More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0679 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_0679  rhodanese-like protein  100 
 
 		 363 aa  752    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.117873  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2892  rhodanese-like protein  46.31 
 
 		 377 aa  311  1e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.351885 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2335  Rhodanese domain protein  43.08 
 
 		 432 aa  283  4.0000000000000003e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.120281  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2272  Rhodanese domain protein  31.91 
 
 		 406 aa  182  1e-44  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0930  sulfur transferase, putative, selenocysteine-containing  35.37 
 
 		 423 aa  152  1e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1861  Rhodanese domain protein  31.35 
 
 		 454 aa  147  3e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2538  rhodanese domain-containing protein  35.6 
 
 		 252 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0413586  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2516  rhodanese-like domain-containing protein  32.64 
 
 		 247 aa  119  7.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.890802  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2058  Rhodanese domain protein  27.32 
 
 		 388 aa  116  6e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3631  rhodanese-like protein  26.54 
 
 		 353 aa  109  8.000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.161268  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4136  rhodanese domain-containing protein  25.6 
 
 		 528 aa  80.5  0.00000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0398256 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1128  Rhodanese domain protein  25.18 
 
 		 529 aa  79  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.921716 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2357  Rhodanese domain protein  28.57 
 
 		 230 aa  79  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0207947  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1219  Rhodanese domain protein  24.75 
 
 		 529 aa  78.6  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.773409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3483  rhodanese domain-containing protein  25 
 
 		 545 aa  74.3  0.000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.38512  normal  0.395437 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  30.46 
 
 		 220 aa  73.6  0.000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1792  rhodanese-like domain protein  24.33 
 
 		 527 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2629  Rhodanese domain protein  28.81 
 
 		 216 aa  72  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.770931  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5232  rhodanese domain-containing protein  23.84 
 
 		 535 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.216825 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0276  rhodanese domain-containing protein  22.82 
 
 		 523 aa  70.9  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3935  rhodanese domain-containing protein  22.71 
 
 		 526 aa  70.9  0.00000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2551  rhodanese domain-containing protein  22.22 
 
 		 380 aa  67.8  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.378324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2691  rhodanese domain-containing protein  25.58 
 
 		 411 aa  67.8  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.608697  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3974  Rhodanese domain protein  23.21 
 
 		 531 aa  67  0.0000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.650632  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2684  Rhodanese domain protein  43.84 
 
 		 101 aa  66.2  0.0000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.245912  normal  0.288607 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3122  rhodanese-like protein  40 
 
 		 127 aa  66.2  0.0000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3602  rhodanese-like protein  24.09 
 
 		 527 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.717675  normal  0.234562 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1246  Rhodanese domain protein  42.86 
 
 		 130 aa  65.9  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000851542  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0928  rhodanese domain-containing protein  36.28 
 
 		 128 aa  64.7  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.585499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6932  beta-lactamase domain protein  29.94 
 
 		 470 aa  64.3  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1508  Rhodanese domain protein  24.39 
 
 		 352 aa  64.7  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.018848  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0806  rhodanese-like protein  35.04 
 
 		 173 aa  64.3  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2930  thiosulfate sulfurtransferase  22.68 
 
 		 533 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.502241 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2356  Rhodanese domain protein  40.85 
 
 		 124 aa  63.9  0.000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0218  Rhodanese domain protein  35.56 
 
 		 124 aa  63.9  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2665  rhodanese domain-containing protein  24 
 
 		 525 aa  63.5  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00593541  normal  0.301159 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4102  Rhodanese domain protein  45.16 
 
 		 138 aa  63.5  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25625  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21500  Rhodanese-like protein  23.51 
 
 		 530 aa  63.5  0.000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.960908  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3018  rhodanese-like protein  40.45 
 
 		 172 aa  63.2  0.000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00360973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2041  rhodanese-like protein  23.08 
 
 		 551 aa  63.2  0.000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0229793 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2832  rhodanese domain-containing protein  42.03 
 
 		 109 aa  63.2  0.000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0018114 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2101  ArsR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 189 aa  62.8  0.000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06606  hypothetical protein  48.15 
 
 		 116 aa  62.4  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3876  Rhodanese domain protein  22.67 
 
 		 541 aa  61.6  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0555  rhodanese domain-containing protein  37.62 
 
 		 173 aa  61.6  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.149088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3161  cystathionine beta-lyase  22.59 
 
 		 896 aa  62  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1901  Rhodanese-related sulfurtransferase-like protein  36.26 
 
 		 201 aa  61.6  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2632  rhodanese domain protein/cystathionine beta-lyase  22.48 
 
 		 931 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0811484  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5044  rhodanese-like protein  22.82 
 
 		 535 aa  61.2  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000724  phage shock protein E  46.3 
 
 		 116 aa  61.2  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4224  rhodanese domain-containing protein  32.91 
 
 		 125 aa  60.8  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5172  beta-lactamase domain protein  27.23 
 
 		 466 aa  60.5  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3684  putative sulfurtransferase (rhodanese)  45.16 
 
 		 113 aa  60.5  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0311109  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30960  Rhodanese-like protein  23.08 
 
 		 527 aa  60.1  0.00000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.621734  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2356  hypothetical protein  40.28 
 
 		 204 aa  60.5  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00137042  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1703  Rhodanese domain protein  43.4 
 
 		 167 aa  60.5  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000369251 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3847  Rhodanese domain protein  36.62 
 
 		 129 aa  60.1  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.323646  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2090  Rhodanese domain protein  42.47 
 
 		 137 aa  60.5  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.147548  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3119  beta-lactamase domain protein  29.33 
 
 		 463 aa  60.1  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1056  putative rhodanese-related sulfurtransferase  41.51 
 
 		 116 aa  59.7  0.00000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.218606  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0162  Rhodanese domain protein  53.85 
 
 		 108 aa  59.7  0.00000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.963879  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1549  Rhodanese domain protein  22.3 
 
 		 533 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.996787 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1658  Rhodanese domain protein  33.72 
 
 		 252 aa  59.7  0.00000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.329991  normal  0.217102 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1523  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  46 
 
 		 550 aa  59.3  0.00000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.861068  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1882  Rhodanese domain protein  23.02 
 
 		 739 aa  58.9  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4064  rhodanese domain-containing protein  44.23 
 
 		 127 aa  59.3  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.585247  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0504  rhodanese domain-containing protein  38.2 
 
 		 152 aa  58.9  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1751  rhodanese-like protein  21.93 
 
 		 569 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14689  normal  0.128287 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5751  beta-lactamase domain-containing protein  25.48 
 
 		 459 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.469011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1058  Rhodanese domain protein  30.43 
 
 		 178 aa  59.3  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0279298 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1559  rhodanese-like protein  46.43 
 
 		 142 aa  59.3  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0146795  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4001  rhodanese domain-containing protein  30.46 
 
 		 146 aa  59.3  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0756  ArsR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 221 aa  58.9  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0398  phage shock protein E, putative  40.98 
 
 		 118 aa  58.5  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3363  rhodanese domain-containing protein  37.33 
 
 		 146 aa  58.2  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0008  rhodanese-like protein  35.64 
 
 		 380 aa  58.5  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.612514 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2476  rhodanese domain-containing protein  49.09 
 
 		 112 aa  58.2  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000491835  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3248  rhodanese-like protein  42.65 
 
 		 288 aa  58.5  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2900  rhodanese domain-containing protein  40.38 
 
 		 127 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.423457  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0913  rhodanese-like domain protein  42.31 
 
 		 127 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.130078  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0646  rhodanese domain-containing protein  36.47 
 
 		 218 aa  58.2  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1212  rhodanese domain-containing protein  35.62 
 
 		 197 aa  58.2  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.998746  normal  0.0818549 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1715  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 221 aa  58.5  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3105  phage shock protein E  50.91 
 
 		 132 aa  57.8  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2512  rhodanese domain-containing protein  22.59 
 
 		 528 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.756013  normal  0.563035 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1199  rhodanese domain-containing protein  38.24 
 
 		 282 aa  57.8  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0177216  hitchhiker  0.00286909 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1130  putative rhodanese-like sulfur transferase  25.91 
 
 		 548 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4320  rhodanese-like domain protein  42.31 
 
 		 127 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3857  rhodanese domain-containing protein  45.16 
 
 		 135 aa  57.8  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.848576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4106  rhodanese-like protein  22.3 
 
 		 568 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.222358  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  46.15 
 
 		 189 aa  57.8  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3541  rhodanese domain-containing protein  37.33 
 
 		 147 aa  57.8  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4260  rhodanese domain-containing protein  22.3 
 
 		 568 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0054703  normal  0.340284 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2883  rhodanese domain-containing protein  37.5 
 
 		 172 aa  57.8  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.8077  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2890  SirA family protein  52 
 
 		 189 aa  57.8  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2631  Rhodanese domain protein  27.03 
 
 		 480 aa  57.4  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5775  rhodanese domain-containing protein  23.1 
 
 		 774 aa  57.4  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116988 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0039  rhodanese domain-containing protein  45.16 
 
 		 135 aa  57.4  0.0000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.861184  normal  0.831321 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0267  beta-lactamase domain protein  27.46 
 
 		 484 aa  57.4  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.30409  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1733  hypothetical protein  32.26 
 
 		 123 aa  57  0.0000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>