More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0944 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0944  rhodanese-like protein  100 
 
 		 133 aa  274  2e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000864682  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00096  Rhodanese-related sulfurtransferase  44.92 
 
 		 132 aa  93.6  9e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1979  rhodanese domain-containing protein  41.27 
 
 		 134 aa  84.3  5e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0195  rhodanese domain-containing protein  34.88 
 
 		 136 aa  82.4  0.000000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2737  rhodanese domain protein  36.51 
 
 		 136 aa  77.8  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.367158  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46930  Rhodanese-domain protein  37.29 
 
 		 126 aa  75.5  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.322809  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1981  rhodanese-like protein  42.86 
 
 		 140 aa  75.9  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.726838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3438  rhodanese/sulfurtransferase-like protein  36.44 
 
 		 123 aa  74.7  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0687  Rhodanese domain protein  40.17 
 
 		 128 aa  73.9  0.0000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000111268  hitchhiker  0.0000834379 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2007  metallo-beta-lactamase family protein  39.06 
 
 		 361 aa  74.3  0.0000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0529  rhodanese-like domain protein  40.17 
 
 		 128 aa  73.9  0.0000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00586876  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0333  rhodanese domain-containing protein  32.5 
 
 		 126 aa  72.8  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.891512  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1733  hypothetical protein  30.16 
 
 		 123 aa  70.9  0.000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2834  rhodanese domain-containing protein  34.17 
 
 		 126 aa  70.5  0.000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00175675 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1575  Rhodanese domain protein  37.6 
 
 		 119 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.34236  hitchhiker  0.0000000711999 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2802  rhodanese domain-containing protein  37.6 
 
 		 119 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000152908  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2782  rhodanese domain-containing protein  37.6 
 
 		 119 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0245575  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2877  rhodanese domain-containing protein  37.6 
 
 		 119 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00119575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2186  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.33 
 
 		 389 aa  69.7  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0893637 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1844  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.15 
 
 		 393 aa  68.9  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1733  hypothetical protein  30.16 
 
 		 123 aa  68.2  0.00000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2887  rhodanese-like protein  38.84 
 
 		 119 aa  66.6  0.00000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.52776  hitchhiker  0.0000448823 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1440  rhodanese domain-containing protein  36 
 
 		 119 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0130754  hitchhiker  0.00000490376 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1761  rhodanese domain-containing protein  38.33 
 
 		 119 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.043359  normal  0.0113467 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1287  rhodanese-like protein  34.13 
 
 		 159 aa  65.9  0.0000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4344  Rhodanese domain protein  34.11 
 
 		 323 aa  65.9  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.987797  normal  0.626066 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1387  rhodanese domain-containing protein  35.2 
 
 		 119 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00873164  hitchhiker  0.000000184443 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1452  rhodanese domain-containing protein  35.2 
 
 		 119 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0322334  hitchhiker  0.00868672 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2188  rhodanese-like protein  38.39 
 
 		 119 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.845551  decreased coverage  0.00268823 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4038  Rhodanese domain protein  35.16 
 
 		 125 aa  64.7  0.0000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.686364  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2041  rhodanese-related sulfurtransferase  36.56 
 
 		 124 aa  64.3  0.0000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0728  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  32.8 
 
 		 388 aa  64.3  0.0000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.652305  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  39.18 
 
 		 189 aa  64.3  0.0000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  35.05 
 
 		 142 aa  63.9  0.0000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2850  Rhodanese domain-containing protein  38.89 
 
 		 102 aa  63.2  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2891  rhodanese domain-containing protein  37.84 
 
 		 130 aa  63.2  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.326534 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2561  rhodanese-like protein  36.21 
 
 		 288 aa  63.2  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.900675  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0130  rhodanese-like domain-containing protein  35.48 
 
 		 124 aa  62.8  0.000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000130588  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1475  rhodanese domain-containing protein  37.17 
 
 		 119 aa  62.8  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0763814  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2504  Rhodanese domain-containing protein  33.87 
 
 		 134 aa  62.8  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0548  hypothetical protein  38.14 
 
 		 131 aa  62  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.173322  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1901  Rhodanese domain protein  31.2 
 
 		 137 aa  62.4  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  34.38 
 
 		 145 aa  61.6  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0406  rhodanese domain-containing protein  41.38 
 
 		 278 aa  62  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.932253 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2199  rhodanese domain-containing protein  38.14 
 
 		 131 aa  62  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.331265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1680  rhodanese domain-containing protein  34.43 
 
 		 154 aa  61.6  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0258  Rhodanese domain protein  33.9 
 
 		 124 aa  61.6  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1406  rhodanese-like protein  33.88 
 
 		 119 aa  60.8  0.000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0700677  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4620  rhodanese-like protein  33.33 
 
 		 130 aa  60.5  0.000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.178094  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1239  rhodanese domain-containing protein  37.89 
 
 		 131 aa  60.5  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0881109  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1816  hypothetical protein  34.38 
 
 		 99 aa  60.5  0.000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0429  uncharacterized NAD(FAD)-dependent dehydrogenase  35.58 
 
 		 820 aa  60.5  0.000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000601829  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2260  Rhodanese domain protein  39.58 
 
 		 153 aa  60.5  0.000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4185  rhodanese-like protein  31.75 
 
 		 130 aa  60.1  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.522252 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2261  rhodanese domain-containing protein  38.37 
 
 		 279 aa  59.7  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1816  rhodanese-like domain-containing protein  35.42 
 
 		 120 aa  60.1  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.717844  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  34.38 
 
 		 123 aa  60.1  0.00000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1817  hypothetical protein  36.46 
 
 		 99 aa  59.7  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2399  rhodanese-like protein  35.05 
 
 		 138 aa  59.7  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2274  rhodanese-related sulfurtransferase  31.53 
 
 		 280 aa  59.7  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000200812  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1937  rhodanese domain-containing protein  32.29 
 
 		 269 aa  59.3  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0286726  hitchhiker  0.00000000917613 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2349  Rhodanese domain protein  37.38 
 
 		 141 aa  59.3  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000398103  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3836  rhodanese-like protein  33.33 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2642  SirA family protein  37.93 
 
 		 201 aa  58.9  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.140879  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0061  Rhodanese domain protein  32.38 
 
 		 277 aa  58.9  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2086  rhodanese-like protein  33.93 
 
 		 121 aa  58.9  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01120  Rhodanese-related sulfurtransferase  40.66 
 
 		 108 aa  58.5  0.00000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5022  rhodanese domain-containing protein  33.63 
 
 		 111 aa  58.5  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635764 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2696  rhodanese domain-containing protein  37.5 
 
 		 119 aa  58.2  0.00000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1666  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  40.82 
 
 		 378 aa  57.4  0.00000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.28085  normal  0.198345 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0127  rhodanese domain-containing protein  40.48 
 
 		 128 aa  57.4  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.344636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4183  rhodanese-like protein  33.67 
 
 		 140 aa  57.4  0.00000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1960  rhodanese-like protein  31.71 
 
 		 155 aa  57  0.00000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000451081  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2890  SirA family protein  35.71 
 
 		 189 aa  57  0.00000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0203  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.2 
 
 		 375 aa  57  0.00000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.357554  normal  0.334206 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1656  Rhodanese domain protein  36.44 
 
 		 438 aa  57  0.00000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.613289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1160  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  37.17 
 
 		 480 aa  57  0.00000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.284227  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0564  Rhodanese domain protein  40.7 
 
 		 98 aa  57  0.00000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000375905  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3773  beta-lactamase-like protein  32.8 
 
 		 354 aa  57  0.00000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.957871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1649  hypothetical protein  32.29 
 
 		 173 aa  56.6  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.616423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3607  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.09 
 
 		 387 aa  56.2  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.156981  normal  0.010154 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0744  rhodanese domain-containing protein  30.77 
 
 		 133 aa  56.2  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.547874 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1202  rhodanese-like protein  29.27 
 
 		 125 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4842  beta-lactamase-like  36.17 
 
 		 346 aa  56.2  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5669  rhodanese domain-containing protein  37.11 
 
 		 113 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.192192  hitchhiker  0.00438713 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4064  rhodanese domain-containing protein  32.41 
 
 		 127 aa  55.5  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.585247  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1869  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 		 117 aa  55.5  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000584453  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2654  hypothetical protein  29.51 
 
 		 116 aa  55.5  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.173279  normal  0.613191 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2364  rhodanese-like domain protein  37.5 
 
 		 141 aa  55.5  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1997  Rhodanese domain protein  37.5 
 
 		 141 aa  55.5  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.885175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3646  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.09 
 
 		 390 aa  55.1  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0520  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  36.36 
 
 		 386 aa  55.1  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.185889  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0124  rhodanese domain-containing protein  31.36 
 
 		 159 aa  55.1  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0378  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 		 284 aa  55.1  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.656719  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3836  rhodanese domain-containing protein  34.82 
 
 		 98 aa  55.1  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3493  UBA/THIF-type NAD/FAD binding, MoeZ/MoeB fmaily protein  35.23 
 
 		 390 aa  55.5  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0114  Rhodanese domain protein  37.89 
 
 		 130 aa  55.1  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.764117  normal  0.501583 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1561  Rhodanese domain protein  31.93 
 
 		 136 aa  54.7  0.0000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4591  rhodanese domain-containing protein  32.03 
 
 		 130 aa  54.7  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2537  rhodanese-like protein  31.5 
 
 		 130 aa  55.1  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>