192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2691 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_2691  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 
411 aa  830    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.608697  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2665  rhodanese domain-containing protein  65.36 
 
 
525 aa  471  1e-132  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00593541  normal  0.301159 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5044  rhodanese-like protein  67.05 
 
 
535 aa  451  1.0000000000000001e-126  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30960  Rhodanese-like protein  62.44 
 
 
527 aa  449  1e-125  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.621734  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3876  Rhodanese domain protein  66.08 
 
 
541 aa  431  1e-120  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4157  rhodanese domain-containing protein  64.56 
 
 
541 aa  432  1e-120  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.759508 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1792  rhodanese-like domain protein  60.59 
 
 
527 aa  428  1e-119  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3684  rhodanese domain-containing protein  64.29 
 
 
555 aa  429  1e-119  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4330  rhodanese domain-containing protein  64.15 
 
 
569 aa  429  1e-119  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.433624  normal  0.0780843 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3602  rhodanese-like protein  58.59 
 
 
527 aa  427  1e-118  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.717675  normal  0.234562 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4106  rhodanese-like protein  64.36 
 
 
568 aa  426  1e-118  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.222358  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4260  rhodanese domain-containing protein  64.36 
 
 
568 aa  426  1e-118  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0054703  normal  0.340284 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3257  rhodanese domain-containing protein  63.74 
 
 
541 aa  426  1e-118  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1751  rhodanese-like protein  63.56 
 
 
569 aa  421  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14689  normal  0.128287 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2512  rhodanese domain-containing protein  61.02 
 
 
528 aa  421  1e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.756013  normal  0.563035 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2215  rhodanese-like protein  61.83 
 
 
532 aa  417  9.999999999999999e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0664029  normal  0.444844 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4598  Rhodanese domain protein  62.5 
 
 
549 aa  409  1e-113  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.664806  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4464  Rhodanese domain protein  62.5 
 
 
549 aa  409  1e-113  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.448284 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1549  Rhodanese domain protein  61 
 
 
533 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.996787 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2930  thiosulfate sulfurtransferase  58.7 
 
 
533 aa  404  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.502241 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30430  thiosulfate sulfurtransferase  62.82 
 
 
527 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5232  rhodanese domain-containing protein  58.4 
 
 
535 aa  398  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.216825 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1350  rhodanese domain-containing protein  58.94 
 
 
528 aa  388  1e-106  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.803854  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2158  putative thiosulfate sulfurtransferase  53.89 
 
 
539 aa  347  2e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.766439  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1882  Rhodanese domain protein  47.41 
 
 
739 aa  301  1e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5775  rhodanese domain-containing protein  46.83 
 
 
774 aa  301  1e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00116988 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1128  Rhodanese domain protein  44.6 
 
 
529 aa  292  8e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.921716 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1219  Rhodanese domain protein  43.43 
 
 
529 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.773409  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2410  rhodanese-like domain-containing protein  47.45 
 
 
555 aa  281  1e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2041  rhodanese-like protein  44.35 
 
 
551 aa  276  4e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0229793 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2405  rhodanese-like domain-containing protein  44.38 
 
 
538 aa  276  4e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3161  cystathionine beta-lyase  44.54 
 
 
896 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21500  Rhodanese-like protein  44.51 
 
 
530 aa  273  4.0000000000000004e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.960908  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3483  rhodanese domain-containing protein  45.4 
 
 
545 aa  271  2e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.38512  normal  0.395437 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4136  rhodanese domain-containing protein  42.98 
 
 
528 aa  265  1e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0398256 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3974  Rhodanese domain protein  42.74 
 
 
531 aa  263  3e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.650632  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0276  rhodanese domain-containing protein  42.08 
 
 
523 aa  261  2e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3935  rhodanese domain-containing protein  39.08 
 
 
526 aa  258  1e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2632  rhodanese domain protein/cystathionine beta-lyase  43.55 
 
 
931 aa  257  3e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0811484  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1130  putative rhodanese-like sulfur transferase  40.05 
 
 
548 aa  244  3e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2551  rhodanese domain-containing protein  39.65 
 
 
380 aa  244  3e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.378324  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2586  putative thiosulfate sulfurtransferase  37.08 
 
 
361 aa  207  4e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.721613  normal  0.12101 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1373  Rhodanese domain protein  39.41 
 
 
521 aa  191  2e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4338  Rhodanese-like protein sulfurtransferase  29.29 
 
 
549 aa  127  3e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  31.53 
 
 
220 aa  69.3  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2516  rhodanese-like domain-containing protein  26.76 
 
 
247 aa  68.9  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.890802  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0679  rhodanese-like protein  25.58 
 
 
363 aa  68.2  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.117873  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2335  Rhodanese domain protein  24.62 
 
 
432 aa  63.2  0.000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.120281  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2632  rhodanese-like protein  36 
 
 
119 aa  61.6  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.437689  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0680  rhodanese domain-containing protein  26.27 
 
 
265 aa  58.9  0.0000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2982  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.42 
 
 
392 aa  55.1  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2221  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  27.07 
 
 
283 aa  53.1  0.000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.28427  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2538  rhodanese domain-containing protein  22.07 
 
 
252 aa  53.1  0.000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0413586  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0631  Rhodanese domain protein  28.74 
 
 
305 aa  52.8  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0797433  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1733  hypothetical protein  30.51 
 
 
123 aa  52.4  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2629  rhodanese domain-containing protein  34.15 
 
 
108 aa  52.8  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0417  Rhodanese domain protein  34.18 
 
 
166 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.678691 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0229  Rhodanese domain protein  32.26 
 
 
140 aa  52.8  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.479162  hitchhiker  0.0025446 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1183  Rhodanese domain protein  28.05 
 
 
279 aa  52.4  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.915724  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6177  beta-lactamase domain protein  31.91 
 
 
470 aa  52.8  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.670762  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2187  rhodanese-like protein  30.93 
 
 
135 aa  52.4  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2491  beta-lactamase-like  24.07 
 
 
455 aa  51.6  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2357  Rhodanese domain protein  25 
 
 
230 aa  51.2  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0207947  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2827  Rhodanese domain protein  37.36 
 
 
135 aa  51.2  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2629  Rhodanese domain protein  26.51 
 
 
216 aa  51.6  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.770931  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2633  Rhodanese domain protein  35.11 
 
 
123 aa  50.8  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.728751  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0513  beta-lactamase domain-containing protein  23.78 
 
 
617 aa  50.8  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2019  ketopantoate reductase ApbA/PanE  35.14 
 
 
627 aa  51.2  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.691708  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0222  Rhodanese domain protein  32.63 
 
 
144 aa  50.8  0.00005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0155932  hitchhiker  0.00402111 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3760  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  26.67 
 
 
393 aa  50.1  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.62685  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0505  rhodanese-like domain-containing protein  36.36 
 
 
169 aa  50.1  0.00008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2631  Rhodanese domain protein  29.25 
 
 
480 aa  49.7  0.00009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2849  beta-lactamase domain-containing protein  27.1 
 
 
480 aa  49.7  0.00009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0210  Rhodanese domain protein  34.09 
 
 
140 aa  49.7  0.00009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.158606 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0305  rhodanese-like protein  33.68 
 
 
137 aa  49.7  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1649  hypothetical protein  30.99 
 
 
173 aa  49.3  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.616423  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1915  rhodanese-like protein  30.39 
 
 
151 aa  49.3  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.299787 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2508  rhodanese domain-containing protein  29.41 
 
 
149 aa  49.3  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1844  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.09 
 
 
393 aa  49.7  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1619  beta-lactamase-like protein  24.74 
 
 
479 aa  49.3  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000199695  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1769  rhodanese domain-containing protein  35.59 
 
 
284 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000405789  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2041  rhodanese-related sulfurtransferase  25.49 
 
 
124 aa  49.3  0.0001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1733  hypothetical protein  28.81 
 
 
123 aa  48.5  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1310  rhodanese-like protein  30.77 
 
 
135 aa  48.9  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.649013  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4102  Rhodanese domain protein  27.84 
 
 
138 aa  48.9  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25625  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4247  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.58 
 
 
386 aa  48.5  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.020881  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1494  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  31.11 
 
 
276 aa  48.9  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.732763 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3857  rhodanese domain-containing protein  31.58 
 
 
135 aa  48.9  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.848576  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2058  Rhodanese domain protein  26.73 
 
 
388 aa  48.5  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3789  Rhodanese domain protein  26.87 
 
 
301 aa  48.5  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0279123  normal  0.459796 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1814  rhodanese domain-containing protein  31.82 
 
 
135 aa  48.5  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.315882  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0677  Rhodanese domain protein  33.08 
 
 
299 aa  48.1  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1817  hypothetical protein  24.51 
 
 
99 aa  48.1  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8385  molybdopterin/thiamine biosynthesis family protein  27.27 
 
 
393 aa  48.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250903  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0354  Rhodanese domain protein  27.72 
 
 
103 aa  48.1  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00605821  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0923  rhodanese-like protein  32.65 
 
 
110 aa  48.1  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0562249  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2186  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  29.36 
 
 
389 aa  48.1  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0893637 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4376  rhodanese domain-containing protein  34.58 
 
 
301 aa  47.8  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46930  Rhodanese-domain protein  32.03 
 
 
126 aa  47.8  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.322809  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0130  rhodanese-like domain-containing protein  24.51 
 
 
124 aa  47.8  0.0004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000130588  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>