226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5232 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1792  rhodanese-like domain protein  60.68 
 
 
527 aa  638    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3602  rhodanese-like protein  61.32 
 
 
527 aa  647    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.717675  normal  0.234562 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2930  thiosulfate sulfurtransferase  67.78 
 
 
533 aa  693    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.502241 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1549  Rhodanese domain protein  68.34 
 
 
533 aa  704    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.996787 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30960  Rhodanese-like protein  62.43 
 
 
527 aa  655    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.621734  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2512  rhodanese domain-containing protein  61.5 
 
 
528 aa  643    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.756013  normal  0.563035 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5232  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 
535 aa  1074    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.216825 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30430  thiosulfate sulfurtransferase  63.55 
 
 
527 aa  620  1e-176  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4157  rhodanese domain-containing protein  62.94 
 
 
541 aa  614  9.999999999999999e-175  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.759508 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5044  rhodanese-like protein  60.48 
 
 
535 aa  614  9.999999999999999e-175  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3684  rhodanese domain-containing protein  62.76 
 
 
555 aa  611  9.999999999999999e-175  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4106  rhodanese-like protein  63.77 
 
 
568 aa  601  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.222358  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4260  rhodanese domain-containing protein  63.77 
 
 
568 aa  601  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0054703  normal  0.340284 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4598  Rhodanese domain protein  61.16 
 
 
549 aa  603  1.0000000000000001e-171  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.664806  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4464  Rhodanese domain protein  61.16 
 
 
549 aa  603  1.0000000000000001e-171  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.448284 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3257  rhodanese domain-containing protein  63.22 
 
 
541 aa  595  1e-169  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4330  rhodanese domain-containing protein  63.13 
 
 
569 aa  597  1e-169  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.433624  normal  0.0780843 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1751  rhodanese-like protein  63.15 
 
 
569 aa  594  1e-168  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14689  normal  0.128287 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2215  rhodanese-like protein  59.4 
 
 
532 aa  585  1e-166  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0664029  normal  0.444844 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3876  Rhodanese domain protein  58.27 
 
 
541 aa  568  1e-161  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1350  rhodanese domain-containing protein  55.85 
 
 
528 aa  568  1e-160  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.803854  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2665  rhodanese domain-containing protein  57.39 
 
 
525 aa  562  1.0000000000000001e-159  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00593541  normal  0.301159 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2158  putative thiosulfate sulfurtransferase  50 
 
 
539 aa  438  1e-121  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.766439  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2691  rhodanese domain-containing protein  58.4 
 
 
411 aa  398  1e-109  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.608697  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1882  Rhodanese domain protein  43.84 
 
 
739 aa  375  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5775  rhodanese domain-containing protein  44.81 
 
 
774 aa  370  1e-101  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00116988 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2041  rhodanese-like protein  43.81 
 
 
551 aa  360  4e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0229793 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1128  Rhodanese domain protein  42.91 
 
 
529 aa  355  1e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.921716 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1219  Rhodanese domain protein  42.8 
 
 
529 aa  345  1e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.773409  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4136  rhodanese domain-containing protein  41.93 
 
 
528 aa  342  1e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0398256 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2410  rhodanese-like domain-containing protein  43.7 
 
 
555 aa  341  2e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0276  rhodanese domain-containing protein  41.86 
 
 
523 aa  335  1e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3483  rhodanese domain-containing protein  41.65 
 
 
545 aa  332  8e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.38512  normal  0.395437 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3974  Rhodanese domain protein  43 
 
 
531 aa  330  3e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.650632  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2405  rhodanese-like domain-containing protein  41.88 
 
 
538 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2632  rhodanese domain protein/cystathionine beta-lyase  40.5 
 
 
931 aa  323  6e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0811484  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3935  rhodanese domain-containing protein  37.08 
 
 
526 aa  315  9.999999999999999e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1130  putative rhodanese-like sulfur transferase  41.11 
 
 
548 aa  310  4e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21500  Rhodanese-like protein  40.15 
 
 
530 aa  310  5e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.960908  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3161  cystathionine beta-lyase  39.13 
 
 
896 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2551  rhodanese domain-containing protein  38.79 
 
 
380 aa  238  1e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.378324  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2586  putative thiosulfate sulfurtransferase  39.76 
 
 
361 aa  212  1e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.721613  normal  0.12101 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1373  Rhodanese domain protein  36.52 
 
 
521 aa  207  4e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4338  Rhodanese-like protein sulfurtransferase  31.73 
 
 
549 aa  173  7.999999999999999e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2516  rhodanese-like domain-containing protein  27.75 
 
 
247 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.890802  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0679  rhodanese-like protein  24.17 
 
 
363 aa  72  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.117873  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2335  Rhodanese domain protein  25.13 
 
 
432 aa  71.2  0.00000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.120281  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  29.13 
 
 
220 aa  69.7  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0680  rhodanese domain-containing protein  27.27 
 
 
265 aa  64.7  0.000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0728  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  39.33 
 
 
388 aa  60.1  0.00000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.652305  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2186  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.02 
 
 
389 aa  59.7  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0893637 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2892  rhodanese-like protein  24.26 
 
 
377 aa  58.9  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.351885 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3210  rhodanese domain-containing protein  32.94 
 
 
142 aa  59.3  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.307395 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6932  beta-lactamase domain protein  31.25 
 
 
470 aa  59.3  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2632  rhodanese-like protein  32.77 
 
 
119 aa  57.8  0.0000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.437689  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4038  Rhodanese domain protein  34.38 
 
 
125 aa  57.4  0.0000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.686364  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2877  rhodanese domain-containing protein  36.46 
 
 
119 aa  57  0.0000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00119575  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2802  rhodanese domain-containing protein  36.46 
 
 
119 aa  57  0.0000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000152908  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1575  Rhodanese domain protein  36.46 
 
 
119 aa  57  0.0000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.34236  hitchhiker  0.0000000711999 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2782  rhodanese domain-containing protein  36.46 
 
 
119 aa  57  0.0000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0245575  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1387  rhodanese domain-containing protein  35.42 
 
 
119 aa  56.6  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00873164  hitchhiker  0.000000184443 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1452  rhodanese domain-containing protein  35.42 
 
 
119 aa  56.6  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0322334  hitchhiker  0.00868672 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2309  metallo-beta-lactamase family protein  30.41 
 
 
472 aa  55.8  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4390  rhodanese domain-containing protein  32.38 
 
 
141 aa  55.5  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2058  Rhodanese domain protein  26.57 
 
 
388 aa  55.5  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0222  Rhodanese domain protein  38.64 
 
 
144 aa  55.5  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0155932  hitchhiker  0.00402111 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1440  rhodanese domain-containing protein  36.36 
 
 
119 aa  55.5  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0130754  hitchhiker  0.00000490376 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2696  rhodanese domain-containing protein  36.05 
 
 
119 aa  54.7  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2654  hypothetical protein  37.35 
 
 
116 aa  54.3  0.000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.173279  normal  0.613191 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4102  Rhodanese domain protein  35.63 
 
 
138 aa  54.3  0.000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25625  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1543  Rhodanese domain protein  34.78 
 
 
138 aa  53.9  0.000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.973949  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46930  Rhodanese-domain protein  38.82 
 
 
126 aa  53.9  0.000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.322809  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2834  rhodanese domain-containing protein  37.93 
 
 
126 aa  53.9  0.000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00175675 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0229  Rhodanese domain protein  35.48 
 
 
140 aa  53.1  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.479162  hitchhiker  0.0025446 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1817  hypothetical protein  25 
 
 
99 aa  53.5  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1733  hypothetical protein  27.97 
 
 
123 aa  53.5  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4842  beta-lactamase-like  30.43 
 
 
346 aa  53.5  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1205  rhodanese domain-containing protein  31.91 
 
 
137 aa  53.5  0.00001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252332  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1861  Rhodanese domain protein  25.82 
 
 
454 aa  53.1  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1475  rhodanese domain-containing protein  36.71 
 
 
119 aa  52.4  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0763814  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2827  Rhodanese domain protein  36.27 
 
 
135 aa  52.8  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2900  rhodanese domain-containing protein  40 
 
 
127 aa  52.8  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.423457  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1816  hypothetical protein  25 
 
 
99 aa  51.6  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2357  Rhodanese domain protein  24.31 
 
 
230 aa  52  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0207947  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2629  Rhodanese domain protein  25.13 
 
 
216 aa  52  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.770931  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2631  Rhodanese domain protein  27.12 
 
 
480 aa  52  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0513  beta-lactamase domain-containing protein  22.92 
 
 
617 aa  52  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6177  beta-lactamase domain protein  31.72 
 
 
470 aa  52  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.670762  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0333  rhodanese domain-containing protein  33.96 
 
 
126 aa  51.6  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.891512  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4064  rhodanese domain-containing protein  38.75 
 
 
127 aa  51.6  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.585247  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2007  metallo-beta-lactamase family protein  38.82 
 
 
361 aa  51.6  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4285  rhodanese-like domain-containing protein  37.5 
 
 
127 aa  51.2  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4112  rhodanese-like domain-containing protein  37.5 
 
 
127 aa  51.2  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3953  rhodanese-related sulfurtransferase  37.5 
 
 
127 aa  51.2  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3963  rhodanese-related sulfurtransferase  37.5 
 
 
127 aa  51.2  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3735  rhodanese domain-containing protein  31.53 
 
 
113 aa  51.2  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00254792 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0611  rhodanese-like protein  33.71 
 
 
141 aa  51.2  0.00005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4340  rhodanese-like domain protein  37.5 
 
 
127 aa  51.2  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4432  rhodanese-like domain-containing protein  37.5 
 
 
127 aa  51.2  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4229  rhodanese-like domain protein  37.5 
 
 
127 aa  51.2  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>