More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0533 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_0533  rhodanese-like protein  100 
 
 
124 aa  257  4e-68  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000000298777  normal  0.316081 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0487  Rhodanese domain protein  51.67 
 
 
134 aa  145  1.0000000000000001e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0775  Rhodanese domain protein  50.81 
 
 
124 aa  137  7e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.61343 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0154  rhodanese domain-containing protein  50.46 
 
 
113 aa  125  2.0000000000000002e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1271  rhodanese-like protein  53.64 
 
 
138 aa  123  8.000000000000001e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2024  Rhodanese domain protein  48.18 
 
 
131 aa  114  5e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0112  rhodanese domain protein  51 
 
 
104 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00002113  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0463  rhodanese domain-containing protein  47.66 
 
 
132 aa  107  6e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000512984  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2860  Rhodanese domain protein  46.79 
 
 
129 aa  106  1e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1280  rhodanese-like protein  36.54 
 
 
170 aa  82.4  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.678095 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  37.5 
 
 
220 aa  81.3  0.000000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  41.11 
 
 
145 aa  71.2  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0020  Rhodanese domain-containing protein  38.1 
 
 
119 aa  68.9  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.529293  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1937  rhodanese domain-containing protein  40.22 
 
 
269 aa  68.2  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0286726  hitchhiker  0.00000000917613 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1149  Rhodanese domain protein  35.48 
 
 
121 aa  68.2  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000462843  hitchhiker  0.00000263083 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2852  Rhodanese domain-containing protein  37.5 
 
 
113 aa  67.8  0.00000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3514  hypothetical protein  34.91 
 
 
107 aa  66.2  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.308602  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2630  Rhodanese domain protein  35.92 
 
 
112 aa  66.6  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3607  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  43.04 
 
 
387 aa  65.5  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.156981  normal  0.010154 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1183  rhodanese-like protein  35 
 
 
122 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2080  rhodanese-like protein  33.96 
 
 
108 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.218119  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2633  Rhodanese domain protein  39.53 
 
 
123 aa  65.5  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.728751  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0744  rhodanese domain-containing protein  37.25 
 
 
133 aa  65.1  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.547874 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1502  rhodanese domain-containing protein  36.63 
 
 
113 aa  65.1  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.184229  normal  0.558017 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3735  rhodanese domain-containing protein  33.65 
 
 
113 aa  64.7  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00254792 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1937  rhodanese-like protein  34.71 
 
 
120 aa  64.3  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.964453  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2629  Rhodanese domain protein  33.64 
 
 
216 aa  64.3  0.0000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.770931  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3362  rhodanese-like protein  33.02 
 
 
108 aa  63.9  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00352544 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3122  rhodanese-like protein  36.67 
 
 
127 aa  62.8  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3449  hypothetical protein  31.73 
 
 
170 aa  61.6  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0310387  normal  0.0600537 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2223  Rhodanese domain protein  38.82 
 
 
108 aa  61.6  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0573  rhodanese-like protein  31.78 
 
 
109 aa  60.8  0.000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000000000146252  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1642  rhodanese domain-containing protein  31.87 
 
 
103 aa  60.8  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0398  phage shock protein E, putative  36.67 
 
 
118 aa  60.5  0.000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3577  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  41.03 
 
 
390 aa  60.5  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.127521  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2218  rhodanese domain protein  30.97 
 
 
118 aa  60.5  0.000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.314079  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3646  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.46 
 
 
390 aa  60.1  0.000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0484  rhodanese-related sulfurtransferase  37.08 
 
 
107 aa  60.1  0.000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3931  Rhodanese domain protein  37.65 
 
 
129 aa  59.3  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0175301 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3493  UBA/THIF-type NAD/FAD binding, MoeZ/MoeB fmaily protein  38.46 
 
 
390 aa  60.1  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4224  rhodanese domain-containing protein  34.44 
 
 
125 aa  60.1  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  31.78 
 
 
142 aa  58.9  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2282  rhodanese/sulfurtransferase-like protein  32.63 
 
 
109 aa  59.3  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.595015  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1190  Rhodanese domain protein  31.5 
 
 
126 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2399  rhodanese-like protein  31.48 
 
 
138 aa  58.5  0.00000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1705  Rhodanese domain protein  30.77 
 
 
185 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000174118 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0428  Rhodanese domain protein  32.47 
 
 
116 aa  58.2  0.00000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000514418  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3913  rhodanese-like protein  33 
 
 
132 aa  58.2  0.00000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.103396  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3847  Rhodanese domain protein  34.44 
 
 
129 aa  58.2  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.323646  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1239  rhodanese-like protein  35.63 
 
 
137 aa  57.8  0.00000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.549266  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1246  Rhodanese domain protein  34.31 
 
 
130 aa  57  0.00000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000851542  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1792  rhodanese-like protein  35.16 
 
 
177 aa  56.6  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1201  rhodanese domain-containing protein  28.44 
 
 
148 aa  56.2  0.0000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.069675  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2890  SirA family protein  35.44 
 
 
189 aa  56.2  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2351  rhodanese domain-containing protein  35.71 
 
 
111 aa  55.8  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1844  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.02 
 
 
393 aa  55.5  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3678  hypothetical protein  32.56 
 
 
107 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.233085 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1499  rhodanese-like protein  34.12 
 
 
111 aa  55.5  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0210  Rhodanese domain protein  31.91 
 
 
140 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.158606 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3176  beta-lactamase domain protein  34.94 
 
 
461 aa  55.8  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00491395  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1392  rhodanese domain-containing protein  33.01 
 
 
120 aa  55.8  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.100688  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0229  Rhodanese domain protein  30 
 
 
140 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.479162  hitchhiker  0.0025446 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3083  rhodanese-like protein  32.95 
 
 
198 aa  55.1  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2364  rhodanese-like domain protein  34.26 
 
 
141 aa  55.5  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0959  Rhodanese domain protein  31.4 
 
 
107 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1997  Rhodanese domain protein  34.26 
 
 
141 aa  55.5  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.885175  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0149  rhodanese domain-containing protein  35.42 
 
 
116 aa  55.5  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0127705 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4216  rhodanese domain-containing protein  32.43 
 
 
144 aa  54.7  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1431  rhodanese domain-containing protein  38.74 
 
 
130 aa  55.1  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.430812  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0039  phage shock protein E  35.9 
 
 
123 aa  55.1  0.0000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2978  hypothetical protein  33.94 
 
 
175 aa  54.3  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.1375 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3100  inner membrane protein YgaP  33.94 
 
 
175 aa  54.3  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.5055  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2995  inner membrane protein YgaP  33.94 
 
 
175 aa  54.3  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.366204  normal  0.0280507 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2911  inner membrane protein YgaP  33.94 
 
 
175 aa  54.3  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1392  rhodanese-like domain-containing protein  32.56 
 
 
144 aa  54.3  0.0000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4512  rhodanese domain-containing protein  31.07 
 
 
111 aa  53.9  0.0000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2103  rhodanese-like protein  31.43 
 
 
108 aa  54.3  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.588432 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2943  inner membrane protein YgaP  33.94 
 
 
175 aa  54.3  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.143183 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1906  Rhodanese domain protein  32.14 
 
 
105 aa  54.3  0.0000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000236409  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2642  SirA family protein  32.26 
 
 
201 aa  53.9  0.0000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.140879  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2817  rhodanese domain-containing protein  34.15 
 
 
116 aa  53.9  0.0000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0255311  normal  0.567823 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1695  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.35 
 
 
393 aa  53.5  0.0000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.294225  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1649  hypothetical protein  31.3 
 
 
173 aa  53.5  0.0000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.616423  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3531  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.94 
 
 
377 aa  53.5  0.0000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.522613  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3210  rhodanese domain-containing protein  36.04 
 
 
142 aa  53.5  0.0000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.307395 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1742  rhodanese-like domain-containing protein  31.87 
 
 
106 aa  53.1  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.112615  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1215  beta-lactamase domain-containing protein  34.94 
 
 
460 aa  52.8  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0173274 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00932  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  28.7 
 
 
379 aa  53.1  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  26.42 
 
 
123 aa  53.1  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1173  rhodanese-like domain protein  31.4 
 
 
148 aa  52.8  0.000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1785  Rhodanese domain protein  29.55 
 
 
277 aa  53.5  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06090  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  28.7 
 
 
379 aa  53.1  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2090  Rhodanese domain protein  29.73 
 
 
137 aa  53.5  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.147548  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  31.52 
 
 
189 aa  53.1  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1591  Rhodanese domain protein  30 
 
 
178 aa  52.8  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0149932  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4191  beta-lactamase domain protein  32.56 
 
 
357 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0163085 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0733  ferredoxin thioredoxin reductase beta chain  36.25 
 
 
247 aa  52.8  0.000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0168606  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1618  rhodanese domain-containing protein  35.56 
 
 
175 aa  52.4  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.576106 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1199  rhodanese domain-containing protein  34.18 
 
 
282 aa  52.4  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0177216  hitchhiker  0.00286909 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1506  cysteine desulfurase  36.25 
 
 
753 aa  52.4  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>