More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0357 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_0357  glutaredoxin-like protein  100 
 
 
110 aa  228  1e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.66028 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2519  glutaredoxin-like protein  74.29 
 
 
109 aa  169  1e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.134397  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4712  glutaredoxin-like protein  79.61 
 
 
109 aa  163  9e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.729225  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09521  glutaredoxin-like protein  60.4 
 
 
107 aa  146  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.221598 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4396  glutaredoxin-like protein  62 
 
 
114 aa  145  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.308725 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1661  glutaredoxin-like protein  61.39 
 
 
107 aa  144  4.0000000000000006e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.147009  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3616  putative glutaredoxin  67.35 
 
 
102 aa  143  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0502  glutaredoxin-related protein  67.35 
 
 
102 aa  143  1e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0678  glutaredoxin-related protein  67.35 
 
 
102 aa  143  1e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3605  glutaredoxin-like protein  67.35 
 
 
102 aa  143  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0974  glutaredoxin-related protein  67.35 
 
 
102 aa  143  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.104778  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1945  glutaredoxin-related protein  67.35 
 
 
102 aa  143  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.980346  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3592  putative glutaredoxin  67.35 
 
 
102 aa  143  1e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.703507  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1418  glutaredoxin-like protein  59.41 
 
 
107 aa  142  2e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.448786  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5478  glutaredoxin-like protein  65.71 
 
 
107 aa  141  3e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2890  glutaredoxin-like protein  65.31 
 
 
103 aa  141  4e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.441106 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2932  glutaredoxin-related protein  66.33 
 
 
102 aa  140  4e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0434  glutaredoxin-like protein  68.04 
 
 
103 aa  140  4e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0591  glutaredoxin-like protein  57.14 
 
 
107 aa  140  5e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0577  glutaredoxin-like protein  69.07 
 
 
103 aa  140  6e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.220445 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3524  glutaredoxin-like protein  68.04 
 
 
103 aa  139  9e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00765276  normal  0.116899 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0412  glutaredoxin-like protein  65.31 
 
 
103 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.738354  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10761  glutaredoxin-like protein  54.46 
 
 
107 aa  138  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.431003 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4728  glutaredoxin-like protein  59 
 
 
107 aa  139  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0939613  normal  0.188207 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2149  glutaredoxin-like protein  62.75 
 
 
111 aa  138  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.907449 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0438  glutaredoxin-like protein  65.31 
 
 
103 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.315589 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9035  predicted protein  60.61 
 
 
117 aa  139  1.9999999999999998e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.958741  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0146  glutaredoxin-like protein  62.24 
 
 
102 aa  137  3.9999999999999997e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0057357  normal  0.16903 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12171  glutaredoxin-like protein  59.18 
 
 
107 aa  137  3.9999999999999997e-32  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.537864  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0639  glutaredoxin-like protein  54.46 
 
 
107 aa  136  7e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14711  glutaredoxin-like protein  54.46 
 
 
107 aa  136  7e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.211551  normal  0.903864 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12181  glutaredoxin-like protein  59.18 
 
 
107 aa  136  7.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0134  glutaredoxin-like protein  62 
 
 
102 aa  136  8.999999999999999e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00271929  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12021  glutaredoxin-like protein  60 
 
 
107 aa  136  8.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4208  glutaredoxin-like protein  61.61 
 
 
110 aa  135  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3595  glutaredoxin-like protein  64.29 
 
 
103 aa  136  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.826772 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1122  glutaredoxin-like protein  57.14 
 
 
107 aa  135  1e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.160765  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1276  glutaredoxin-like protein  62.86 
 
 
108 aa  136  1e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0848  glutaredoxin-like protein  64.42 
 
 
109 aa  135  1e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.609526  normal  0.565462 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0480  glutaredoxin-like protein  63.27 
 
 
103 aa  135  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.810756  normal  0.505328 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2904  hypothetical protein  63.64 
 
 
103 aa  135  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0508  glutaredoxin-like protein  63.27 
 
 
103 aa  135  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.10469  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2784  glutaredoxin-like protein  57 
 
 
107 aa  135  2e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2597  glutaredoxin-like protein  63.27 
 
 
103 aa  135  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.583628  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1939  glutaredoxin-like protein  60.78 
 
 
111 aa  134  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0358021  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2723  glutaredoxin-like protein  62.24 
 
 
103 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3377  glutaredoxin-like protein  56 
 
 
107 aa  134  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2734  glutaredoxin-like protein  56 
 
 
107 aa  134  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.546465  hitchhiker  0.0000029189 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0849  glutaredoxin-like protein  62.86 
 
 
109 aa  133  7.000000000000001e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.539719  normal  0.527344 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0778  glutaredoxin-like protein  62.86 
 
 
109 aa  133  7.000000000000001e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.228725  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2667  glutaredoxin-like protein  59.38 
 
 
115 aa  133  8e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.144494  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1710  putative monothiol glutaredoxin  62.14 
 
 
120 aa  133  9e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0700819 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3150  glutaredoxin-like protein  62.63 
 
 
103 aa  133  9e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0389298  normal  0.0157235 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0729  glutaredoxin-like protein  59.22 
 
 
111 aa  132  9.999999999999999e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2801  glutaredoxin-like protein  61.62 
 
 
103 aa  132  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.420164 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3047  glutaredoxin-like protein  61.9 
 
 
103 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.994053  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1936  glutaredoxin-related protein  58.82 
 
 
111 aa  131  1.9999999999999998e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1556  glutaredoxin-like protein  61.9 
 
 
105 aa  131  3e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00461361 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3683  glutaredoxin-like protein  58.49 
 
 
106 aa  131  3e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0773  glutaredoxin-like protein  63.21 
 
 
109 aa  131  3e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.045295 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2391  glutaredoxin-like protein  61.76 
 
 
110 aa  131  3.9999999999999996e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.593827  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1145  glutaredoxin-like protein  52.43 
 
 
108 aa  131  3.9999999999999996e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0705  glutaredoxin-like protein  57.94 
 
 
109 aa  130  6e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1508  glutaredoxin-like protein  61.05 
 
 
111 aa  130  6.999999999999999e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.454801 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3370  glutaredoxin-like protein  57 
 
 
308 aa  130  7.999999999999999e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.616165 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02424  putative glutaredoxin-like protein, putative  57 
 
 
308 aa  130  7.999999999999999e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0011  glutaredoxin-like protein  57.84 
 
 
112 aa  130  7.999999999999999e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2078  glutaredoxin-related protein  58.33 
 
 
110 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0835  glutaredoxin-related protein  60.78 
 
 
130 aa  129  1.0000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3204  glutaredoxin-like protein  62.14 
 
 
117 aa  129  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0827  glutaredoxin-related protein  60.78 
 
 
130 aa  129  1.0000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3466  glutaredoxin-like protein  62.37 
 
 
113 aa  128  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.147483  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0187  glutaredoxin-like protein  52.94 
 
 
111 aa  129  2.0000000000000002e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.381703  normal  0.468757 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0007  glutaredoxin-like protein  58.76 
 
 
112 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0681902 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2584  glutaredoxin-like protein  56.76 
 
 
112 aa  129  2.0000000000000002e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.442279  normal  0.361888 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1273  glutaredoxin-like protein  57.84 
 
 
111 aa  128  3e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.909876  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1496  glutaredoxin-like protein  58 
 
 
308 aa  127  5.0000000000000004e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.353854  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0520  hypothetical protein  61.86 
 
 
110 aa  127  5.0000000000000004e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0968275 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1556  glutaredoxin-like protein  58 
 
 
308 aa  127  5.0000000000000004e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5883  putative glutaredoxin family protein  59.18 
 
 
109 aa  127  6e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0738843  normal  0.762824 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1426  glutaredoxin-like protein  63.92 
 
 
109 aa  126  8.000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.495839  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1021  glutaredoxin-like protein  64.44 
 
 
110 aa  126  9.000000000000001e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0681267  normal  0.445361 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3886  glutaredoxin-like protein  58 
 
 
308 aa  126  1.0000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5393  putative glutaredoxin family protein  57 
 
 
112 aa  125  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0595  glutaredoxin-like protein  58.16 
 
 
109 aa  126  1.0000000000000001e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0120135  hitchhiker  6.40079e-17 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2639  glutaredoxin-like protein  54.81 
 
 
106 aa  125  2.0000000000000002e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.49425  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1599  glutaredoxin-like protein  60.22 
 
 
123 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.283027  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0677  glutaredoxin-like protein  57.14 
 
 
111 aa  125  2.0000000000000002e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.835173  normal  0.0315958 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3038  glutaredoxin-related protein  58.16 
 
 
110 aa  124  3e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2647  glutaredoxin-like protein  58.16 
 
 
110 aa  124  3e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1598  glutaredoxin-like protein  57.14 
 
 
121 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0834574 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2953  glutaredoxin-related protein  57.14 
 
 
121 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1116  glutaredoxin-like protein  57.28 
 
 
120 aa  124  4.0000000000000003e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0123  glutaredoxin-like protein  58.51 
 
 
110 aa  124  5e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.826994 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3704  glutaredoxin-like protein  59.14 
 
 
127 aa  124  5e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.473777  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0892  glutaredoxin-like protein  57.14 
 
 
121 aa  124  6e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.137957 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_8492  predicted protein  54.63 
 
 
123 aa  123  7e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00589447  normal  0.207924 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0012  glutaredoxin-like protein  52.25 
 
 
111 aa  123  7e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1796  glutaredoxin-like protein  60.22 
 
 
108 aa  123  8.000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.565897  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4088  glutaredoxin-like protein  56.38 
 
 
128 aa  122  1e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>