More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1530 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1530  rhodanese-like  100 
 
 
118 aa  237  2.9999999999999997e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.251959  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02371  rhodanese-like protein  99.15 
 
 
118 aa  235  2e-61  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16081  rhodanese-like protein  60.17 
 
 
117 aa  142  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01801  rhodanese-like protein  56.78 
 
 
117 aa  136  1e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0504917  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2096  rhodanese-like protein  53.98 
 
 
117 aa  120  5e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2416  rhodanese-like protein  53.98 
 
 
118 aa  120  9e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01921  rhodanese-like protein  44.83 
 
 
116 aa  100  7e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01811  rhodanese-like protein  42.37 
 
 
116 aa  95.9  2e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.353327  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01831  rhodanese-like protein  40.87 
 
 
116 aa  91.7  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0165  rhodanese-like protein  40.17 
 
 
118 aa  90.1  8e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0119337  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0484  rhodanese-related sulfurtransferase  44.14 
 
 
107 aa  82.4  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2710  rhodanese-like protein  42.73 
 
 
107 aa  82.4  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0713  rhodanese-like protein  44.25 
 
 
120 aa  81.3  0.000000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.082726  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0750  rhodanese-like protein  38.6 
 
 
107 aa  79.3  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5122  Rhodanese domain protein  42.86 
 
 
116 aa  77.4  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.572476  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1662  rhodanese-like protein  40.91 
 
 
119 aa  77  0.00000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0528375  normal  0.0957797 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0881  rhodanese domain-containing protein  40 
 
 
107 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.691799 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1695  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  41.59 
 
 
393 aa  75.5  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.294225  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1506  rhodanese-like domain-containing protein  40 
 
 
107 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.207517  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0432  rhodanese-like protein  40 
 
 
107 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0911  rhodanese domain-containing protein  40 
 
 
107 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.174972  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2480  rhodanese domain-containing protein  39.09 
 
 
107 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1132  rhodanese domain-containing protein  39.64 
 
 
119 aa  74.3  0.0000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.237662  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3100  rhodanese domain-containing protein  39.13 
 
 
109 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0615  rhodanese-like protein  44.57 
 
 
114 aa  72.8  0.000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.442702 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1742  rhodanese-like domain-containing protein  36.94 
 
 
106 aa  72  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.112615  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1836  Rhodanese domain protein  35.96 
 
 
112 aa  72.4  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.324614  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2568  rhodanese-like domain-containing protein  39.09 
 
 
107 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0799  rhodanese domain-containing protein  40 
 
 
107 aa  72  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2045  rhodanese-like domain-containing protein  39.09 
 
 
107 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.550294  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3125  rhodanese-like domain-containing protein  39.09 
 
 
107 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4015  rhodanese-related sulfurtransferase  40.95 
 
 
107 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0179275  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3064  rhodanese domain-containing protein  39.09 
 
 
107 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0788  rhodanese domain-containing protein  40 
 
 
107 aa  72  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.677785  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2027  rhodanese domain-containing protein  35.96 
 
 
112 aa  72.4  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.168756  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3957  rhodanese domain-containing protein  36.84 
 
 
115 aa  70.9  0.000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.998099  normal  0.190366 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3925  rhodanese-like protein  34.23 
 
 
107 aa  70.5  0.000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1127  rhodanese domain-containing protein  40.62 
 
 
121 aa  70.5  0.000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2603  rhodanese-like protein  35.65 
 
 
113 aa  70.1  0.000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2247  rhodanese domain-containing protein  40.54 
 
 
107 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.256006  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3494  Rhodanese domain protein  35.83 
 
 
112 aa  69.7  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1161  Rhodanese domain protein  41.18 
 
 
115 aa  70.1  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0902  Rhodanese domain protein  43.48 
 
 
119 aa  68.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0876  Rhodanese domain protein  43.48 
 
 
119 aa  68.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1665  rhodanese-like protein  39.58 
 
 
120 aa  68.9  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.937901 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3458  Rhodanese domain protein  35.71 
 
 
107 aa  68.9  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0959  Rhodanese domain protein  38.74 
 
 
107 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2174  rhodanese-like domain-containing protein  38.18 
 
 
107 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0428  Rhodanese domain protein  37.17 
 
 
116 aa  67.8  0.00000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000514418  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0735  rhodanese-like domain-containing protein  38.18 
 
 
107 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2282  rhodanese/sulfurtransferase-like protein  37.29 
 
 
109 aa  67  0.00000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.595015  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1496  glutaredoxin-like protein  39.56 
 
 
308 aa  67  0.00000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.353854  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1556  glutaredoxin-like protein  39.56 
 
 
308 aa  67  0.00000000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2112  rhodanese domain-containing protein  42.71 
 
 
114 aa  67  0.00000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0658185  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3463  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.4 
 
 
379 aa  66.2  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.838901  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3678  hypothetical protein  37.84 
 
 
107 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.233085 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0646  Rhodanese domain protein  33.63 
 
 
110 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.126659 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0203  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.64 
 
 
375 aa  65.9  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.357554  normal  0.334206 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2438  rhodanese domain-containing protein  38.3 
 
 
114 aa  63.5  0.0000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.517598 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0696  hypothetical protein  30.97 
 
 
110 aa  63.5  0.0000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.014224  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2817  rhodanese domain-containing protein  32.2 
 
 
116 aa  63.5  0.0000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0255311  normal  0.567823 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1757  rhodanese domain-containing protein  41.49 
 
 
134 aa  63.2  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0421554  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2697  rhodanese domain-containing protein  39.18 
 
 
107 aa  63.2  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.431269  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3531  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.51 
 
 
377 aa  62.8  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.522613  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0949  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.61 
 
 
383 aa  62  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0318  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.13 
 
 
383 aa  61.6  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.139087 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0605  Rhodanese domain protein  31.86 
 
 
110 aa  61.6  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.415478  normal  0.72873 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0723  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.13 
 
 
383 aa  62  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3722  Rhodanese domain protein  32.46 
 
 
112 aa  61.2  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3886  glutaredoxin-like protein  36.59 
 
 
308 aa  61.6  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3825  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.04 
 
 
387 aa  60.8  0.000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.380998  normal  0.141711 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1041  Rhodanese domain protein  37.84 
 
 
106 aa  60.8  0.000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1680  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.94 
 
 
395 aa  60.8  0.000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.683784  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02424  putative glutaredoxin-like protein, putative  39.56 
 
 
308 aa  60.8  0.000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  37.25 
 
 
142 aa  60.8  0.000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3370  glutaredoxin-like protein  38.46 
 
 
308 aa  60.1  0.000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.616165 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0158  hypothetical protein  38.79 
 
 
391 aa  59.7  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0492  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.18 
 
 
407 aa  59.7  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00601241 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2351  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 
111 aa  60.1  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0833  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  35.45 
 
 
390 aa  58.9  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2696  rhodanese-like protein  35.14 
 
 
105 aa  58.5  0.00000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2982  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.36 
 
 
392 aa  56.6  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1769  hypothetical protein  39.29 
 
 
423 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.549048  normal  0.774559 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1280  rhodanese-like protein  36.63 
 
 
170 aa  56.2  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.678095 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  38 
 
 
220 aa  56.6  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4247  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.82 
 
 
386 aa  56.6  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.020881  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_20318  predicted protein  35.4 
 
 
460 aa  55.8  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3760  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.27 
 
 
393 aa  55.5  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.62685  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1246  Rhodanese domain protein  37.74 
 
 
130 aa  55.8  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000851542  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1940  rhodanese-like protein  35.29 
 
 
388 aa  55.5  0.0000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.865805  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0390  rhodanese-like protein  37.5 
 
 
378 aa  55.5  0.0000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.734  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0718  UBA/THIF-type NAD/FAD-binding protein  39.29 
 
 
390 aa  55.1  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0611  rhodanese-like protein  37.86 
 
 
141 aa  54.7  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1035  Rhodanese domain protein  37.84 
 
 
106 aa  55.1  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0214  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.02 
 
 
361 aa  54.7  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1642  rhodanese domain-containing protein  40.24 
 
 
103 aa  54.7  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2139  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.21 
 
 
386 aa  54.3  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000312689  normal  0.0185629 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00900  Rhodanese-related sulfurtransferase  36.36 
 
 
118 aa  54.3  0.0000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8385  molybdopterin/thiamine biosynthesis family protein  34.69 
 
 
393 aa  53.9  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250903  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3405  rhodanese domain-containing protein  34.95 
 
 
101 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>