More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0615 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0615  rhodanese-like protein  100 
 
 
114 aa  237  4e-62  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.442702 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1132  rhodanese domain-containing protein  53.57 
 
 
119 aa  122  2e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.237662  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1161  Rhodanese domain protein  54.13 
 
 
115 aa  121  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0713  rhodanese-like protein  52.29 
 
 
120 aa  117  3.9999999999999996e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.082726  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1662  rhodanese-like protein  48.65 
 
 
119 aa  110  8.000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0528375  normal  0.0957797 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0876  Rhodanese domain protein  57.78 
 
 
119 aa  109  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0902  Rhodanese domain protein  57.78 
 
 
119 aa  109  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5122  Rhodanese domain protein  56.52 
 
 
116 aa  108  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.572476  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2480  rhodanese domain-containing protein  44.55 
 
 
107 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0799  rhodanese domain-containing protein  45 
 
 
107 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0788  rhodanese domain-containing protein  45 
 
 
107 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.677785  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0484  rhodanese-related sulfurtransferase  46.39 
 
 
107 aa  80.1  0.000000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2697  rhodanese domain-containing protein  41.07 
 
 
107 aa  80.1  0.000000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.431269  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4015  rhodanese-related sulfurtransferase  45.36 
 
 
107 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0179275  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1506  rhodanese-like domain-containing protein  44 
 
 
107 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.207517  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3458  Rhodanese domain protein  42.34 
 
 
107 aa  79.7  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2045  rhodanese-like domain-containing protein  44 
 
 
107 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.550294  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3100  rhodanese domain-containing protein  44 
 
 
109 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3125  rhodanese-like domain-containing protein  44 
 
 
107 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3064  rhodanese domain-containing protein  44 
 
 
107 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0432  rhodanese-like protein  41.82 
 
 
107 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0911  rhodanese domain-containing protein  41.82 
 
 
107 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.174972  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0881  rhodanese domain-containing protein  41.82 
 
 
107 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.691799 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2568  rhodanese-like domain-containing protein  44 
 
 
107 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1665  rhodanese-like protein  40.65 
 
 
120 aa  78.6  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.937901 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2416  rhodanese-like protein  45.1 
 
 
118 aa  77.8  0.00000000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02371  rhodanese-like protein  45.65 
 
 
118 aa  76.3  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1742  rhodanese-like domain-containing protein  47.19 
 
 
106 aa  76.3  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.112615  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2247  rhodanese domain-containing protein  42.72 
 
 
107 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.256006  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0959  Rhodanese domain protein  43.82 
 
 
107 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3678  hypothetical protein  42.27 
 
 
107 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.233085 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2174  rhodanese-like domain-containing protein  43 
 
 
107 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0735  rhodanese-like domain-containing protein  43 
 
 
107 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2438  rhodanese domain-containing protein  47.25 
 
 
114 aa  73.9  0.0000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.517598 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1757  rhodanese domain-containing protein  40.22 
 
 
134 aa  73.2  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0421554  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1530  rhodanese-like  44.57 
 
 
118 aa  72.8  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.251959  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16081  rhodanese-like protein  43.33 
 
 
117 aa  73.2  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1127  rhodanese domain-containing protein  39.34 
 
 
121 aa  73.2  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2112  rhodanese domain-containing protein  41.3 
 
 
114 aa  72.4  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0658185  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0750  rhodanese-like protein  37.14 
 
 
107 aa  71.6  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2096  rhodanese-like protein  42.71 
 
 
117 aa  71.2  0.000000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1041  Rhodanese domain protein  40.45 
 
 
106 aa  70.9  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1695  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  44.94 
 
 
393 aa  70.9  0.000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.294225  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3957  rhodanese domain-containing protein  46.15 
 
 
115 aa  70.5  0.000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.998099  normal  0.190366 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2282  rhodanese/sulfurtransferase-like protein  40.45 
 
 
109 aa  70.1  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.595015  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2892  Rhodanese domain protein  43.9 
 
 
121 aa  68.9  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0696  hypothetical protein  37.96 
 
 
110 aa  68.2  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.014224  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2603  rhodanese-like protein  39.56 
 
 
113 aa  68.6  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1035  Rhodanese domain protein  40 
 
 
106 aa  67.4  0.00000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2027  rhodanese domain-containing protein  41.76 
 
 
112 aa  66.6  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.168756  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1836  Rhodanese domain protein  41.76 
 
 
112 aa  66.6  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.324614  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3925  rhodanese-like protein  35.14 
 
 
107 aa  65.9  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2710  rhodanese-like protein  39.33 
 
 
107 aa  66.2  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0941  rhodanese-domain protein  41.25 
 
 
121 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000120327  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2696  rhodanese-like protein  38.53 
 
 
105 aa  65.1  0.0000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0203  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  42.7 
 
 
375 aa  65.1  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.357554  normal  0.334206 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0390  rhodanese-like protein  38.6 
 
 
378 aa  64.3  0.0000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.734  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2351  rhodanese domain-containing protein  39 
 
 
111 aa  64.3  0.0000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0563  Rhodanese domain protein  36.17 
 
 
121 aa  64.3  0.0000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000600861  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0646  Rhodanese domain protein  35.19 
 
 
110 aa  63.9  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.126659 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3722  Rhodanese domain protein  39.05 
 
 
112 aa  63.5  0.0000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1246  Rhodanese domain protein  41.67 
 
 
130 aa  63.2  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000851542  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0869  rhodanese-like domain-containing protein  42.31 
 
 
119 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0723  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  41.57 
 
 
383 aa  62  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1123  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.98 
 
 
396 aa  62.4  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.632622  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3494  Rhodanese domain protein  35.96 
 
 
112 aa  61.2  0.000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3493  UBA/THIF-type NAD/FAD binding, MoeZ/MoeB fmaily protein  39.13 
 
 
390 aa  61.2  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2644  Rhodanese domain protein  40.79 
 
 
102 aa  61.2  0.000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00713239  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3646  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.13 
 
 
390 aa  61.2  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_9623  predicted protein  32.67 
 
 
98 aa  61.2  0.000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0447798 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1940  rhodanese-like protein  33.61 
 
 
388 aa  60.5  0.000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.865805  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4503  rhodanese-like domain protein  38.46 
 
 
119 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000135209 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3577  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.04 
 
 
390 aa  60.5  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.127521  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0165  rhodanese-like protein  40.86 
 
 
118 aa  59.7  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0119337  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0605  Rhodanese domain protein  33.04 
 
 
110 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.415478  normal  0.72873 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0949  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.36 
 
 
383 aa  60.1  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2218  rhodanese domain protein  36.54 
 
 
118 aa  59.7  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.314079  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0214  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.78 
 
 
361 aa  59.7  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4247  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.61 
 
 
386 aa  59.3  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.020881  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0318  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.45 
 
 
383 aa  58.9  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.139087 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22891  molybdopterin biosynthesis protein  36.46 
 
 
409 aa  59.3  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2817  rhodanese domain-containing protein  37.23 
 
 
116 aa  58.9  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0255311  normal  0.567823 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2274  rhodanese-related sulfurtransferase  35.64 
 
 
280 aa  58.5  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000200812  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3463  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.55 
 
 
379 aa  58.5  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.838901  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1078  rhodanese-like protein  36.47 
 
 
255 aa  58.5  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0473759  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0922  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  35.56 
 
 
390 aa  58.5  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698196  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0689  rhodanese domain-containing protein  38.46 
 
 
120 aa  58.2  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3607  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.87 
 
 
387 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.156981  normal  0.010154 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1642  rhodanese domain-containing protein  36.25 
 
 
103 aa  58.2  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0061  Rhodanese domain protein  37.65 
 
 
277 aa  58.2  0.00000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01801  rhodanese-like protein  39.78 
 
 
117 aa  57.8  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0504917  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06750  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  34.55 
 
 
398 aa  57.8  0.00000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0428  Rhodanese domain protein  33.03 
 
 
116 aa  57.8  0.00000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000514418  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01831  rhodanese-like protein  39.13 
 
 
116 aa  57.8  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01921  rhodanese-like protein  35.48 
 
 
116 aa  57.4  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  38.71 
 
 
145 aa  57.4  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0689  rhodanese-like domain-containing protein  36.36 
 
 
119 aa  57.4  0.00000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.152263  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0675  rhodanese-like domain-containing protein  36.36 
 
 
119 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.852423  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0873  rhodanese-like domain protein  36.36 
 
 
119 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000378208 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0099  rhodanese domain-containing protein  34.09 
 
 
102 aa  57.4  0.00000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.973774  normal  0.0985137 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>