More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1960 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_1960  rhodanese-like protein  100 
 
 		 155 aa  321  2e-87  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000451081  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2325  Rhodanese domain protein  68.63 
 
 		 155 aa  232  1.0000000000000001e-60  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0667353  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1862  Rhodanese domain protein  62.99 
 
 		 161 aa  220  7e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.364067  normal  0.0328946 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0124  rhodanese domain-containing protein  63.4 
 
 		 159 aa  219  1.9999999999999999e-56  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0025  Rhodanese domain protein  61.18 
 
 		 157 aa  212  9.999999999999999e-55  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000045135  normal  0.0554367 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0032  rhodanese-like protein  61.69 
 
 		 157 aa  212  1.9999999999999998e-54  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000171668  normal  0.0651616 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0691  Rhodanese domain protein  58.17 
 
 		 158 aa  209  1e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0493491  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2260  Rhodanese domain protein  48.37 
 
 		 153 aa  160  5.0000000000000005e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1680  rhodanese domain-containing protein  51.64 
 
 		 154 aa  108  3e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1981  rhodanese-like protein  44.25 
 
 		 140 aa  105  2e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.726838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1901  Rhodanese domain protein  34.65 
 
 		 137 aa  105  2e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2737  rhodanese domain protein  40 
 
 		 136 aa  98.6  3e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.367158  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0529  rhodanese-like domain protein  37.19 
 
 		 128 aa  88.6  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00586876  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0687  Rhodanese domain protein  37.19 
 
 		 128 aa  88.6  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000111268  hitchhiker  0.0000834379 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1733  hypothetical protein  35.9 
 
 		 123 aa  84.3  6e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1733  hypothetical protein  35.04 
 
 		 123 aa  81.3  0.000000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1979  rhodanese domain-containing protein  35.38 
 
 		 134 aa  79  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1816  rhodanese-like domain-containing protein  34.43 
 
 		 120 aa  74.7  0.0000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.717844  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  33.66 
 
 		 123 aa  73.9  0.0000000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46930  Rhodanese-domain protein  37.01 
 
 		 126 aa  73.6  0.0000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.322809  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2041  rhodanese-related sulfurtransferase  28.69 
 
 		 124 aa  69.3  0.00000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00096  Rhodanese-related sulfurtransferase  33.33 
 
 		 132 aa  68.9  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0333  rhodanese domain-containing protein  33.63 
 
 		 126 aa  68.2  0.00000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.891512  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3735  rhodanese domain-containing protein  33.61 
 
 		 113 aa  67.8  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00254792 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0130  rhodanese-like domain-containing protein  27.87 
 
 		 124 aa  67.4  0.00000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000130588  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0258  Rhodanese domain protein  33.96 
 
 		 124 aa  67  0.00000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2007  metallo-beta-lactamase family protein  31.86 
 
 		 361 aa  66.6  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2188  rhodanese-like protein  33.6 
 
 		 119 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.845551  decreased coverage  0.00268823 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2877  rhodanese domain-containing protein  34.43 
 
 		 119 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00119575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2782  rhodanese domain-containing protein  34.43 
 
 		 119 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0245575  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1406  rhodanese-like protein  35.58 
 
 		 119 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0700677  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2802  rhodanese domain-containing protein  34.43 
 
 		 119 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000152908  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1575  Rhodanese domain protein  34.43 
 
 		 119 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.34236  hitchhiker  0.0000000711999 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0787  Rhodanese domain protein  29.57 
 
 		 154 aa  65.5  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.403999  normal  0.138616 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4344  Rhodanese domain protein  33.07 
 
 		 323 aa  65.9  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.987797  normal  0.626066 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4038  Rhodanese domain protein  32.84 
 
 		 125 aa  65.5  0.0000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.686364  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1869  rhodanese domain-containing protein  31.91 
 
 		 117 aa  65.5  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000584453  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2536  rhodanese domain-containing protein  30.53 
 
 		 145 aa  64.7  0.0000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2654  hypothetical protein  32.17 
 
 		 116 aa  64.3  0.0000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.173279  normal  0.613191 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1440  rhodanese domain-containing protein  31.97 
 
 		 119 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0130754  hitchhiker  0.00000490376 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1387  rhodanese domain-containing protein  31.97 
 
 		 119 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00873164  hitchhiker  0.000000184443 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2696  rhodanese domain-containing protein  28.69 
 
 		 119 aa  63.9  0.0000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0195  rhodanese domain-containing protein  34.78 
 
 		 136 aa  63.5  0.0000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1475  rhodanese domain-containing protein  32.79 
 
 		 119 aa  63.5  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0763814  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4697  Rhodanese domain protein  31.82 
 
 		 184 aa  63.5  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0900105 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5944  Rhodanese domain protein  34.38 
 
 		 102 aa  63.5  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0969772 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1911  rhodanese domain-containing protein  33.98 
 
 		 189 aa  62.8  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000193462  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3847  Rhodanese domain protein  33.01 
 
 		 129 aa  62.8  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.323646  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1502  rhodanese domain-containing protein  33.02 
 
 		 113 aa  62.4  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.184229  normal  0.558017 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2887  rhodanese-like protein  31.97 
 
 		 119 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.52776  hitchhiker  0.0000448823 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0548  hypothetical protein  35.14 
 
 		 131 aa  61.6  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.173322  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2632  rhodanese-like protein  35.04 
 
 		 119 aa  61.6  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.437689  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3458  Rhodanese domain protein  33.96 
 
 		 107 aa  61.2  0.000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2834  rhodanese domain-containing protein  28.68 
 
 		 126 aa  61.2  0.000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00175675 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2491  beta-lactamase-like  30.56 
 
 		 455 aa  60.8  0.000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0871  rhodanese domain-containing protein  26.89 
 
 		 127 aa  61.2  0.000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.436528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1452  rhodanese domain-containing protein  31.15 
 
 		 119 aa  61.2  0.000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0322334  hitchhiker  0.00868672 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01624  putative phage shock protein E  35.71 
 
 		 136 aa  60.8  0.000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1761  rhodanese domain-containing protein  29.51 
 
 		 119 aa  60.5  0.000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.043359  normal  0.0113467 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  37.5 
 
 		 189 aa  60.5  0.000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3083  rhodanese-like protein  35.29 
 
 		 198 aa  60.1  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2186  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.77 
 
 		 389 aa  60.1  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0893637 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2891  rhodanese domain-containing protein  30 
 
 		 130 aa  60.1  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.326534 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0533  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.33 
 
 		 568 aa  60.5  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.913571  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1287  rhodanese-like protein  28.46 
 
 		 159 aa  59.7  0.00000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0928  rhodanese domain-containing protein  31.52 
 
 		 128 aa  59.7  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.585499  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1310  rhodanese-like protein  33.68 
 
 		 135 aa  59.7  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.649013  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2199  rhodanese domain-containing protein  34.23 
 
 		 131 aa  59.3  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.331265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1844  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.11 
 
 		 393 aa  59.3  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1561  Rhodanese domain protein  29.03 
 
 		 136 aa  59.7  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0937  rhodanese domain protein  34.38 
 
 		 186 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000726035  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2642  SirA family protein  34.02 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.140879  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1202  rhodanese-like protein  36.56 
 
 		 125 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4506  rhodanese domain protein  32.61 
 
 		 186 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000693639 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4024  rhodanese domain-containing protein  36.9 
 
 		 225 aa  58.9  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.125541  normal  0.61527 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1829  rhodanese domain-containing protein  36.9 
 
 		 225 aa  58.9  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.835748  normal  0.540125 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2309  metallo-beta-lactamase family protein  30.19 
 
 		 472 aa  58.5  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2851  rhodanese domain-containing protein  31.4 
 
 		 130 aa  58.5  0.00000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.131553  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2037  Rhodanese domain protein  27.48 
 
 		 189 aa  58.2  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00546701  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0566  aminotransferase class V  33.33 
 
 		 771 aa  58.5  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1201  rhodanese domain-containing protein  29.91 
 
 		 148 aa  58.2  0.00000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.069675  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1703  Rhodanese domain protein  31.31 
 
 		 167 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000369251 
 
 
-
 
NC_002936  DET1392  rhodanese-like domain-containing protein  28.04 
 
 		 144 aa  58.2  0.00000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5402  rhodanese domain-containing protein  35.71 
 
 		 221 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.172427 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5692  rhodanese domain-containing protein  35.71 
 
 		 221 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3210  rhodanese domain-containing protein  32.26 
 
 		 142 aa  57.8  0.00000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.307395 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5313  rhodanese-like protein  35.71 
 
 		 221 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0229  Rhodanese domain protein  31.52 
 
 		 140 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.479162  hitchhiker  0.0025446 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2644  Rhodanese domain protein  32.71 
 
 		 102 aa  57.8  0.00000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00713239  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0984  rhodanese domain-containing protein  36.9 
 
 		 192 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1656  Rhodanese domain protein  31.2 
 
 		 438 aa  57.8  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.613289  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3931  Rhodanese domain protein  32.32 
 
 		 129 aa  57.8  0.00000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0175301 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0738  rhodanese domain-containing protein  34.38 
 
 		 186 aa  57.4  0.00000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0001064  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0776  rhodanese domain-containing protein  34.38 
 
 		 186 aa  57.4  0.00000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4620  rhodanese-like protein  28.95 
 
 		 130 aa  57.4  0.00000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.178094  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0157  hypothetical protein  31 
 
 		 148 aa  57.4  0.00000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4591  rhodanese domain-containing protein  33.88 
 
 		 130 aa  57.4  0.00000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0686  hypothetical protein  34.38 
 
 		 186 aa  57.4  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.745505  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3773  beta-lactamase-like protein  34.58 
 
 		 354 aa  57.4  0.00000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.957871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1642  rhodanese domain-containing protein  32.61 
 
 		 103 aa  57.4  0.00000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>