More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_0911 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008060  Bcen_0432  rhodanese-like protein  100 
 
 
107 aa  221  3e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0911  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 
107 aa  221  3e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.174972  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0881  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 
107 aa  221  3e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.691799 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4015  rhodanese-related sulfurtransferase  96.26 
 
 
107 aa  214  5e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0179275  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2480  rhodanese domain-containing protein  95.33 
 
 
107 aa  211  1.9999999999999998e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0788  rhodanese domain-containing protein  95.33 
 
 
107 aa  210  4.9999999999999996e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.677785  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0799  rhodanese domain-containing protein  95.33 
 
 
107 aa  210  4.9999999999999996e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1506  rhodanese-like domain-containing protein  91.59 
 
 
107 aa  201  3e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.207517  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2568  rhodanese-like domain-containing protein  88.79 
 
 
107 aa  199  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2045  rhodanese-like domain-containing protein  88.79 
 
 
107 aa  199  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.550294  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3125  rhodanese-like domain-containing protein  88.79 
 
 
107 aa  199  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3064  rhodanese domain-containing protein  88.79 
 
 
107 aa  199  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3100  rhodanese domain-containing protein  88.79 
 
 
109 aa  199  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0735  rhodanese-like domain-containing protein  87.85 
 
 
107 aa  195  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2174  rhodanese-like domain-containing protein  87.85 
 
 
107 aa  195  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0959  Rhodanese domain protein  78.5 
 
 
107 aa  178  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3678  hypothetical protein  78.5 
 
 
107 aa  178  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.233085 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2247  rhodanese domain-containing protein  74.77 
 
 
107 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.256006  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0750  rhodanese-like protein  58.88 
 
 
107 aa  147  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2710  rhodanese-like protein  60.75 
 
 
107 aa  136  7.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3925  rhodanese-like protein  54.21 
 
 
107 aa  132  9.999999999999999e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0484  rhodanese-related sulfurtransferase  55.14 
 
 
107 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3458  Rhodanese domain protein  55.14 
 
 
107 aa  127  4.0000000000000003e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0696  hypothetical protein  54.55 
 
 
110 aa  120  9e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.014224  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3722  Rhodanese domain protein  55.56 
 
 
112 aa  119  9e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0605  Rhodanese domain protein  53.64 
 
 
110 aa  117  6e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.415478  normal  0.72873 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1041  Rhodanese domain protein  53.27 
 
 
106 aa  116  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1836  Rhodanese domain protein  52.83 
 
 
112 aa  115  3e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.324614  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2603  rhodanese-like protein  57.41 
 
 
113 aa  115  3e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2027  rhodanese domain-containing protein  52.83 
 
 
112 aa  115  3e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.168756  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2817  rhodanese domain-containing protein  50.89 
 
 
116 aa  115  3e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0255311  normal  0.567823 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0646  Rhodanese domain protein  50 
 
 
110 aa  114  6e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.126659 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1742  rhodanese-like domain-containing protein  54.21 
 
 
106 aa  113  6.9999999999999995e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.112615  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1665  rhodanese-like protein  53.85 
 
 
120 aa  112  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.937901 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1127  rhodanese domain-containing protein  51.69 
 
 
121 aa  109  1.0000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2438  rhodanese domain-containing protein  52.83 
 
 
114 aa  108  2.0000000000000002e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.517598 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3957  rhodanese domain-containing protein  49.54 
 
 
115 aa  108  3e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.998099  normal  0.190366 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2351  rhodanese domain-containing protein  50 
 
 
111 aa  107  4.0000000000000004e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1035  Rhodanese domain protein  47.66 
 
 
106 aa  104  3e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1695  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  48.11 
 
 
393 aa  103  1e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.294225  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2696  rhodanese-like protein  46.73 
 
 
105 aa  101  4e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2282  rhodanese/sulfurtransferase-like protein  52.33 
 
 
109 aa  98.6  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.595015  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3531  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  48.39 
 
 
377 aa  98.6  3e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.522613  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0949  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  47.62 
 
 
383 aa  94.4  4e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0723  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  44.23 
 
 
383 aa  88.2  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0743  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  49.41 
 
 
392 aa  87  7e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.754392  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1662  rhodanese-like protein  47.19 
 
 
119 aa  85.5  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0528375  normal  0.0957797 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0203  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  47.13 
 
 
375 aa  85.9  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.357554  normal  0.334206 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1680  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  44.94 
 
 
395 aa  84.7  4e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.683784  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5122  Rhodanese domain protein  41.57 
 
 
116 aa  84.3  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.572476  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1161  Rhodanese domain protein  42.7 
 
 
115 aa  84  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0318  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  43.27 
 
 
383 aa  83.2  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.139087 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1132  rhodanese domain-containing protein  41.75 
 
 
119 aa  82.8  0.000000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.237662  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2697  rhodanese domain-containing protein  53.49 
 
 
107 aa  80.5  0.000000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.431269  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1757  rhodanese domain-containing protein  47.67 
 
 
134 aa  80.5  0.000000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0421554  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02700  Molybdopterin biosynthesis protein, MoeB  42.42 
 
 
377 aa  79.3  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3494  Rhodanese domain protein  38.83 
 
 
112 aa  79  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  44.16 
 
 
145 aa  79  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0615  rhodanese-like protein  41.82 
 
 
114 aa  79.3  0.00000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.442702 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3463  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  41.86 
 
 
379 aa  79.3  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.838901  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3886  glutaredoxin-like protein  44.86 
 
 
308 aa  78.6  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0214  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40.57 
 
 
361 aa  78.2  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0713  rhodanese-like protein  43.82 
 
 
120 aa  78.2  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.082726  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0902  Rhodanese domain protein  41.57 
 
 
119 aa  77.8  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0876  Rhodanese domain protein  41.57 
 
 
119 aa  77.8  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2852  Rhodanese domain-containing protein  43.18 
 
 
113 aa  77.4  0.00000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2112  rhodanese domain-containing protein  45.35 
 
 
114 aa  76.3  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0658185  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2633  Rhodanese domain protein  41.25 
 
 
123 aa  76.6  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.728751  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1530  rhodanese-like  40 
 
 
118 aa  75.9  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.251959  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02371  rhodanese-like protein  39.09 
 
 
118 aa  75.9  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1937  rhodanese domain-containing protein  44.16 
 
 
269 aa  75.9  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0286726  hitchhiker  0.00000000917613 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2634  NADH oxidase/rhodanese-related sulfurtransferase  43.37 
 
 
105 aa  75.5  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0428  Rhodanese domain protein  38.64 
 
 
116 aa  74.7  0.0000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000514418  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2630  Rhodanese domain protein  45.45 
 
 
112 aa  73.9  0.0000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2891  Rhodanese domain protein  41.67 
 
 
98 aa  73.6  0.0000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2416  rhodanese-like protein  39.29 
 
 
118 aa  73.6  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0563  Rhodanese domain protein  35.05 
 
 
121 aa  72.8  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000600861  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1073  ThiF/MoeZ/MoeB domain/rhodanese-like domain-containing protein  37.37 
 
 
368 aa  72  0.000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0941  molybdopterin biosynthesis MoeB protein  37.37 
 
 
368 aa  72  0.000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.217219  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1496  glutaredoxin-like protein  44.44 
 
 
308 aa  72  0.000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.353854  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1556  glutaredoxin-like protein  44.44 
 
 
308 aa  72  0.000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3607  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.82 
 
 
387 aa  70.9  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.156981  normal  0.010154 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0994  hypothetical protein  40.18 
 
 
390 aa  70.9  0.000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000186232  normal  0.0867734 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0281  Rhodanese domain protein  42.17 
 
 
108 aa  70.5  0.000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.161319 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0158  hypothetical protein  39.39 
 
 
391 aa  70.5  0.000000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3646  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.82 
 
 
390 aa  69.7  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01801  rhodanese-like protein  38.1 
 
 
117 aa  70.1  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0504917  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1246  Rhodanese domain protein  42.7 
 
 
130 aa  70.1  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000851542  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2892  Rhodanese domain protein  35.9 
 
 
121 aa  69.3  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2644  Rhodanese domain protein  41.89 
 
 
102 aa  68.9  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00713239  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0218  Rhodanese domain protein  37.04 
 
 
124 aa  68.9  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1906  Rhodanese domain protein  39.47 
 
 
105 aa  68.9  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000236409  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0296  hypothetical protein  41.18 
 
 
377 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3493  UBA/THIF-type NAD/FAD binding, MoeZ/MoeB fmaily protein  37.65 
 
 
390 aa  69.3  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3803  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  38.46 
 
 
390 aa  68.9  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.209325  normal  0.526883 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3370  glutaredoxin-like protein  39.8 
 
 
308 aa  69.3  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.616165 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2218  rhodanese domain protein  42.67 
 
 
118 aa  68.6  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.314079  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0573  rhodanese-like protein  34.48 
 
 
109 aa  68.6  0.00000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000000000146252  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2356  Rhodanese domain protein  33 
 
 
124 aa  68.6  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3577  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.47 
 
 
390 aa  68.2  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.127521  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>