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.772754  normal  0.208991 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02371  rhodanese-like protein  32.2 
 
 
118 aa  63.5  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5691  beta-lactamase domain-containing protein  33.04 
 
 
459 aa  63.5  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  39.02 
 
 
145 aa  62.8  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1161  Rhodanese domain protein  36.46 
 
 
115 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5312  beta-lactamase-like protein  33.04 
 
 
459 aa  63.5  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4023  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 
459 aa  62.8  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.139103  normal  0.561085 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5401  beta-lactamase domain-containing protein  33.04 
 
 
459 aa  63.5  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.854326  normal  0.319128 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2112  rhodanese domain-containing protein  36.54 
 
 
114 aa  62.4  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0658185  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1132  rhodanese domain-containing protein  39.39 
 
 
119 aa  62.4  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.237662  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3463  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.17 
 
 
379 aa  62.4  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.838901  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0922  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  36.73 
 
 
390 aa  62.4  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698196  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3607  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.78 
 
 
387 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.156981  normal  0.010154 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2892  Rhodanese domain protein  36.25 
 
 
121 aa  61.6  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0713  rhodanese-like protein  34.38 
 
 
120 aa  61.2  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.082726  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02700  Molybdopterin biosynthesis protein, MoeB  36.36 
 
 
377 aa  60.8  0.000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2634  NADH oxidase/rhodanese-related sulfurtransferase  39.08 
 
 
105 aa  60.8  0.000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3646  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.87 
 
 
390 aa  60.5  0.000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3803  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  32.74 
 
 
390 aa  60.5  0.000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.209325  normal  0.526883 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1138  rhodanese domain-containing protein  43.37 
 
 
113 aa  60.1  0.000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.0000773759  normal  0.329269 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1215  beta-lactamase domain-containing protein  33.01 
 
 
460 aa  60.1  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0173274 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0941  molybdopterin biosynthesis MoeB protein  30.43 
 
 
368 aa  59.3  0.00000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.217219  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2416  rhodanese-like protein  35.9 
 
 
118 aa  59.3  0.00000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0615  rhodanese-like protein  37.23 
 
 
114 aa  58.9  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.442702 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1073  ThiF/MoeZ/MoeB domain/rhodanese-like domain-containing protein  30.43 
 
 
368 aa  59.3  0.00000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5669  rhodanese domain-containing protein  39.76 
 
 
113 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.192192  hitchhiker  0.00438713 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0902  Rhodanese domain protein  34.95 
 
 
119 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5122  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 
116 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.572476  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0876  Rhodanese domain protein  34.95 
 
 
119 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1662  rhodanese-like protein  35.42 
 
 
119 aa  57.8  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0528375  normal  0.0957797 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3493  UBA/THIF-type NAD/FAD binding, MoeZ/MoeB fmaily protein  34.78 
 
 
390 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16081  rhodanese-like protein  34.82 
 
 
117 aa  58.2  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0688  beta-lactamase domain-containing protein  32.98 
 
 
450 aa  58.2  0.00000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.715713  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0226  Rhodanese domain protein  41.11 
 
 
113 aa  57.8  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1937  rhodanese domain-containing protein  35.23 
 
 
269 aa  57.8  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0286726  hitchhiker  0.00000000917613 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0020  Rhodanese domain-containing protein  34.15 
 
 
119 aa  57.8  0.00000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.529293  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>