166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3876 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1792  rhodanese-like domain protein  63.93 
 
 		 527 aa  643    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3602  rhodanese-like protein  62.99 
 
 		 527 aa  635    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.717675  normal  0.234562 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5044  rhodanese-like protein  71.74 
 
 		 535 aa  753    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1751  rhodanese-like protein  68.45 
 
 		 569 aa  685    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14689  normal  0.128287 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4464  Rhodanese domain protein  70.59 
 
 		 549 aa  702    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.448284 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30960  Rhodanese-like protein  67.29 
 
 		 527 aa  654    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.621734  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2215  rhodanese-like protein  71.32 
 
 		 532 aa  723    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0664029  normal  0.444844 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4106  rhodanese-like protein  68.74 
 
 		 568 aa  687    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.222358  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3684  rhodanese domain-containing protein  69.12 
 
 		 555 aa  699    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4260  rhodanese domain-containing protein  68.74 
 
 		 568 aa  687    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0054703  normal  0.340284 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3876  Rhodanese domain protein  100 
 
 		 541 aa  1078    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4598  Rhodanese domain protein  70.59 
 
 		 549 aa  702    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.664806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4330  rhodanese domain-containing protein  68.44 
 
 		 569 aa  670    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.433624  normal  0.0780843 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2512  rhodanese domain-containing protein  65.05 
 
 		 528 aa  640    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.756013  normal  0.563035 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3257  rhodanese domain-containing protein  68.56 
 
 		 541 aa  684    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4157  rhodanese domain-containing protein  68.75 
 
 		 541 aa  696    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.759508 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1549  Rhodanese domain protein  62.27 
 
 		 533 aa  620  1e-176  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.996787 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2930  thiosulfate sulfurtransferase  62.27 
 
 		 533 aa  610  1e-173  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.502241 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30430  thiosulfate sulfurtransferase  64.09 
 
 		 527 aa  594  1e-168  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5232  rhodanese domain-containing protein  60.07 
 
 		 535 aa  580  1e-164  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.216825 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1350  rhodanese domain-containing protein  57.79 
 
 		 528 aa  565  1e-160  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.803854  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2665  rhodanese domain-containing protein  59.92 
 
 		 525 aa  553  1e-156  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00593541  normal  0.301159 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2691  rhodanese domain-containing protein  63.93 
 
 		 411 aa  433  1e-120  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.608697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2158  putative thiosulfate sulfurtransferase  49.35 
 
 		 539 aa  423  1e-117  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.766439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5775  rhodanese domain-containing protein  47.83 
 
 		 774 aa  389  1e-107  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116988 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1882  Rhodanese domain protein  46.97 
 
 		 739 aa  379  1e-104  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2041  rhodanese-like protein  42.72 
 
 		 551 aa  345  2e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0229793 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2410  rhodanese-like domain-containing protein  43.92 
 
 		 555 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3483  rhodanese domain-containing protein  42.75 
 
 		 545 aa  333  6e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.38512  normal  0.395437 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1128  Rhodanese domain protein  41.95 
 
 		 529 aa  332  1e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.921716 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1219  Rhodanese domain protein  43.02 
 
 		 529 aa  322  9.999999999999999e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.773409  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2632  rhodanese domain protein/cystathionine beta-lyase  41.17 
 
 		 931 aa  316  7e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0811484  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1130  putative rhodanese-like sulfur transferase  40.04 
 
 		 548 aa  311  2e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0276  rhodanese domain-containing protein  41.72 
 
 		 523 aa  308  2.0000000000000002e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3161  cystathionine beta-lyase  44.37 
 
 		 896 aa  307  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2405  rhodanese-like domain-containing protein  40.86 
 
 		 538 aa  301  2e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3974  Rhodanese domain protein  42.44 
 
 		 531 aa  299  7e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.650632  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21500  Rhodanese-like protein  41.21 
 
 		 530 aa  299  1e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.960908  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4136  rhodanese domain-containing protein  41.78 
 
 		 528 aa  298  2e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0398256 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3935  rhodanese domain-containing protein  37.14 
 
 		 526 aa  291  2e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2551  rhodanese domain-containing protein  38.21 
 
 		 380 aa  218  2e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.378324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2586  putative thiosulfate sulfurtransferase  40.11 
 
 		 361 aa  216  9.999999999999999e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.721613  normal  0.12101 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1373  Rhodanese domain protein  34.36 
 
 		 521 aa  207  3e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4338  Rhodanese-like protein sulfurtransferase  34.23 
 
 		 549 aa  164  5.0000000000000005e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  33.18 
 
 		 220 aa  72.4  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2516  rhodanese-like domain-containing protein  22.91 
 
 		 247 aa  62.8  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.890802  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0679  rhodanese-like protein  22.67 
 
 		 363 aa  62  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.117873  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2629  Rhodanese domain protein  30.37 
 
 		 216 aa  57.4  0.0000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.770931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2491  beta-lactamase-like  25.35 
 
 		 455 aa  57  0.0000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2309  metallo-beta-lactamase family protein  26.85 
 
 		 472 aa  56.6  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2335  Rhodanese domain protein  25.93 
 
 		 432 aa  55.5  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.120281  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2357  Rhodanese domain protein  28.72 
 
 		 230 aa  55.5  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0207947  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2654  hypothetical protein  40 
 
 		 116 aa  55.1  0.000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.173279  normal  0.613191 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0680  rhodanese domain-containing protein  25.4 
 
 		 265 aa  54.7  0.000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2186  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.48 
 
 		 389 aa  53.9  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0893637 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46930  Rhodanese-domain protein  39 
 
 		 126 aa  52.8  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.322809  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2631  Rhodanese domain protein  27.1 
 
 		 480 aa  53.1  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1844  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.35 
 
 		 393 aa  53.5  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6102  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  32.26 
 
 		 380 aa  53.5  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.202691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04370  Rhodanese-related sulfurtransferase  34 
 
 		 163 aa  52.4  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00155672 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2858  Rhodanese domain protein  25.38 
 
 		 305 aa  52.8  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0022  Rhodanese domain-containing protein  34.07 
 
 		 122 aa  52.4  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0728  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  35.96 
 
 		 388 aa  52  0.00003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.652305  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1826  beta-lactamase-like protein  26.73 
 
 		 457 aa  52  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2849  beta-lactamase domain-containing protein  26.61 
 
 		 480 aa  52  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4842  beta-lactamase-like  33.03 
 
 		 346 aa  51.6  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1543  Rhodanese domain protein  33.64 
 
 		 138 aa  51.2  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.973949  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6177  beta-lactamase domain protein  30.69 
 
 		 470 aa  51.2  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.670762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0871  rhodanese domain-containing protein  38.46 
 
 		 127 aa  50.8  0.00006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.436528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0513  beta-lactamase domain-containing protein  26.14 
 
 		 617 aa  50.4  0.00007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0622  rhodanese domain-containing protein  29.7 
 
 		 271 aa  50.4  0.00008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3176  beta-lactamase domain protein  33.04 
 
 		 461 aa  50.4  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00491395  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1817  hypothetical protein  24.72 
 
 		 99 aa  50.1  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2892  rhodanese-like protein  23.36 
 
 		 377 aa  50.1  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.351885 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  30.61 
 
 		 123 aa  50.1  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2041  rhodanese-related sulfurtransferase  31 
 
 		 124 aa  50.1  0.0001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1183  Rhodanese domain protein  25.76 
 
 		 279 aa  50.1  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.915724  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3148  putative phage shock protein E  30.38 
 
 		 133 aa  48.9  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1733  hypothetical protein  26.27 
 
 		 123 aa  49.3  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2007  metallo-beta-lactamase family protein  37 
 
 		 361 aa  49.3  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2652  rhodanese-like protein  37.97 
 
 		 130 aa  49.3  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0032  rhodanese-like protein  29 
 
 		 248 aa  48.5  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4038  Rhodanese domain protein  29.46 
 
 		 125 aa  48.5  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.686364  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0130  rhodanese-like domain-containing protein  30 
 
 		 124 aa  48.5  0.0003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000130588  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2633  Rhodanese domain protein  36.36 
 
 		 123 aa  48.1  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.728751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1642  rhodanese domain-containing protein  38.36 
 
 		 103 aa  48.1  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0218  Rhodanese domain protein  39.74 
 
 		 124 aa  47.8  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2837  Rhodanese domain protein  37.1 
 
 		 130 aa  47.8  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0114953  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2356  Rhodanese domain protein  39.74 
 
 		 124 aa  47.8  0.0006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1387  rhodanese domain-containing protein  35.71 
 
 		 119 aa  47.8  0.0006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00873164  hitchhiker  0.000000184443 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1452  rhodanese domain-containing protein  35.71 
 
 		 119 aa  47.8  0.0006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0322334  hitchhiker  0.00868672 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1440  rhodanese domain-containing protein  35.71 
 
 		 119 aa  47.8  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0130754  hitchhiker  0.00000490376 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2834  rhodanese domain-containing protein  38.1 
 
 		 126 aa  47.8  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00175675 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4064  rhodanese domain-containing protein  37.04 
 
 		 127 aa  47.4  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.585247  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2680  rhodanese-like protein  38.18 
 
 		 105 aa  47.4  0.0007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4376  rhodanese domain-containing protein  35.71 
 
 		 301 aa  47.4  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3847  Rhodanese domain protein  31.48 
 
 		 129 aa  47  0.0008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.323646  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2058  Rhodanese domain protein  26.04 
 
 		 388 aa  47  0.0008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2272  Rhodanese domain protein  24.33 
 
 		 406 aa  47  0.0009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0333  rhodanese domain-containing protein  31.73 
 
 		 126 aa  46.6  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.891512  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>