More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0222 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0222  Rhodanese domain protein  100 
 
 		 144 aa  286  9e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0155932  hitchhiker  0.00402111 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0319  Rhodanese domain protein  68.89 
 
 		 143 aa  191  2e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.104155  normal  0.0108474 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2147  Rhodanese domain protein  58.14 
 
 		 138 aa  149  2e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.486233  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7122  rhodanese domain-containing protein  50.39 
 
 		 159 aa  122  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.252303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4212  Rhodanese domain protein  40.16 
 
 		 241 aa  86.3  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.204414  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2063  rhodanese-like protein  39.1 
 
 		 144 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2642  rhodanese domain-containing protein  38.71 
 
 		 145 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.234476  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3285  Rhodanese domain protein  42.34 
 
 		 136 aa  79  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.654327  normal  0.0818449 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3657  Rhodanese domain protein  33.06 
 
 		 133 aa  79  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4736  rhodanese domain-containing protein  40 
 
 		 144 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.705468  normal  0.163303 
 
 
-
 
NC_003296  RS03114  hypothetical protein  36.28 
 
 		 133 aa  75.9  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0450436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2078  rhodanese domain-containing protein  30.65 
 
 		 132 aa  74.7  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.04221  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0872  rhodanese domain-containing protein  32.79 
 
 		 131 aa  73.9  0.0000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2472  rhodanese domain-containing protein  30.65 
 
 		 132 aa  74.3  0.0000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.86428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4402  rhodanese domain-containing protein  42.98 
 
 		 141 aa  73.2  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3032  Rhodanese domain protein  38.26 
 
 		 136 aa  72.8  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00401141  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5891  Rhodanese domain protein  38.24 
 
 		 146 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1235  rhodanese domain-containing protein  36.97 
 
 		 142 aa  71.6  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0188  hypothetical protein  38.98 
 
 		 166 aa  72  0.000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3452  rhodanese-like protein  41.23 
 
 		 139 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.647498  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4914  rhodanese domain-containing protein  41.23 
 
 		 139 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.367762  normal  0.616913 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2188  rhodanese-like protein  37.4 
 
 		 119 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.845551  decreased coverage  0.00268823 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2782  rhodanese domain-containing protein  45.45 
 
 		 119 aa  69.3  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0245575  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2877  rhodanese domain-containing protein  45.45 
 
 		 119 aa  69.3  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00119575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2802  rhodanese domain-containing protein  45.45 
 
 		 119 aa  69.3  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000152908  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2864  Rhodanese domain-containing protein  36.51 
 
 		 143 aa  70.1  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1575  Rhodanese domain protein  45.45 
 
 		 119 aa  69.3  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.34236  hitchhiker  0.0000000711999 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0777  rhodanese-like protein  39.84 
 
 		 139 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.808709  normal  0.0344492 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6431  rhodanese domain-containing protein  38.6 
 
 		 134 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.940174 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1000  putative sulfurtransferase  29.82 
 
 		 124 aa  67.8  0.00000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.308152  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1130  rhodanese-related sulfurtransferase  29.82 
 
 		 146 aa  67.8  0.00000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4425  Rhodanese domain protein  38.79 
 
 		 129 aa  67  0.00000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1475  rhodanese domain-containing protein  39.77 
 
 		 119 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0763814  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3345  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  43.01 
 
 		 562 aa  65.9  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2149  rhodanese domain protein  38.26 
 
 		 131 aa  65.5  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.262587  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1443  Rhodanese domain protein  38.54 
 
 		 112 aa  65.1  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.095571  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1733  hypothetical protein  31.86 
 
 		 123 aa  64.7  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2696  rhodanese domain-containing protein  37.5 
 
 		 119 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1844  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.41 
 
 		 393 aa  63.9  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1733  hypothetical protein  31.86 
 
 		 123 aa  64.3  0.0000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2834  rhodanese domain-containing protein  40.65 
 
 		 126 aa  63.9  0.0000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00175675 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2088  hypothetical protein  35.2 
 
 		 169 aa  63.5  0.0000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0947585  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1387  rhodanese domain-containing protein  38.2 
 
 		 119 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00873164  hitchhiker  0.000000184443 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1452  rhodanese domain-containing protein  38.2 
 
 		 119 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0322334  hitchhiker  0.00868672 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1406  rhodanese-like protein  32.52 
 
 		 119 aa  63.2  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0700677  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1761  rhodanese domain-containing protein  36.78 
 
 		 119 aa  62.4  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.043359  normal  0.0113467 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0258  Rhodanese domain protein  34.95 
 
 		 124 aa  62.4  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3698  rhodanese domain-containing protein  41.6 
 
 		 141 aa  62  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.562484  normal  0.386083 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1986  rhodanese domain-containing protein  35 
 
 		 137 aa  61.6  0.000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.22674 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1440  rhodanese domain-containing protein  36.17 
 
 		 119 aa  61.2  0.000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0130754  hitchhiker  0.00000490376 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46930  Rhodanese-domain protein  42.31 
 
 		 126 aa  60.8  0.000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.322809  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4865  rhodanese domain-containing protein  41.74 
 
 		 139 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.22928  hitchhiker  0.000154413 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4349  rhodanese domain-containing protein  41.74 
 
 		 139 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000446887 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16580  Rhodanese-related sulfurtransferase  41.77 
 
 		 106 aa  60.5  0.000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0172752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2101  ArsR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 189 aa  60.1  0.000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5372  rhodanese domain-containing protein  41.23 
 
 		 139 aa  59.3  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0673577  normal  0.0625322 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2832  rhodanese domain-containing protein  40.58 
 
 		 109 aa  59.7  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0018114 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2887  rhodanese-like protein  37.5 
 
 		 119 aa  59.7  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.52776  hitchhiker  0.0000448823 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2503  rhodanese-related sulfurtransferase  37.78 
 
 		 112 aa  58.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.314097 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2041  rhodanese-related sulfurtransferase  34.09 
 
 		 124 aa  58.5  0.00000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1122  rhodanese-like protein  32.95 
 
 		 141 aa  58.5  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0130  rhodanese-like domain-containing protein  31.87 
 
 		 124 aa  58.2  0.00000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000130588  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1867  Rhodanese domain protein  38.71 
 
 		 181 aa  58.2  0.00000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4016  thiosulfate sulfurtransferase  39.53 
 
 		 109 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2186  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.82 
 
 		 389 aa  57.8  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0893637 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0728  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  37.39 
 
 		 388 aa  58.2  0.00000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.652305  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11691  transcriptional regulator  42.55 
 
 		 218 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.393301 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0871  rhodanese domain-containing protein  26.92 
 
 		 127 aa  57.4  0.00000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.436528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2654  hypothetical protein  39.24 
 
 		 116 aa  57  0.00000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.173279  normal  0.613191 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3438  rhodanese/sulfurtransferase-like protein  31.43 
 
 		 123 aa  57  0.00000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0122  thiosulfate sulfurtransferase  37.36 
 
 		 108 aa  56.2  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  38.37 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1363  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 227 aa  56.2  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2632  rhodanese-like protein  33.94 
 
 		 119 aa  56.2  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.437689  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4038  Rhodanese domain protein  35.64 
 
 		 125 aa  56.2  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.686364  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3257  rhodanese domain-containing protein  39.77 
 
 		 541 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4330  rhodanese domain-containing protein  38.89 
 
 		 569 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.433624  normal  0.0780843 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1167  beta-lactamase domain protein  32.67 
 
 		 470 aa  55.5  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.705193  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5232  rhodanese domain-containing protein  38.64 
 
 		 535 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.216825 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0418  Rhodanese domain protein  36.05 
 
 		 112 aa  55.8  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2204  transcriptional regulator, ArsR family  37.93 
 
 		 221 aa  55.1  0.0000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.345359  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46860  thiosulfate sulfurtransferase  43.02 
 
 		 112 aa  55.5  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1761  rhodanese-like domain-containing protein  40.35 
 
 		 174 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.637912  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4106  rhodanese-like protein  38.89 
 
 		 568 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.222358  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4260  rhodanese domain-containing protein  38.89 
 
 		 568 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0054703  normal  0.340284 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2883  rhodanese domain-containing protein  33.71 
 
 		 172 aa  55.1  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.8077  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4157  rhodanese domain-containing protein  38.64 
 
 		 541 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.759508 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2592  rhodanese domain-containing protein  36.08 
 
 		 119 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.261053  normal  0.428361 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0137  rhodanese domain-containing protein  36.67 
 
 		 108 aa  54.7  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0462  ArsR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 253 aa  54.7  0.0000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3937  ArsR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 219 aa  54.3  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.364905 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4773  Rhodanese domain-containing protein  39.76 
 
 		 104 aa  54.7  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0201355  hitchhiker  0.000148861 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3684  rhodanese domain-containing protein  38.64 
 
 		 555 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3128  ArsR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 223 aa  54.3  0.0000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.141213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3913  rhodanese-like protein  35 
 
 		 132 aa  54.3  0.0000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.103396  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0061  Rhodanese domain protein  34.48 
 
 		 277 aa  53.9  0.0000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3240  regulatory protein, ArsR  37.5 
 
 		 221 aa  53.9  0.0000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.135637  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2850  Rhodanese domain-containing protein  38.37 
 
 		 102 aa  53.9  0.0000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1959  hypothetical protein  35 
 
 		 320 aa  53.9  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.247119  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0756  transcriptional regulator, ArsR family  35.87 
 
 		 222 aa  53.9  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.213263  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>