More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_3083 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_3083  rhodanese-like protein  100 
 
 		 198 aa  401  1e-111  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5692  rhodanese domain-containing protein  50.52 
 
 		 221 aa  196  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5313  rhodanese-like protein  50.52 
 
 		 221 aa  196  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5402  rhodanese domain-containing protein  50.52 
 
 		 221 aa  196  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.172427 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0984  rhodanese domain-containing protein  51.09 
 
 		 192 aa  187  1e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2224  rhodanese domain-containing protein  49.21 
 
 		 199 aa  184  7e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.335069 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1829  rhodanese domain-containing protein  50.27 
 
 		 225 aa  182  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.835748  normal  0.540125 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4024  rhodanese domain-containing protein  49.73 
 
 		 225 aa  182  3e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.125541  normal  0.61527 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2085  rhodanese domain-containing protein  47.67 
 
 		 194 aa  179  2.9999999999999997e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.252289  normal  0.0462986 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3362  rhodanese domain-containing protein  54.44 
 
 		 197 aa  164  8e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.544911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1911  rhodanese domain-containing protein  43.5 
 
 		 189 aa  157  1e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000193462  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1901  Rhodanese-related sulfurtransferase-like protein  44.1 
 
 		 201 aa  153  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2037  Rhodanese domain protein  47.53 
 
 		 189 aa  154  1e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00546701  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1706  Rhodanese domain protein  53.37 
 
 		 190 aa  149  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0369363  normal  0.872619 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21670  Rhodanese-related sulfurtransferase  48.26 
 
 		 197 aa  149  2e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1212  rhodanese domain-containing protein  45.65 
 
 		 197 aa  148  6e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.998746  normal  0.0818549 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3833  rhodanese domain-containing protein  41.04 
 
 		 218 aa  134  9.999999999999999e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0203  Rhodanese domain protein  42.16 
 
 		 204 aa  132  5e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3083  rhodanese/sulfurtransferase-like protein  42.26 
 
 		 182 aa  124  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.200312  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1184  Rhodanese domain protein  38.51 
 
 		 194 aa  114  8.999999999999998e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.111986  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0936  rhodanese-like protein  38.01 
 
 		 181 aa  107  1e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0889376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1792  rhodanese-like protein  37.06 
 
 		 177 aa  103  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2293  hypothetical protein  33.14 
 
 		 190 aa  103  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000207442 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21280  Rhodanese-related sulfurtransferase  43.04 
 
 		 216 aa  102  4e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.781801  normal  0.0577684 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1705  Rhodanese domain protein  33.12 
 
 		 185 aa  99.8  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000174118 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1620  rhodanese domain-containing protein  36.42 
 
 		 173 aa  97.1  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000202366  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2943  inner membrane protein YgaP  34.12 
 
 		 175 aa  84.7  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.143183 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02524  predicted inner membrane protein with hydrolase activity  30.99 
 
 		 174 aa  84  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1591  Rhodanese domain protein  30 
 
 		 178 aa  84  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0149932  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2911  inner membrane protein YgaP  34.12 
 
 		 175 aa  84  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02488  hypothetical protein  30.99 
 
 		 174 aa  84  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3100  inner membrane protein YgaP  34.12 
 
 		 175 aa  84  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.5055  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2995  inner membrane protein YgaP  34.12 
 
 		 175 aa  84  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.366204  normal  0.0280507 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2803  putative inner membrane protein  30.99 
 
 		 174 aa  84  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2978  hypothetical protein  34.12 
 
 		 175 aa  83.6  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.1375 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1015  Rhodanese domain protein  30.41 
 
 		 174 aa  82.8  0.000000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1038  rhodanese domain-containing protein  30.41 
 
 		 174 aa  82.8  0.000000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3910  putative inner membrane protein  31.4 
 
 		 172 aa  81.3  0.000000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.347321 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0494  rhodanese-like protein  34.48 
 
 		 168 aa  80.5  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2371  rhodanese-like protein  30.59 
 
 		 175 aa  79.7  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000779942  hitchhiker  0.0000187001 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3213  putative inner membrane protein  30.41 
 
 		 174 aa  79.7  0.00000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2948  putative inner membrane protein  30.41 
 
 		 174 aa  79.7  0.00000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2871  Rhodanese domain protein  30 
 
 		 178 aa  79  0.00000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.202618  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2892  Rhodanese domain protein  42.11 
 
 		 121 aa  79  0.00000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0717  rhodanese domain-containing protein  33.01 
 
 		 144 aa  77.4  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  34 
 
 		 123 aa  77  0.0000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2274  rhodanese domain-containing protein  31.03 
 
 		 175 aa  77.4  0.0000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.137134 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2788  putative inner membrane protein  30.23 
 
 		 174 aa  75.5  0.0000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.34112 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  37.38 
 
 		 145 aa  75.5  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0611  rhodanese-like protein  32.41 
 
 		 141 aa  75.1  0.0000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4216  rhodanese domain-containing protein  36.78 
 
 		 144 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1246  Rhodanese domain protein  39.42 
 
 		 130 aa  73.9  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000851542  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2187  rhodanese-like protein  39.53 
 
 		 135 aa  73.2  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2633  Rhodanese domain protein  38.71 
 
 		 123 aa  73.2  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.728751  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2356  Rhodanese domain protein  36.63 
 
 		 124 aa  72.8  0.000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1642  rhodanese domain-containing protein  38.38 
 
 		 103 aa  72.4  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0218  Rhodanese domain protein  39.36 
 
 		 124 aa  72.4  0.000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0229  Rhodanese domain protein  34.12 
 
 		 140 aa  72.4  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.479162  hitchhiker  0.0025446 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1173  rhodanese-like domain protein  36.84 
 
 		 148 aa  72  0.000000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1543  Rhodanese domain protein  32.69 
 
 		 138 aa  72  0.000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.973949  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1392  rhodanese-like domain-containing protein  36.84 
 
 		 144 aa  71.6  0.000000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0417  rhodanese-like domain-containing protein  32.35 
 
 		 135 aa  71.6  0.000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.764861  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0563  Rhodanese domain protein  38.04 
 
 		 121 aa  70.9  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000600861  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01624  putative phage shock protein E  37.65 
 
 		 136 aa  70.9  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0871  rhodanese domain-containing protein  35.29 
 
 		 127 aa  70.9  0.00000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.436528  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3148  putative phage shock protein E  32 
 
 		 133 aa  70.1  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0498  rhodanese domain-containing protein  31.37 
 
 		 135 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3207  rhodanese-like domain-containing protein  31.37 
 
 		 135 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1646  Rhodanese domain protein  30.46 
 
 		 209 aa  70.1  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0663  rhodanese-like domain-containing protein  31.37 
 
 		 135 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3847  Rhodanese domain protein  33.02 
 
 		 129 aa  70.1  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.323646  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0267  rhodanese domain-containing protein  31.76 
 
 		 161 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.968437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2218  rhodanese domain protein  41.05 
 
 		 118 aa  70.5  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.314079  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1412  rhodanese-like domain-containing protein  31.37 
 
 		 135 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1937  rhodanese domain-containing protein  34.58 
 
 		 269 aa  70.1  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0286726  hitchhiker  0.00000000917613 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2839  rhodanese-like domain-containing protein  31.37 
 
 		 135 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0479  rhodanese domain-containing protein  31.37 
 
 		 135 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0180  rhodanese-like domain-containing protein  31.37 
 
 		 135 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4469  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 		 144 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00345024 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4876  rhodanese domain-containing protein  34.48 
 
 		 144 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2536  rhodanese domain-containing protein  34.12 
 
 		 145 aa  69.7  0.00000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3913  rhodanese-like protein  36.67 
 
 		 132 aa  69.7  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.103396  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3805  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 		 170 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.715987 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1959  hypothetical protein  34 
 
 		 320 aa  69.3  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.247119  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4180  putative rhodanese-related sulfurtransferase  30.93 
 
 		 141 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0210  Rhodanese domain protein  32.94 
 
 		 140 aa  68.9  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.158606 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  39 
 
 		 220 aa  68.6  0.00000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0061  rhodanese-like protein  32.35 
 
 		 130 aa  68.9  0.00000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0533  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.33 
 
 		 568 aa  68.6  0.00000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.913571  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0535  Rhodanese domain protein  30.39 
 
 		 141 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3931  Rhodanese domain protein  33.02 
 
 		 129 aa  68.2  0.00000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0175301 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4797  beta-lactamase domain-containing protein  40.66 
 
 		 356 aa  68.2  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.303253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0162  Rhodanese domain protein  43.68 
 
 		 108 aa  68.2  0.00000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.963879  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2890  SirA family protein  36 
 
 		 189 aa  68.2  0.00000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0025  Rhodanese domain protein  35.4 
 
 		 157 aa  67.8  0.00000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000045135  normal  0.0554367 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4320  rhodanese-like domain protein  33.64 
 
 		 127 aa  67.8  0.00000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2260  Rhodanese domain protein  33.91 
 
 		 153 aa  68.2  0.00000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4503  rhodanese-like domain protein  33.33 
 
 		 119 aa  68.2  0.00000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000135209 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0447  rhodanese domain-containing protein  31.37 
 
 		 140 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.185748  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2399  rhodanese-like protein  35.23 
 
 		 138 aa  67.8  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>