More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02424 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_02424  putative glutaredoxin-like protein, putative  100 
 
 
308 aa  622  1e-177  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3370  glutaredoxin-like protein  80.52 
 
 
308 aa  520  1e-146  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.616165 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1496  glutaredoxin-like protein  76.95 
 
 
308 aa  493  9.999999999999999e-139  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.353854  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1556  glutaredoxin-like protein  76.95 
 
 
308 aa  494  9.999999999999999e-139  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3886  glutaredoxin-like protein  46.67 
 
 
308 aa  271  7e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1936  glutaredoxin-related protein  65.59 
 
 
111 aa  130  2.0000000000000002e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1116  glutaredoxin-like protein  58.33 
 
 
120 aa  130  3e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0357  glutaredoxin-like protein  57 
 
 
110 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.66028 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4728  glutaredoxin-like protein  52.48 
 
 
107 aa  129  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0939613  normal  0.188207 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1710  putative monothiol glutaredoxin  58.59 
 
 
120 aa  129  6e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0700819 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09521  glutaredoxin-like protein  53.47 
 
 
107 aa  127  3e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.221598 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2519  glutaredoxin-like protein  57.29 
 
 
109 aa  126  4.0000000000000003e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.134397  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3377  glutaredoxin-like protein  52.48 
 
 
107 aa  125  8.000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2734  glutaredoxin-like protein  52.48 
 
 
107 aa  125  8.000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.546465  hitchhiker  0.0000029189 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4396  glutaredoxin-like protein  50.98 
 
 
114 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.308725 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4712  glutaredoxin-like protein  56.7 
 
 
109 aa  124  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.729225  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1939  glutaredoxin-like protein  56.12 
 
 
111 aa  123  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0358021  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1661  glutaredoxin-like protein  53.47 
 
 
107 aa  123  4e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.147009  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2149  glutaredoxin-like protein  56.12 
 
 
111 aa  122  7e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.907449 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5478  glutaredoxin-like protein  54.37 
 
 
107 aa  122  8e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2784  glutaredoxin-like protein  48.48 
 
 
107 aa  122  9.999999999999999e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1556  glutaredoxin-like protein  56 
 
 
105 aa  122  9.999999999999999e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00461361 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0848  glutaredoxin-like protein  55.24 
 
 
109 aa  122  9.999999999999999e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.609526  normal  0.565462 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1124  glutaredoxin-like protein  55.67 
 
 
112 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0520  hypothetical protein  57.84 
 
 
110 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0968275 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1273  glutaredoxin-like protein  54.08 
 
 
111 aa  122  9.999999999999999e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.909876  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0849  glutaredoxin-like protein  56.44 
 
 
109 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.539719  normal  0.527344 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0639  glutaredoxin-like protein  51.49 
 
 
107 aa  121  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14711  glutaredoxin-like protein  51.49 
 
 
107 aa  121  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.211551  normal  0.903864 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0778  glutaredoxin-like protein  56.44 
 
 
109 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.228725  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_37615  glutaredoxin  58.06 
 
 
149 aa  120  3e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0011  glutaredoxin-like protein  53.61 
 
 
112 aa  120  3e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2171  glutaredoxin-like protein  54.17 
 
 
119 aa  120  3.9999999999999996e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.95609  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9035  predicted protein  55.21 
 
 
117 aa  120  3.9999999999999996e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.958741  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10761  glutaredoxin-like protein  50.5 
 
 
107 aa  119  4.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.431003 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0007  glutaredoxin-like protein  54.64 
 
 
112 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0681902 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2316  glutaredoxin-like protein  53.76 
 
 
129 aa  119  6e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.102324  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1145  glutaredoxin-like protein  49.5 
 
 
108 aa  119  6e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0677  glutaredoxin-like protein  50 
 
 
111 aa  119  6e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.835173  normal  0.0315958 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5883  putative glutaredoxin family protein  54.9 
 
 
109 aa  119  7.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0738843  normal  0.762824 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1508  glutaredoxin-like protein  56.99 
 
 
111 aa  119  7.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.454801 
 
 
-
 
NC_004310  BR0835  glutaredoxin-related protein  56.99 
 
 
130 aa  118  9.999999999999999e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0827  glutaredoxin-related protein  56.99 
 
 
130 aa  118  9.999999999999999e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0591  glutaredoxin-like protein  50 
 
 
107 aa  118  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1418  glutaredoxin-like protein  50.5 
 
 
107 aa  118  9.999999999999999e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.448786  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_5638  predicted protein  50.53 
 
 
304 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.85631  normal  0.0243125 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2391  glutaredoxin-like protein  57.3 
 
 
110 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.593827  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0773  glutaredoxin-like protein  54.29 
 
 
109 aa  117  1.9999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.045295 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_8492  predicted protein  53.76 
 
 
123 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00589447  normal  0.207924 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1312  glutaredoxin-like protein  53.06 
 
 
112 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0729  glutaredoxin-like protein  52 
 
 
111 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2904  hypothetical protein  56.7 
 
 
103 aa  117  3e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2597  glutaredoxin-like protein  54.64 
 
 
103 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.583628  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0480  glutaredoxin-like protein  54.64 
 
 
103 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.810756  normal  0.505328 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0508  glutaredoxin-like protein  54.64 
 
 
103 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.10469  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3117  glutaredoxin-like protein  49.07 
 
 
113 aa  116  3.9999999999999997e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.736059 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1276  glutaredoxin-like protein  51.46 
 
 
108 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3150  glutaredoxin-like protein  55.67 
 
 
103 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0389298  normal  0.0157235 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1641  glutaredoxin-like protein  52.04 
 
 
113 aa  117  3.9999999999999997e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4088  glutaredoxin-like protein  51.02 
 
 
128 aa  116  3.9999999999999997e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3595  glutaredoxin-like protein  53.61 
 
 
103 aa  116  5e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.826772 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1392  glutaredoxin-like protein  54.17 
 
 
120 aa  116  6e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.394027  normal  0.177187 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2801  glutaredoxin-like protein  54.64 
 
 
103 aa  116  6e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.420164 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4208  glutaredoxin-like protein  53 
 
 
110 aa  115  7.999999999999999e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1122  glutaredoxin-like protein  48.08 
 
 
107 aa  115  7.999999999999999e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.160765  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0438  glutaredoxin-like protein  53.61 
 
 
103 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.315589 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2890  glutaredoxin-like protein  54.64 
 
 
103 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.441106 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5393  putative glutaredoxin family protein  52.04 
 
 
112 aa  115  7.999999999999999e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0412  glutaredoxin-like protein  53.61 
 
 
103 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.738354  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1796  glutaredoxin-like protein  51.02 
 
 
108 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.565897  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2953  glutaredoxin-related protein  49.5 
 
 
121 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0705  glutaredoxin-like protein  51.02 
 
 
109 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2932  glutaredoxin-related protein  53.61 
 
 
102 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3204  glutaredoxin-like protein  51.92 
 
 
117 aa  115  8.999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1598  glutaredoxin-like protein  49.5 
 
 
121 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0834574 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0502  glutaredoxin-related protein  53.61 
 
 
102 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12021  glutaredoxin-like protein  49.49 
 
 
107 aa  114  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0678  glutaredoxin-related protein  53.61 
 
 
102 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1945  glutaredoxin-related protein  53.61 
 
 
102 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.980346  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3605  glutaredoxin-like protein  53.61 
 
 
102 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0577  glutaredoxin-like protein  54.64 
 
 
103 aa  114  1.0000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.220445 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0974  glutaredoxin-related protein  53.61 
 
 
102 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.104778  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3616  putative glutaredoxin  53.61 
 
 
102 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0892  glutaredoxin-like protein  49.5 
 
 
121 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.137957 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3592  putative glutaredoxin  53.61 
 
 
102 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.703507  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0123  glutaredoxin-like protein  51.96 
 
 
110 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.826994 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1186  glutaredoxin-like protein  51.82 
 
 
112 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.242969 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_27972  predicted protein  49.49 
 
 
338 aa  114  2.0000000000000002e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1599  glutaredoxin-like protein  50 
 
 
123 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.283027  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12171  glutaredoxin-like protein  47.12 
 
 
107 aa  114  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.537864  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0595  glutaredoxin-like protein  49.48 
 
 
109 aa  114  2.0000000000000002e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0120135  hitchhiker  6.40079e-17 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3038  glutaredoxin-like protein  50.98 
 
 
115 aa  114  3e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2896  glutaredoxin-like protein  50.98 
 
 
115 aa  114  3e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12181  glutaredoxin-like protein  47.12 
 
 
107 aa  113  3e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1426  glutaredoxin-like protein  63.53 
 
 
109 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.495839  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3683  glutaredoxin-like protein  53.06 
 
 
106 aa  113  4.0000000000000004e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3047  glutaredoxin-like protein  53.06 
 
 
103 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.994053  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48859  predicted protein  53 
 
 
134 aa  113  4.0000000000000004e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.815373  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0134  glutaredoxin-like protein  52.58 
 
 
102 aa  113  4.0000000000000004e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00271929  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2460  glutaredoxin-like protein  50.53 
 
 
109 aa  113  5e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>