More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1431 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1431  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 		 130 aa  259  6e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.430812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1453  rhodanese domain-containing protein  41.53 
 
 		 121 aa  97.1  8e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2223  Rhodanese domain protein  44.25 
 
 		 108 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2080  rhodanese-like protein  41.96 
 
 		 108 aa  73.2  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.218119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3362  rhodanese-like protein  41.96 
 
 		 108 aa  72  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00352544 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1280  rhodanese-like protein  41.07 
 
 		 170 aa  72  0.000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.678095 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3514  hypothetical protein  40 
 
 		 107 aa  68.9  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.308602  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0082  Rhodanese domain protein  40.18 
 
 		 108 aa  68.6  0.00000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.459536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  38.1 
 
 		 220 aa  64.7  0.0000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2364  rhodanese-like domain protein  35.94 
 
 		 141 aa  63.9  0.0000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1997  Rhodanese domain protein  35.94 
 
 		 141 aa  63.9  0.0000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.885175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1499  rhodanese-like protein  39.09 
 
 		 111 aa  63.9  0.0000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2103  rhodanese-like protein  37.84 
 
 		 108 aa  63.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.588432 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1705  Rhodanese domain protein  39.8 
 
 		 185 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000174118 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1239  rhodanese-like protein  39.09 
 
 		 137 aa  61.2  0.000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.549266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0149  rhodanese domain-containing protein  41.94 
 
 		 116 aa  60.5  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0127705 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1190  Rhodanese domain protein  34.55 
 
 		 126 aa  60.5  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3482  rhodanese-related sulfurtransferase-like protein  35.87 
 
 		 147 aa  60.1  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1618  rhodanese domain-containing protein  38.1 
 
 		 175 aa  60.1  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.576106 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1392  rhodanese domain-containing protein  36.45 
 
 		 120 aa  59.7  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.100688  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4028  rhodanese domain-containing protein  39.25 
 
 		 110 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  31.2 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5944  Rhodanese domain protein  36.89 
 
 		 102 aa  59.3  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0969772 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1184  Rhodanese domain protein  37.27 
 
 		 194 aa  58.9  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.111986  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000724  phage shock protein E  32.79 
 
 		 116 aa  58.9  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0744  rhodanese domain-containing protein  40.57 
 
 		 133 aa  58.2  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.547874 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2850  Rhodanese domain-containing protein  40.66 
 
 		 102 aa  57.8  0.00000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6071  putative rhodanese-related sulfurtransferase  36.07 
 
 		 131 aa  57.8  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0611  rhodanese-like protein  36.11 
 
 		 141 aa  57.8  0.00000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1792  rhodanese-like protein  36.94 
 
 		 177 aa  57.4  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06606  hypothetical protein  37.96 
 
 		 116 aa  57  0.00000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1814  rhodanese domain-containing protein  37.96 
 
 		 135 aa  56.2  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.315882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1113  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  33.07 
 
 		 254 aa  56.6  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2891  Rhodanese domain protein  38.61 
 
 		 98 aa  55.5  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2894  rhodanese domain-containing protein  38.1 
 
 		 113 aa  55.8  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.127379  normal  0.672082 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1937  rhodanese-like protein  38.1 
 
 		 120 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.964453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0928  rhodanese domain-containing protein  40.19 
 
 		 128 aa  55.1  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.585499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0455  rhodanese domain-containing protein  31.53 
 
 		 139 aa  55.1  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0701  rhodanese domain protein, putative  36.56 
 
 		 124 aa  55.1  0.0000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3723  rhodanese domain-containing protein  36.36 
 
 		 112 aa  54.7  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.464029  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0487  Rhodanese domain protein  37.72 
 
 		 134 aa  54.7  0.0000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1710  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  35.45 
 
 		 379 aa  54.7  0.0000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0241  rhodanese domain-containing protein  34.31 
 
 		 118 aa  54.7  0.0000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1774  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  35.45 
 
 		 386 aa  54.7  0.0000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0154  rhodanese domain-containing protein  38.3 
 
 		 113 aa  54.7  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2630  Rhodanese domain protein  39.81 
 
 		 112 aa  54.7  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2590  rhodanese domain-containing protein  35.71 
 
 		 113 aa  54.3  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0351  hypothetical protein  37.84 
 
 		 155 aa  53.9  0.0000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000374621  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1183  rhodanese-like protein  33.33 
 
 		 122 aa  53.9  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0775  Rhodanese domain protein  39.09 
 
 		 124 aa  53.9  0.0000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.61343 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0127  rhodanese domain-containing protein  37.5 
 
 		 128 aa  53.9  0.0000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.344636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1308  Rhodanese domain protein  38.68 
 
 		 118 aa  53.9  0.0000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4291  rhodanese-like protein  34.51 
 
 		 130 aa  53.9  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.144766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1537  rhodanese-like protein  31.4 
 
 		 175 aa  53.9  0.0000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.655026  normal  0.211338 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0678  Rhodanese domain protein  37.17 
 
 		 110 aa  53.5  0.0000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.682716 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1649  hypothetical protein  25.9 
 
 		 173 aa  53.1  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.616423  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5363  Rhodanese domain protein  36.63 
 
 		 106 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3913  rhodanese-like protein  39.05 
 
 		 132 aa  53.1  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.103396  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0046  rhodanese domain-containing protein  29.37 
 
 		 144 aa  52.8  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000263421 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0052  rhodanese domain-containing protein  29.6 
 
 		 158 aa  53.1  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000103873 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1146  Rhodanese domain protein  36.78 
 
 		 137 aa  52.8  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0154905  hitchhiker  0.0000789559 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1502  rhodanese domain-containing protein  38.1 
 
 		 113 aa  52.8  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.184229  normal  0.558017 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01150  Rhodanese-related sulfurtransferase  36.63 
 
 		 107 aa  52.4  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0463  rhodanese-related sulfurtransferase  26.36 
 
 		 144 aa  52.4  0.000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00932  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  34.26 
 
 		 379 aa  52.4  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0229  Rhodanese domain protein  34.11 
 
 		 140 aa  52.4  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.479162  hitchhiker  0.0025446 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2500  rhodanese-like protein  36.46 
 
 		 186 aa  52.4  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1212  rhodanese domain-containing protein  38.2 
 
 		 197 aa  52.4  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.998746  normal  0.0818549 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4620  rhodanese-like protein  35.65 
 
 		 130 aa  52.4  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.178094  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1704  putative sulfurtransferase  26.36 
 
 		 141 aa  52.4  0.000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2537  rhodanese-like protein  39.29 
 
 		 130 aa  52.4  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06090  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  34.26 
 
 		 379 aa  52.4  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0044  rhodanese domain-containing protein  29.37 
 
 		 144 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00248227 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0061  rhodanese-like protein  31.09 
 
 		 130 aa  52.8  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2162  rhodanese domain-containing protein  41.25 
 
 		 131 aa  52.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.236799  normal  0.0673229 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3607  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40.48 
 
 		 387 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.156981  normal  0.010154 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2168  Rhodanese domain protein  34.83 
 
 		 136 aa  51.6  0.000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6117  hypothetical protein  40 
 
 		 131 aa  51.6  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.447985  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3735  rhodanese domain-containing protein  39.05 
 
 		 113 aa  51.6  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00254792 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4102  Rhodanese domain protein  38.32 
 
 		 138 aa  52  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25625  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1857  rhodanese domain-containing protein  35 
 
 		 136 aa  51.6  0.000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.483436  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2923  Rhodanese domain protein  35.29 
 
 		 99 aa  52  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.669081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4150  Rhodanese domain protein  38.18 
 
 		 128 aa  51.2  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.344241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0213  Rhodanese domain protein  40 
 
 		 109 aa  51.6  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0263  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 		 116 aa  51.2  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2254  hypothetical protein  25 
 
 		 139 aa  51.2  0.000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2225  hypothetical protein  25 
 
 		 139 aa  51.2  0.000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2917  rhodanese-like protein  34.86 
 
 		 137 aa  51.2  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2691  rhodanese domain-containing protein  34.71 
 
 		 125 aa  51.2  0.000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1816  rhodanese-like domain-containing protein  31.2 
 
 		 120 aa  50.8  0.000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.717844  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3899  rhodanese domain-containing protein  37.84 
 
 		 129 aa  50.8  0.000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.485004 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1310  rhodanese-like protein  37.61 
 
 		 135 aa  50.8  0.000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.649013  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3697  rhodanese-like protein  28.57 
 
 		 144 aa  50.8  0.000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1508  Rhodanese domain protein  30.89 
 
 		 207 aa  50.4  0.000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0463  rhodanese domain-containing protein  36.36 
 
 		 132 aa  50.8  0.000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000512984  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2852  Rhodanese domain-containing protein  36.45 
 
 		 113 aa  50.4  0.000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3122  rhodanese-like protein  32.58 
 
 		 127 aa  50.4  0.000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0020  Rhodanese domain-containing protein  37.04 
 
 		 119 aa  50.4  0.000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.529293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2697  rhodanese domain-containing protein  34.29 
 
 		 107 aa  50.4  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.431269  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2642  SirA family protein  36.71 
 
 		 201 aa  50.1  0.000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.140879  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>