More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1937 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_1937  rhodanese-like protein  100 
 
 		 120 aa  236  5.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.964453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1183  rhodanese-like protein  60 
 
 		 122 aa  153  6e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1190  Rhodanese domain protein  61.16 
 
 		 126 aa  148  3e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1051  rhodanese-like protein  61.67 
 
 		 122 aa  130  9e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3100  inner membrane protein YgaP  40.95 
 
 		 175 aa  72  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.5055  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2995  inner membrane protein YgaP  40.95 
 
 		 175 aa  72  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.366204  normal  0.0280507 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2978  hypothetical protein  40.95 
 
 		 175 aa  72  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.1375 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2911  inner membrane protein YgaP  40.95 
 
 		 175 aa  72  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2948  putative inner membrane protein  38.79 
 
 		 174 aa  71.2  0.000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3213  putative inner membrane protein  38.79 
 
 		 174 aa  71.2  0.000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2943  inner membrane protein YgaP  40.95 
 
 		 175 aa  71.2  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.143183 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2371  rhodanese-like protein  42.57 
 
 		 175 aa  70.5  0.000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000779942  hitchhiker  0.0000187001 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1015  Rhodanese domain protein  38.79 
 
 		 174 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1620  rhodanese domain-containing protein  41.35 
 
 		 173 aa  70.1  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000202366  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1038  rhodanese domain-containing protein  38.79 
 
 		 174 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02524  predicted inner membrane protein with hydrolase activity  37.93 
 
 		 174 aa  68.2  0.00000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2788  putative inner membrane protein  38.79 
 
 		 174 aa  68.2  0.00000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.34112 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02488  hypothetical protein  37.93 
 
 		 174 aa  68.2  0.00000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3910  putative inner membrane protein  38.79 
 
 		 172 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.347321 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2803  putative inner membrane protein  37.93 
 
 		 174 aa  68.2  0.00000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0744  rhodanese domain-containing protein  38.61 
 
 		 133 aa  67  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.547874 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1392  rhodanese domain-containing protein  42.57 
 
 		 120 aa  66.6  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.100688  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2103  rhodanese-like protein  40.7 
 
 		 108 aa  66.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.588432 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3362  rhodanese-like protein  40.7 
 
 		 108 aa  64.3  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00352544 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  36.45 
 
 		 220 aa  63.2  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2223  Rhodanese domain protein  36.79 
 
 		 108 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0494  rhodanese-like protein  39.45 
 
 		 168 aa  62  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3913  rhodanese-like protein  33.02 
 
 		 132 aa  62  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.103396  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1280  rhodanese-like protein  36.7 
 
 		 170 aa  61.2  0.000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.678095 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1239  rhodanese-like protein  41.86 
 
 		 137 aa  59.7  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.549266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2475  rhodanese domain-containing protein  44.71 
 
 		 108 aa  60.1  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2080  rhodanese-like protein  40.7 
 
 		 108 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.218119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0573  rhodanese-like protein  33.67 
 
 		 109 aa  58.9  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000000000146252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1705  Rhodanese domain protein  32.76 
 
 		 185 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000174118 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2590  rhodanese domain-containing protein  38.71 
 
 		 113 aa  58.2  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1792  rhodanese-like protein  33.04 
 
 		 177 aa  57.8  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1499  rhodanese-like protein  38.37 
 
 		 111 aa  57  0.00000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2274  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 		 175 aa  56.2  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.137134 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0533  rhodanese-like protein  35.29 
 
 		 124 aa  56.2  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000000298777  normal  0.316081 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2680  rhodanese-like protein  40.37 
 
 		 105 aa  56.2  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3514  hypothetical protein  37.21 
 
 		 107 aa  56.2  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.308602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1431  rhodanese domain-containing protein  39.6 
 
 		 130 aa  55.8  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.430812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  33.01 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2630  Rhodanese domain protein  37.11 
 
 		 112 aa  55.1  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0775  Rhodanese domain protein  34.96 
 
 		 124 aa  55.1  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.61343 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2085  rhodanese domain-containing protein  40.37 
 
 		 194 aa  55.1  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.252289  normal  0.0462986 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0020  Rhodanese domain-containing protein  37.14 
 
 		 119 aa  54.7  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.529293  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2629  Rhodanese domain protein  35.71 
 
 		 216 aa  54.7  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.770931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3607  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  41 
 
 		 387 aa  55.1  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.156981  normal  0.010154 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0924  rhodanese domain-containing protein  39.13 
 
 		 176 aa  54.7  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4138  Rhodanese domain protein  37 
 
 		 102 aa  54.7  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4164  Rhodanese domain protein  36.54 
 
 		 102 aa  54.7  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.741744  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2364  rhodanese-like domain protein  37.25 
 
 		 141 aa  54.3  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1997  Rhodanese domain protein  37.25 
 
 		 141 aa  54.3  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.885175  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1591  Rhodanese domain protein  35.71 
 
 		 178 aa  53.9  0.0000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0149932  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4022  rhodanese-like protein  38.54 
 
 		 102 aa  53.5  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.203152  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2871  Rhodanese domain protein  33.64 
 
 		 178 aa  53.5  0.0000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.202618  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4224  rhodanese domain-containing protein  35 
 
 		 125 aa  52.8  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0936  rhodanese-like protein  38.55 
 
 		 181 aa  53.1  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0889376  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4704  Rhodanese domain protein  39.18 
 
 		 114 aa  53.5  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.930099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3723  rhodanese domain-containing protein  39.39 
 
 		 112 aa  52.8  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.464029  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0032  rhodanese-like protein  34.31 
 
 		 248 aa  52  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3122  rhodanese-like protein  35 
 
 		 127 aa  52  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1757  rhodanese domain-containing protein  42.31 
 
 		 134 aa  51.6  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0421554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3805  rhodanese domain-containing protein  30.77 
 
 		 170 aa  51.6  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.715987 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3835  rhodanese domain-containing protein  38.14 
 
 		 113 aa  51.2  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4642  Rhodanese domain protein  36.46 
 
 		 109 aa  50.8  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.845465  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1618  rhodanese domain-containing protein  41.11 
 
 		 175 aa  50.8  0.000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.576106 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0296  hypothetical protein  41.56 
 
 		 377 aa  50.4  0.000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4186  sulphate transporter  35 
 
 		 711 aa  50.4  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.680572  unclonable  0.000013918 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0094  rhodanese-like protein  37 
 
 		 110 aa  50.4  0.000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1308  Rhodanese domain protein  40.4 
 
 		 118 aa  50.1  0.000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0398  phage shock protein E, putative  33.33 
 
 		 118 aa  49.7  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0205  Rhodanese domain protein  39.18 
 
 		 113 aa  49.7  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1710  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  33.33 
 
 		 379 aa  49.7  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3458  Rhodanese domain protein  36.25 
 
 		 107 aa  49.7  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2500  rhodanese-like protein  35.29 
 
 		 186 aa  50.1  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1774  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  33.33 
 
 		 386 aa  49.7  0.00001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1308  Rhodanese domain protein  35.9 
 
 		 271 aa  49.7  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.197822  normal  0.0310663 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2516  rhodanese-like domain-containing protein  25.23 
 
 		 247 aa  48.9  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.890802  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1844  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30 
 
 		 393 aa  49.3  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0773  Rhodanese domain protein  32.99 
 
 		 117 aa  49.3  0.00002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3493  UBA/THIF-type NAD/FAD binding, MoeZ/MoeB fmaily protein  41.25 
 
 		 390 aa  48.9  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2894  rhodanese domain-containing protein  41.41 
 
 		 113 aa  48.9  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.127379  normal  0.672082 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3836  rhodanese domain-containing protein  36.9 
 
 		 98 aa  48.9  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0154  rhodanese domain-containing protein  30.63 
 
 		 113 aa  49.3  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3931  Rhodanese domain protein  31.4 
 
 		 129 aa  48.9  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0175301 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3082  Rhodanese domain protein  37.19 
 
 		 131 aa  48.9  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.689626  normal  0.0783096 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2480  rhodanese domain-containing protein  34.62 
 
 		 107 aa  48.1  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1502  rhodanese domain-containing protein  38.27 
 
 		 113 aa  48.5  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.184229  normal  0.558017 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1271  rhodanese-like protein  30.48 
 
 		 138 aa  48.9  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5422  rhodanese domain-containing protein  39.56 
 
 		 116 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.500506  normal  0.598915 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21280  Rhodanese-related sulfurtransferase  37.63 
 
 		 216 aa  48.5  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.781801  normal  0.0577684 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0881  rhodanese domain-containing protein  37.18 
 
 		 107 aa  48.9  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.691799 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0432  rhodanese-like protein  37.18 
 
 		 107 aa  48.9  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5042  rhodanese-like protein  39.56 
 
 		 116 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.982785  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3577  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  42.31 
 
 		 390 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.127521  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0788  rhodanese domain-containing protein  35.9 
 
 		 107 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.677785  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0911  rhodanese domain-containing protein  37.18 
 
 		 107 aa  48.9  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.174972  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3847  Rhodanese domain protein  29.81 
 
 		 129 aa  48.5  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.323646  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>