More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3370 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_3370  glutaredoxin-like protein  100 
 
 
308 aa  622  1e-177  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.616165 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02424  putative glutaredoxin-like protein, putative  80.52 
 
 
308 aa  520  1e-146  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1496  glutaredoxin-like protein  75.32 
 
 
308 aa  478  1e-134  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.353854  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1556  glutaredoxin-like protein  75.32 
 
 
308 aa  478  1e-134  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3886  glutaredoxin-like protein  46.62 
 
 
308 aa  257  2e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2519  glutaredoxin-like protein  62.5 
 
 
109 aa  133  3e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.134397  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1710  putative monothiol glutaredoxin  59.57 
 
 
120 aa  130  4.0000000000000003e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0700819 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0357  glutaredoxin-like protein  57 
 
 
110 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.66028 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4396  glutaredoxin-like protein  53.33 
 
 
114 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.308725 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1116  glutaredoxin-like protein  56.25 
 
 
120 aa  125  7e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4728  glutaredoxin-like protein  50.96 
 
 
107 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0939613  normal  0.188207 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2316  glutaredoxin-like protein  53.27 
 
 
129 aa  123  4e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.102324  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0729  glutaredoxin-like protein  55 
 
 
111 aa  122  7e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_37615  glutaredoxin  59.14 
 
 
149 aa  122  9e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0639  glutaredoxin-like protein  51.92 
 
 
107 aa  122  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1936  glutaredoxin-related protein  59.14 
 
 
111 aa  121  9.999999999999999e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14711  glutaredoxin-like protein  51.92 
 
 
107 aa  122  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.211551  normal  0.903864 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1145  glutaredoxin-like protein  50 
 
 
108 aa  121  9.999999999999999e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2784  glutaredoxin-like protein  49.04 
 
 
107 aa  121  9.999999999999999e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1124  glutaredoxin-like protein  57.73 
 
 
112 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10761  glutaredoxin-like protein  50.96 
 
 
107 aa  121  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.431003 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0508  glutaredoxin-like protein  55 
 
 
103 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.10469  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1661  glutaredoxin-like protein  50.96 
 
 
107 aa  120  1.9999999999999998e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.147009  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2171  glutaredoxin-like protein  54.17 
 
 
119 aa  121  1.9999999999999998e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.95609  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0480  glutaredoxin-like protein  55 
 
 
103 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.810756  normal  0.505328 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2597  glutaredoxin-like protein  55 
 
 
103 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.583628  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09521  glutaredoxin-like protein  49.04 
 
 
107 aa  120  3e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.221598 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3595  glutaredoxin-like protein  54 
 
 
103 aa  120  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.826772 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0591  glutaredoxin-like protein  51.55 
 
 
107 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0438  glutaredoxin-like protein  55 
 
 
103 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.315589 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0412  glutaredoxin-like protein  55 
 
 
103 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.738354  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2460  glutaredoxin-like protein  53.47 
 
 
109 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1392  glutaredoxin-like protein  53.54 
 
 
120 aa  119  7e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.394027  normal  0.177187 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2932  glutaredoxin-related protein  56.7 
 
 
102 aa  119  7e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4712  glutaredoxin-like protein  55.67 
 
 
109 aa  119  7e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.729225  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0778  glutaredoxin-like protein  55.45 
 
 
109 aa  119  7.999999999999999e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.228725  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0849  glutaredoxin-like protein  55.45 
 
 
109 aa  119  7.999999999999999e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.539719  normal  0.527344 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2734  glutaredoxin-like protein  49.04 
 
 
107 aa  119  9e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.546465  hitchhiker  0.0000029189 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3377  glutaredoxin-like protein  49.04 
 
 
107 aa  119  9e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5478  glutaredoxin-like protein  53.54 
 
 
107 aa  118  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0349  glutaredoxin-like protein  52.48 
 
 
109 aa  118  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.508433 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0705  glutaredoxin-like protein  54.08 
 
 
109 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_5638  predicted protein  53.19 
 
 
304 aa  118  9.999999999999999e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.85631  normal  0.0243125 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2890  glutaredoxin-like protein  54 
 
 
103 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.441106 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0974  glutaredoxin-related protein  55.67 
 
 
102 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.104778  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0502  glutaredoxin-related protein  55.67 
 
 
102 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0678  glutaredoxin-related protein  55.67 
 
 
102 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5883  putative glutaredoxin family protein  54.9 
 
 
109 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0738843  normal  0.762824 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3605  glutaredoxin-like protein  55.67 
 
 
102 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1945  glutaredoxin-related protein  55.67 
 
 
102 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.980346  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3616  putative glutaredoxin  55.67 
 
 
102 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3592  putative glutaredoxin  55.67 
 
 
102 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.703507  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0595  glutaredoxin-like protein  51.49 
 
 
109 aa  118  1.9999999999999998e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0120135  hitchhiker  6.40079e-17 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2953  glutaredoxin-related protein  49.5 
 
 
121 aa  117  3e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1418  glutaredoxin-like protein  50 
 
 
107 aa  117  3e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.448786  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3117  glutaredoxin-like protein  49.54 
 
 
113 aa  117  3e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.736059 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0007  glutaredoxin-like protein  55.67 
 
 
112 aa  117  3e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0681902 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1598  glutaredoxin-like protein  49.5 
 
 
121 aa  117  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0834574 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1242  glutaredoxin-related protein  50.98 
 
 
116 aa  116  3.9999999999999997e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.828915 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1939  glutaredoxin-like protein  56.12 
 
 
111 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0358021  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1150  glutaredoxin-like protein  50.98 
 
 
116 aa  116  3.9999999999999997e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_8492  predicted protein  56.99 
 
 
123 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00589447  normal  0.207924 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0123  glutaredoxin-like protein  55.88 
 
 
110 aa  116  5e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.826994 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0011  glutaredoxin-like protein  53.61 
 
 
112 aa  116  5e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0848  glutaredoxin-like protein  52.38 
 
 
109 aa  116  5e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.609526  normal  0.565462 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0259  glutaredoxin-related protein  58.59 
 
 
110 aa  116  6e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12171  glutaredoxin-like protein  52.58 
 
 
107 aa  116  6e-25  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.537864  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2427  glutaredoxin-like protein  50 
 
 
110 aa  115  6e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.17903  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1122  glutaredoxin-like protein  51.55 
 
 
107 aa  116  6e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.160765  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2149  glutaredoxin-like protein  59.55 
 
 
111 aa  116  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.907449 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1276  glutaredoxin-like protein  52.43 
 
 
108 aa  116  6e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0434  glutaredoxin-like protein  53 
 
 
103 aa  116  6e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2723  glutaredoxin-like protein  53 
 
 
103 aa  116  6e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0892  glutaredoxin-like protein  49.5 
 
 
121 aa  116  6e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.137957 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4088  glutaredoxin-like protein  52.78 
 
 
128 aa  116  6e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3683  glutaredoxin-like protein  56.31 
 
 
106 aa  115  6.9999999999999995e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0677  glutaredoxin-like protein  45.87 
 
 
111 aa  115  7.999999999999999e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.835173  normal  0.0315958 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3524  glutaredoxin-like protein  53 
 
 
103 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00765276  normal  0.116899 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_27972  predicted protein  49.49 
 
 
338 aa  115  8.999999999999998e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12181  glutaredoxin-like protein  52.58 
 
 
107 aa  115  8.999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2667  glutaredoxin-like protein  54 
 
 
115 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.144494  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9035  predicted protein  48.08 
 
 
117 aa  114  2.0000000000000002e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.958741  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4208  glutaredoxin-like protein  54 
 
 
110 aa  114  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1556  glutaredoxin-like protein  52 
 
 
105 aa  114  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00461361 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2438  glutaredoxin-related protein  49.51 
 
 
110 aa  114  2.0000000000000002e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000187955  normal  0.0679264 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0520  hypothetical protein  53.92 
 
 
110 aa  113  3e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0968275 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0773  glutaredoxin-like protein  53.33 
 
 
109 aa  113  3e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.045295 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1186  glutaredoxin-like protein  50.93 
 
 
112 aa  114  3e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.242969 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1641  glutaredoxin-like protein  53.06 
 
 
113 aa  114  3e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1396  glutaredoxin-like protein  46.53 
 
 
109 aa  113  3e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.420177  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1508  glutaredoxin-like protein  55.91 
 
 
111 aa  113  5e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.454801 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3038  glutaredoxin-like protein  49.47 
 
 
115 aa  113  5e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2896  glutaredoxin-like protein  49.47 
 
 
115 aa  113  5e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1312  glutaredoxin-like protein  52.04 
 
 
112 aa  113  5e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3466  glutaredoxin-like protein  56.99 
 
 
113 aa  112  6e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.147483  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1610  glutaredoxin-like protein  52.53 
 
 
135 aa  112  7.000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.542573  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2499  glutaredoxin-like protein  53.68 
 
 
106 aa  112  7.000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2801  glutaredoxin-like protein  54.64 
 
 
103 aa  112  7.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.420164 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12021  glutaredoxin-like protein  53.26 
 
 
107 aa  112  7.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0134  glutaredoxin-like protein  54.64 
 
 
102 aa  112  8.000000000000001e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00271929  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>