More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2590 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_2590  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 
113 aa  232  2.0000000000000002e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2223  Rhodanese domain protein  55.14 
 
 
108 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3514  hypothetical protein  52.88 
 
 
107 aa  122  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.308602  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2080  rhodanese-like protein  54.29 
 
 
108 aa  121  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.218119  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2103  rhodanese-like protein  50.47 
 
 
108 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.588432 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1239  rhodanese-like protein  52.88 
 
 
137 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.549266  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1499  rhodanese-like protein  51.92 
 
 
111 aa  117  4.9999999999999996e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3362  rhodanese-like protein  51.43 
 
 
108 aa  117  6e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00352544 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2475  rhodanese domain-containing protein  48.48 
 
 
108 aa  100  5e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1392  rhodanese domain-containing protein  52.63 
 
 
120 aa  98.6  3e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.100688  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0678  Rhodanese domain protein  50.98 
 
 
110 aa  95.1  3e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.682716 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5025  Rhodanese domain protein  50 
 
 
107 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.569347 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2435  rhodanese domain-containing protein  48.08 
 
 
106 aa  91.3  4e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.192108  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4510  rhodanese domain-containing protein  49.04 
 
 
107 aa  91.3  5e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4973  Rhodanese domain protein  49.04 
 
 
107 aa  91.3  5e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.133162 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1705  Rhodanese domain protein  44.57 
 
 
185 aa  86.3  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000174118 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1618  rhodanese domain-containing protein  43.56 
 
 
175 aa  86.3  1e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.576106 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5363  Rhodanese domain protein  46.67 
 
 
106 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5070  rhodanese domain-containing protein  45.71 
 
 
106 aa  84.7  4e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.34245  normal  0.0277572 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0241  rhodanese domain-containing protein  38.83 
 
 
118 aa  84  7e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3723  rhodanese domain-containing protein  43.3 
 
 
112 aa  83.2  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.464029  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1330  rhodanese domain-containing protein  44.76 
 
 
112 aa  81.3  0.000000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.434015 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1183  rhodanese-like protein  39.81 
 
 
122 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1792  rhodanese-like protein  38.78 
 
 
177 aa  72.4  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  40.38 
 
 
220 aa  71.6  0.000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1280  rhodanese-like protein  39.42 
 
 
170 aa  70.9  0.000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.678095 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0936  rhodanese-like protein  40.62 
 
 
181 aa  68.9  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0889376  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2894  rhodanese domain-containing protein  42.05 
 
 
113 aa  68.6  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.127379  normal  0.672082 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1190  Rhodanese domain protein  35.85 
 
 
126 aa  67  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1937  rhodanese domain-containing protein  34.65 
 
 
269 aa  66.2  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0286726  hitchhiker  0.00000000917613 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  34.65 
 
 
145 aa  65.5  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2630  Rhodanese domain protein  35.78 
 
 
112 aa  63.9  0.0000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1937  rhodanese-like protein  39.78 
 
 
120 aa  63.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.964453  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1642  rhodanese domain-containing protein  35.29 
 
 
103 aa  62  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2500  rhodanese-like protein  36.45 
 
 
186 aa  62  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4138  Rhodanese domain protein  38.14 
 
 
102 aa  61.2  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0520  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  38.24 
 
 
386 aa  61.6  0.000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.185889  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4164  Rhodanese domain protein  38.14 
 
 
102 aa  61.2  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.741744  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3913  rhodanese-like protein  39.77 
 
 
132 aa  61.6  0.000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.103396  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3760  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  44.87 
 
 
393 aa  61.6  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.62685  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3735  rhodanese domain-containing protein  36.08 
 
 
113 aa  61.2  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00254792 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8385  molybdopterin/thiamine biosynthesis family protein  40.24 
 
 
393 aa  60.8  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250903  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4022  rhodanese-like protein  38.14 
 
 
102 aa  60.8  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.203152  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2943  inner membrane protein YgaP  36.89 
 
 
175 aa  60.5  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.143183 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2995  inner membrane protein YgaP  36.89 
 
 
175 aa  60.5  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.366204  normal  0.0280507 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3100  inner membrane protein YgaP  36.89 
 
 
175 aa  60.5  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.5055  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2911  inner membrane protein YgaP  36.89 
 
 
175 aa  60.5  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2978  hypothetical protein  36.89 
 
 
175 aa  60.1  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.1375 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3667  beta-lactamase-like  37.61 
 
 
346 aa  60.1  0.000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3684  putative sulfurtransferase (rhodanese)  40.74 
 
 
113 aa  60.1  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0311109  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3493  UBA/THIF-type NAD/FAD binding, MoeZ/MoeB fmaily protein  43.42 
 
 
390 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2125  rhodanese-like protein  40.82 
 
 
141 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.949088  normal  0.0126023 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1559  rhodanese-like protein  31.96 
 
 
142 aa  59.7  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0146795  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1502  rhodanese domain-containing protein  36.73 
 
 
113 aa  60.1  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.184229  normal  0.558017 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2982  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  41.03 
 
 
392 aa  59.3  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  36.54 
 
 
142 aa  59.3  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0922  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  37.14 
 
 
390 aa  59.3  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698196  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7815  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  39.77 
 
 
393 aa  59.3  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2917  rhodanese-like protein  37.27 
 
 
137 aa  59.3  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1997  Rhodanese domain protein  35.24 
 
 
141 aa  59.3  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.885175  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2629  Rhodanese domain protein  34.95 
 
 
216 aa  59.3  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.770931  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2364  rhodanese-like domain protein  35.24 
 
 
141 aa  59.3  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2631  Rhodanese domain protein  34.34 
 
 
480 aa  58.5  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2349  Rhodanese domain protein  32.67 
 
 
141 aa  58.5  0.00000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000398103  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1591  Rhodanese domain protein  37.5 
 
 
178 aa  58.5  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0149932  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3577  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  43.42 
 
 
390 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.127521  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1649  hypothetical protein  33.33 
 
 
173 aa  58.2  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.616423  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0383  beta-lactamase domain protein  35.29 
 
 
471 aa  58.2  0.00000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1844  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.14 
 
 
393 aa  57.8  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1051  rhodanese-like protein  42.06 
 
 
122 aa  57.4  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1308  Rhodanese domain protein  37.62 
 
 
118 aa  57.4  0.00000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1431  rhodanese domain-containing protein  36.04 
 
 
130 aa  57  0.00000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.430812  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3607  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  42.11 
 
 
387 aa  56.2  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.156981  normal  0.010154 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0667  Rhodanese domain protein  34.04 
 
 
104 aa  56.6  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4670  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  36.27 
 
 
392 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.794416  normal  0.136136 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1308  Rhodanese domain protein  38.96 
 
 
271 aa  56.6  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.197822  normal  0.0310663 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0020  Rhodanese domain-containing protein  33.64 
 
 
119 aa  56.6  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.529293  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2504  Rhodanese domain-containing protein  36.04 
 
 
134 aa  56.2  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2024  Rhodanese domain protein  32.58 
 
 
131 aa  55.5  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13136  molybdenum cofactor biosynthesis protein moeB2  40.24 
 
 
389 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.318899 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0833  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  36.56 
 
 
390 aa  56.2  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2860  Rhodanese domain protein  31.31 
 
 
129 aa  56.2  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0611  rhodanese-like protein  30.91 
 
 
141 aa  55.8  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3803  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  36.19 
 
 
390 aa  55.8  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.209325  normal  0.526883 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3646  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40.79 
 
 
390 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1310  rhodanese-like protein  34.48 
 
 
135 aa  56.2  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.649013  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0094  rhodanese-like protein  35.64 
 
 
110 aa  55.5  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1666  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  35.71 
 
 
378 aa  55.8  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.28085  normal  0.198345 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4028  rhodanese domain-containing protein  40.86 
 
 
110 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2632  rhodanese-like protein  40.78 
 
 
119 aa  55.1  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.437689  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2037  Rhodanese domain protein  35.87 
 
 
189 aa  55.1  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00546701  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3825  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  43.59 
 
 
387 aa  54.7  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.380998  normal  0.141711 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6257  hypothetical protein  37.27 
 
 
137 aa  54.7  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.760302 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4842  beta-lactamase-like  35.24 
 
 
346 aa  54.7  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2496  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40.79 
 
 
399 aa  54.7  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000124873 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2536  rhodanese domain-containing protein  33.66 
 
 
145 aa  54.7  0.0000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2871  Rhodanese domain protein  34.65 
 
 
178 aa  54.7  0.0000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.202618  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0487  Rhodanese domain protein  32.08 
 
 
134 aa  54.7  0.0000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1706  Rhodanese domain protein  37.93 
 
 
190 aa  54.7  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0369363  normal  0.872619 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0564  Rhodanese domain protein  34.04 
 
 
98 aa  54.7  0.0000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000375905  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>