More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_1591 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_1591  Rhodanese domain protein  100 
 
 		 178 aa  361  4e-99  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0149932  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2871  Rhodanese domain protein  81.46 
 
 		 178 aa  300  6.000000000000001e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.202618  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2274  rhodanese domain-containing protein  63.43 
 
 		 175 aa  221  6e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.137134 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1015  Rhodanese domain protein  60.59 
 
 		 174 aa  202  2e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3910  putative inner membrane protein  60.71 
 
 		 172 aa  202  2e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.347321 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1038  rhodanese domain-containing protein  60.59 
 
 		 174 aa  202  2e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02524  predicted inner membrane protein with hydrolase activity  60 
 
 		 174 aa  201  4e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02488  hypothetical protein  60 
 
 		 174 aa  201  4e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2803  putative inner membrane protein  60 
 
 		 174 aa  201  4e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3213  putative inner membrane protein  60 
 
 		 174 aa  201  6e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2948  putative inner membrane protein  60.12 
 
 		 174 aa  200  9e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2788  putative inner membrane protein  60 
 
 		 174 aa  198  3e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.34112 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3100  inner membrane protein YgaP  57.49 
 
 		 175 aa  190  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.5055  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2943  inner membrane protein YgaP  57.49 
 
 		 175 aa  190  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.143183 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2995  inner membrane protein YgaP  57.49 
 
 		 175 aa  190  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.366204  normal  0.0280507 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2911  inner membrane protein YgaP  57.49 
 
 		 175 aa  190  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2978  hypothetical protein  56.89 
 
 		 175 aa  189  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.1375 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0494  rhodanese-like protein  56.9 
 
 		 168 aa  182  2.0000000000000003e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2371  rhodanese-like protein  53.8 
 
 		 175 aa  182  2.0000000000000003e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000779942  hitchhiker  0.0000187001 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1620  rhodanese domain-containing protein  50 
 
 		 173 aa  169  2e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000202366  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1792  rhodanese-like protein  46.95 
 
 		 177 aa  142  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1705  Rhodanese domain protein  43.95 
 
 		 185 aa  135  4e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000174118 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0924  rhodanese domain-containing protein  50 
 
 		 176 aa  134  6.0000000000000005e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0936  rhodanese-like protein  41.95 
 
 		 181 aa  127  1.0000000000000001e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0889376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3083  rhodanese/sulfurtransferase-like protein  41.36 
 
 		 182 aa  115  3.9999999999999997e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.200312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2293  hypothetical protein  40 
 
 		 190 aa  106  1e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000207442 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1184  Rhodanese domain protein  37.64 
 
 		 194 aa  97.8  8e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.111986  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1901  Rhodanese-related sulfurtransferase-like protein  35.52 
 
 		 201 aa  94  9e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2085  rhodanese domain-containing protein  35.43 
 
 		 194 aa  91.3  6e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.252289  normal  0.0462986 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21670  Rhodanese-related sulfurtransferase  36.05 
 
 		 197 aa  90.9  8e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2224  rhodanese domain-containing protein  35.03 
 
 		 199 aa  90.5  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.335069 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1646  Rhodanese domain protein  36.09 
 
 		 209 aa  89.4  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2037  Rhodanese domain protein  35.63 
 
 		 189 aa  85.1  5e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00546701  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3083  rhodanese-like protein  30 
 
 		 198 aa  84  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5313  rhodanese-like protein  32.78 
 
 		 221 aa  83.6  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5402  rhodanese domain-containing protein  32.78 
 
 		 221 aa  83.6  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.172427 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5692  rhodanese domain-containing protein  35.03 
 
 		 221 aa  83.6  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3833  rhodanese domain-containing protein  35.67 
 
 		 218 aa  82.8  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0984  rhodanese domain-containing protein  34.97 
 
 		 192 aa  81.6  0.000000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1829  rhodanese domain-containing protein  35.71 
 
 		 225 aa  80.1  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.835748  normal  0.540125 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4024  rhodanese domain-containing protein  35.06 
 
 		 225 aa  79.7  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.125541  normal  0.61527 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1911  rhodanese domain-containing protein  31.18 
 
 		 189 aa  77  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000193462  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1212  rhodanese domain-containing protein  32.76 
 
 		 197 aa  76.3  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.998746  normal  0.0818549 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0203  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 		 204 aa  76.6  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  39.47 
 
 		 220 aa  73.6  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1706  Rhodanese domain protein  36.65 
 
 		 190 aa  73.2  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0369363  normal  0.872619 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1183  rhodanese-like protein  40.35 
 
 		 122 aa  72.8  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1618  rhodanese domain-containing protein  35.19 
 
 		 175 aa  72  0.000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.576106 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21280  Rhodanese-related sulfurtransferase  33.87 
 
 		 216 aa  71.6  0.000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.781801  normal  0.0577684 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3362  rhodanese domain-containing protein  33.99 
 
 		 197 aa  70.5  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.544911  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1190  Rhodanese domain protein  41.23 
 
 		 126 aa  68.9  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1997  Rhodanese domain protein  35.64 
 
 		 141 aa  67.8  0.00000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.885175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2364  rhodanese-like domain protein  35.64 
 
 		 141 aa  67.8  0.00000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3723  rhodanese domain-containing protein  43 
 
 		 112 aa  65.9  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.464029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1937  rhodanese domain-containing protein  35.85 
 
 		 269 aa  65.5  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0286726  hitchhiker  0.00000000917613 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1280  rhodanese-like protein  41.18 
 
 		 170 aa  65.1  0.0000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.678095 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  37.74 
 
 		 145 aa  64.3  0.0000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2475  rhodanese domain-containing protein  40 
 
 		 108 aa  63.9  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0241  rhodanese domain-containing protein  39.56 
 
 		 118 aa  61.6  0.000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1392  rhodanese domain-containing protein  39.39 
 
 		 120 aa  60.5  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.100688  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1308  Rhodanese domain protein  37.14 
 
 		 118 aa  60.1  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3913  rhodanese-like protein  38.38 
 
 		 132 aa  60.1  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.103396  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2630  Rhodanese domain protein  39.6 
 
 		 112 aa  60.1  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1844  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.91 
 
 		 393 aa  58.9  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1543  Rhodanese domain protein  37.14 
 
 		 138 aa  58.5  0.00000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.973949  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0210  Rhodanese domain protein  35.63 
 
 		 140 aa  58.5  0.00000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.158606 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3449  hypothetical protein  30.17 
 
 		 170 aa  58.5  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0310387  normal  0.0600537 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4022  rhodanese-like protein  39.39 
 
 		 102 aa  58.5  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.203152  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0229  Rhodanese domain protein  34.65 
 
 		 140 aa  58.2  0.00000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.479162  hitchhiker  0.0025446 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46860  thiosulfate sulfurtransferase  38.61 
 
 		 112 aa  58.2  0.00000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3835  rhodanese domain-containing protein  39 
 
 		 113 aa  57.8  0.00000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4614  Rhodanese domain protein  37.11 
 
 		 129 aa  57.8  0.00000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0480272  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4164  Rhodanese domain protein  38.71 
 
 		 102 aa  57  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.741744  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3514  hypothetical protein  37.25 
 
 		 107 aa  57.4  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.308602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4138  Rhodanese domain protein  38.71 
 
 		 102 aa  57.4  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2223  Rhodanese domain protein  37.89 
 
 		 108 aa  57  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0305  rhodanese-like protein  36.27 
 
 		 137 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1649  hypothetical protein  28.97 
 
 		 173 aa  57  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.616423  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1051  rhodanese-like protein  40.35 
 
 		 122 aa  56.6  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2103  rhodanese-like protein  38.61 
 
 		 108 aa  56.6  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.588432 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1499  rhodanese-like protein  37 
 
 		 111 aa  57  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0403  rhodanese domain-containing protein  37.62 
 
 		 104 aa  55.8  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.059592  hitchhiker  0.000249249 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1239  rhodanese-like protein  37 
 
 		 137 aa  55.8  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.549266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1642  rhodanese domain-containing protein  40.23 
 
 		 103 aa  55.8  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2080  rhodanese-like protein  37.62 
 
 		 108 aa  55.5  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.218119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3735  rhodanese domain-containing protein  37.38 
 
 		 113 aa  55.5  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00254792 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0447  rhodanese domain-containing protein  34 
 
 		 140 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.185748  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0611  rhodanese-like protein  30.19 
 
 		 141 aa  55.1  0.0000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1149  Rhodanese domain protein  41.11 
 
 		 121 aa  54.7  0.0000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000462843  hitchhiker  0.00000263083 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2399  rhodanese-like protein  30.53 
 
 		 138 aa  54.7  0.0000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1183  beta-lactamase domain protein  35.92 
 
 		 476 aa  54.7  0.0000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0291229  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3362  rhodanese-like protein  37.62 
 
 		 108 aa  54.7  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00352544 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3847  Rhodanese domain protein  33.65 
 
 		 129 aa  54.3  0.0000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.323646  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0354  hypothetical protein  31.31 
 
 		 151 aa  53.5  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.842496  normal  0.122714 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2349  Rhodanese domain protein  32.98 
 
 		 141 aa  54.3  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000398103  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2894  rhodanese domain-containing protein  37.74 
 
 		 113 aa  53.9  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.127379  normal  0.672082 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1937  rhodanese-like protein  35.71 
 
 		 120 aa  53.9  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.964453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0744  rhodanese domain-containing protein  30.61 
 
 		 133 aa  53.9  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.547874 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3931  Rhodanese domain protein  32.11 
 
 		 129 aa  53.9  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0175301 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0383  beta-lactamase domain protein  35.92 
 
 		 471 aa  53.5  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>