192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4338 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_4338  Rhodanese-like protein sulfurtransferase  100 
 
 		 549 aa  1098    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2041  rhodanese-like protein  31.56 
 
 		 551 aa  186  1.0000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0229793 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3602  rhodanese-like protein  31.21 
 
 		 527 aa  177  3e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.717675  normal  0.234562 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3483  rhodanese domain-containing protein  31.36 
 
 		 545 aa  178  3e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.38512  normal  0.395437 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1219  Rhodanese domain protein  33.13 
 
 		 529 aa  177  4e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.773409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5232  rhodanese domain-containing protein  31.98 
 
 		 535 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.216825 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1128  Rhodanese domain protein  33 
 
 		 529 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.921716 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1882  Rhodanese domain protein  31.75 
 
 		 739 aa  172  1e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3935  rhodanese domain-containing protein  28.28 
 
 		 526 aa  170  5e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2930  thiosulfate sulfurtransferase  31.44 
 
 		 533 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.502241 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2410  rhodanese-like domain-containing protein  32.8 
 
 		 555 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3684  rhodanese domain-containing protein  31.94 
 
 		 555 aa  168  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1549  Rhodanese domain protein  32.11 
 
 		 533 aa  167  4e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.996787 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4157  rhodanese domain-containing protein  31.94 
 
 		 541 aa  167  5.9999999999999996e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.759508 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5775  rhodanese domain-containing protein  32.43 
 
 		 774 aa  165  2.0000000000000002e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116988 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1792  rhodanese-like domain protein  30.37 
 
 		 527 aa  164  3e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2665  rhodanese domain-containing protein  30.37 
 
 		 525 aa  164  5.0000000000000005e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00593541  normal  0.301159 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4136  rhodanese domain-containing protein  30.66 
 
 		 528 aa  163  1e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0398256 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2512  rhodanese domain-containing protein  30.11 
 
 		 528 aa  162  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.756013  normal  0.563035 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4106  rhodanese-like protein  29.6 
 
 		 568 aa  161  3e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.222358  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4464  Rhodanese domain protein  31.75 
 
 		 549 aa  161  3e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.448284 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4260  rhodanese domain-containing protein  29.6 
 
 		 568 aa  161  3e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0054703  normal  0.340284 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4598  Rhodanese domain protein  31.75 
 
 		 549 aa  161  3e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.664806  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3876  Rhodanese domain protein  34.35 
 
 		 541 aa  160  4e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0276  rhodanese domain-containing protein  31.1 
 
 		 523 aa  160  6e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30960  Rhodanese-like protein  31.03 
 
 		 527 aa  157  4e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.621734  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1751  rhodanese-like protein  30.32 
 
 		 569 aa  157  4e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14689  normal  0.128287 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30430  thiosulfate sulfurtransferase  30.48 
 
 		 527 aa  157  6e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3257  rhodanese domain-containing protein  30.07 
 
 		 541 aa  156  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2405  rhodanese-like domain-containing protein  30.74 
 
 		 538 aa  155  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3974  Rhodanese domain protein  31.22 
 
 		 531 aa  155  2.9999999999999998e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.650632  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21500  Rhodanese-like protein  31.21 
 
 		 530 aa  154  5e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.960908  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5044  rhodanese-like protein  30.16 
 
 		 535 aa  150  4e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4330  rhodanese domain-containing protein  30.29 
 
 		 569 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.433624  normal  0.0780843 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2215  rhodanese-like protein  30.55 
 
 		 532 aa  148  3e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0664029  normal  0.444844 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2632  rhodanese domain protein/cystathionine beta-lyase  28.75 
 
 		 931 aa  141  3e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0811484  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1373  Rhodanese domain protein  28.93 
 
 		 521 aa  141  3e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1130  putative rhodanese-like sulfur transferase  32.86 
 
 		 548 aa  137  5e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1350  rhodanese domain-containing protein  27.96 
 
 		 528 aa  136  9e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.803854  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3161  cystathionine beta-lyase  32.08 
 
 		 896 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2691  rhodanese domain-containing protein  29.29 
 
 		 411 aa  127  7e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.608697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2158  putative thiosulfate sulfurtransferase  29.08 
 
 		 539 aa  123  8e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.766439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2586  putative thiosulfate sulfurtransferase  30.81 
 
 		 361 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.721613  normal  0.12101 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2551  rhodanese domain-containing protein  30.59 
 
 		 380 aa  112  2.0000000000000002e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.378324  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0229  Rhodanese domain protein  41.38 
 
 		 140 aa  66.6  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.479162  hitchhiker  0.0025446 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3857  rhodanese domain-containing protein  43.02 
 
 		 135 aa  64.7  0.000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.848576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0039  rhodanese domain-containing protein  34.95 
 
 		 135 aa  63.5  0.000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.861184  normal  0.831321 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2827  Rhodanese domain protein  36.59 
 
 		 135 aa  62.4  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1122  rhodanese-like protein  36.47 
 
 		 141 aa  62  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1310  rhodanese-like protein  36.47 
 
 		 135 aa  61.2  0.00000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.649013  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0210  Rhodanese domain protein  39.08 
 
 		 140 aa  60.8  0.00000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.158606 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0928  rhodanese domain-containing protein  39.02 
 
 		 128 aa  58.9  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.585499  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4102  Rhodanese domain protein  37.8 
 
 		 138 aa  57.4  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25625  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1915  rhodanese-like protein  34.65 
 
 		 151 aa  57  0.0000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.299787 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0354  hypothetical protein  36.78 
 
 		 151 aa  56.6  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.842496  normal  0.122714 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0714  putative transmembrane protein  40.24 
 
 		 138 aa  56.6  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.274241  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2356  Rhodanese domain protein  36.47 
 
 		 124 aa  55.8  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4180  putative rhodanese-related sulfurtransferase  34.48 
 
 		 141 aa  55.5  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4320  rhodanese-like domain protein  32.14 
 
 		 127 aa  55.1  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4064  rhodanese domain-containing protein  34.15 
 
 		 127 aa  55.1  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.585247  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3515  rhodanese domain-containing protein  36.59 
 
 		 140 aa  55.1  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00152607 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0218  Rhodanese domain protein  36.47 
 
 		 124 aa  54.7  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0535  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 		 141 aa  54.3  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0913  rhodanese-like domain protein  32.14 
 
 		 127 aa  54.3  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.130078  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1543  Rhodanese domain protein  34.88 
 
 		 138 aa  53.9  0.000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.973949  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4285  rhodanese-like domain-containing protein  30.95 
 
 		 127 aa  53.5  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4112  rhodanese-like domain-containing protein  30.95 
 
 		 127 aa  53.5  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3953  rhodanese-related sulfurtransferase  30.95 
 
 		 127 aa  53.5  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3963  rhodanese-related sulfurtransferase  30.95 
 
 		 127 aa  53.5  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4340  rhodanese-like domain protein  30.95 
 
 		 127 aa  53.5  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4432  rhodanese-like domain-containing protein  30.95 
 
 		 127 aa  53.5  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4229  rhodanese-like domain protein  30.95 
 
 		 127 aa  53.5  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1814  rhodanese domain-containing protein  31.4 
 
 		 135 aa  52.8  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.315882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1911  rhodanese domain-containing protein  34.95 
 
 		 189 aa  52.4  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000193462  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2633  Rhodanese domain protein  37.21 
 
 		 123 aa  52.4  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.728751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2900  rhodanese domain-containing protein  29.76 
 
 		 127 aa  52.4  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.423457  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0267  rhodanese domain-containing protein  31.4 
 
 		 161 aa  52.4  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.968437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0305  rhodanese-like protein  32.56 
 
 		 137 aa  52  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0417  Rhodanese domain protein  34.65 
 
 		 166 aa  51.6  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.678691 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  34.88 
 
 		 142 aa  50.8  0.00006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0887  rhodanese-like protein  35.37 
 
 		 136 aa  50.8  0.00006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.726229  normal  0.333017 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2399  rhodanese-like protein  31.71 
 
 		 138 aa  50.8  0.00007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1502  rhodanese domain-containing protein  33.01 
 
 		 113 aa  50.4  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.184229  normal  0.558017 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0134  Rhodanese domain protein  31.53 
 
 		 145 aa  50.4  0.00008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.410653 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4038  Rhodanese domain protein  30.39 
 
 		 125 aa  50.4  0.00008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.686364  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  34.04 
 
 		 145 aa  50.4  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2187  rhodanese-like protein  34.88 
 
 		 135 aa  50.1  0.00009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5022  rhodanese domain-containing protein  31.31 
 
 		 111 aa  50.4  0.00009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635764 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1937  rhodanese domain-containing protein  34.04 
 
 		 269 aa  50.4  0.00009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0286726  hitchhiker  0.00000000917613 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3083  rhodanese-like protein  30 
 
 		 198 aa  50.1  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3438  rhodanese/sulfurtransferase-like protein  32.35 
 
 		 123 aa  49.7  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3833  rhodanese domain-containing protein  33.04 
 
 		 218 aa  49.7  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2508  rhodanese domain-containing protein  31.68 
 
 		 149 aa  50.1  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46930  Rhodanese-domain protein  37.08 
 
 		 126 aa  50.1  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.322809  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3735  rhodanese domain-containing protein  33.01 
 
 		 113 aa  50.1  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00254792 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1733  hypothetical protein  27.1 
 
 		 123 aa  49.3  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3760  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  28.8 
 
 		 393 aa  49.3  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.62685  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0923  rhodanese-like protein  32.41 
 
 		 110 aa  49.7  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0562249  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3504  rhodanese domain-containing protein  33.8 
 
 		 135 aa  49.3  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.64144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1592  rhodanese domain-containing protein  38.1 
 
 		 128 aa  48.9  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0744252  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>