198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2215 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_30960  Rhodanese-like protein  68.59 
 
 		 527 aa  694    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.621734  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1792  rhodanese-like domain protein  64.2 
 
 		 527 aa  645    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1549  Rhodanese domain protein  64.06 
 
 		 533 aa  645    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.996787 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3602  rhodanese-like protein  64.22 
 
 		 527 aa  652    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.717675  normal  0.234562 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3257  rhodanese domain-containing protein  73.22 
 
 		 541 aa  734    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5044  rhodanese-like protein  80.38 
 
 		 535 aa  840    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3876  Rhodanese domain protein  71.14 
 
 		 541 aa  727    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1751  rhodanese-like protein  74.06 
 
 		 569 aa  738    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14689  normal  0.128287 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4157  rhodanese domain-containing protein  73.07 
 
 		 541 aa  751    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.759508 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2512  rhodanese domain-containing protein  66.23 
 
 		 528 aa  662    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.756013  normal  0.563035 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2215  rhodanese-like protein  100 
 
 		 532 aa  1066    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0664029  normal  0.444844 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4106  rhodanese-like protein  73.6 
 
 		 568 aa  738    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.222358  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4464  Rhodanese domain protein  73.52 
 
 		 549 aa  745    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.448284 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3684  rhodanese domain-containing protein  73.26 
 
 		 555 aa  750    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30430  thiosulfate sulfurtransferase  67.19 
 
 		 527 aa  646    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4260  rhodanese domain-containing protein  73.6 
 
 		 568 aa  738    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0054703  normal  0.340284 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4598  Rhodanese domain protein  73.52 
 
 		 549 aa  745    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.664806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4330  rhodanese domain-containing protein  73.27 
 
 		 569 aa  727    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.433624  normal  0.0780843 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2930  thiosulfate sulfurtransferase  63.13 
 
 		 533 aa  624  1e-177  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.502241 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5232  rhodanese domain-containing protein  59.4 
 
 		 535 aa  595  1e-169  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.216825 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1350  rhodanese domain-containing protein  59.06 
 
 		 528 aa  590  1e-167  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.803854  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2665  rhodanese domain-containing protein  59.58 
 
 		 525 aa  564  1.0000000000000001e-159  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00593541  normal  0.301159 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2158  putative thiosulfate sulfurtransferase  48.42 
 
 		 539 aa  427  1e-118  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.766439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2691  rhodanese domain-containing protein  61.56 
 
 		 411 aa  427  1e-118  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.608697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5775  rhodanese domain-containing protein  46.55 
 
 		 774 aa  400  9.999999999999999e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116988 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1882  Rhodanese domain protein  44.07 
 
 		 739 aa  379  1e-104  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2041  rhodanese-like protein  44.38 
 
 		 551 aa  365  1e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0229793 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3483  rhodanese domain-containing protein  42.69 
 
 		 545 aa  355  1e-96  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.38512  normal  0.395437 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1128  Rhodanese domain protein  43.86 
 
 		 529 aa  343  5.999999999999999e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.921716 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1219  Rhodanese domain protein  42.94 
 
 		 529 aa  340  4e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.773409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2410  rhodanese-like domain-containing protein  42.45 
 
 		 555 aa  333  6e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2632  rhodanese domain protein/cystathionine beta-lyase  41.44 
 
 		 931 aa  327  3e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0811484  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2405  rhodanese-like domain-containing protein  41.28 
 
 		 538 aa  324  2e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21500  Rhodanese-like protein  41.94 
 
 		 530 aa  325  2e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.960908  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3974  Rhodanese domain protein  42.3 
 
 		 531 aa  322  7e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.650632  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1130  putative rhodanese-like sulfur transferase  40.75 
 
 		 548 aa  320  5e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4136  rhodanese domain-containing protein  41.94 
 
 		 528 aa  320  5e-86  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0398256 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0276  rhodanese domain-containing protein  39.63 
 
 		 523 aa  319  1e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3161  cystathionine beta-lyase  39.58 
 
 		 896 aa  292  1e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3935  rhodanese domain-containing protein  36.66 
 
 		 526 aa  291  2e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2551  rhodanese domain-containing protein  38.83 
 
 		 380 aa  231  2e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.378324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2586  putative thiosulfate sulfurtransferase  41.16 
 
 		 361 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.721613  normal  0.12101 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1373  Rhodanese domain protein  35.89 
 
 		 521 aa  212  1e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4338  Rhodanese-like protein sulfurtransferase  30.31 
 
 		 549 aa  147  6e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2516  rhodanese-like domain-containing protein  25.88 
 
 		 247 aa  71.6  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.890802  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2629  Rhodanese domain protein  28.28 
 
 		 216 aa  67.8  0.0000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.770931  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0680  rhodanese domain-containing protein  29.88 
 
 		 265 aa  67.4  0.0000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2335  Rhodanese domain protein  27.42 
 
 		 432 aa  65.1  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.120281  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  30.32 
 
 		 220 aa  64.3  0.000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2186  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40 
 
 		 389 aa  57.8  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0893637 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0513  beta-lactamase domain-containing protein  26.39 
 
 		 617 aa  56.6  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2632  rhodanese-like protein  40.21 
 
 		 119 aa  55.8  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.437689  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2834  rhodanese domain-containing protein  39.33 
 
 		 126 aa  55.1  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00175675 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2629  rhodanese domain-containing protein  37.65 
 
 		 108 aa  53.9  0.000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2491  beta-lactamase-like  26.5 
 
 		 455 aa  53.9  0.000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1817  hypothetical protein  26.97 
 
 		 99 aa  53.5  0.000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1733  hypothetical protein  30.51 
 
 		 123 aa  52.8  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0333  rhodanese domain-containing protein  34.23 
 
 		 126 aa  53.5  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.891512  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0022  Rhodanese domain-containing protein  32.69 
 
 		 122 aa  52.4  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1502  rhodanese domain-containing protein  32.38 
 
 		 113 aa  52.4  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.184229  normal  0.558017 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1911  rhodanese domain-containing protein  32.67 
 
 		 189 aa  52.8  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000193462  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0130  rhodanese-like domain-containing protein  30.43 
 
 		 124 aa  51.6  0.00003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000130588  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1543  Rhodanese domain protein  30.91 
 
 		 138 aa  51.6  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.973949  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0535  Rhodanese domain protein  36.84 
 
 		 141 aa  51.2  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2326  beta-lactamase domain-containing protein  27.36 
 
 		 467 aa  51.2  0.00005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6102  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  34.11 
 
 		 380 aa  51.2  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.202691  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1816  rhodanese-like domain-containing protein  38.04 
 
 		 120 aa  50.8  0.00006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.717844  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0229  Rhodanese domain protein  34.69 
 
 		 140 aa  50.4  0.00007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.479162  hitchhiker  0.0025446 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2357  Rhodanese domain protein  24.17 
 
 		 230 aa  50.4  0.00008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0207947  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2913  beta-lactamase domain protein  27.14 
 
 		 469 aa  50.4  0.00008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0134  Rhodanese domain protein  31.73 
 
 		 145 aa  50.4  0.00008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.410653 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  32.67 
 
 		 123 aa  50.1  0.00009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1816  hypothetical protein  25.84 
 
 		 99 aa  50.1  0.00009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2508  rhodanese domain-containing protein  37.21 
 
 		 149 aa  50.1  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0679  rhodanese-like protein  21.4 
 
 		 363 aa  49.7  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.117873  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0417  Rhodanese domain protein  34.88 
 
 		 166 aa  50.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.678691 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3913  rhodanese-like protein  36.36 
 
 		 132 aa  49.7  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.103396  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1619  beta-lactamase-like protein  28.05 
 
 		 479 aa  50.1  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000199695  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4038  Rhodanese domain protein  29.57 
 
 		 125 aa  49.7  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.686364  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2631  Rhodanese domain protein  26.8 
 
 		 480 aa  50.1  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2475  rhodanese domain-containing protein  35.92 
 
 		 108 aa  50.1  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2309  metallo-beta-lactamase family protein  25 
 
 		 472 aa  48.9  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2272  Rhodanese domain protein  23.99 
 
 		 406 aa  48.9  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1733  hypothetical protein  28.81 
 
 		 123 aa  48.9  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0305  rhodanese-like protein  33.68 
 
 		 137 aa  48.9  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6185  rhodanese-like protein  35.56 
 
 		 140 aa  48.9  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4842  beta-lactamase-like  36.05 
 
 		 346 aa  48.9  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1183  beta-lactamase domain protein  28.57 
 
 		 476 aa  48.9  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0291229  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1183  Rhodanese domain protein  32.85 
 
 		 279 aa  49.3  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.915724  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6932  beta-lactamase domain protein  29.76 
 
 		 470 aa  49.3  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2041  rhodanese-related sulfurtransferase  29.57 
 
 		 124 aa  49.3  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1652  Rhodanese domain protein  26.26 
 
 		 137 aa  48.9  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.964264 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2867  rhodanese domain-containing protein  38.04 
 
 		 140 aa  48.5  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4180  putative rhodanese-related sulfurtransferase  36.96 
 
 		 141 aa  48.9  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04370  Rhodanese-related sulfurtransferase  34.65 
 
 		 163 aa  48.5  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00155672 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46930  Rhodanese-domain protein  39.08 
 
 		 126 aa  48.5  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.322809  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2058  Rhodanese domain protein  25.89 
 
 		 388 aa  48.5  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3128  ArsR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 223 aa  48.5  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.141213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0623  ArsR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 223 aa  48.1  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00128738 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2766  hypothetical protein  42.37 
 
 		 90 aa  48.1  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>