156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4212 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4212  Rhodanese domain protein  100 
 
 		 241 aa  483  1e-135  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.204414  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03114  hypothetical protein  60.61 
 
 		 133 aa  174  9e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0450436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2078  rhodanese domain-containing protein  58.91 
 
 		 132 aa  164  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.04221  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2472  rhodanese domain-containing protein  58.91 
 
 		 132 aa  164  1.0000000000000001e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.86428  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3657  Rhodanese domain protein  58.14 
 
 		 133 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0872  rhodanese domain-containing protein  47.37 
 
 		 131 aa  139  3e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4736  rhodanese domain-containing protein  40.91 
 
 		 144 aa  94  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.705468  normal  0.163303 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2642  rhodanese domain-containing protein  42.16 
 
 		 145 aa  92.8  4e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.234476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2063  rhodanese-like protein  37.98 
 
 		 144 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7122  rhodanese domain-containing protein  38.06 
 
 		 159 aa  90.5  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.252303  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3285  Rhodanese domain protein  40 
 
 		 136 aa  90.1  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.654327  normal  0.0818449 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3032  Rhodanese domain protein  37.17 
 
 		 136 aa  87.4  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00401141  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0777  rhodanese-like protein  39.09 
 
 		 139 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.808709  normal  0.0344492 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2147  Rhodanese domain protein  38.39 
 
 		 138 aa  84.7  0.000000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.486233  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1235  rhodanese domain-containing protein  37.86 
 
 		 142 aa  82.8  0.000000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0222  Rhodanese domain protein  40.16 
 
 		 144 aa  81.6  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0155932  hitchhiker  0.00402111 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1761  rhodanese-like domain-containing protein  43.88 
 
 		 174 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.637912  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0319  Rhodanese domain protein  42.37 
 
 		 143 aa  80.5  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.104155  normal  0.0108474 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3698  rhodanese domain-containing protein  43.43 
 
 		 141 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.562484  normal  0.386083 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6431  rhodanese domain-containing protein  35.92 
 
 		 134 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.940174 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2213  rhodanese-like domain-containing protein  42.86 
 
 		 155 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00171016  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0963  rhodanese domain-containing protein  42.86 
 
 		 155 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.144935  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0834  rhodanese-like domain-containing protein  42.86 
 
 		 155 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.974825  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3452  rhodanese-like protein  38.24 
 
 		 139 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.647498  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4914  rhodanese domain-containing protein  38.24 
 
 		 139 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.367762  normal  0.616913 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0054  rhodanese-like domain-containing protein  42.86 
 
 		 155 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0184557  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0871  rhodanese domain-containing protein  42.86 
 
 		 155 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1566  rhodanese-like domain-containing protein  42.86 
 
 		 155 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0532908  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5891  Rhodanese domain protein  34.21 
 
 		 146 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0188  hypothetical protein  37.14 
 
 		 166 aa  77.8  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2088  hypothetical protein  34.48 
 
 		 169 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0947585  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4402  rhodanese domain-containing protein  36.7 
 
 		 141 aa  74.3  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2149  rhodanese domain protein  40.2 
 
 		 131 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.262587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5372  rhodanese domain-containing protein  39.22 
 
 		 139 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0673577  normal  0.0625322 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1986  rhodanese domain-containing protein  36.52 
 
 		 137 aa  72.8  0.000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.22674 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4425  Rhodanese domain protein  36.45 
 
 		 129 aa  72  0.000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4349  rhodanese domain-containing protein  40.2 
 
 		 139 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000446887 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4865  rhodanese domain-containing protein  40.2 
 
 		 139 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.22928  hitchhiker  0.000154413 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1000  putative sulfurtransferase  31.67 
 
 		 124 aa  70.1  0.00000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.308152  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1130  rhodanese-related sulfurtransferase  31.4 
 
 		 146 aa  69.7  0.00000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0462  ArsR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 253 aa  59.3  0.00000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0589  Rhodanese domain protein  33.93 
 
 		 164 aa  58.2  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000910595 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2516  rhodanese-like domain-containing protein  33 
 
 		 247 aa  57  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.890802  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2941  ArsR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 222 aa  56.6  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0008  rhodanese-like protein  36.52 
 
 		 380 aa  56.2  0.0000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.612514 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0576  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 		 164 aa  55.8  0.0000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00003083  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1705  Rhodanese domain protein  35.19 
 
 		 185 aa  53.9  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000174118 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2538  rhodanese domain-containing protein  34.15 
 
 		 252 aa  54.3  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0413586  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0533  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.11 
 
 		 568 aa  54.3  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.913571  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3283  ArsR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 226 aa  53.1  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1715  transcriptional regulator, ArsR family  30.85 
 
 		 221 aa  52.8  0.000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2523  rhodanese-related sulfurtransferase  32.74 
 
 		 170 aa  52.8  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000271872  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1102  ArsR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 228 aa  52.8  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.780057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2883  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 		 172 aa  52.8  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.8077  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0183  transcriptional regulator, ArsR family  27.81 
 
 		 227 aa  52.4  0.000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3258  rhodanese domain-containing protein  32.17 
 
 		 226 aa  52.4  0.000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4453  ArsR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 233 aa  51.2  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.9784 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0623  ArsR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 223 aa  51.2  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00128738 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1819  Rhodanese domain protein  33.61 
 
 		 271 aa  51.2  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03109  hypothetical protein  36.84 
 
 		 92 aa  50.8  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.042332  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1363  ArsR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 227 aa  50.8  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0646  rhodanese domain-containing protein  32.67 
 
 		 218 aa  50.4  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0686  SirA family protein  36 
 
 		 194 aa  50.8  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1392  rhodanese-like domain-containing protein  30.93 
 
 		 144 aa  50.4  0.00003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0687  Rhodanese domain protein  32.03 
 
 		 128 aa  50.1  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000111268  hitchhiker  0.0000834379 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2892  rhodanese-like protein  33.68 
 
 		 377 aa  50.1  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.351885 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2736  ArsR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 227 aa  50.1  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.635873  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0529  rhodanese-like domain protein  32.03 
 
 		 128 aa  50.1  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00586876  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2629  rhodanese domain-containing protein  36.89 
 
 		 108 aa  50.4  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2204  transcriptional regulator, ArsR family  32.18 
 
 		 221 aa  49.7  0.00004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.345359  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0756  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 222 aa  48.9  0.00006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.213263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3427  ArsR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 234 aa  48.9  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.299912  normal  0.0245638 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1173  rhodanese-like domain protein  28.71 
 
 		 148 aa  48.9  0.00007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2126  ArsR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 221 aa  48.1  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.436052  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1201  rhodanese domain-containing protein  27.27 
 
 		 148 aa  48.1  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.069675  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0930  sulfur transferase, putative, selenocysteine-containing  30.19 
 
 		 423 aa  47.4  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2739  ArsR family transcriptional regulator  35 
 
 		 220 aa  47.4  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0533498  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3661  Cupin 2 conserved barrel domain protein  43.33 
 
 		 218 aa  47.4  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3468  transcriptional activator domain-containing protein  32.61 
 
 		 223 aa  47.8  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3920  rhodanese domain-containing protein  34.44 
 
 		 167 aa  47.4  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.305185  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3735  rhodanese domain-containing protein  31.25 
 
 		 113 aa  47.4  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00254792 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0701  thiosulfate sulfurtransferase GlpE  34.78 
 
 		 107 aa  47.8  0.0002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  3.6297700000000005e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0679  rhodanese-like protein  35.06 
 
 		 363 aa  47  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.117873  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0936  rhodanese-like protein  32.22 
 
 		 181 aa  46.2  0.0004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0889376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0075  rhodanese domain-containing protein  30.69 
 
 		 218 aa  46.2  0.0004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3941  Rhodanese domain protein  39.36 
 
 		 143 aa  46.2  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0334  rhodanese-like protein  36.14 
 
 		 137 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.206424  normal  0.623131 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1278  ArsR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 231 aa  46.2  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.362007  normal  0.180316 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2737  rhodanese domain protein  27.87 
 
 		 136 aa  46.2  0.0005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.367158  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11691  transcriptional regulator  30.91 
 
 		 218 aa  46.2  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.393301 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4216  rhodanese domain-containing protein  37.78 
 
 		 144 aa  46.2  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1961  transcriptional regulator, ArsR family  29.89 
 
 		 222 aa  45.8  0.0006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.172252  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0756  ArsR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 221 aa  45.4  0.0007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4464  Rhodanese domain protein  36.89 
 
 		 549 aa  45.8  0.0007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.448284 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1502  rhodanese domain-containing protein  30.09 
 
 		 113 aa  45.4  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.184229  normal  0.558017 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3128  ArsR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 223 aa  45.4  0.0007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.141213  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4598  Rhodanese domain protein  36.89 
 
 		 549 aa  45.8  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.664806  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3148  putative phage shock protein E  27.62 
 
 		 133 aa  45.4  0.0008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3468  rhodanese domain-containing protein  30.23 
 
 		 221 aa  45.4  0.0008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.572814  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10329  ArsR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 226 aa  45.4  0.0008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>