More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeAg_B2911 on replicon NC_011149
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A2995  inner membrane protein YgaP  100 
 
 		 175 aa  355  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.366204  normal  0.0280507 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3100  inner membrane protein YgaP  100 
 
 		 175 aa  355  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.5055  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2911  inner membrane protein YgaP  100 
 
 		 175 aa  355  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2943  inner membrane protein YgaP  99.43 
 
 		 175 aa  354  3.9999999999999996e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.143183 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2978  hypothetical protein  98.86 
 
 		 175 aa  352  1e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.1375 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1015  Rhodanese domain protein  76.3 
 
 		 174 aa  276  9e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1038  rhodanese domain-containing protein  76.3 
 
 		 174 aa  276  9e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02524  predicted inner membrane protein with hydrolase activity  76.3 
 
 		 174 aa  276  1e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2803  putative inner membrane protein  76.3 
 
 		 174 aa  276  1e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02488  hypothetical protein  76.3 
 
 		 174 aa  276  1e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2948  putative inner membrane protein  75.86 
 
 		 174 aa  276  1e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3910  putative inner membrane protein  76.61 
 
 		 172 aa  274  5e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.347321 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3213  putative inner membrane protein  75.72 
 
 		 174 aa  274  5e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2788  putative inner membrane protein  76.3 
 
 		 174 aa  274  6e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.34112 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2274  rhodanese domain-containing protein  60.24 
 
 		 175 aa  209  2e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.137134 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1591  Rhodanese domain protein  57.49 
 
 		 178 aa  190  1e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0149932  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1620  rhodanese domain-containing protein  56.65 
 
 		 173 aa  187  5e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000202366  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2371  rhodanese-like protein  54.34 
 
 		 175 aa  184  5e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000779942  hitchhiker  0.0000187001 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2871  Rhodanese domain protein  55.09 
 
 		 178 aa  179  1e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.202618  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0494  rhodanese-like protein  53.25 
 
 		 168 aa  175  4e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1792  rhodanese-like protein  47.71 
 
 		 177 aa  138  4.999999999999999e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0924  rhodanese domain-containing protein  50 
 
 		 176 aa  129  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1705  Rhodanese domain protein  41.25 
 
 		 185 aa  126  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000174118 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0936  rhodanese-like protein  42.01 
 
 		 181 aa  125  3e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0889376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2293  hypothetical protein  39.62 
 
 		 190 aa  105  4e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000207442 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3083  rhodanese/sulfurtransferase-like protein  38.75 
 
 		 182 aa  103  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.200312  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1184  Rhodanese domain protein  39.2 
 
 		 194 aa  102  4e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.111986  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2085  rhodanese domain-containing protein  35.06 
 
 		 194 aa  87.8  7e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.252289  normal  0.0462986 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1646  Rhodanese domain protein  34.64 
 
 		 209 aa  87.4  9e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3083  rhodanese-like protein  34.12 
 
 		 198 aa  84  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1911  rhodanese domain-containing protein  35.9 
 
 		 189 aa  80.5  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000193462  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21670  Rhodanese-related sulfurtransferase  33.12 
 
 		 197 aa  80.1  0.00000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3833  rhodanese domain-containing protein  36.18 
 
 		 218 aa  79  0.00000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1901  Rhodanese-related sulfurtransferase-like protein  35.03 
 
 		 201 aa  77.8  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2224  rhodanese domain-containing protein  32.47 
 
 		 199 aa  77.8  0.00000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.335069 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0984  rhodanese domain-containing protein  33.99 
 
 		 192 aa  77.4  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1183  rhodanese-like protein  39.66 
 
 		 122 aa  76.6  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5313  rhodanese-like protein  33.33 
 
 		 221 aa  76.3  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5692  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 		 221 aa  76.3  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5402  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 		 221 aa  76.3  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.172427 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3362  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 		 197 aa  75.1  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.544911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1618  rhodanese domain-containing protein  32.16 
 
 		 175 aa  75.1  0.0000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.576106 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1212  rhodanese domain-containing protein  33.14 
 
 		 197 aa  73.9  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.998746  normal  0.0818549 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1937  rhodanese-like protein  40.95 
 
 		 120 aa  72  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.964453  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1190  Rhodanese domain protein  39.32 
 
 		 126 aa  71.6  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2037  Rhodanese domain protein  31.98 
 
 		 189 aa  70.9  0.000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00546701  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1829  rhodanese domain-containing protein  32.03 
 
 		 225 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.835748  normal  0.540125 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4024  rhodanese domain-containing protein  32.03 
 
 		 225 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.125541  normal  0.61527 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3913  rhodanese-like protein  40.4 
 
 		 132 aa  66.2  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.103396  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2103  rhodanese-like protein  39.39 
 
 		 108 aa  66.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.588432 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21280  Rhodanese-related sulfurtransferase  35.98 
 
 		 216 aa  65.1  0.0000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.781801  normal  0.0577684 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2629  Rhodanese domain protein  42.57 
 
 		 216 aa  64.3  0.0000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.770931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3362  rhodanese-like protein  38.61 
 
 		 108 aa  63.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00352544 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0229  Rhodanese domain protein  37.86 
 
 		 140 aa  62.4  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.479162  hitchhiker  0.0025446 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2475  rhodanese domain-containing protein  43.96 
 
 		 108 aa  62.4  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1280  rhodanese-like protein  39.62 
 
 		 170 aa  62.4  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.678095 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4876  rhodanese domain-containing protein  37.04 
 
 		 144 aa  61.6  0.000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1706  Rhodanese domain protein  33.96 
 
 		 190 aa  61.6  0.000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0369363  normal  0.872619 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2223  Rhodanese domain protein  38.38 
 
 		 108 aa  61.2  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3210  rhodanese domain-containing protein  37.36 
 
 		 142 aa  60.8  0.000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.307395 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1239  rhodanese-like protein  37.37 
 
 		 137 aa  60.1  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.549266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0203  Rhodanese domain protein  33.55 
 
 		 204 aa  60.5  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2080  rhodanese-like protein  39.39 
 
 		 108 aa  59.7  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.218119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0744  rhodanese domain-containing protein  37.37 
 
 		 133 aa  59.7  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.547874 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  34.51 
 
 		 220 aa  60.1  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0611  rhodanese-like protein  34.95 
 
 		 141 aa  59.3  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1649  hypothetical protein  36.28 
 
 		 173 aa  58.9  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.616423  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2364  rhodanese-like domain protein  39.25 
 
 		 141 aa  59.3  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1997  Rhodanese domain protein  39.25 
 
 		 141 aa  59.3  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.885175  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2630  Rhodanese domain protein  41.18 
 
 		 112 aa  58.9  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4216  rhodanese domain-containing protein  36.19 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2349  Rhodanese domain protein  40.91 
 
 		 141 aa  58.9  0.00000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000398103  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3735  rhodanese domain-containing protein  40.59 
 
 		 113 aa  58.5  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00254792 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3514  hypothetical protein  35.35 
 
 		 107 aa  58.5  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.308602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4469  rhodanese domain-containing protein  37.04 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00345024 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2117  sulphate transporter  42.53 
 
 		 703 aa  58.2  0.00000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.271394  normal  0.0391706 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2116  sulphate transporter  42.53 
 
 		 703 aa  58.2  0.00000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.242384 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1502  rhodanese domain-containing protein  39.6 
 
 		 113 aa  58.2  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.184229  normal  0.558017 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3805  rhodanese domain-containing protein  35.19 
 
 		 170 aa  57  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.715987 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1499  rhodanese-like protein  37.76 
 
 		 111 aa  57  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0241  rhodanese domain-containing protein  34.95 
 
 		 118 aa  57  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0267  rhodanese domain-containing protein  32.38 
 
 		 161 aa  57  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.968437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1271  rhodanese-like protein  34.82 
 
 		 138 aa  56.2  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4022  rhodanese-like protein  40 
 
 		 102 aa  56.6  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.203152  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3697  rhodanese-like protein  33.33 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0535  Rhodanese domain protein  34.29 
 
 		 141 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2590  rhodanese domain-containing protein  36.89 
 
 		 113 aa  55.8  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3835  rhodanese domain-containing protein  40.82 
 
 		 113 aa  55.8  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4331  rhodanese domain-containing protein  35.48 
 
 		 149 aa  55.5  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0041  rhodanese domain-containing protein  35.48 
 
 		 144 aa  55.5  0.0000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0403  rhodanese domain-containing protein  39.8 
 
 		 104 aa  55.5  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.059592  hitchhiker  0.000249249 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1392  rhodanese domain-containing protein  42.68 
 
 		 120 aa  55.5  0.0000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.100688  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0383  beta-lactamase domain protein  36.19 
 
 		 471 aa  55.5  0.0000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0048  Rhodanese domain protein  35.48 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0338944 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0305  rhodanese-like protein  36.84 
 
 		 137 aa  55.1  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0210  Rhodanese domain protein  38.46 
 
 		 140 aa  55.1  0.0000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.158606 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0044  rhodanese domain-containing protein  35.48 
 
 		 149 aa  54.7  0.0000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4180  putative rhodanese-related sulfurtransferase  33.33 
 
 		 141 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0048  rhodanese domain-containing protein  35.48 
 
 		 149 aa  54.7  0.0000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000123958 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0052  rhodanese domain-containing protein  32.41 
 
 		 158 aa  54.3  0.0000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000103873 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>