More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_3458 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_3458  rhodanese-like protein  100 
 
 		 140 aa  286  7e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.204377  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4134  Rhodanese domain protein  88.32 
 
 		 138 aa  258  1e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.64767  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1914  rhodanese-like protein  89.36 
 
 		 141 aa  257  3e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0674986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6257  hypothetical protein  84.67 
 
 		 137 aa  237  4e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.760302 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2125  rhodanese-like protein  80.71 
 
 		 141 aa  231  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.949088  normal  0.0126023 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2917  rhodanese-like protein  70.59 
 
 		 137 aa  206  9e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3899  rhodanese domain-containing protein  68.18 
 
 		 129 aa  187  5e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.485004 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2504  Rhodanese domain-containing protein  63.71 
 
 		 134 aa  163  9e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0272  hypothetical protein  55.56 
 
 		 141 aa  145  2.0000000000000003e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2310  rhodanese-like protein  56.35 
 
 		 127 aa  143  7.0000000000000006e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0460  rhodanese domain-containing protein  51.47 
 
 		 138 aa  141  3e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.821321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2537  rhodanese-like protein  52.38 
 
 		 130 aa  137  7e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4591  rhodanese domain-containing protein  55.28 
 
 		 130 aa  134  4e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3836  rhodanese-like protein  48.53 
 
 		 140 aa  133  8e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4183  rhodanese-like protein  48.53 
 
 		 140 aa  131  3e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1561  Rhodanese domain protein  50.82 
 
 		 136 aa  125  1.0000000000000001e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2110  rhodanese-like protein  62.37 
 
 		 133 aa  124  4.0000000000000003e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.972039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1857  rhodanese domain-containing protein  49.18 
 
 		 136 aa  122  2e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.483436  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0114  Rhodanese domain protein  46.03 
 
 		 130 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.764117  normal  0.501583 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2299  rhodanese-like protein  50 
 
 		 131 aa  115  1.9999999999999998e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.688081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4150  Rhodanese domain protein  46.4 
 
 		 128 aa  110  9e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.344241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6071  putative rhodanese-related sulfurtransferase  43.28 
 
 		 131 aa  110  9e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0127  rhodanese domain-containing protein  45.24 
 
 		 128 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.344636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4620  rhodanese-like protein  44.44 
 
 		 130 aa  106  1e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.178094  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2891  rhodanese domain-containing protein  43.65 
 
 		 130 aa  103  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.326534 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1202  rhodanese-like protein  42.28 
 
 		 125 aa  99  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4291  rhodanese-like protein  38.58 
 
 		 130 aa  97.4  6e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.144766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4185  rhodanese-like protein  39.37 
 
 		 130 aa  96.3  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.522252 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2199  rhodanese domain-containing protein  41.46 
 
 		 131 aa  93.6  7e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.331265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0548  hypothetical protein  41.46 
 
 		 131 aa  93.6  8e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.173322  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4950  Rhodanese domain protein  38.21 
 
 		 129 aa  90.1  9e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.369685  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1936  rhodanese-like protein  45.16 
 
 		 125 aa  89.4  1e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.060767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1239  rhodanese domain-containing protein  40.16 
 
 		 131 aa  90.1  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0881109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2076  rhodanese-like protein  35.77 
 
 		 126 aa  86.3  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.640935  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1109  rhodanese-like  61.54 
 
 		 71 aa  83.2  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1388  Rhodanese domain protein  35.77 
 
 		 130 aa  76.3  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.267933  normal  0.0200875 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0691  putative Zn-dependent hydrolase including glyoxylases /rhodanese-related sulfurtransferase  39.45 
 
 		 345 aa  73.6  0.0000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.979433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2737  rhodanese domain protein  34.71 
 
 		 136 aa  72.8  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.367158  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2646  beta-lactamase domain protein  43.75 
 
 		 344 aa  72  0.000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0728  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  36.43 
 
 		 388 aa  71.2  0.000000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.652305  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2041  rhodanese-related sulfurtransferase  34.17 
 
 		 124 aa  71.2  0.000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1816  rhodanese-like domain-containing protein  38.78 
 
 		 120 aa  70.5  0.000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.717844  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3553  rhodanese domain-containing protein  32.26 
 
 		 133 aa  70.1  0.000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0130  rhodanese-like domain-containing protein  33.33 
 
 		 124 aa  70.1  0.00000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000130588  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3667  beta-lactamase-like  36.89 
 
 		 346 aa  69.7  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3438  rhodanese/sulfurtransferase-like protein  35.71 
 
 		 123 aa  67.8  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3082  Rhodanese domain protein  31.45 
 
 		 131 aa  67.8  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.689626  normal  0.0783096 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0472  Rhodanese domain protein  33.6 
 
 		 163 aa  67.4  0.00000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0333  rhodanese domain-containing protein  35.66 
 
 		 126 aa  67  0.00000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.891512  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2186  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.83 
 
 		 389 aa  66.6  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0893637 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46930  Rhodanese-domain protein  42.86 
 
 		 126 aa  66.2  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.322809  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0529  rhodanese-like domain protein  38.95 
 
 		 128 aa  65.5  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00586876  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0687  Rhodanese domain protein  38.95 
 
 		 128 aa  65.5  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000111268  hitchhiker  0.0000834379 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4940  Rhodanese domain protein  38.55 
 
 		 124 aa  65.5  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2895  beta-lactamase-like protein  35.92 
 
 		 346 aa  64.7  0.0000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00973984 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1483  rhodanese-like protein  35.25 
 
 		 140 aa  64.3  0.0000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.197506  normal  0.337603 
 
 
-
 
NC_002936  DET1392  rhodanese-like domain-containing protein  32.79 
 
 		 144 aa  63.9  0.0000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1689  Rhodanese domain-containing protein  33.07 
 
 		 141 aa  63.9  0.0000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.168466  normal  0.158024 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4038  Rhodanese domain protein  34.17 
 
 		 125 aa  63.5  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.686364  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1901  Rhodanese domain protein  30.47 
 
 		 137 aa  62.8  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4344  Rhodanese domain protein  32.8 
 
 		 323 aa  62.4  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.987797  normal  0.626066 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00096  Rhodanese-related sulfurtransferase  34.96 
 
 		 132 aa  62.4  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4842  beta-lactamase-like  32.03 
 
 		 346 aa  62.4  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0258  Rhodanese domain protein  34.23 
 
 		 124 aa  62.4  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1475  rhodanese domain-containing protein  35 
 
 		 119 aa  62.8  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0763814  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2834  rhodanese domain-containing protein  34.68 
 
 		 126 aa  61.6  0.000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00175675 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1844  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40.2 
 
 		 393 aa  61.2  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4874  Rhodanese domain protein  32.28 
 
 		 134 aa  60.8  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2007  metallo-beta-lactamase family protein  33.04 
 
 		 361 aa  60.5  0.000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0787  Rhodanese domain protein  32.2 
 
 		 154 aa  60.5  0.000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.403999  normal  0.138616 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1173  rhodanese-like domain protein  30.33 
 
 		 148 aa  59.7  0.00000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1733  hypothetical protein  34.83 
 
 		 123 aa  59.3  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1981  rhodanese-like protein  36.46 
 
 		 140 aa  59.3  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.726838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1579  Rhodanese domain protein  33.88 
 
 		 131 aa  59.3  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00521027  normal  0.140987 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6069  Rhodanese domain protein  35.79 
 
 		 204 aa  58.5  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.180105  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4389  rhodanese domain-containing protein  31.45 
 
 		 124 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2654  hypothetical protein  35.96 
 
 		 116 aa  58.2  0.00000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.173279  normal  0.613191 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1257  hypothetical protein  41.25 
 
 		 93 aa  57.8  0.00000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.265625  normal  0.967549 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4167  rhodanese-like protein  31.45 
 
 		 124 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4233  rhodanese domain-containing protein  31.45 
 
 		 124 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1733  hypothetical protein  33.71 
 
 		 123 aa  57.8  0.00000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2723  beta-lactamase domain protein  34.62 
 
 		 476 aa  57.8  0.00000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00124827  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4148  cysteine dioxygenase type I  33.33 
 
 		 294 aa  57.4  0.00000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4683  rhodanese domain-containing protein  31.62 
 
 		 122 aa  57  0.00000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0692547  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2536  rhodanese domain-containing protein  31.97 
 
 		 145 aa  56.2  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4023  beta-lactamase domain-containing protein  34.15 
 
 		 459 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.139103  normal  0.561085 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11084  hypothetical protein  36.9 
 
 		 131 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.7245e-55  normal  0.140954 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  32.43 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1830  beta-lactamase domain-containing protein  34.15 
 
 		 459 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.772754  normal  0.208991 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4510  rhodanese domain-containing protein  38.61 
 
 		 107 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4973  Rhodanese domain protein  38.61 
 
 		 107 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.133162 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2435  rhodanese domain-containing protein  37.89 
 
 		 106 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.192108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2188  rhodanese-like protein  38.82 
 
 		 119 aa  56.2  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.845551  decreased coverage  0.00268823 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1705  Rhodanese domain protein  30.91 
 
 		 185 aa  55.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000174118 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4982  rhodanese domain-containing protein  34.07 
 
 		 127 aa  55.8  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.497826  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01624  putative phage shock protein E  27.72 
 
 		 136 aa  55.8  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5025  Rhodanese domain protein  38.61 
 
 		 107 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.569347 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13136  molybdenum cofactor biosynthesis protein moeB2  32.04 
 
 		 389 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.318899 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1392  rhodanese domain-containing protein  36.17 
 
 		 120 aa  55.1  0.0000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.100688  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1575  Rhodanese domain protein  39.56 
 
 		 119 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.34236  hitchhiker  0.0000000711999 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>