More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1190 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_1190  Rhodanese domain protein  100 
 
 		 126 aa  256  8e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1183  rhodanese-like protein  77.69 
 
 		 122 aa  193  7e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1051  rhodanese-like protein  83.47 
 
 		 122 aa  180  6e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1937  rhodanese-like protein  61.16 
 
 		 120 aa  148  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.964453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2371  rhodanese-like protein  43.97 
 
 		 175 aa  81.6  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000779942  hitchhiker  0.0000187001 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1620  rhodanese domain-containing protein  39.66 
 
 		 173 aa  73.2  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000202366  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2995  inner membrane protein YgaP  39.32 
 
 		 175 aa  71.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.366204  normal  0.0280507 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3100  inner membrane protein YgaP  39.32 
 
 		 175 aa  71.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.5055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2103  rhodanese-like protein  33.94 
 
 		 108 aa  71.6  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.588432 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2978  hypothetical protein  39.32 
 
 		 175 aa  71.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.1375 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2911  inner membrane protein YgaP  39.32 
 
 		 175 aa  71.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2223  Rhodanese domain protein  36.7 
 
 		 108 aa  71.2  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2943  inner membrane protein YgaP  39.32 
 
 		 175 aa  70.9  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.143183 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1280  rhodanese-like protein  41.67 
 
 		 170 aa  70.5  0.000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.678095 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2080  rhodanese-like protein  37.61 
 
 		 108 aa  70.5  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.218119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3362  rhodanese-like protein  37.61 
 
 		 108 aa  69.7  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00352544 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1239  rhodanese-like protein  36.19 
 
 		 137 aa  68.9  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.549266  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1591  Rhodanese domain protein  41.23 
 
 		 178 aa  68.9  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0149932  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1392  rhodanese domain-containing protein  36.54 
 
 		 120 aa  68.6  0.00000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.100688  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0744  rhodanese domain-containing protein  38.1 
 
 		 133 aa  67.4  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.547874 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2274  rhodanese domain-containing protein  36.61 
 
 		 175 aa  67.4  0.00000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.137134 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3723  rhodanese domain-containing protein  37.5 
 
 		 112 aa  66.2  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.464029  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0775  Rhodanese domain protein  37.4 
 
 		 124 aa  65.9  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.61343 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1499  rhodanese-like protein  34.31 
 
 		 111 aa  65.5  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1015  Rhodanese domain protein  36.75 
 
 		 174 aa  64.7  0.0000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3514  hypothetical protein  34.29 
 
 		 107 aa  64.3  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.308602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1038  rhodanese domain-containing protein  36.75 
 
 		 174 aa  64.7  0.0000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3910  putative inner membrane protein  36.75 
 
 		 172 aa  64.3  0.0000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.347321 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 		 142 aa  63.9  0.0000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02524  predicted inner membrane protein with hydrolase activity  35.9 
 
 		 174 aa  63.5  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02488  hypothetical protein  35.9 
 
 		 174 aa  63.5  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2803  putative inner membrane protein  35.9 
 
 		 174 aa  63.5  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2475  rhodanese domain-containing protein  41.86 
 
 		 108 aa  62.4  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2871  Rhodanese domain protein  38.89 
 
 		 178 aa  61.6  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.202618  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3835  rhodanese domain-containing protein  41.58 
 
 		 113 aa  61.2  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3213  putative inner membrane protein  35.04 
 
 		 174 aa  61.6  0.000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2948  putative inner membrane protein  35.04 
 
 		 174 aa  61.6  0.000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  33.64 
 
 		 220 aa  61.2  0.000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2590  rhodanese domain-containing protein  35.85 
 
 		 113 aa  61.2  0.000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2788  putative inner membrane protein  36.61 
 
 		 174 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.34112 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1431  rhodanese domain-containing protein  34.55 
 
 		 130 aa  60.8  0.000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.430812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1705  Rhodanese domain protein  33 
 
 		 185 aa  60.5  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000174118 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1792  rhodanese-like protein  31.62 
 
 		 177 aa  59.7  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0032  rhodanese-like protein  33.64 
 
 		 248 aa  60.1  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3735  rhodanese domain-containing protein  35.64 
 
 		 113 aa  59.3  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00254792 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0787  Rhodanese domain protein  31.58 
 
 		 154 aa  58.5  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.403999  normal  0.138616 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0494  rhodanese-like protein  36.28 
 
 		 168 aa  58.5  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1997  Rhodanese domain protein  36.45 
 
 		 141 aa  58.5  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.885175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0241  rhodanese domain-containing protein  33.96 
 
 		 118 aa  58.5  0.00000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2364  rhodanese-like domain protein  36.45 
 
 		 141 aa  58.5  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1308  Rhodanese domain protein  38 
 
 		 118 aa  58.2  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1183  beta-lactamase domain protein  32.35 
 
 		 476 aa  57.8  0.00000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0291229  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0094  rhodanese-like protein  38.24 
 
 		 110 aa  57.8  0.00000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2254  hypothetical protein  26.92 
 
 		 139 aa  57.4  0.00000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2225  hypothetical protein  26.92 
 
 		 139 aa  57.4  0.00000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1502  rhodanese domain-containing protein  34.65 
 
 		 113 aa  56.2  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.184229  normal  0.558017 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0936  rhodanese-like protein  32 
 
 		 181 aa  56.6  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0889376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3805  rhodanese domain-containing protein  34.62 
 
 		 170 aa  56.2  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.715987 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0305  rhodanese-like protein  31.07 
 
 		 137 aa  55.1  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0082  Rhodanese domain protein  36.27 
 
 		 108 aa  54.7  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.459536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1543  Rhodanese domain protein  32.08 
 
 		 138 aa  54.3  0.0000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.973949  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1649  hypothetical protein  29.17 
 
 		 173 aa  53.9  0.0000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.616423  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0924  rhodanese domain-containing protein  33.62 
 
 		 176 aa  53.5  0.0000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1184  Rhodanese domain protein  30.58 
 
 		 194 aa  53.1  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.111986  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0611  rhodanese-like protein  30.56 
 
 		 141 aa  53.1  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6185  rhodanese-like protein  30.1 
 
 		 140 aa  53.5  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0210  Rhodanese domain protein  36.73 
 
 		 140 aa  53.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.158606 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1901  Rhodanese-related sulfurtransferase-like protein  39.13 
 
 		 201 aa  53.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0020  Rhodanese domain-containing protein  37.14 
 
 		 119 aa  53.1  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.529293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00122  sulfurtransferase  30.28 
 
 		 144 aa  53.1  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2536  rhodanese domain-containing protein  29.63 
 
 		 145 aa  52  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4818  rhodanese domain-containing protein  34.26 
 
 		 144 aa  52.4  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.355939  hitchhiker  0.000187411 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2630  Rhodanese domain protein  35.64 
 
 		 112 aa  52.8  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4469  rhodanese domain-containing protein  30.91 
 
 		 144 aa  52.8  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00345024 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0871  rhodanese domain-containing protein  29.25 
 
 		 127 aa  52.8  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.436528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0717  rhodanese domain-containing protein  31.73 
 
 		 144 aa  52.4  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4102  Rhodanese domain protein  32.35 
 
 		 138 aa  51.6  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25625  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0447  rhodanese domain-containing protein  29.13 
 
 		 140 aa  52  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.185748  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0229  Rhodanese domain protein  35.51 
 
 		 140 aa  52  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.479162  hitchhiker  0.0025446 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3667  beta-lactamase-like  36.04 
 
 		 346 aa  52  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2242  rhodanese-like protein  29.13 
 
 		 140 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.98062  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2856  rhodanese domain-containing protein  29.13 
 
 		 140 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0154  rhodanese domain-containing protein  35.51 
 
 		 113 aa  52  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  33.71 
 
 		 123 aa  51.2  0.000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0463  rhodanese-related sulfurtransferase  30.1 
 
 		 144 aa  51.6  0.000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0487  Rhodanese domain protein  31.82 
 
 		 134 aa  51.2  0.000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1704  putative sulfurtransferase  30.1 
 
 		 141 aa  51.2  0.000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2867  rhodanese domain-containing protein  29.13 
 
 		 140 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0354  hypothetical protein  34.29 
 
 		 151 aa  51.2  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.842496  normal  0.122714 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1814  rhodanese domain-containing protein  33.98 
 
 		 135 aa  51.2  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.315882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0701  thiosulfate sulfurtransferase GlpE  30.28 
 
 		 107 aa  51.2  0.000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  3.6297700000000005e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2188  Rhodanese domain protein  40 
 
 		 109 aa  51.2  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0415469  hitchhiker  0.000000235552 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2558  rhodanese-like domain protein  40 
 
 		 109 aa  51.2  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.029677  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3697  rhodanese-like protein  33.03 
 
 		 144 aa  50.8  0.000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4876  rhodanese domain-containing protein  30.91 
 
 		 144 aa  50.8  0.000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0134  Rhodanese domain protein  30.19 
 
 		 145 aa  50.8  0.000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.410653 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2911  rhodanese domain-containing protein  28.16 
 
 		 140 aa  50.4  0.000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0061  rhodanese-like protein  32.11 
 
 		 130 aa  50.8  0.000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2085  rhodanese domain-containing protein  36.89 
 
 		 194 aa  50.4  0.000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.252289  normal  0.0462986 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2773  rhodanese domain-containing protein  28.16 
 
 		 140 aa  50.4  0.000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>