290 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2438 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2438  glutaredoxin-related protein  100 
 
 		 110 aa  228  2e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000187955  normal  0.0679264 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14040  Glutaredoxin4 protein  75 
 
 		 108 aa  179  2e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1614  hypothetical protein  73.15 
 
 		 108 aa  175  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18650  hypothetical protein  73.15 
 
 		 108 aa  175  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0667348 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1110  glutaredoxin-like protein  77.27 
 
 		 111 aa  174  3e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3339  glutaredoxin-like protein  72.22 
 
 		 108 aa  174  5e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0384172  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1081  glutaredoxin-related protein  76.36 
 
 		 111 aa  174  5e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.581257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3898  glutaredoxin-like protein  74.07 
 
 		 108 aa  173  7e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.713119 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4161  glutaredoxin-related protein  74.07 
 
 		 108 aa  173  9e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1122  glutaredoxin-like protein  78.79 
 
 		 152 aa  172  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.636525  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4331  glutaredoxin-like protein  78.79 
 
 		 111 aa  172  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.488621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2129  glutaredoxin-like protein  74.07 
 
 		 112 aa  172  9.999999999999999e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.883675  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002935  glutaredoxin-related protein  70.09 
 
 		 116 aa  170  5e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000192998  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4524  glutaredoxin-like protein  76.77 
 
 		 113 aa  170  6.999999999999999e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.532221  normal  0.0568785 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03013  hypothetical protein  67.59 
 
 		 116 aa  167  3e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2449  glutaredoxin-like protein  65.45 
 
 		 112 aa  165  2e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.182264  normal  0.0446478 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01624  hypothetical protein  68.22 
 
 		 115 aa  164  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.521708  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1986  glutaredoxin-like protein  68.22 
 
 		 115 aa  164  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.235572  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1850  hypothetical protein  68.22 
 
 		 115 aa  164  2.9999999999999998e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000478311  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01614  hypothetical protein  68.22 
 
 		 115 aa  164  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.562952  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1732  hypothetical protein  68.22 
 
 		 115 aa  164  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.358242  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1866  hypothetical protein  68.22 
 
 		 115 aa  164  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000387905  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1975  hypothetical protein  68.22 
 
 		 115 aa  164  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0010307 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2366  hypothetical protein  68.22 
 
 		 115 aa  164  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00389248  normal  0.442313 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1544  hypothetical protein  68.22 
 
 		 115 aa  164  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.310031 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1603  hypothetical protein  68.22 
 
 		 115 aa  164  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1910  hypothetical protein  68.22 
 
 		 115 aa  164  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1686  glutaredoxin-like protein  66.36 
 
 		 114 aa  164  4e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1529  hypothetical protein  68.22 
 
 		 115 aa  164  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1543  hypothetical protein  68.22 
 
 		 115 aa  164  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.416029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1741  hypothetical protein  68.22 
 
 		 115 aa  164  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000591153  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2386  hypothetical protein  67.29 
 
 		 116 aa  163  5.9999999999999996e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0290699  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1859  putative glutaredoxin  69.52 
 
 		 111 aa  163  6.9999999999999995e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1758  hypothetical protein  65.45 
 
 		 116 aa  163  8e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000225662  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2569  hypothetical protein  65.45 
 
 		 116 aa  163  8e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0109727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1866  hypothetical protein  65.45 
 
 		 116 aa  163  8e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.252998  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1718  hypothetical protein  66.36 
 
 		 116 aa  162  1.0000000000000001e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000856261  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1793  hypothetical protein  66.36 
 
 		 115 aa  162  1.0000000000000001e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.169606  normal  0.0260358 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3388  glutaredoxin-like protein  69.16 
 
 		 109 aa  162  1.0000000000000001e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.459255  normal  0.239887 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02749  putative glutaredoxin like protein  68.22 
 
 		 116 aa  162  1.0000000000000001e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2198  hypothetical protein  68.22 
 
 		 115 aa  161  3e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.390421  hitchhiker  0.00000502867 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2670  hypothetical protein  67.29 
 
 		 116 aa  161  3e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0262215  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3475  glutaredoxin,-like protein  69.7 
 
 		 116 aa  160  4.0000000000000004e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1396  glutaredoxin-like protein  65.71 
 
 		 109 aa  160  4.0000000000000004e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.420177  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1631  hypothetical protein  61.82 
 
 		 110 aa  159  1e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000352705  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1640  glutaredoxin-like protein  61.82 
 
 		 110 aa  159  1e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000581694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1573  glutaredoxin-like protein  61.82 
 
 		 110 aa  159  1e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000259728  normal  0.0657649 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1648  glutaredoxin-like protein  61.82 
 
 		 110 aa  159  1e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00000432966  hitchhiker  0.000256673 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2880  glutaredoxin domain-containing protein  61.82 
 
 		 110 aa  157  3e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1688  glutaredoxin-like protein  61.82 
 
 		 110 aa  158  3e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000000296306  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1820  glutaredoxin-like protein  62.73 
 
 		 110 aa  158  3e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000369012  normal  0.269643 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1748  glutaredoxin-like protein  62.83 
 
 		 113 aa  158  3e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000000425193  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1776  glutaredoxin-like protein  61.82 
 
 		 110 aa  157  4e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000000936402  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2502  glutaredoxin-like protein  61.82 
 
 		 110 aa  157  4e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000230073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1783  glutaredoxin-like protein  61.82 
 
 		 110 aa  157  4e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000151147  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1640  glutaredoxin-like protein  63.81 
 
 		 111 aa  156  1e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000518322  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2316  glutaredoxin-like protein  62.96 
 
 		 129 aa  155  2e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.102324  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2427  glutaredoxin-like protein  61.9 
 
 		 110 aa  154  5.0000000000000005e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.17903  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1919  glutaredoxin-related protein  60.91 
 
 		 110 aa  154  5.0000000000000005e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00265167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1835  glutaredoxin-like protein  62.5 
 
 		 116 aa  150  8e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000570749  normal  0.937939 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1964  glutaredoxin-like protein  60.95 
 
 		 113 aa  149  2e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0459539  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1242  glutaredoxin-related protein  62.14 
 
 		 116 aa  147  3e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.828915 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2160  glutaredoxin-like protein  57.8 
 
 		 116 aa  148  3e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.277546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1150  glutaredoxin-like protein  62.14 
 
 		 116 aa  147  3e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2444  glutaredoxin-like protein  57.8 
 
 		 115 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.72039  normal  0.0565869 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3038  glutaredoxin-like protein  63.46 
 
 		 115 aa  146  1.0000000000000001e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2896  glutaredoxin-like protein  63.46 
 
 		 115 aa  146  1.0000000000000001e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0963  glutaredoxin-like protein  61.17 
 
 		 111 aa  146  1.0000000000000001e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000957456 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1034  glutaredoxin-like protein  58.1 
 
 		 108 aa  142  2e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000907202  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0595  glutaredoxin-like protein  59.41 
 
 		 109 aa  142  2e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0120135  hitchhiker  6.40079e-17 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2460  glutaredoxin-like protein  50.46 
 
 		 109 aa  139  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0349  glutaredoxin-like protein  49.54 
 
 		 109 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.508433 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0729  glutaredoxin-like protein  55.45 
 
 		 111 aa  135  1e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1149  glutaredoxin-like protein  47.27 
 
 		 112 aa  135  2e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2078  glutaredoxin-related protein  50 
 
 		 110 aa  130  7.999999999999999e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0086  glutaredoxin-related protein  51.43 
 
 		 119 aa  129  1.0000000000000001e-29  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0938468  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51060  glutaredoxin-related protein  54.81 
 
 		 109 aa  125  1.0000000000000001e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0783867  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2225  monothiol glutaredoxin  49.51 
 
 		 104 aa  125  2.0000000000000002e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2499  glutaredoxin-like protein  49.51 
 
 		 106 aa  123  8.000000000000001e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1374  glutaredoxin-like protein  48.08 
 
 		 106 aa  123  9e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.431306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01315  putative glutaredoxin-like protein  48.54 
 
 		 106 aa  122  1e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.359363  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2134  glutaredoxin-like protein  48.54 
 
 		 104 aa  122  2e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.681937  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0596  glutaredoxin-like protein  46.79 
 
 		 115 aa  120  5e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.097988  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2639  glutaredoxin-like protein  51.4 
 
 		 106 aa  120  7e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.49425  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0259  glutaredoxin-related protein  54.46 
 
 		 110 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_37615  glutaredoxin  51.04 
 
 		 149 aa  118  1.9999999999999998e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0354  glutaredoxin-like protein  48.08 
 
 		 109 aa  114  3e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0757306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1426  glutaredoxin-like protein  47.12 
 
 		 109 aa  114  3.9999999999999997e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.495839  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1496  glutaredoxin-like protein  46.94 
 
 		 308 aa  114  5e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.353854  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1556  glutaredoxin-like protein  46.94 
 
 		 308 aa  114  5e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3370  glutaredoxin-like protein  49.51 
 
 		 308 aa  114  5e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.616165 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0245  glutaredoxin-like protein  48.54 
 
 		 105 aa  113  8.999999999999998e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.254771  normal  0.100624 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2647  glutaredoxin-like protein  47.52 
 
 		 110 aa  112  1.0000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3038  glutaredoxin-related protein  47.52 
 
 		 110 aa  112  1.0000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2723  glutaredoxin-like protein  46.6 
 
 		 103 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1610  glutaredoxin-like protein  51.58 
 
 		 135 aa  111  4.0000000000000004e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.542573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0438  glutaredoxin-like protein  45.63 
 
 		 103 aa  110  5e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.315589 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0412  glutaredoxin-like protein  45.63 
 
 		 103 aa  110  5e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.738354  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3616  putative glutaredoxin  45.1 
 
 		 102 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0508  glutaredoxin-like protein  44.66 
 
 		 103 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.10469  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>