211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1658 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1658  Rhodanese domain protein  100 
 
 
252 aa  520  1e-147  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.329991  normal  0.217102 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2645  Rhodanese domain protein  43.59 
 
 
147 aa  106  3e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.799  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0505  rhodanese-like domain-containing protein  38.84 
 
 
169 aa  90.9  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3018  rhodanese-like protein  36.89 
 
 
172 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00360973  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3920  rhodanese domain-containing protein  35.85 
 
 
167 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.305185  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0589  Rhodanese domain protein  36.44 
 
 
164 aa  79.7  0.00000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000910595 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0576  Rhodanese domain protein  35.59 
 
 
164 aa  80.1  0.00000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00003083  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0382  Rhodanese domain protein  32.76 
 
 
274 aa  74.7  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0199253  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2883  rhodanese domain-containing protein  33.59 
 
 
172 aa  74.3  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.8077  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1513  cyclic nucleotide-binding protein  35.24 
 
 
308 aa  69.7  0.00000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00604424  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2523  rhodanese-related sulfurtransferase  30.63 
 
 
170 aa  69.3  0.00000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000271872  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3059  rhodanese domain-containing protein  31.73 
 
 
177 aa  66.2  0.0000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.865399  normal  0.233409 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2516  rhodanese-like domain-containing protein  35.42 
 
 
247 aa  65.1  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.890802  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2538  rhodanese domain-containing protein  31.03 
 
 
252 aa  65.1  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0413586  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2335  Rhodanese domain protein  35.16 
 
 
432 aa  62.4  0.000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.120281  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4773  Rhodanese domain-containing protein  34.09 
 
 
104 aa  62  0.000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0201355  hitchhiker  0.000148861 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0679  rhodanese-like protein  33.72 
 
 
363 aa  60.5  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.117873  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2272  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 
406 aa  60.1  0.00000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2941  ArsR family transcriptional regulator  30.56 
 
 
222 aa  59.3  0.00000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1443  Rhodanese domain protein  31.82 
 
 
112 aa  58.2  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.095571  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2503  rhodanese-related sulfurtransferase  31.46 
 
 
112 aa  57  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.314097 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2892  rhodanese-like protein  35.23 
 
 
377 aa  57  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.351885 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0713  rhodanese domain-containing protein  29.36 
 
 
142 aa  56.6  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1705  Rhodanese domain protein  33.64 
 
 
185 aa  57  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000174118 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2631  Rhodanese domain protein  26.77 
 
 
480 aa  55.8  0.0000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1559  rhodanese-like protein  25.66 
 
 
142 aa  55.5  0.0000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0146795  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2849  beta-lactamase domain-containing protein  27.1 
 
 
480 aa  54.7  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0333  rhodanese domain-containing protein  28.3 
 
 
126 aa  55.1  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.891512  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0806  rhodanese-like protein  31.71 
 
 
173 aa  54.7  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2864  Rhodanese domain-containing protein  32.04 
 
 
143 aa  54.3  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1989  Rhodanese domain protein  32.98 
 
 
273 aa  53.5  0.000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.576744  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1392  rhodanese-like domain-containing protein  30.4 
 
 
144 aa  53.5  0.000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2834  rhodanese domain-containing protein  27.93 
 
 
126 aa  52.8  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00175675 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0737  rhodanese domain-containing protein  33.91 
 
 
144 aa  52.4  0.000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.109302  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0088  rhodanese domain-containing protein  36.14 
 
 
153 aa  51.6  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00487418 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2792  YceI family protein  27.83 
 
 
314 aa  50.4  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0418  Rhodanese domain protein  22.47 
 
 
112 aa  51.2  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1937  rhodanese domain-containing protein  26.06 
 
 
269 aa  50.8  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0286726  hitchhiker  0.00000000917613 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1201  rhodanese domain-containing protein  29.09 
 
 
148 aa  50.1  0.00003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.069675  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1677  Rhodanese domain protein  27.59 
 
 
174 aa  50.4  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1861  Rhodanese domain protein  32.94 
 
 
454 aa  50.1  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0319  Rhodanese domain protein  29.17 
 
 
143 aa  50.1  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.104155  normal  0.0108474 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0930  sulfur transferase, putative, selenocysteine-containing  29.21 
 
 
423 aa  49.7  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0008  rhodanese-like protein  29.77 
 
 
380 aa  49.7  0.00005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.612514 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  24.65 
 
 
145 aa  49.7  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0447  rhodanese domain-containing protein  24.27 
 
 
140 aa  49.7  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.185748  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1173  rhodanese-like domain protein  29.46 
 
 
148 aa  49.3  0.00006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1058  Rhodanese domain protein  30.36 
 
 
178 aa  48.9  0.00007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0279298 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1649  hypothetical protein  30.09 
 
 
173 aa  49.3  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.616423  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2041  rhodanese-related sulfurtransferase  28.7 
 
 
124 aa  48.9  0.00008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2570  rhodanese domain-containing protein  25.23 
 
 
151 aa  48.9  0.00008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0116994 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3468  transcriptional activator domain-containing protein  24.27 
 
 
223 aa  48.9  0.00008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3876  rhodanese domain-containing protein  24.11 
 
 
147 aa  48.1  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0354  Rhodanese domain protein  31.37 
 
 
103 aa  48.5  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00605821  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1475  rhodanese domain-containing protein  24.59 
 
 
119 aa  48.1  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0763814  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2911  rhodanese domain-containing protein  24.27 
 
 
140 aa  48.1  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2773  rhodanese domain-containing protein  24.27 
 
 
140 aa  48.1  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1961  transcriptional regulator, ArsR family  24.3 
 
 
222 aa  47.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.172252  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0611  rhodanese-like protein  25.96 
 
 
141 aa  47.4  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4842  beta-lactamase-like  27.22 
 
 
346 aa  47.8  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2242  rhodanese-like protein  24.27 
 
 
140 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.98062  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2856  rhodanese domain-containing protein  24.27 
 
 
140 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0871  rhodanese domain-containing protein  30.85 
 
 
127 aa  47.4  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.436528  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2867  rhodanese domain-containing protein  24.27 
 
 
140 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0787  Rhodanese domain protein  29.23 
 
 
154 aa  47  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.403999  normal  0.138616 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2058  Rhodanese domain protein  31 
 
 
388 aa  47  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  29.91 
 
 
220 aa  47  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2186  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  28.57 
 
 
389 aa  47  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0893637 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1543  Rhodanese domain protein  31.18 
 
 
138 aa  47  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.973949  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0130  rhodanese-like domain-containing protein  27.83 
 
 
124 aa  47.4  0.0003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000130588  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1280  rhodanese-like protein  30.34 
 
 
170 aa  47  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.678095 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0555  rhodanese domain-containing protein  32.98 
 
 
173 aa  47  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.149088  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1363  ArsR family transcriptional regulator  24.07 
 
 
227 aa  47  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2261  sulfurtransferase  24.81 
 
 
271 aa  47  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1130  rhodanese-related sulfurtransferase  26.06 
 
 
146 aa  47  0.0003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0931  rhodanese-like domain-containing protein  29.79 
 
 
301 aa  46.6  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2063  rhodanese-like protein  27.91 
 
 
144 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6185  rhodanese-like protein  23.3 
 
 
140 aa  46.6  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0678  rhodanese-like protein  25.26 
 
 
401 aa  46.6  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.622569  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4001  rhodanese domain-containing protein  25 
 
 
146 aa  46.6  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0756  ArsR family transcriptional regulator  26.14 
 
 
221 aa  46.6  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2261  rhodanese domain-containing protein  29.41 
 
 
279 aa  46.6  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0490  rhodanese domain-containing protein  24.11 
 
 
147 aa  46.6  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2642  rhodanese domain-containing protein  28.89 
 
 
145 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.234476  normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3468  rhodanese domain-containing protein  25 
 
 
221 aa  46.6  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.572814  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4614  Rhodanese domain protein  34.02 
 
 
129 aa  46.2  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0480272  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2472  rhodanese domain-containing protein  32.97 
 
 
132 aa  46.2  0.0005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.86428  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2078  rhodanese domain-containing protein  32.97 
 
 
132 aa  46.2  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.04221  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4390  rhodanese domain-containing protein  28.04 
 
 
141 aa  45.8  0.0006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3541  rhodanese domain-containing protein  24.11 
 
 
147 aa  46.2  0.0006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0535  Rhodanese domain protein  26.21 
 
 
141 aa  45.8  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3363  rhodanese domain-containing protein  23.58 
 
 
146 aa  46.2  0.0006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2007  metallo-beta-lactamase family protein  24.51 
 
 
361 aa  45.8  0.0007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1502  rhodanese domain-containing protein  26.92 
 
 
113 aa  45.8  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.184229  normal  0.558017 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3199  hypothetical protein  30 
 
 
146 aa  45.8  0.0007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000000504945  unclonable  0.00000352479 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1406  rhodanese-like protein  23.97 
 
 
119 aa  45.8  0.0007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0700677  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3448  PE-PGRS family protein  30 
 
 
146 aa  45.8  0.0007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1819  Rhodanese domain protein  29.06 
 
 
271 aa  45.4  0.0008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2044  Rhodanese domain protein  27.62 
 
 
114 aa  45.4  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1440  Rhodanese domain protein  26.92 
 
 
171 aa  45.4  0.0008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000930131  normal  0.141829 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>