More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1665 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_1665  rhodanese-like protein  100 
 
 
120 aa  247  5e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.937901 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1127  rhodanese domain-containing protein  79.34 
 
 
121 aa  194  3e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3722  Rhodanese domain protein  65 
 
 
112 aa  147  4e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2603  rhodanese-like protein  57.5 
 
 
113 aa  134  5e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2027  rhodanese domain-containing protein  56.67 
 
 
112 aa  133  9.999999999999999e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.168756  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1836  Rhodanese domain protein  56.67 
 
 
112 aa  133  9.999999999999999e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.324614  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2351  rhodanese domain-containing protein  55.83 
 
 
111 aa  129  1.0000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2817  rhodanese domain-containing protein  56.1 
 
 
116 aa  127  4.0000000000000003e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0255311  normal  0.567823 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3957  rhodanese domain-containing protein  51.67 
 
 
115 aa  122  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.998099  normal  0.190366 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0959  Rhodanese domain protein  60.78 
 
 
107 aa  116  9e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1506  rhodanese-like domain-containing protein  56.41 
 
 
107 aa  116  9e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.207517  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0750  rhodanese-like protein  50 
 
 
107 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2480  rhodanese domain-containing protein  56.41 
 
 
107 aa  115  3e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3678  hypothetical protein  62.11 
 
 
107 aa  113  6.9999999999999995e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.233085 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3100  rhodanese domain-containing protein  54.7 
 
 
109 aa  113  7.999999999999999e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3125  rhodanese-like domain-containing protein  54.7 
 
 
107 aa  113  7.999999999999999e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3064  rhodanese domain-containing protein  54.7 
 
 
107 aa  113  7.999999999999999e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2045  rhodanese-like domain-containing protein  54.7 
 
 
107 aa  113  7.999999999999999e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.550294  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2568  rhodanese-like domain-containing protein  54.7 
 
 
107 aa  113  7.999999999999999e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0881  rhodanese domain-containing protein  53.85 
 
 
107 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.691799 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0432  rhodanese-like protein  53.85 
 
 
107 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0911  rhodanese domain-containing protein  53.85 
 
 
107 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.174972  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0799  rhodanese domain-containing protein  53.85 
 
 
107 aa  111  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0788  rhodanese domain-containing protein  53.85 
 
 
107 aa  111  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.677785  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4015  rhodanese-related sulfurtransferase  58.95 
 
 
107 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0179275  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2247  rhodanese domain-containing protein  58.95 
 
 
107 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.256006  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0735  rhodanese-like domain-containing protein  53.85 
 
 
107 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2174  rhodanese-like domain-containing protein  53.85 
 
 
107 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2710  rhodanese-like protein  54.64 
 
 
107 aa  104  5e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2438  rhodanese domain-containing protein  49.17 
 
 
114 aa  100  8e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.517598 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1041  Rhodanese domain protein  50.5 
 
 
106 aa  95.5  2e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1742  rhodanese-like domain-containing protein  44.54 
 
 
106 aa  91.3  4e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.112615  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1035  Rhodanese domain protein  42.02 
 
 
106 aa  91.3  4e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0484  rhodanese-related sulfurtransferase  42.5 
 
 
107 aa  90.9  5e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0696  hypothetical protein  45.08 
 
 
110 aa  89.7  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.014224  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2282  rhodanese/sulfurtransferase-like protein  47.87 
 
 
109 aa  90.1  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.595015  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2696  rhodanese-like protein  39.5 
 
 
105 aa  88.2  4e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1695  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  43.97 
 
 
393 aa  87.8  4e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.294225  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1680  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  45.92 
 
 
395 aa  87  7e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.683784  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0646  Rhodanese domain protein  43.44 
 
 
110 aa  85.9  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.126659 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0605  Rhodanese domain protein  43.44 
 
 
110 aa  85.9  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.415478  normal  0.72873 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3925  rhodanese-like protein  40.34 
 
 
107 aa  85.1  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3458  Rhodanese domain protein  44.21 
 
 
107 aa  84.7  4e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3531  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  47.87 
 
 
377 aa  84  6e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.522613  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0615  rhodanese-like protein  40.65 
 
 
114 aa  78.6  0.00000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.442702 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0203  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  43.88 
 
 
375 aa  78.6  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.357554  normal  0.334206 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0743  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  46.24 
 
 
392 aa  76.6  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.754392  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0428  Rhodanese domain protein  37.38 
 
 
116 aa  75.5  0.0000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000514418  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1496  glutaredoxin-like protein  39.5 
 
 
308 aa  75.5  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.353854  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1556  glutaredoxin-like protein  39.5 
 
 
308 aa  75.5  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0214  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.13 
 
 
361 aa  74.3  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3494  Rhodanese domain protein  35.9 
 
 
112 aa  72.8  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1161  Rhodanese domain protein  38.71 
 
 
115 aa  70.9  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0876  Rhodanese domain protein  37.63 
 
 
119 aa  70.1  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0902  Rhodanese domain protein  37.63 
 
 
119 aa  70.1  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0723  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.75 
 
 
383 aa  69.7  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01811  rhodanese-like protein  33.33 
 
 
116 aa  69.7  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.353327  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0922  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  42 
 
 
390 aa  70.1  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698196  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1530  rhodanese-like  39.58 
 
 
118 aa  68.9  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.251959  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02371  rhodanese-like protein  39.58 
 
 
118 aa  68.9  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5122  Rhodanese domain protein  36.56 
 
 
116 aa  69.3  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.572476  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2697  rhodanese domain-containing protein  41.12 
 
 
107 aa  67.8  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.431269  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1132  rhodanese domain-containing protein  39.78 
 
 
119 aa  67.8  0.00000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.237662  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2096  rhodanese-like protein  42.71 
 
 
117 aa  67.4  0.00000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2416  rhodanese-like protein  46.88 
 
 
118 aa  67.4  0.00000000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3803  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  35.83 
 
 
390 aa  67.4  0.00000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.209325  normal  0.526883 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0713  rhodanese-like protein  37.63 
 
 
120 aa  67  0.00000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.082726  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  43.53 
 
 
145 aa  67  0.00000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2112  rhodanese domain-containing protein  41.41 
 
 
114 aa  66.6  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0658185  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01831  rhodanese-like protein  32.48 
 
 
116 aa  66.6  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3886  glutaredoxin-like protein  33.61 
 
 
308 aa  66.6  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1246  Rhodanese domain protein  42.17 
 
 
130 aa  65.9  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000851542  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1662  rhodanese-like protein  39.78 
 
 
119 aa  65.9  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0528375  normal  0.0957797 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0165  rhodanese-like protein  31.62 
 
 
118 aa  65.9  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0119337  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01801  rhodanese-like protein  35 
 
 
117 aa  65.9  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0504917  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1757  rhodanese domain-containing protein  42.42 
 
 
134 aa  65.9  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0421554  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0949  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.9 
 
 
383 aa  65.5  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0318  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.04 
 
 
383 aa  65.5  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.139087 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3463  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.3 
 
 
379 aa  63.9  0.0000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.838901  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16081  rhodanese-like protein  37.5 
 
 
117 aa  63.2  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1937  rhodanese domain-containing protein  41.57 
 
 
269 aa  63.2  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0286726  hitchhiker  0.00000000917613 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0941  molybdopterin biosynthesis MoeB protein  37.23 
 
 
368 aa  62.4  0.000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.217219  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4697  Rhodanese domain protein  36.67 
 
 
184 aa  62.8  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0900105 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1073  ThiF/MoeZ/MoeB domain/rhodanese-like domain-containing protein  37.23 
 
 
368 aa  62.4  0.000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01921  rhodanese-like protein  29.66 
 
 
116 aa  62  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3370  glutaredoxin-like protein  42.25 
 
 
308 aa  61.2  0.000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.616165 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02424  putative glutaredoxin-like protein, putative  40.43 
 
 
308 aa  60.5  0.000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06750  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  38.95 
 
 
398 aa  60.5  0.000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1123  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.48 
 
 
396 aa  59.7  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.632622  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0563  Rhodanese domain protein  36.59 
 
 
121 aa  59.7  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000600861  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1280  rhodanese-like protein  38.89 
 
 
170 aa  58.9  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.678095 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  38.82 
 
 
220 aa  59.3  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2892  Rhodanese domain protein  37.04 
 
 
121 aa  59.3  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1138  rhodanese domain-containing protein  42.86 
 
 
113 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.0000773759  normal  0.329269 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0744  rhodanese domain-containing protein  35.56 
 
 
133 aa  58.2  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.547874 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0296  hypothetical protein  38.61 
 
 
377 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4247  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.84 
 
 
386 aa  57.8  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.020881  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2416  thiosulfate sulfurtransferase  30.53 
 
 
106 aa  57.4  0.00000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000293751  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01150  Rhodanese-related sulfurtransferase  41.67 
 
 
107 aa  57.4  0.00000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3510  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.89 
 
 
395 aa  57  0.00000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>