216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1388 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1388  Rhodanese domain protein  100 
 
 		 130 aa  253  6e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.267933  normal  0.0200875 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0472  Rhodanese domain protein  61.29 
 
 		 163 aa  155  2e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4874  Rhodanese domain protein  62.3 
 
 		 134 aa  150  5.9999999999999996e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1579  Rhodanese domain protein  60.98 
 
 		 131 aa  141  4e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00521027  normal  0.140987 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1689  Rhodanese domain-containing protein  55.56 
 
 		 141 aa  137  7e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.168466  normal  0.158024 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4940  Rhodanese domain protein  61.54 
 
 		 124 aa  136  1e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3082  Rhodanese domain protein  59.35 
 
 		 131 aa  135  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.689626  normal  0.0783096 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3553  rhodanese domain-containing protein  56.2 
 
 		 133 aa  130  5e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1483  rhodanese-like protein  53.91 
 
 		 140 aa  130  6e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.197506  normal  0.337603 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4982  rhodanese domain-containing protein  56.1 
 
 		 127 aa  129  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.497826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4167  rhodanese-like protein  57.38 
 
 		 124 aa  128  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4233  rhodanese domain-containing protein  57.38 
 
 		 124 aa  128  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4389  rhodanese domain-containing protein  57.38 
 
 		 124 aa  128  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2034  rhodanese domain-containing protein  56.41 
 
 		 122 aa  124  6e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.28011 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3323  Rhodanese domain protein  52.42 
 
 		 138 aa  120  6e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11084  hypothetical protein  55.73 
 
 		 131 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.7245e-55  normal  0.140954 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4683  rhodanese domain-containing protein  52.99 
 
 		 122 aa  118  3e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0692547  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4148  cysteine dioxygenase type I  54.46 
 
 		 294 aa  117  7.999999999999999e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6069  Rhodanese domain protein  60 
 
 		 204 aa  106  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.180105  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3899  rhodanese domain-containing protein  40.17 
 
 		 129 aa  81.6  0.000000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.485004 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2125  rhodanese-like protein  37.19 
 
 		 141 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.949088  normal  0.0126023 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3458  rhodanese-like protein  35.77 
 
 		 140 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.204377  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46930  Rhodanese-domain protein  35.94 
 
 		 126 aa  74.7  0.0000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.322809  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0291  Rhodanese domain protein  36.7 
 
 		 125 aa  74.3  0.0000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.49635 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6071  putative rhodanese-related sulfurtransferase  33.33 
 
 		 131 aa  73.9  0.0000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1914  rhodanese-like protein  33.87 
 
 		 141 aa  72.8  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0674986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6257  hypothetical protein  37.19 
 
 		 137 aa  73.2  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.760302 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0934  Rhodanese domain protein  39.58 
 
 		 143 aa  73.2  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.20591  normal  0.0292515 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4134  Rhodanese domain protein  31.71 
 
 		 138 aa  71.6  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.64767  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2917  rhodanese-like protein  34.71 
 
 		 137 aa  70.1  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3836  rhodanese-like protein  34.75 
 
 		 140 aa  68.9  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2504  Rhodanese domain-containing protein  33.88 
 
 		 134 aa  67.8  0.00000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1981  rhodanese-like protein  39.45 
 
 		 140 aa  67.4  0.00000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.726838  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0272  hypothetical protein  40.62 
 
 		 141 aa  67  0.00000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4291  rhodanese-like protein  29.6 
 
 		 130 aa  67  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.144766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4950  Rhodanese domain protein  32.54 
 
 		 129 aa  66.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.369685  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4185  rhodanese-like protein  31.2 
 
 		 130 aa  66.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.522252 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2737  rhodanese domain protein  33.86 
 
 		 136 aa  66.2  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.367158  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0529  rhodanese-like domain protein  41.41 
 
 		 128 aa  65.9  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00586876  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0687  Rhodanese domain protein  41.41 
 
 		 128 aa  65.9  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000111268  hitchhiker  0.0000834379 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1160  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  39.2 
 
 		 480 aa  65.5  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.284227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2891  rhodanese domain-containing protein  35.96 
 
 		 130 aa  64.3  0.0000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.326534 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0127  rhodanese domain-containing protein  36.8 
 
 		 128 aa  63.9  0.0000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.344636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4183  rhodanese-like protein  33.9 
 
 		 140 aa  63.9  0.0000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1857  rhodanese domain-containing protein  35.35 
 
 		 136 aa  63.5  0.0000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.483436  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2834  rhodanese domain-containing protein  30.95 
 
 		 126 aa  62.4  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00175675 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1202  rhodanese-like protein  31.62 
 
 		 125 aa  62  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4620  rhodanese-like protein  34.78 
 
 		 130 aa  62  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.178094  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1816  rhodanese-like domain-containing protein  33.05 
 
 		 120 aa  61.6  0.000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.717844  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2186  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.79 
 
 		 389 aa  61.2  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0893637 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2310  rhodanese-like protein  35.96 
 
 		 127 aa  60.5  0.000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0114  Rhodanese domain protein  36.8 
 
 		 130 aa  60.5  0.000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.764117  normal  0.501583 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1901  Rhodanese domain protein  29.92 
 
 		 137 aa  60.5  0.000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2852  Rhodanese domain-containing protein  36.97 
 
 		 113 aa  60.1  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0460  rhodanese domain-containing protein  35.16 
 
 		 138 aa  59.7  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.821321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2199  rhodanese domain-containing protein  34.65 
 
 		 131 aa  59.7  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.331265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0548  hypothetical protein  34.65 
 
 		 131 aa  59.3  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.173322  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1844  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.54 
 
 		 393 aa  58.9  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1561  Rhodanese domain protein  31.15 
 
 		 136 aa  58.5  0.00000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4842  beta-lactamase-like  41 
 
 		 346 aa  58.5  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4591  rhodanese domain-containing protein  41.3 
 
 		 130 aa  58.5  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2041  rhodanese-related sulfurtransferase  30.77 
 
 		 124 aa  57.8  0.00000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2076  rhodanese-like protein  31.67 
 
 		 126 aa  58.2  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.640935  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2110  rhodanese-like protein  32.63 
 
 		 133 aa  57.8  0.00000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.972039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1239  rhodanese domain-containing protein  34.13 
 
 		 131 aa  57.8  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0881109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00932  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  36.94 
 
 		 379 aa  57.4  0.00000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06090  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  36.94 
 
 		 379 aa  57.4  0.00000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1475  rhodanese domain-containing protein  35.44 
 
 		 119 aa  57.4  0.00000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0763814  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6102  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  34.82 
 
 		 380 aa  57  0.00000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.202691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0258  Rhodanese domain protein  29.73 
 
 		 124 aa  56.2  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1936  rhodanese-like protein  29.84 
 
 		 125 aa  56.6  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.060767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0130  rhodanese-like domain-containing protein  29.67 
 
 		 124 aa  56.6  0.0000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000130588  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2537  rhodanese-like protein  35.58 
 
 		 130 aa  56.6  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4038  Rhodanese domain protein  29.84 
 
 		 125 aa  55.8  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.686364  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3913  rhodanese-like protein  36.45 
 
 		 132 aa  56.2  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.103396  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0047  rhodanese-like protein  36.7 
 
 		 139 aa  55.8  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2188  rhodanese-like protein  37.66 
 
 		 119 aa  55.8  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.845551  decreased coverage  0.00268823 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4150  Rhodanese domain protein  35.34 
 
 		 128 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.344241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0728  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  31.67 
 
 		 388 aa  54.7  0.0000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.652305  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0195  rhodanese domain-containing protein  30.47 
 
 		 136 aa  53.9  0.0000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2007  metallo-beta-lactamase family protein  41.33 
 
 		 361 aa  53.9  0.0000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2299  rhodanese-like protein  27.87 
 
 		 131 aa  53.1  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.688081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1406  rhodanese-like protein  30.63 
 
 		 119 aa  53.5  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0700677  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2632  rhodanese-like protein  36.07 
 
 		 119 aa  53.1  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.437689  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2696  rhodanese domain-containing protein  29.35 
 
 		 119 aa  53.1  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2887  rhodanese-like protein  31.52 
 
 		 119 aa  53.1  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.52776  hitchhiker  0.0000448823 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1774  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  32.43 
 
 		 386 aa  52.4  0.000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2654  hypothetical protein  29.73 
 
 		 116 aa  52.4  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.173279  normal  0.613191 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2864  Rhodanese domain-containing protein  32.29 
 
 		 143 aa  52.8  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4344  Rhodanese domain protein  29.51 
 
 		 323 aa  52.4  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.987797  normal  0.626066 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2877  rhodanese domain-containing protein  35.48 
 
 		 119 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00119575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1575  Rhodanese domain protein  35.48 
 
 		 119 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.34236  hitchhiker  0.0000000711999 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1761  rhodanese domain-containing protein  29.35 
 
 		 119 aa  52  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.043359  normal  0.0113467 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2802  rhodanese domain-containing protein  35.48 
 
 		 119 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000152908  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0333  rhodanese domain-containing protein  28.46 
 
 		 126 aa  52  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.891512  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2782  rhodanese domain-containing protein  35.48 
 
 		 119 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0245575  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1710  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  32.43 
 
 		 379 aa  52  0.000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1452  rhodanese domain-containing protein  31.71 
 
 		 119 aa  51.2  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0322334  hitchhiker  0.00868672 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  32.71 
 
 		 142 aa  51.2  0.000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2326  beta-lactamase domain-containing protein  33.7 
 
 		 467 aa  51.6  0.000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>