278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2642 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_2642  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 		 145 aa  300  6.000000000000001e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.234476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2063  rhodanese-like protein  64.14 
 
 		 144 aa  199  9.999999999999999e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3032  Rhodanese domain protein  60.32 
 
 		 136 aa  165  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00401141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0188  hypothetical protein  58.91 
 
 		 166 aa  158  3e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4736  rhodanese domain-containing protein  58.27 
 
 		 144 aa  155  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.705468  normal  0.163303 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0777  rhodanese-like protein  55.88 
 
 		 139 aa  156  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.808709  normal  0.0344492 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4402  rhodanese domain-containing protein  59.4 
 
 		 141 aa  154  5.0000000000000005e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2088  hypothetical protein  56.59 
 
 		 169 aa  150  5e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0947585  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3452  rhodanese-like protein  57.78 
 
 		 139 aa  149  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.647498  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4914  rhodanese domain-containing protein  57.78 
 
 		 139 aa  149  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.367762  normal  0.616913 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3285  Rhodanese domain protein  59.38 
 
 		 136 aa  149  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.654327  normal  0.0818449 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5891  Rhodanese domain protein  55.04 
 
 		 146 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2149  rhodanese domain protein  56 
 
 		 131 aa  140  5e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.262587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5372  rhodanese domain-containing protein  58.82 
 
 		 139 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0673577  normal  0.0625322 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1986  rhodanese domain-containing protein  49.25 
 
 		 137 aa  139  9.999999999999999e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.22674 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6431  rhodanese domain-containing protein  54.96 
 
 		 134 aa  138  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.940174 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4425  Rhodanese domain protein  51.18 
 
 		 129 aa  136  7.999999999999999e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3698  rhodanese domain-containing protein  56.3 
 
 		 141 aa  135  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.562484  normal  0.386083 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4349  rhodanese domain-containing protein  55.97 
 
 		 139 aa  134  4e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000446887 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4865  rhodanese domain-containing protein  58.27 
 
 		 139 aa  130  5e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.22928  hitchhiker  0.000154413 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1235  rhodanese domain-containing protein  48.12 
 
 		 142 aa  127  7.000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2213  rhodanese-like domain-containing protein  59.65 
 
 		 155 aa  124  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00171016  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0834  rhodanese-like domain-containing protein  62.86 
 
 		 155 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.974825  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0871  rhodanese domain-containing protein  62.86 
 
 		 155 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1566  rhodanese-like domain-containing protein  62.86 
 
 		 155 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0532908  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0054  rhodanese-like domain-containing protein  62.86 
 
 		 155 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0184557  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0963  rhodanese domain-containing protein  61.9 
 
 		 155 aa  123  9e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.144935  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1761  rhodanese-like domain-containing protein  50.71 
 
 		 174 aa  120  6e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.637912  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2147  Rhodanese domain protein  47.11 
 
 		 138 aa  106  1e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.486233  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0872  rhodanese domain-containing protein  38.64 
 
 		 131 aa  103  6e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03114  hypothetical protein  39.66 
 
 		 133 aa  96.3  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0450436  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4212  Rhodanese domain protein  42.16 
 
 		 241 aa  92.8  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.204414  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3657  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 		 133 aa  92  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7122  rhodanese domain-containing protein  43.65 
 
 		 159 aa  92.4  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.252303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2078  rhodanese domain-containing protein  32.56 
 
 		 132 aa  89.7  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.04221  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2472  rhodanese domain-containing protein  32.56 
 
 		 132 aa  89.4  1e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.86428  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0319  Rhodanese domain protein  40.52 
 
 		 143 aa  80.5  0.000000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.104155  normal  0.0108474 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0222  Rhodanese domain protein  38.71 
 
 		 144 aa  75.1  0.0000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0155932  hitchhiker  0.00402111 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1130  rhodanese-related sulfurtransferase  34.19 
 
 		 146 aa  65.9  0.0000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1000  putative sulfurtransferase  33.9 
 
 		 124 aa  65.5  0.0000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.308152  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2941  ArsR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 222 aa  63.9  0.0000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1363  ArsR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 227 aa  64.3  0.0000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0462  ArsR family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 253 aa  63.2  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1102  ArsR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 228 aa  63.2  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.780057  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1961  transcriptional regulator, ArsR family  33.58 
 
 		 222 aa  62  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.172252  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2101  ArsR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 189 aa  61.2  0.000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2204  transcriptional regulator, ArsR family  32.28 
 
 		 221 aa  58.9  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.345359  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0756  ArsR family transcriptional regulator  37 
 
 		 221 aa  58.9  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3468  transcriptional activator domain-containing protein  31.75 
 
 		 223 aa  58.5  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3283  ArsR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 226 aa  58.2  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11691  transcriptional regulator  35.54 
 
 		 218 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.393301 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4453  ArsR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 233 aa  57  0.00000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.9784 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0382  ArsR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 224 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1222  ArsR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 224 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2862  ArsR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 224 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2126  ArsR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 221 aa  56.2  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.436052  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0356  rhodanese domain-containing protein  36.67 
 
 		 114 aa  56.6  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0425  ArsR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 230 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1571  ArsR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 224 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.543844  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1758  ArsR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 224 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.99053  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2038  rhodanese domain-containing protein  37.93 
 
 		 124 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2179  ArsR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 124 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3438  rhodanese/sulfurtransferase-like protein  34.55 
 
 		 123 aa  55.8  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2631  Rhodanese domain protein  31.19 
 
 		 480 aa  55.1  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1278  ArsR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 231 aa  55.5  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.362007  normal  0.180316 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0075  rhodanese domain-containing protein  36.9 
 
 		 218 aa  55.1  0.0000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3128  ArsR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 223 aa  54.7  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.141213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2857  rhodanese domain-containing protein  35.77 
 
 		 173 aa  54.7  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.871228  normal  0.0137642 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2645  Rhodanese domain protein  30.36 
 
 		 147 aa  53.9  0.0000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.799  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10329  ArsR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 226 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1715  transcriptional regulator, ArsR family  34.88 
 
 		 221 aa  53.5  0.0000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0382  Rhodanese domain protein  38 
 
 		 274 aa  53.5  0.0000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0199253  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1392  rhodanese-like domain-containing protein  31.18 
 
 		 144 aa  53.1  0.000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2274  rhodanese-related sulfurtransferase  41.94 
 
 		 280 aa  53.1  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000200812  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0623  ArsR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 223 aa  53.1  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00128738 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2516  rhodanese-like domain-containing protein  32.22 
 
 		 247 aa  52.4  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.890802  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2736  ArsR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 227 aa  52.4  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.635873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  39.09 
 
 		 220 aa  52.4  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3059  rhodanese domain-containing protein  38.27 
 
 		 177 aa  52.8  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.865399  normal  0.233409 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2905  ArsR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 224 aa  51.6  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.562518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4097  ArsR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 235 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.896356  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4328  ArsR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 235 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0812017  normal  0.0670515 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0756  transcriptional regulator, ArsR family  33.7 
 
 		 222 aa  52  0.000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.213263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2184  phage shock protein E  43.75 
 
 		 129 aa  51.6  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0017776  hitchhiker  0.00888717 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4173  ArsR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 235 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.801909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0646  rhodanese domain-containing protein  31.03 
 
 		 218 aa  52  0.000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2139  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  27.82 
 
 		 386 aa  51.2  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000312689  normal  0.0185629 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2523  rhodanese-related sulfurtransferase  35.71 
 
 		 170 aa  51.2  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000271872  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3468  rhodanese domain-containing protein  34.57 
 
 		 221 aa  50.8  0.000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.572814  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0418  Rhodanese domain protein  40.23 
 
 		 112 aa  50.8  0.000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2739  ArsR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 220 aa  50.4  0.000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0533498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3240  regulatory protein, ArsR  30.28 
 
 		 221 aa  50.8  0.000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.135637  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13136  molybdenum cofactor biosynthesis protein moeB2  33.33 
 
 		 389 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.318899 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1173  rhodanese-like domain protein  31.03 
 
 		 148 aa  49.7  0.00001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3258  rhodanese domain-containing protein  32 
 
 		 226 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0833  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  33.33 
 
 		 390 aa  49.7  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2538  rhodanese domain-containing protein  34.21 
 
 		 252 aa  49.3  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0413586  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4884  rhodanese-like protein  30.23 
 
 		 137 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1201  rhodanese domain-containing protein  27.96 
 
 		 148 aa  49.3  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.069675  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5106  rhodanese domain-containing protein  31.87 
 
 		 137 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>