254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_2499 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_2499  glutaredoxin-like protein  100 
 
 		 106 aa  221  2e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1426  glutaredoxin-like protein  69.7 
 
 		 109 aa  157  3e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.495839  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0245  glutaredoxin-like protein  69.7 
 
 		 105 aa  156  9e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.254771  normal  0.100624 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2639  glutaredoxin-like protein  62.63 
 
 		 106 aa  140  4e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.49425  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3038  glutaredoxin-related protein  61 
 
 		 110 aa  140  5e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2647  glutaredoxin-like protein  61 
 
 		 110 aa  140  5e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18650  hypothetical protein  63.11 
 
 		 108 aa  140  6e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0667348 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1614  hypothetical protein  63.11 
 
 		 108 aa  140  6e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3683  glutaredoxin-like protein  64.58 
 
 		 106 aa  139  9e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3339  glutaredoxin-like protein  60.19 
 
 		 108 aa  138  3e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0384172  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0577  glutaredoxin-like protein  63 
 
 		 103 aa  137  3e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.220445 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2078  glutaredoxin-related protein  57.55 
 
 		 110 aa  137  3.9999999999999997e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3038  glutaredoxin-like protein  59.22 
 
 		 115 aa  137  6e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2896  glutaredoxin-like protein  59.22 
 
 		 115 aa  137  6e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0434  glutaredoxin-like protein  59.22 
 
 		 103 aa  137  6e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1945  glutaredoxin-related protein  62 
 
 		 102 aa  137  7e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.980346  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0502  glutaredoxin-related protein  62 
 
 		 102 aa  137  7e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0974  glutaredoxin-related protein  62 
 
 		 102 aa  137  7e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.104778  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3616  putative glutaredoxin  62 
 
 		 102 aa  137  7e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3605  glutaredoxin-like protein  62 
 
 		 102 aa  137  7e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0480  glutaredoxin-like protein  61.17 
 
 		 103 aa  137  7e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.810756  normal  0.505328 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2932  glutaredoxin-related protein  62 
 
 		 102 aa  137  7e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3592  putative glutaredoxin  62 
 
 		 102 aa  137  7e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.703507  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2597  glutaredoxin-like protein  61.17 
 
 		 103 aa  137  7e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.583628  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0508  glutaredoxin-like protein  61.17 
 
 		 103 aa  137  7e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.10469  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0678  glutaredoxin-related protein  62 
 
 		 102 aa  137  7e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1149  glutaredoxin-like protein  62.14 
 
 		 112 aa  136  8.999999999999999e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0438  glutaredoxin-like protein  60.19 
 
 		 103 aa  136  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.315589 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3595  glutaredoxin-like protein  61.17 
 
 		 103 aa  136  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.826772 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0349  glutaredoxin-like protein  56.19 
 
 		 109 aa  135  1e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.508433 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2890  glutaredoxin-like protein  61.17 
 
 		 103 aa  136  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.441106 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0412  glutaredoxin-like protein  60.19 
 
 		 103 aa  136  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.738354  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2460  glutaredoxin-like protein  56.31 
 
 		 109 aa  135  1e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1081  glutaredoxin-related protein  58.82 
 
 		 111 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.581257  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14040  Glutaredoxin4 protein  59.22 
 
 		 108 aa  135  3.0000000000000003e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1631  hypothetical protein  58.25 
 
 		 110 aa  134  5e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000352705  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4331  glutaredoxin-like protein  60 
 
 		 111 aa  134  5e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.488621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03013  hypothetical protein  58.25 
 
 		 116 aa  133  8e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3524  glutaredoxin-like protein  57.28 
 
 		 103 aa  133  8e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00765276  normal  0.116899 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002935  glutaredoxin-related protein  57.28 
 
 		 116 aa  133  8e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000192998  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0848  glutaredoxin-like protein  62.63 
 
 		 109 aa  133  8e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.609526  normal  0.565462 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2569  hypothetical protein  57.84 
 
 		 116 aa  133  9e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0109727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1866  hypothetical protein  57.84 
 
 		 116 aa  133  9e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.252998  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1758  hypothetical protein  57.84 
 
 		 116 aa  133  9e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000225662  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2904  hypothetical protein  62.63 
 
 		 103 aa  133  9.999999999999999e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1122  glutaredoxin-like protein  60 
 
 		 152 aa  132  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.636525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3898  glutaredoxin-like protein  57.55 
 
 		 108 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.713119 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2723  glutaredoxin-like protein  56.31 
 
 		 103 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1110  glutaredoxin-like protein  56.86 
 
 		 111 aa  131  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0520  hypothetical protein  61.46 
 
 		 110 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0968275 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4524  glutaredoxin-like protein  58.82 
 
 		 113 aa  131  3e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.532221  normal  0.0568785 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2129  glutaredoxin-like protein  55.24 
 
 		 112 aa  130  3.9999999999999996e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.883675  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1686  glutaredoxin-like protein  57.43 
 
 		 114 aa  130  5e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4161  glutaredoxin-related protein  56.6 
 
 		 108 aa  130  9e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3150  glutaredoxin-like protein  61.62 
 
 		 103 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0389298  normal  0.0157235 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0596  glutaredoxin-like protein  60.19 
 
 		 115 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.097988  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1276  glutaredoxin-like protein  61.86 
 
 		 108 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5478  glutaredoxin-like protein  61.86 
 
 		 107 aa  129  1.0000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3047  glutaredoxin-like protein  62.5 
 
 		 103 aa  128  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.994053  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2427  glutaredoxin-like protein  53.92 
 
 		 110 aa  128  2.0000000000000002e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.17903  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1718  hypothetical protein  55.88 
 
 		 116 aa  128  2.0000000000000002e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000856261  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2801  glutaredoxin-like protein  60.61 
 
 		 103 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.420164 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1034  glutaredoxin-like protein  57.84 
 
 		 108 aa  128  2.0000000000000002e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000907202  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2198  hypothetical protein  54.9 
 
 		 115 aa  129  2.0000000000000002e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.390421  hitchhiker  0.00000502867 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0354  glutaredoxin-like protein  57.58 
 
 		 109 aa  129  2.0000000000000002e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0757306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0773  glutaredoxin-like protein  60.61 
 
 		 109 aa  129  2.0000000000000002e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.045295 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1793  hypothetical protein  55.45 
 
 		 115 aa  128  3e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.169606  normal  0.0260358 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0146  glutaredoxin-like protein  58.33 
 
 		 102 aa  127  4.0000000000000003e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0057357  normal  0.16903 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1529  hypothetical protein  55.45 
 
 		 115 aa  127  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1603  hypothetical protein  55.45 
 
 		 115 aa  127  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1741  hypothetical protein  55.45 
 
 		 115 aa  127  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000591153  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1543  hypothetical protein  55.45 
 
 		 115 aa  127  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.416029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1910  hypothetical protein  55.45 
 
 		 115 aa  127  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01624  hypothetical protein  55.45 
 
 		 115 aa  127  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.521708  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1986  glutaredoxin-like protein  55.45 
 
 		 115 aa  127  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.235572  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1850  hypothetical protein  55.45 
 
 		 115 aa  127  5.0000000000000004e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000478311  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1866  hypothetical protein  55.45 
 
 		 115 aa  127  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000387905  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2366  hypothetical protein  55.45 
 
 		 115 aa  127  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00389248  normal  0.442313 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1975  hypothetical protein  55.45 
 
 		 115 aa  127  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0010307 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1544  hypothetical protein  55.45 
 
 		 115 aa  127  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.310031 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1859  putative glutaredoxin  54.37 
 
 		 111 aa  127  5.0000000000000004e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01614  hypothetical protein  55.45 
 
 		 115 aa  127  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.562952  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1732  hypothetical protein  55.45 
 
 		 115 aa  127  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.358242  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02749  putative glutaredoxin like protein  56 
 
 		 116 aa  127  6e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0778  glutaredoxin-like protein  57.28 
 
 		 109 aa  126  1.0000000000000001e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.228725  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0963  glutaredoxin-like protein  58 
 
 		 111 aa  126  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000957456 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3204  glutaredoxin-like protein  61.46 
 
 		 117 aa  126  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0849  glutaredoxin-like protein  57.28 
 
 		 109 aa  126  1.0000000000000001e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.539719  normal  0.527344 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2519  glutaredoxin-like protein  54.9 
 
 		 109 aa  125  2.0000000000000002e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.134397  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0134  glutaredoxin-like protein  58.33 
 
 		 102 aa  125  3e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00271929  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01315  putative glutaredoxin-like protein  52.43 
 
 		 106 aa  124  3e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.359363  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2449  glutaredoxin-like protein  50.94 
 
 		 112 aa  125  3e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.182264  normal  0.0446478 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3388  glutaredoxin-like protein  55 
 
 		 109 aa  124  4.0000000000000003e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.459255  normal  0.239887 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1936  glutaredoxin-related protein  59 
 
 		 111 aa  123  6e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1820  glutaredoxin-like protein  51.46 
 
 		 110 aa  123  7e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000369012  normal  0.269643 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2438  glutaredoxin-related protein  49.51 
 
 		 110 aa  123  8.000000000000001e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000187955  normal  0.0679264 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2149  glutaredoxin-like protein  57 
 
 		 111 aa  123  9e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.907449 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3475  glutaredoxin,-like protein  54 
 
 		 116 aa  123  1e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1964  glutaredoxin-like protein  52.43 
 
 		 113 aa  122  1e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0459539  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1835  glutaredoxin-like protein  53.54 
 
 		 116 aa  122  1e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000570749  normal  0.937939 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>