More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0696 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0696  hypothetical protein  100 
 
 		 110 aa  226  1e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.014224  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0605  Rhodanese domain protein  83.64 
 
 		 110 aa  191  4e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.415478  normal  0.72873 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0646  Rhodanese domain protein  81.82 
 
 		 110 aa  187  5e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.126659 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0750  rhodanese-like protein  73.64 
 
 		 107 aa  157  4e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2710  rhodanese-like protein  61.82 
 
 		 107 aa  135  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0959  Rhodanese domain protein  58.18 
 
 		 107 aa  130  5e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3678  hypothetical protein  59.09 
 
 		 107 aa  130  6e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.233085 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2247  rhodanese domain-containing protein  58.18 
 
 		 107 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.256006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3925  rhodanese-like protein  58.18 
 
 		 107 aa  125  2.0000000000000002e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2480  rhodanese domain-containing protein  55.45 
 
 		 107 aa  120  8e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0432  rhodanese-like protein  54.55 
 
 		 107 aa  120  9e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0881  rhodanese domain-containing protein  54.55 
 
 		 107 aa  120  9e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.691799 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0911  rhodanese domain-containing protein  54.55 
 
 		 107 aa  120  9e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.174972  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1506  rhodanese-like domain-containing protein  55.45 
 
 		 107 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.207517  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0799  rhodanese domain-containing protein  53.64 
 
 		 107 aa  117  7e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4015  rhodanese-related sulfurtransferase  53.64 
 
 		 107 aa  117  7e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0179275  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0788  rhodanese domain-containing protein  53.64 
 
 		 107 aa  117  7e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.677785  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3100  rhodanese domain-containing protein  53.64 
 
 		 109 aa  116  7.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3125  rhodanese-like domain-containing protein  53.64 
 
 		 107 aa  116  9e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3064  rhodanese domain-containing protein  53.64 
 
 		 107 aa  116  9e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2568  rhodanese-like domain-containing protein  53.64 
 
 		 107 aa  116  9e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2045  rhodanese-like domain-containing protein  53.64 
 
 		 107 aa  116  9e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.550294  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3458  Rhodanese domain protein  55.45 
 
 		 107 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2174  rhodanese-like domain-containing protein  52.73 
 
 		 107 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0735  rhodanese-like domain-containing protein  52.73 
 
 		 107 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1041  Rhodanese domain protein  55.45 
 
 		 106 aa  107  5e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1742  rhodanese-like domain-containing protein  52.73 
 
 		 106 aa  105  3e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.112615  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0484  rhodanese-related sulfurtransferase  50.91 
 
 		 107 aa  103  6e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2603  rhodanese-like protein  47.83 
 
 		 113 aa  100  8e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1035  Rhodanese domain protein  50.91 
 
 		 106 aa  100  8e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2696  rhodanese-like protein  53.64 
 
 		 105 aa  99.4  1e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3722  Rhodanese domain protein  49.12 
 
 		 112 aa  95.5  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1695  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  46.79 
 
 		 393 aa  93.2  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.294225  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3957  rhodanese domain-containing protein  46.15 
 
 		 115 aa  90.9  5e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.998099  normal  0.190366 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1127  rhodanese domain-containing protein  46.28 
 
 		 121 aa  90.5  8e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1665  rhodanese-like protein  45.08 
 
 		 120 aa  89.7  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.937901 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2817  rhodanese domain-containing protein  41.53 
 
 		 116 aa  87.8  5e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0255311  normal  0.567823 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3463  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  43.18 
 
 		 379 aa  85.5  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.838901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2351  rhodanese domain-containing protein  41.23 
 
 		 111 aa  85.9  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2027  rhodanese domain-containing protein  41.28 
 
 		 112 aa  84.3  5e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.168756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1836  Rhodanese domain protein  41.28 
 
 		 112 aa  84.3  5e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.324614  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2438  rhodanese domain-containing protein  47.46 
 
 		 114 aa  84  7e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.517598 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3531  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40.57 
 
 		 377 aa  83.6  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.522613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5669  rhodanese domain-containing protein  53.16 
 
 		 113 aa  79  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.192192  hitchhiker  0.00438713 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0203  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  45.05 
 
 		 375 aa  77.4  0.00000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.357554  normal  0.334206 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0318  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40.74 
 
 		 383 aa  77  0.00000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.139087 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0949  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.45 
 
 		 383 aa  76.6  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1138  rhodanese domain-containing protein  53.16 
 
 		 113 aa  75.5  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.0000773759  normal  0.329269 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0723  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.96 
 
 		 383 aa  74.7  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2282  rhodanese/sulfurtransferase-like protein  40.45 
 
 		 109 aa  73.9  0.0000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.595015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  44.05 
 
 		 145 aa  73.6  0.0000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2697  rhodanese domain-containing protein  42.05 
 
 		 107 aa  72.8  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.431269  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5422  rhodanese domain-containing protein  45.45 
 
 		 116 aa  72.8  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.500506  normal  0.598915 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0214  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  44.12 
 
 		 361 aa  72.4  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5042  rhodanese-like protein  45.45 
 
 		 116 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.982785  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5130  rhodanese domain-containing protein  45.45 
 
 		 116 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.183608  normal  0.915775 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0296  hypothetical protein  42.72 
 
 		 377 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2416  rhodanese-like protein  38.18 
 
 		 118 aa  71.2  0.000000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02700  Molybdopterin biosynthesis protein, MoeB  41.57 
 
 		 377 aa  69.3  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0941  molybdopterin biosynthesis MoeB protein  37.27 
 
 		 368 aa  69.3  0.00000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.217219  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1073  ThiF/MoeZ/MoeB domain/rhodanese-like domain-containing protein  37.27 
 
 		 368 aa  69.3  0.00000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1680  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40.86 
 
 		 395 aa  69.3  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.683784  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0615  rhodanese-like protein  37.96 
 
 		 114 aa  68.2  0.00000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.442702 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1785  Rhodanese domain protein  38.54 
 
 		 277 aa  67.8  0.00000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1246  Rhodanese domain protein  44.16 
 
 		 130 aa  67.8  0.00000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000851542  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2022  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  37.27 
 
 		 386 aa  67.8  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.236297 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3494  Rhodanese domain protein  39.25 
 
 		 112 aa  67.4  0.00000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3313  beta-lactamase domain-containing protein  48.91 
 
 		 356 aa  67  0.00000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.412228  normal  0.175146 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0743  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  39.77 
 
 		 392 aa  67  0.00000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.754392  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2112  rhodanese domain-containing protein  34.69 
 
 		 114 aa  66.6  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0658185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1937  rhodanese domain-containing protein  40.91 
 
 		 269 aa  66.6  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0286726  hitchhiker  0.00000000917613 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1215  beta-lactamase domain-containing protein  46.15 
 
 		 460 aa  66.2  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0173274 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0020  Rhodanese domain-containing protein  37.8 
 
 		 119 aa  64.7  0.0000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.529293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0166  Rhodanese domain protein  43.75 
 
 		 115 aa  64.7  0.0000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.919693 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01801  rhodanese-like protein  34.78 
 
 		 117 aa  65.1  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0504917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0667  Rhodanese domain protein  31.13 
 
 		 104 aa  64.3  0.0000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1161  Rhodanese domain protein  35.87 
 
 		 115 aa  64.3  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2891  Rhodanese domain protein  35.35 
 
 		 98 aa  63.9  0.0000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1757  rhodanese domain-containing protein  34.69 
 
 		 134 aa  63.5  0.0000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0421554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16081  rhodanese-like protein  30.65 
 
 		 117 aa  63.5  0.0000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1530  rhodanese-like  30.97 
 
 		 118 aa  63.5  0.0000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.251959  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02371  rhodanese-like protein  30.97 
 
 		 118 aa  63.5  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01120  Rhodanese-related sulfurtransferase  38.89 
 
 		 108 aa  62.8  0.000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0922  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  43.18 
 
 		 390 aa  63.5  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698196  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5022  rhodanese domain-containing protein  39.58 
 
 		 111 aa  63.2  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635764 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01811  rhodanese-like protein  30.17 
 
 		 116 aa  63.5  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.353327  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2629  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 		 216 aa  63.2  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.770931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2261  rhodanese domain-containing protein  37.08 
 
 		 279 aa  62.4  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2982  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.56 
 
 		 392 aa  62.8  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1132  rhodanese domain-containing protein  34.21 
 
 		 119 aa  62.4  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.237662  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2763  Rhodanese domain protein  32.71 
 
 		 105 aa  62  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0148242  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1543  Rhodanese domain protein  37.36 
 
 		 138 aa  62  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.973949  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0165  rhodanese-like protein  30.17 
 
 		 118 aa  61.6  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0119337  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0902  Rhodanese domain protein  36.96 
 
 		 119 aa  62  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0876  Rhodanese domain protein  36.96 
 
 		 119 aa  62  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0692  rhodanese domain-containing protein  41.84 
 
 		 149 aa  62  0.000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  31.31 
 
 		 220 aa  62  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5355  beta-lactamase domain-containing protein  45.05 
 
 		 356 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0182  Beta-lactamase-like  43.96 
 
 		 356 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.237116 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4814  beta-lactamase domain-containing protein  45.05 
 
 		 356 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.116566  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>