More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_1761 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_1761  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 		 119 aa  248  1e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.043359  normal  0.0113467 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2887  rhodanese-like protein  78.81 
 
 		 119 aa  201  2e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.52776  hitchhiker  0.0000448823 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2188  rhodanese-like protein  74.36 
 
 		 119 aa  194  3e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.845551  decreased coverage  0.00268823 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1475  rhodanese domain-containing protein  75 
 
 		 119 aa  190  5e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0763814  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1406  rhodanese-like protein  67.8 
 
 		 119 aa  181  4.0000000000000006e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0700677  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2782  rhodanese domain-containing protein  66.1 
 
 		 119 aa  172  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0245575  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1575  Rhodanese domain protein  66.1 
 
 		 119 aa  172  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.34236  hitchhiker  0.0000000711999 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2802  rhodanese domain-containing protein  66.1 
 
 		 119 aa  172  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000152908  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2877  rhodanese domain-containing protein  66.1 
 
 		 119 aa  172  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00119575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1440  rhodanese domain-containing protein  66.1 
 
 		 119 aa  167  5e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0130754  hitchhiker  0.00000490376 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1387  rhodanese domain-containing protein  65.25 
 
 		 119 aa  166  8e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00873164  hitchhiker  0.000000184443 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1452  rhodanese domain-containing protein  64.41 
 
 		 119 aa  163  5.9999999999999996e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0322334  hitchhiker  0.00868672 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2696  rhodanese domain-containing protein  62.71 
 
 		 119 aa  157  6e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4038  Rhodanese domain protein  57.85 
 
 		 125 aa  135  2e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.686364  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2041  rhodanese-related sulfurtransferase  47.5 
 
 		 124 aa  122  1e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0130  rhodanese-like domain-containing protein  46.67 
 
 		 124 aa  121  4e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000130588  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1733  hypothetical protein  43.55 
 
 		 123 aa  103  6e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1733  hypothetical protein  42.74 
 
 		 123 aa  101  3e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3438  rhodanese/sulfurtransferase-like protein  44.95 
 
 		 123 aa  101  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0258  Rhodanese domain protein  39.47 
 
 		 124 aa  83.6  8e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2654  hypothetical protein  51.32 
 
 		 116 aa  82.8  0.000000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.173279  normal  0.613191 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2186  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.43 
 
 		 389 aa  78.6  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0893637 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0728  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  40.43 
 
 		 388 aa  79.3  0.00000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.652305  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4344  Rhodanese domain protein  38.6 
 
 		 323 aa  78.6  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.987797  normal  0.626066 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0354  hypothetical protein  38.24 
 
 		 151 aa  76.3  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.842496  normal  0.122714 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3836  rhodanese-like protein  32.54 
 
 		 140 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1816  rhodanese-like domain-containing protein  39.64 
 
 		 120 aa  75.9  0.0000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.717844  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1981  rhodanese-like protein  35.65 
 
 		 140 aa  74.7  0.0000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.726838  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0229  Rhodanese domain protein  41.76 
 
 		 140 aa  74.3  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.479162  hitchhiker  0.0025446 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46930  Rhodanese-domain protein  47.44 
 
 		 126 aa  74.3  0.0000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.322809  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4183  rhodanese-like protein  33.6 
 
 		 140 aa  72.8  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2007  metallo-beta-lactamase family protein  38.1 
 
 		 361 aa  72.8  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2834  rhodanese domain-containing protein  35.96 
 
 		 126 aa  72.4  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00175675 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0210  Rhodanese domain protein  40.66 
 
 		 140 aa  72  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.158606 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1703  Rhodanese domain protein  36.46 
 
 		 167 aa  72  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000369251 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2737  rhodanese domain protein  38.1 
 
 		 136 aa  72  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.367158  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1844  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.05 
 
 		 393 aa  71.2  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1816  hypothetical protein  40.66 
 
 		 99 aa  70.5  0.000000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0687  Rhodanese domain protein  35.09 
 
 		 128 aa  70.1  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000111268  hitchhiker  0.0000834379 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0529  rhodanese-like domain protein  35.09 
 
 		 128 aa  70.1  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00586876  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2864  Rhodanese domain-containing protein  39.76 
 
 		 143 aa  69.7  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1817  hypothetical protein  39.56 
 
 		 99 aa  67.4  0.00000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6185  rhodanese-like protein  36.26 
 
 		 140 aa  67  0.00000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0447  rhodanese domain-containing protein  36.26 
 
 		 140 aa  67  0.00000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.185748  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2773  rhodanese domain-containing protein  36.26 
 
 		 140 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1901  Rhodanese domain protein  30.7 
 
 		 137 aa  66.6  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0944  rhodanese-like protein  38.33 
 
 		 133 aa  66.2  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000864682  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2911  rhodanese domain-containing protein  36.26 
 
 		 140 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2364  rhodanese-like domain protein  38.2 
 
 		 141 aa  65.9  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1167  beta-lactamase domain protein  32.04 
 
 		 470 aa  65.9  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.705193  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1997  Rhodanese domain protein  38.2 
 
 		 141 aa  65.9  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.885175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2242  rhodanese-like protein  35.16 
 
 		 140 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.98062  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2856  rhodanese domain-containing protein  35.16 
 
 		 140 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1656  Rhodanese domain protein  41.94 
 
 		 438 aa  65.1  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.613289  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  35.96 
 
 		 142 aa  65.1  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2399  rhodanese-like protein  36.67 
 
 		 138 aa  65.1  0.0000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4028  rhodanese domain-containing protein  41.18 
 
 		 110 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2867  rhodanese domain-containing protein  35.16 
 
 		 140 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2274  rhodanese-related sulfurtransferase  41.18 
 
 		 280 aa  64.7  0.0000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000200812  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0333  rhodanese domain-containing protein  36.78 
 
 		 126 aa  65.1  0.0000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.891512  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0535  Rhodanese domain protein  35.16 
 
 		 141 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2504  Rhodanese domain-containing protein  34.13 
 
 		 134 aa  64.7  0.0000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16580  Rhodanese-related sulfurtransferase  39.51 
 
 		 106 aa  63.9  0.0000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0172752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4180  putative rhodanese-related sulfurtransferase  35.16 
 
 		 141 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0383  beta-lactamase domain protein  38.55 
 
 		 471 aa  63.9  0.0000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01280  hypothetical protein  40.48 
 
 		 117 aa  63.2  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000449614  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2187  rhodanese-like protein  35.16 
 
 		 135 aa  63.2  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2632  rhodanese-like protein  44.3 
 
 		 119 aa  63.5  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.437689  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2850  Rhodanese domain-containing protein  37 
 
 		 102 aa  63.2  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2361  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain-containing protein  40.96 
 
 		 484 aa  62.4  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0105565  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2319  hydroxyacylglutathione hydrolase  40.96 
 
 		 478 aa  62.8  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.001105  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2277  hydroxyacylglutathione hydrolase  40.96 
 
 		 478 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.95304  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0222  Rhodanese domain protein  36.78 
 
 		 144 aa  62.4  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0155932  hitchhiker  0.00402111 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2552  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain protein  40.96 
 
 		 478 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08286e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3523  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.17 
 
 		 478 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2538  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain-containing protein  40.96 
 
 		 484 aa  62.4  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.343645  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0460  rhodanese domain-containing protein  30.95 
 
 		 138 aa  62.8  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.821321  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11818  conserved hypothetical rhodanese-domain protein  35.11 
 
 		 125 aa  62.4  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.799219  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1732  hydroxyacylglutathione hydrolase  40.96 
 
 		 478 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00322507 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2261  rhodanese domain-containing protein  34.91 
 
 		 279 aa  62.4  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1979  rhodanese domain-containing protein  35.2 
 
 		 134 aa  62.4  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0195  rhodanese domain-containing protein  33.9 
 
 		 136 aa  62.4  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1543  Rhodanese domain protein  30.77 
 
 		 138 aa  61.6  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.973949  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4842  beta-lactamase-like  37.35 
 
 		 346 aa  61.6  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1680  rhodanese domain-containing protein  40.48 
 
 		 154 aa  62  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2849  beta-lactamase domain-containing protein  31.37 
 
 		 480 aa  61.6  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2720  Rhodanese domain protein  39.24 
 
 		 113 aa  61.6  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000079592  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0611  rhodanese-like protein  34.83 
 
 		 141 aa  61.2  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1862  Rhodanese domain protein  31.15 
 
 		 161 aa  61.6  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.364067  normal  0.0328946 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0928  rhodanese domain-containing protein  33.7 
 
 		 128 aa  61.6  0.000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.585499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0871  rhodanese domain-containing protein  31.19 
 
 		 127 aa  61.6  0.000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.436528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1666  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  41.18 
 
 		 378 aa  61.2  0.000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.28085  normal  0.198345 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2631  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 		 480 aa  60.8  0.000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00900  Rhodanese-related sulfurtransferase  34.95 
 
 		 118 aa  60.8  0.000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4102  Rhodanese domain protein  33.72 
 
 		 138 aa  60.8  0.000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25625  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2044  Rhodanese domain protein  42.17 
 
 		 114 aa  60.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1160  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  40.24 
 
 		 480 aa  60.8  0.000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.284227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1960  rhodanese-like protein  29.51 
 
 		 155 aa  60.5  0.000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000451081  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0267  rhodanese domain-containing protein  32.97 
 
 		 161 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.968437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1199  rhodanese domain-containing protein  35.92 
 
 		 282 aa  59.7  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0177216  hitchhiker  0.00286909 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>