21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2766 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_2766  hypothetical protein  100 
 
 
90 aa  181  3e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5775  rhodanese domain-containing protein  44.44 
 
 
774 aa  48.5  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00116988 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4157  rhodanese domain-containing protein  44.07 
 
 
541 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.759508 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2215  rhodanese-like protein  42.37 
 
 
532 aa  48.1  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0664029  normal  0.444844 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5044  rhodanese-like protein  40 
 
 
535 aa  47.8  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4330  rhodanese domain-containing protein  42.37 
 
 
569 aa  47.4  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.433624  normal  0.0780843 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4260  rhodanese domain-containing protein  42.37 
 
 
568 aa  47.8  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0054703  normal  0.340284 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4106  rhodanese-like protein  42.37 
 
 
568 aa  47.8  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.222358  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1751  rhodanese-like protein  42.37 
 
 
569 aa  47.4  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14689  normal  0.128287 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5232  rhodanese domain-containing protein  40.68 
 
 
535 aa  47  0.00009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.216825 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3684  rhodanese domain-containing protein  42.37 
 
 
555 aa  46.2  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3257  rhodanese domain-containing protein  42.37 
 
 
541 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30960  Rhodanese-like protein  40.68 
 
 
527 aa  46.2  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.621734  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4464  Rhodanese domain protein  38.33 
 
 
549 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.448284 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4598  Rhodanese domain protein  38.33 
 
 
549 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.664806  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1549  Rhodanese domain protein  35.59 
 
 
533 aa  45.1  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.996787 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2512  rhodanese domain-containing protein  38.33 
 
 
528 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.756013  normal  0.563035 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2930  thiosulfate sulfurtransferase  37.29 
 
 
533 aa  42  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.502241 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1882  Rhodanese domain protein  37.1 
 
 
739 aa  42  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1792  rhodanese-like domain protein  38.98 
 
 
527 aa  40.8  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30430  thiosulfate sulfurtransferase  34.88 
 
 
527 aa  40.4  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>