More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1564 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_1564  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 		 296 aa  603  1.0000000000000001e-171  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2517  rhodanese-like domain/cysteine-rich domain-containing protein  52.31 
 
 		 665 aa  325  6e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.853873  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1671  Rhodanese domain protein  32.12 
 
 		 280 aa  108  1e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0966638  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1560  rhodanese domain-containing protein  29.02 
 
 		 321 aa  108  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000411556  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2270  Thiosulfate sulfurtransferase  33.46 
 
 		 285 aa  105  6e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0920  Thiosulfate sulfurtransferase  31.76 
 
 		 286 aa  105  7e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.189036 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4850  rhodanese-like protein  29.96 
 
 		 300 aa  105  8e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.146616 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2659  Rhodanese domain protein  28.84 
 
 		 293 aa  105  9e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.119104  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0954  Rhodanese domain protein  32.68 
 
 		 283 aa  104  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0593  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  33.2 
 
 		 285 aa  104  2e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0591  rhodanese domain-containing protein  31.2 
 
 		 295 aa  103  2e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1275  Rhodanese domain protein  32.08 
 
 		 356 aa  102  6e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000898965  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1312  Rhodanese domain protein  32.38 
 
 		 288 aa  101  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0899  thiosulfate sulfurtransferase  30.66 
 
 		 282 aa  100  4e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1954  Rhodanese domain protein  27.96 
 
 		 335 aa  99  9e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.535428 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0680  rhodanese domain-containing protein  26.47 
 
 		 265 aa  98.2  1e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2079  rhodanese domain-containing protein  30.92 
 
 		 340 aa  97.8  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5151  rhodanese domain-containing protein  30.24 
 
 		 321 aa  98.2  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.541862  normal  0.700824 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4279  Rhodanese domain protein  28.19 
 
 		 321 aa  96.3  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03590  rhodanese-related sulfurtransferase  31.85 
 
 		 304 aa  96.3  5e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4339  Rhodanese domain protein  28.19 
 
 		 321 aa  96.3  6e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.599399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1488  rhodanese domain-containing protein  30.52 
 
 		 355 aa  95.5  8e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.305791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2206  thiosulfate sulfurtransferase  30.28 
 
 		 286 aa  95.5  9e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2866  rhodanese domain-containing protein  29.15 
 
 		 284 aa  95.1  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1030  Thiosulfate sulfurtransferase  29.23 
 
 		 283 aa  95.1  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0259593 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1333  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  29.15 
 
 		 284 aa  95.1  1e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1253  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  29.3 
 
 		 289 aa  95.5  1e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2858  Rhodanese domain protein  26.44 
 
 		 305 aa  95.1  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2787  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  29.21 
 
 		 284 aa  94.7  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0188  Rhodanese domain protein  29.78 
 
 		 285 aa  94.7  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0747  rhodanese domain-containing protein  30.49 
 
 		 305 aa  94  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.544739 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1892  Rhodanese domain protein  27.76 
 
 		 278 aa  93.6  3e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.474796  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32980  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase protein  32.92 
 
 		 284 aa  93.6  3e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0176  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  27.95 
 
 		 793 aa  92.8  5e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.9868  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37710  rhodanese-related sulfurtransferase  29.88 
 
 		 279 aa  92.8  6e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.272937 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02073  rhodanese-related sulfurtransferase  28.51 
 
 		 276 aa  92.8  6e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.161687  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3021  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  29.24 
 
 		 289 aa  92.8  7e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.927756  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2095  Rhodanese domain protein  28.52 
 
 		 297 aa  92.8  7e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5343  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  30.04 
 
 		 284 aa  92.4  9e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0028  rhodanese domain-containing protein  30.92 
 
 		 297 aa  92.4  9e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.53804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0689  rhodanese domain-containing protein  29.71 
 
 		 291 aa  92.4  9e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0296  rhodanese domain-containing protein  29.63 
 
 		 301 aa  92  9e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2719  thiosulfate sulfurtransferase  31.28 
 
 		 279 aa  92  1e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4507  rhodanese-like protein  29.63 
 
 		 286 aa  92  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1171  Rhodanese domain protein  26.76 
 
 		 305 aa  91.7  1e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000963951  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2802  thiosulfate sulfurtransferase  28.68 
 
 		 290 aa  91.7  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0252  Rhodanese domain protein  29.51 
 
 		 285 aa  92  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2652  Rhodanese domain protein  31.82 
 
 		 306 aa  91.7  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.619492  normal  0.838465 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1897  thiosulfate sulfurtransferase  29.73 
 
 		 273 aa  91.7  1e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.060194  normal  0.211414 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1666  thiosulfate sulfurtransferase  31.3 
 
 		 303 aa  91.7  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.200846  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1409  thiosulfate sulfurtransferase  27.68 
 
 		 285 aa  91.7  1e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0120648 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0354  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  30.52 
 
 		 285 aa  91.3  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4351  thiosulfate sulfurtransferase  30.33 
 
 		 281 aa  91.3  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.352154  normal  0.607689 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0944  Rhodanese domain protein  26.26 
 
 		 307 aa  90.9  2e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000021463  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0449  rhodanese-like protein  31.15 
 
 		 277 aa  90.9  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.890664 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2805  rhodanese domain-containing protein  29.02 
 
 		 362 aa  91.3  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1460  rhodanese domain-containing protein  28.34 
 
 		 288 aa  90.5  3e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.058733  normal  0.145252 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1146  Rhodanese domain protein  29.84 
 
 		 297 aa  90.1  4e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0368023  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1239  Rhodanese domain protein  28.68 
 
 		 284 aa  90.1  4e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.954881  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1646  thiosulfate sulfurtransferase  30.17 
 
 		 277 aa  90.1  4e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0108718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4529  thiosulfate sulfurtransferase  29.46 
 
 		 277 aa  89.7  5e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1687  Rhodanese domain protein  28.42 
 
 		 290 aa  89.7  5e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0301278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4616  thiosulfate sulfurtransferase  29.46 
 
 		 277 aa  89.7  5e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4912  thiosulfate sulfurtransferase  29.46 
 
 		 277 aa  89.7  5e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1808  Rhodanese domain protein  31.52 
 
 		 297 aa  89.4  6e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0995  Rhodanese domain protein  29.8 
 
 		 296 aa  89.4  7e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.079295  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2742  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  27.57 
 
 		 284 aa  89  9e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6169  rhodanese domain-containing protein  30.89 
 
 		 277 aa  88.2  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.845163  normal  0.179847 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1776  Rhodanese domain protein  31.08 
 
 		 335 aa  88.6  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.305984  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0340  rhodanese domain-containing protein  28.81 
 
 		 282 aa  88.6  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.316076  hitchhiker  0.00258596 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0912  Rhodanese domain protein  30.52 
 
 		 305 aa  89  1e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.251547  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0430  Rhodanese domain protein  29.92 
 
 		 286 aa  88.2  1e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5101  thiosulfate sulfurtransferase  30.17 
 
 		 277 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0224  rhodanese domain-containing protein  28.9 
 
 		 272 aa  88.6  1e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0198439  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1421  rhodanese domain-containing protein  29.48 
 
 		 288 aa  87.8  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.692836  decreased coverage  0.00000340615 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1977  rhodanese domain-containing protein  28.62 
 
 		 291 aa  87.8  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.131653 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2209  Rhodanese domain protein  28.4 
 
 		 285 aa  87.4  2e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0460  thiosulfate sulfurtransferase  29.34 
 
 		 279 aa  87.8  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.755575  normal  0.367746 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1618  Rhodanese domain protein  30.13 
 
 		 291 aa  87.8  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.97892  normal  0.0367317 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47500  putative 3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  30 
 
 		 284 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0405  rhodanese domain-containing protein  27.97 
 
 		 296 aa  87.8  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0602  Thiosulfate sulfurtransferase  29.88 
 
 		 279 aa  87.8  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07810  rhodanese-related sulfurtransferase  31.78 
 
 		 375 aa  87.4  3e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1615  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  30.11 
 
 		 285 aa  87.4  3e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1210  rhodanese domain-containing protein  29.77 
 
 		 289 aa  87.4  3e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5168  rhodanese domain-containing protein  29.12 
 
 		 284 aa  87  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2636  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  30.63 
 
 		 292 aa  87  3e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.488566  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0441  rhodanese domain-containing protein  28.21 
 
 		 281 aa  86.7  4e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000883325 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3055  rhodanese-like protein  28.88 
 
 		 279 aa  86.7  4e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.403851  normal  0.0127336 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6828  Rhodanese domain protein  29.75 
 
 		 281 aa  86.7  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1659  Rhodanese domain protein  31.85 
 
 		 307 aa  87  4e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000135994 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5914  thiosulfate sulfurtransferase  27.13 
 
 		 283 aa  87  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.259229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4780  rhodanese domain-containing protein  30.07 
 
 		 305 aa  86.7  4e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.720691  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5118  rhodanese domain protein  28.46 
 
 		 284 aa  86.7  5e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1615  Rhodanese domain protein  27.21 
 
 		 289 aa  86.3  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.12037  normal  0.481952 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4992  rhodanese domain-containing protein  28.46 
 
 		 284 aa  86.3  6e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1183  rhodanese-like protein  28.08 
 
 		 286 aa  86.3  6e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0717  rhodanese domain-containing protein  28.11 
 
 		 281 aa  86.3  6e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.140717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3079  Rhodanese domain protein  28.4 
 
 		 301 aa  85.9  8e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.946899  normal  0.0542249 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0356  rhodanese domain-containing protein  29.51 
 
 		 267 aa  85.5  9e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>