More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_4510 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_4510  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 		 107 aa  216  1e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4973  Rhodanese domain protein  100 
 
 		 107 aa  216  1e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.133162 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5025  Rhodanese domain protein  94.39 
 
 		 107 aa  207  5e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.569347 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2435  rhodanese domain-containing protein  73.58 
 
 		 106 aa  167  4e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.192108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5070  rhodanese domain-containing protein  70.75 
 
 		 106 aa  154  4e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.34245  normal  0.0277572 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5363  Rhodanese domain protein  68.87 
 
 		 106 aa  152  1e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0678  Rhodanese domain protein  52.83 
 
 		 110 aa  104  4e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.682716 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2223  Rhodanese domain protein  46.67 
 
 		 108 aa  84.7  4e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1392  rhodanese domain-containing protein  45.79 
 
 		 120 aa  83.6  7e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.100688  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2080  rhodanese-like protein  46.23 
 
 		 108 aa  83.6  7e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.218119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3362  rhodanese-like protein  45.71 
 
 		 108 aa  83.6  9e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00352544 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1330  rhodanese domain-containing protein  42.86 
 
 		 112 aa  82  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.434015 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2590  rhodanese domain-containing protein  49.04 
 
 		 113 aa  82.8  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2103  rhodanese-like protein  44.76 
 
 		 108 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.588432 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3514  hypothetical protein  44.44 
 
 		 107 aa  80.9  0.000000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.308602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2475  rhodanese domain-containing protein  46.15 
 
 		 108 aa  79  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1499  rhodanese-like protein  46.53 
 
 		 111 aa  79.3  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1239  rhodanese-like protein  44.76 
 
 		 137 aa  76.6  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.549266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0241  rhodanese domain-containing protein  37.14 
 
 		 118 aa  73.9  0.0000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3684  putative sulfurtransferase (rhodanese)  43.68 
 
 		 113 aa  70.9  0.000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0311109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3723  rhodanese domain-containing protein  43.96 
 
 		 112 aa  68.2  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.464029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2894  rhodanese domain-containing protein  36.89 
 
 		 113 aa  63.9  0.0000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.127379  normal  0.672082 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1705  Rhodanese domain protein  32.38 
 
 		 185 aa  62  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000174118 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1564  rhodanese domain-containing protein  36.89 
 
 		 296 aa  62.4  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2917  rhodanese-like protein  39.81 
 
 		 137 aa  62.4  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1618  rhodanese domain-containing protein  35.92 
 
 		 175 aa  62  0.000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.576106 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3899  rhodanese domain-containing protein  38.94 
 
 		 129 aa  61.2  0.000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.485004 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0691  putative Zn-dependent hydrolase including glyoxylases /rhodanese-related sulfurtransferase  36.21 
 
 		 345 aa  60.5  0.000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.979433  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2504  Rhodanese domain-containing protein  36.04 
 
 		 134 aa  59.3  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3667  beta-lactamase-like  37.5 
 
 		 346 aa  59.3  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2500  rhodanese-like protein  38.53 
 
 		 186 aa  58.5  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2895  beta-lactamase-like protein  39.42 
 
 		 346 aa  58.2  0.00000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00973984 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2364  rhodanese-like domain protein  33.01 
 
 		 141 aa  57.8  0.00000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1997  Rhodanese domain protein  33.01 
 
 		 141 aa  57.8  0.00000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.885175  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4102  Rhodanese domain protein  34.48 
 
 		 138 aa  57.8  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25625  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3005  Rhodanese domain-containing protein  38.1 
 
 		 228 aa  56.6  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.603948  normal  0.106826 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2299  rhodanese-like protein  36.08 
 
 		 131 aa  56.6  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.688081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3458  rhodanese-like protein  38.61 
 
 		 140 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.204377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1792  rhodanese-like protein  31.43 
 
 		 177 aa  55.5  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3913  rhodanese-like protein  36.73 
 
 		 132 aa  56.2  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.103396  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2737  rhodanese domain protein  31.78 
 
 		 136 aa  54.3  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.367158  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3170  Rhodanese domain protein  39.53 
 
 		 224 aa  54.3  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.212738 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1914  rhodanese-like protein  39.36 
 
 		 141 aa  54.7  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0674986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4028  rhodanese domain-containing protein  38.32 
 
 		 110 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4138  Rhodanese domain protein  33.98 
 
 		 102 aa  53.9  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3857  rhodanese domain-containing protein  35.63 
 
 		 135 aa  53.9  0.0000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.848576  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1816  rhodanese-like domain-containing protein  35.87 
 
 		 120 aa  53.9  0.0000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.717844  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2517  rhodanese-like domain/cysteine-rich domain-containing protein  32.98 
 
 		 665 aa  53.5  0.0000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.853873  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2007  metallo-beta-lactamase family protein  33.01 
 
 		 361 aa  53.5  0.0000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3148  putative phage shock protein E  28.43 
 
 		 133 aa  52.8  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1703  Rhodanese domain protein  33.71 
 
 		 167 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000369251 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4164  Rhodanese domain protein  33.98 
 
 		 102 aa  53.5  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.741744  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0039  rhodanese domain-containing protein  34.48 
 
 		 135 aa  53.1  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.861184  normal  0.831321 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0213  Rhodanese domain protein  39.8 
 
 		 109 aa  52.8  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4022  rhodanese-like protein  33.98 
 
 		 102 aa  52.8  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.203152  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6257  hypothetical protein  37.23 
 
 		 137 aa  52.4  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.760302 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13136  molybdenum cofactor biosynthesis protein moeB2  34.38 
 
 		 389 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.318899 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0928  rhodanese domain-containing protein  33.72 
 
 		 128 aa  52.8  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.585499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2850  Rhodanese domain-containing protein  36.05 
 
 		 102 aa  51.2  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0114  Rhodanese domain protein  41.94 
 
 		 130 aa  51.2  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.764117  normal  0.501583 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2037  Rhodanese domain protein  33.64 
 
 		 189 aa  51.6  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00546701  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0156  rhodanese domain-containing protein  35.71 
 
 		 111 aa  51.2  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.634327  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1474  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.23 
 
 		 403 aa  51.2  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.790679  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3607  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.1 
 
 		 387 aa  51.2  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.156981  normal  0.010154 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3646  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.76 
 
 		 390 aa  51.2  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2310  rhodanese-like protein  35.85 
 
 		 127 aa  51.2  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4134  Rhodanese domain protein  35.29 
 
 		 138 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.64767  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0691  Rhodanese domain protein  36.56 
 
 		 158 aa  50.8  0.000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0493491  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2125  rhodanese-like protein  36.73 
 
 		 141 aa  50.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.949088  normal  0.0126023 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4591  rhodanese domain-containing protein  37.89 
 
 		 130 aa  50.8  0.000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3240  regulatory protein, ArsR  34.29 
 
 		 221 aa  50.8  0.000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.135637  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3493  UBA/THIF-type NAD/FAD binding, MoeZ/MoeB fmaily protein  39.29 
 
 		 390 aa  50.4  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2646  beta-lactamase domain protein  37.8 
 
 		 344 aa  49.7  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1190  Rhodanese domain protein  35.48 
 
 		 126 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4670  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  37.21 
 
 		 392 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.794416  normal  0.136136 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3577  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.1 
 
 		 390 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.127521  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2218  rhodanese domain protein  36.19 
 
 		 118 aa  48.9  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.314079  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2399  rhodanese-like protein  34.12 
 
 		 138 aa  48.9  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8385  molybdopterin/thiamine biosynthesis family protein  33.33 
 
 		 393 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0936  rhodanese-like protein  37.21 
 
 		 181 aa  48.9  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0889376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3836  rhodanese-like protein  28.16 
 
 		 140 aa  49.7  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_13503  Rhodanese-related sulfurtransferase  34.44 
 
 		 129 aa  49.3  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.258058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00900  Rhodanese-related sulfurtransferase  34.12 
 
 		 118 aa  49.3  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1561  Rhodanese domain protein  30.91 
 
 		 136 aa  48.5  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1901  Rhodanese-related sulfurtransferase-like protein  33.7 
 
 		 201 aa  48.5  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1308  Rhodanese domain protein  36.67 
 
 		 118 aa  48.1  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC05040  endoplasmic reticulum protein, putative  33.7 
 
 		 179 aa  48.1  0.00004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.575301  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1183  rhodanese-like protein  33.65 
 
 		 122 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1399  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  37.35 
 
 		 400 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2662  rhodanese domain-containing protein  27.18 
 
 		 120 aa  48.1  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.553385  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1417  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  37.35 
 
 		 400 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1453  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  37.35 
 
 		 400 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.640225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3257  rhodanese domain-containing protein  31.73 
 
 		 221 aa  47.8  0.00005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0639581  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0520  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  31.76 
 
 		 386 aa  47.8  0.00005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.185889  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1706  Rhodanese domain protein  33.72 
 
 		 190 aa  47.8  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0369363  normal  0.872619 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2537  rhodanese-like protein  36.96 
 
 		 130 aa  47.8  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0183  transcriptional regulator, ArsR family  34.65 
 
 		 227 aa  47.8  0.00005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1814  rhodanese domain-containing protein  34.48 
 
 		 135 aa  47.8  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.315882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0460  rhodanese domain-containing protein  28.3 
 
 		 138 aa  47.4  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.821321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1797  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  36.05 
 
 		 397 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.171411 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>