277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_30960 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_5232  rhodanese domain-containing protein  62.43 
 
 
535 aa  655    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.216825 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1792  rhodanese-like domain protein  74 
 
 
527 aa  794    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3602  rhodanese-like protein  75.14 
 
 
527 aa  806    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.717675  normal  0.234562 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30960  Rhodanese-like protein  100 
 
 
527 aa  1047    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.621734  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5044  rhodanese-like protein  68.14 
 
 
535 aa  677    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4598  Rhodanese domain protein  67.3 
 
 
549 aa  685    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.664806  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1751  rhodanese-like protein  69.16 
 
 
569 aa  680    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14689  normal  0.128287 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1350  rhodanese domain-containing protein  61.79 
 
 
528 aa  649    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.803854  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4157  rhodanese domain-containing protein  68.73 
 
 
541 aa  696    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.759508 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2930  thiosulfate sulfurtransferase  69.27 
 
 
533 aa  692    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.502241 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2215  rhodanese-like protein  68.59 
 
 
532 aa  683    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0664029  normal  0.444844 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3257  rhodanese domain-containing protein  68.97 
 
 
541 aa  681    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1549  Rhodanese domain protein  70.04 
 
 
533 aa  710    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.996787 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4106  rhodanese-like protein  69.35 
 
 
568 aa  685    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.222358  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4330  rhodanese domain-containing protein  68.97 
 
 
569 aa  682    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.433624  normal  0.0780843 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3684  rhodanese domain-containing protein  68.73 
 
 
555 aa  697    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30430  thiosulfate sulfurtransferase  79.13 
 
 
527 aa  796    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4260  rhodanese domain-containing protein  69.35 
 
 
568 aa  685    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0054703  normal  0.340284 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2512  rhodanese domain-containing protein  75.52 
 
 
528 aa  796    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.756013  normal  0.563035 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3876  Rhodanese domain protein  67.11 
 
 
541 aa  646    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4464  Rhodanese domain protein  67.3 
 
 
549 aa  685    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.448284 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2665  rhodanese domain-containing protein  60.19 
 
 
525 aa  592  1e-168  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00593541  normal  0.301159 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2158  putative thiosulfate sulfurtransferase  51.76 
 
 
539 aa  468  9.999999999999999e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.766439  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2691  rhodanese domain-containing protein  62.44 
 
 
411 aa  449  1e-125  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.608697  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5775  rhodanese domain-containing protein  47.33 
 
 
774 aa  412  1e-114  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00116988 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1882  Rhodanese domain protein  43.2 
 
 
739 aa  382  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2041  rhodanese-like protein  44.73 
 
 
551 aa  381  1e-104  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0229793 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3483  rhodanese domain-containing protein  44.57 
 
 
545 aa  374  1e-102  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.38512  normal  0.395437 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1128  Rhodanese domain protein  42.72 
 
 
529 aa  352  1e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.921716 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2410  rhodanese-like domain-containing protein  43.66 
 
 
555 aa  347  4e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1219  Rhodanese domain protein  42.3 
 
 
529 aa  345  8.999999999999999e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.773409  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2632  rhodanese domain protein/cystathionine beta-lyase  41.75 
 
 
931 aa  345  1e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0811484  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0276  rhodanese domain-containing protein  43.39 
 
 
523 aa  343  2.9999999999999997e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4136  rhodanese domain-containing protein  42.43 
 
 
528 aa  342  9e-93  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0398256 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2405  rhodanese-like domain-containing protein  42.8 
 
 
538 aa  339  9e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3974  Rhodanese domain protein  42.99 
 
 
531 aa  330  4e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.650632  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21500  Rhodanese-like protein  42 
 
 
530 aa  323  4e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.960908  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1130  putative rhodanese-like sulfur transferase  40.19 
 
 
548 aa  318  2e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3161  cystathionine beta-lyase  42.38 
 
 
896 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3935  rhodanese domain-containing protein  37.28 
 
 
526 aa  301  2e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2551  rhodanese domain-containing protein  39.7 
 
 
380 aa  253  6e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.378324  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2586  putative thiosulfate sulfurtransferase  41.14 
 
 
361 aa  237  5.0000000000000005e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.721613  normal  0.12101 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1373  Rhodanese domain protein  37.22 
 
 
521 aa  227  4e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4338  Rhodanese-like protein sulfurtransferase  30.31 
 
 
549 aa  156  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  31.78 
 
 
220 aa  74.3  0.000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0680  rhodanese domain-containing protein  29.2 
 
 
265 aa  67.4  0.0000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2335  Rhodanese domain protein  24.7 
 
 
432 aa  67  0.0000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.120281  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2629  Rhodanese domain protein  26.5 
 
 
216 aa  67  0.0000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.770931  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2516  rhodanese-like domain-containing protein  26.03 
 
 
247 aa  62.8  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.890802  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2058  Rhodanese domain protein  28.72 
 
 
388 aa  63.2  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0513  beta-lactamase domain-containing protein  23.65 
 
 
617 aa  62  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2357  Rhodanese domain protein  26.6 
 
 
230 aa  60.5  0.00000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0207947  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0679  rhodanese-like protein  23.68 
 
 
363 aa  60.1  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.117873  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1502  rhodanese domain-containing protein  35.24 
 
 
113 aa  59.7  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.184229  normal  0.558017 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2892  rhodanese-like protein  23.83 
 
 
377 aa  58.5  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.351885 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2632  rhodanese-like protein  37.37 
 
 
119 aa  57.4  0.0000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.437689  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1861  Rhodanese domain protein  26.06 
 
 
454 aa  57  0.0000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1817  hypothetical protein  25.53 
 
 
99 aa  56.2  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2654  hypothetical protein  37.35 
 
 
116 aa  56.6  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.173279  normal  0.613191 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4102  Rhodanese domain protein  34.48 
 
 
138 aa  55.1  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25625  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2858  Rhodanese domain protein  23.55 
 
 
305 aa  55.1  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2849  beta-lactamase domain-containing protein  28.44 
 
 
480 aa  54.7  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2186  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.71 
 
 
389 aa  54.7  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0893637 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2538  rhodanese domain-containing protein  22.87 
 
 
252 aa  55.1  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0413586  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1705  Rhodanese domain protein  33.67 
 
 
185 aa  55.1  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000174118 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5172  beta-lactamase domain protein  27.98 
 
 
466 aa  54.7  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1310  rhodanese-like protein  35.63 
 
 
135 aa  54.3  0.000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.649013  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2631  Rhodanese domain protein  31.82 
 
 
480 aa  54.3  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0714  putative transmembrane protein  39.08 
 
 
138 aa  53.9  0.000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.274241  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2326  beta-lactamase domain-containing protein  26.32 
 
 
467 aa  53.9  0.000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1816  rhodanese-like domain-containing protein  39.71 
 
 
120 aa  53.1  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.717844  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2041  rhodanese-related sulfurtransferase  31.11 
 
 
124 aa  52.8  0.00001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4469  rhodanese domain-containing protein  28.74 
 
 
144 aa  52.8  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00345024 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1816  hypothetical protein  24.47 
 
 
99 aa  53.1  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3847  Rhodanese domain protein  33.94 
 
 
129 aa  52.8  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.323646  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6177  beta-lactamase domain protein  30.65 
 
 
470 aa  53.5  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.670762  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3735  rhodanese domain-containing protein  33.98 
 
 
113 aa  52.8  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00254792 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0039  rhodanese domain-containing protein  34.48 
 
 
135 aa  52.8  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.861184  normal  0.831321 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4876  rhodanese domain-containing protein  27.59 
 
 
144 aa  52.4  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2729  hydrolase  33.98 
 
 
456 aa  52.8  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.252968  decreased coverage  0.0000538772 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2491  beta-lactamase-like  28.06 
 
 
455 aa  52.8  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4038  Rhodanese domain protein  30.19 
 
 
125 aa  52.8  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.686364  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1508  Rhodanese domain protein  23.23 
 
 
352 aa  52.4  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.018848  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0728  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  33.33 
 
 
388 aa  52.8  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.652305  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0218  Rhodanese domain protein  39.47 
 
 
124 aa  51.6  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2853  Rhodanese domain-containing protein  36.9 
 
 
116 aa  51.6  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1649  hypothetical protein  31.2 
 
 
173 aa  51.2  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.616423  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4180  putative rhodanese-related sulfurtransferase  32.95 
 
 
141 aa  51.2  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3931  Rhodanese domain protein  33.03 
 
 
129 aa  51.6  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0175301 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0130  rhodanese-like domain-containing protein  30 
 
 
124 aa  51.6  0.00004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000130588  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2356  Rhodanese domain protein  39.47 
 
 
124 aa  51.6  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16580  Rhodanese-related sulfurtransferase  41.03 
 
 
106 aa  51.2  0.00005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0172752  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2007  metallo-beta-lactamase family protein  37.5 
 
 
361 aa  51.2  0.00005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2187  rhodanese-like protein  35.63 
 
 
135 aa  50.8  0.00005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2508  rhodanese domain-containing protein  32.1 
 
 
149 aa  50.8  0.00006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1826  beta-lactamase-like protein  29.15 
 
 
457 aa  50.8  0.00006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3165  rhodanese domain-containing protein  32.18 
 
 
138 aa  50.8  0.00006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4064  rhodanese domain-containing protein  39.47 
 
 
127 aa  50.8  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.585247  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0447  rhodanese domain-containing protein  34.67 
 
 
140 aa  50.4  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.185748  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2644  Rhodanese domain protein  35.64 
 
 
102 aa  50.4  0.00007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00713239  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>