243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3483 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_3483  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 		 545 aa  1101    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.38512  normal  0.395437 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2512  rhodanese domain-containing protein  45.3 
 
 		 528 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.756013  normal  0.563035 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30960  Rhodanese-like protein  44.57 
 
 		 527 aa  389  1e-107  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.621734  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5044  rhodanese-like protein  43.61 
 
 		 535 aa  386  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2665  rhodanese domain-containing protein  44.16 
 
 		 525 aa  387  1e-106  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00593541  normal  0.301159 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1882  Rhodanese domain protein  45.27 
 
 		 739 aa  387  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1792  rhodanese-like domain protein  42.53 
 
 		 527 aa  383  1e-105  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3602  rhodanese-like protein  42.72 
 
 		 527 aa  384  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.717675  normal  0.234562 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5775  rhodanese domain-containing protein  44.83 
 
 		 774 aa  379  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116988 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2410  rhodanese-like domain-containing protein  45.58 
 
 		 555 aa  379  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30430  thiosulfate sulfurtransferase  45.38 
 
 		 527 aa  376  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2041  rhodanese-like protein  43.32 
 
 		 551 aa  372  1e-101  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0229793 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2215  rhodanese-like protein  42.69 
 
 		 532 aa  365  1e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0664029  normal  0.444844 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4464  Rhodanese domain protein  43.52 
 
 		 549 aa  364  2e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.448284 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4598  Rhodanese domain protein  43.52 
 
 		 549 aa  364  2e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.664806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4157  rhodanese domain-containing protein  43.38 
 
 		 541 aa  362  1e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.759508 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21500  Rhodanese-like protein  42.83 
 
 		 530 aa  361  2e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.960908  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3684  rhodanese domain-containing protein  42.99 
 
 		 555 aa  359  6e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1219  Rhodanese domain protein  43.65 
 
 		 529 aa  356  6.999999999999999e-97  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.773409  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2632  rhodanese domain protein/cystathionine beta-lyase  40.87 
 
 		 931 aa  354  2e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0811484  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0276  rhodanese domain-containing protein  43.12 
 
 		 523 aa  353  5e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2158  putative thiosulfate sulfurtransferase  43.15 
 
 		 539 aa  352  8e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.766439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1549  Rhodanese domain protein  41.62 
 
 		 533 aa  352  1e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.996787 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5232  rhodanese domain-containing protein  41.65 
 
 		 535 aa  350  4e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.216825 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3876  Rhodanese domain protein  43.51 
 
 		 541 aa  349  6e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4106  rhodanese-like protein  42.61 
 
 		 568 aa  347  3e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.222358  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4260  rhodanese domain-containing protein  42.61 
 
 		 568 aa  347  3e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0054703  normal  0.340284 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1128  Rhodanese domain protein  42.88 
 
 		 529 aa  347  4e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.921716 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2930  thiosulfate sulfurtransferase  41.25 
 
 		 533 aa  346  7e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.502241 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1751  rhodanese-like protein  41.97 
 
 		 569 aa  345  1e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14689  normal  0.128287 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3257  rhodanese domain-containing protein  42.61 
 
 		 541 aa  345  1e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1350  rhodanese domain-containing protein  41 
 
 		 528 aa  343  5.999999999999999e-93  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.803854  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4330  rhodanese domain-containing protein  43.02 
 
 		 569 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.433624  normal  0.0780843 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2405  rhodanese-like domain-containing protein  42.26 
 
 		 538 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4136  rhodanese domain-containing protein  40.68 
 
 		 528 aa  330  6e-89  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0398256 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3161  cystathionine beta-lyase  41.1 
 
 		 896 aa  325  1e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3935  rhodanese domain-containing protein  37.81 
 
 		 526 aa  321  1.9999999999999998e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1130  putative rhodanese-like sulfur transferase  38.66 
 
 		 548 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3974  Rhodanese domain protein  40 
 
 		 531 aa  310  4e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.650632  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2691  rhodanese domain-containing protein  45.4 
 
 		 411 aa  276  9e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.608697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1373  Rhodanese domain protein  33.83 
 
 		 521 aa  236  7e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2551  rhodanese domain-containing protein  40.59 
 
 		 380 aa  229  8e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.378324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2586  putative thiosulfate sulfurtransferase  39.76 
 
 		 361 aa  203  8e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.721613  normal  0.12101 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4338  Rhodanese-like protein sulfurtransferase  31.65 
 
 		 549 aa  192  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0679  rhodanese-like protein  25 
 
 		 363 aa  76.3  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.117873  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2516  rhodanese-like domain-containing protein  24.15 
 
 		 247 aa  66.2  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.890802  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2892  rhodanese-like protein  24.18 
 
 		 377 aa  65.1  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.351885 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1861  Rhodanese domain protein  23.48 
 
 		 454 aa  63.5  0.000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2629  Rhodanese domain protein  26.98 
 
 		 216 aa  62  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.770931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2335  Rhodanese domain protein  22.16 
 
 		 432 aa  60.5  0.00000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.120281  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  28.29 
 
 		 220 aa  60.5  0.00000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2272  Rhodanese domain protein  22.78 
 
 		 406 aa  59.7  0.0000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3165  rhodanese domain-containing protein  34.48 
 
 		 138 aa  59.7  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0680  rhodanese domain-containing protein  31.06 
 
 		 265 aa  58.9  0.0000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2538  rhodanese domain-containing protein  22.8 
 
 		 252 aa  58.5  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0413586  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0047  beta-lactamase domain protein  25.46 
 
 		 466 aa  57.8  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1826  beta-lactamase-like protein  28.5 
 
 		 457 aa  57.4  0.0000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2631  Rhodanese domain protein  29.9 
 
 		 480 aa  57  0.0000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1619  beta-lactamase-like protein  30.88 
 
 		 479 aa  55.1  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000199695  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2007  metallo-beta-lactamase family protein  32.98 
 
 		 361 aa  54.3  0.000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0417  Rhodanese domain protein  40.48 
 
 		 166 aa  54.7  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.678691 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1844  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.89 
 
 		 393 aa  54.7  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2737  rhodanese domain protein  29.82 
 
 		 136 aa  53.9  0.000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.367158  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46930  Rhodanese-domain protein  39.77 
 
 		 126 aa  53.9  0.000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.322809  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0513  beta-lactamase domain-containing protein  31.85 
 
 		 617 aa  53.9  0.000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0930  sulfur transferase, putative, selenocysteine-containing  25 
 
 		 423 aa  53.5  0.000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3523  hydroxyacylglutathione hydrolase  23.04 
 
 		 478 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0229  Rhodanese domain protein  35.23 
 
 		 140 aa  52.8  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.479162  hitchhiker  0.0025446 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4842  beta-lactamase-like  34.58 
 
 		 346 aa  53.1  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0738  rhodanese domain-containing protein  30.93 
 
 		 186 aa  52.4  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0001064  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3931  Rhodanese domain protein  34.74 
 
 		 129 aa  52.4  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0175301 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0776  rhodanese domain-containing protein  30.93 
 
 		 186 aa  52.4  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1246  Rhodanese domain protein  31.73 
 
 		 130 aa  52.8  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000851542  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4024  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 		 225 aa  52  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.125541  normal  0.61527 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0032  rhodanese-like protein  27.62 
 
 		 248 aa  52  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2913  beta-lactamase domain protein  21.37 
 
 		 469 aa  52  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1829  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 		 225 aa  52  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.835748  normal  0.540125 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0928  rhodanese domain-containing protein  37.21 
 
 		 128 aa  51.6  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.585499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2834  rhodanese domain-containing protein  40.45 
 
 		 126 aa  52  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00175675 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0447  rhodanese domain-containing protein  32.99 
 
 		 140 aa  51.6  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.185748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0744  rhodanese domain-containing protein  32.67 
 
 		 133 aa  51.6  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.547874 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2849  beta-lactamase domain-containing protein  25.12 
 
 		 480 aa  51.6  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0984  rhodanese domain-containing protein  35.29 
 
 		 192 aa  51.2  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4376  rhodanese domain-containing protein  34.82 
 
 		 301 aa  51.2  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  29.17 
 
 		 123 aa  50.8  0.00006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0672  hypothetical protein  29.9 
 
 		 186 aa  50.8  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00074605  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2041  rhodanese-related sulfurtransferase  25.51 
 
 		 124 aa  50.8  0.00006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2260  Rhodanese domain protein  35.87 
 
 		 153 aa  50.8  0.00006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1215  beta-lactamase domain-containing protein  27.5 
 
 		 460 aa  50.4  0.00007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0173274 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3847  Rhodanese domain protein  33.68 
 
 		 129 aa  50.4  0.00007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.323646  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3735  rhodanese domain-containing protein  32.67 
 
 		 113 aa  50.4  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00254792 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4102  Rhodanese domain protein  34.88 
 
 		 138 aa  50.4  0.00008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25625  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0795  rhodanese-like domain-containing protein  34.31 
 
 		 102 aa  50.1  0.00009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1287  rhodanese-like protein  29.46 
 
 		 159 aa  50.4  0.00009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2570  rhodanese domain-containing protein  30.97 
 
 		 151 aa  50.4  0.00009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0116994 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1642  rhodanese domain-containing protein  31 
 
 		 103 aa  49.7  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4390  rhodanese domain-containing protein  34.34 
 
 		 141 aa  49.7  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0495  hypothetical protein  35.42 
 
 		 132 aa  50.1  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2058  Rhodanese domain protein  20.27 
 
 		 388 aa  50.1  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5692  rhodanese domain-containing protein  31.37 
 
 		 221 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>