More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3789 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_3789  Rhodanese domain protein  100 
 
 
301 aa  576  1.0000000000000001e-163  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0279123  normal  0.459796 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27500  rhodanese-related sulfurtransferase  48.62 
 
 
280 aa  223  2e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1466  Rhodanese domain protein  50.51 
 
 
282 aa  223  4e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0394652  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2918  thiosulfate sulfurtransferase  49.14 
 
 
276 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1631  Rhodanese domain protein  50.34 
 
 
291 aa  218  7.999999999999999e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00167409  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1421  rhodanese domain-containing protein  50.34 
 
 
288 aa  215  5.9999999999999996e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.692836  decreased coverage  0.00000340615 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4149  Rhodanese domain protein  47.44 
 
 
283 aa  213  1.9999999999999998e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1460  rhodanese domain-containing protein  48.99 
 
 
288 aa  208  8e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.058733  normal  0.145252 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1860  Rhodanese domain protein  48.14 
 
 
282 aa  208  1e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0293763  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4306  Rhodanese domain protein  49.44 
 
 
272 aa  207  2e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.913868  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0631  Rhodanese domain protein  44.3 
 
 
305 aa  206  3e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0797433  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7064  thiosulfate sulfurtransferase  48.28 
 
 
270 aa  206  4e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.508402  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1417  thiosulfate sulfurtransferase  44.95 
 
 
289 aa  205  7e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2381  rhodanese domain-containing protein  50 
 
 
275 aa  202  7e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.305388 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4550  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  48.8 
 
 
419 aa  201  9e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.757162 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2596  Rhodanese domain protein  48.97 
 
 
282 aa  199  3e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.126951  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07810  rhodanese-related sulfurtransferase  47.76 
 
 
375 aa  198  9e-50  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2019  ketopantoate reductase ApbA/PanE  45.97 
 
 
627 aa  197  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.691708  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5604  Rhodanese domain protein  46.18 
 
 
287 aa  196  5.000000000000001e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2038  Rhodanese domain protein  45.32 
 
 
295 aa  196  6e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0677  Rhodanese domain protein  46.96 
 
 
299 aa  193  3e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2431  Rhodanese domain protein  45.71 
 
 
295 aa  193  4e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3367  rhodanese domain-containing protein  44.26 
 
 
312 aa  192  5e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3212  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  43.22 
 
 
299 aa  192  7e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.389078  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4806  thiosulfate sulfurtransferase  48.31 
 
 
279 aa  190  2e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.404932  normal  0.290903 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2635  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  43.3 
 
 
278 aa  190  2.9999999999999997e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.273027  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2620  rhodanese-like protein  43.92 
 
 
285 aa  188  8e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.632482 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4720  thiosulfate sulfurtransferase  48.61 
 
 
270 aa  188  1e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.190744  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6785  Rhodanese domain protein  43.09 
 
 
289 aa  187  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0412413  hitchhiker  0.0000256266 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0325  rhodanese domain-containing protein  41.53 
 
 
289 aa  186  4e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0847  rhodanese domain-containing protein  41.53 
 
 
289 aa  186  4e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.641684  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2397  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  41.53 
 
 
289 aa  186  4e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1507  rhodanese domain-containing protein  41.53 
 
 
289 aa  186  4e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1701  rhodanese domain-containing protein  41.53 
 
 
289 aa  186  4e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0359  rhodanese domain-containing protein  41.53 
 
 
289 aa  186  4e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2539  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  41.53 
 
 
289 aa  186  4e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.920072  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3069  Rhodanese domain protein  45.67 
 
 
277 aa  183  3e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.597651 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5105  thiosulfate sulfurtransferase  47.57 
 
 
269 aa  182  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.384708  normal  0.247578 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2226  thiosulfate sulfurtransferase protein  42.67 
 
 
296 aa  182  6e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2415  ketopantoate reductase ApbA/PanE-like  45.64 
 
 
687 aa  181  9.000000000000001e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.427729  normal  0.379727 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2831  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  43.23 
 
 
289 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1776  Rhodanese domain protein  42.62 
 
 
301 aa  181  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0610  rhodanese domain-containing protein  41.86 
 
 
289 aa  181  1e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3952  rhodanese domain-containing protein  42.47 
 
 
290 aa  180  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0877  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  42.91 
 
 
287 aa  179  4.999999999999999e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0952  Rhodanese domain protein  42.71 
 
 
284 aa  178  8e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.63885  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5322  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  43.05 
 
 
281 aa  178  9e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.710111 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29210  rhodanese-related sulfurtransferase  46.74 
 
 
297 aa  178  1e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2636  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  43.81 
 
 
292 aa  176  6e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.488566  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2370  Rhodanese domain protein  44.98 
 
 
298 aa  171  2e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000188451 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1452  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  43.81 
 
 
282 aa  170  3e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2489  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  39.73 
 
 
282 aa  170  3e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06480  rhodanese-related sulfurtransferase  44.57 
 
 
310 aa  169  4e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1742  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  38.11 
 
 
300 aa  169  4e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.782779 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12314  thiosulfate sulfurtransferase sseB  42.23 
 
 
284 aa  169  5e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0593  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  40.59 
 
 
285 aa  169  7e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00777  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  45.1 
 
 
290 aa  168  8e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0224116  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11880  rhodanese-related sulfurtransferase  42.86 
 
 
307 aa  167  2e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0631029  normal  0.808545 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3246  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  40.21 
 
 
289 aa  167  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0068458 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5168  rhodanese domain-containing protein  40.42 
 
 
284 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2237  rhodanese domain-containing protein  38.61 
 
 
304 aa  166  5.9999999999999996e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.814145  normal  0.0284823 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0177  Rhodanese domain-containing protein  41.08 
 
 
278 aa  165  8e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000691288  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2623  rhodanese domain-containing protein  35.36 
 
 
283 aa  164  2.0000000000000002e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0188  Rhodanese domain protein  42.86 
 
 
285 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4824  rhodanese domain-containing protein  40.73 
 
 
289 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0196782  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1566  Rhodanese domain protein  37.01 
 
 
302 aa  163  3e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1048  Rhodanese domain protein  42.8 
 
 
281 aa  163  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.11236 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32980  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase protein  44.57 
 
 
284 aa  163  4.0000000000000004e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2880  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  38.38 
 
 
289 aa  162  6e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.518579  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2634  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  39.38 
 
 
283 aa  162  8.000000000000001e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1319  Rhodanese domain protein  43.12 
 
 
300 aa  161  1e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.147779  normal  0.429606 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4992  rhodanese domain-containing protein  39.16 
 
 
284 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0159  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  41.67 
 
 
292 aa  160  3e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3515  thiosulfate sulfurtransferase  43.73 
 
 
278 aa  159  4e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.432298  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5118  rhodanese domain protein  39.72 
 
 
284 aa  159  7e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1776  Rhodanese domain protein  41.82 
 
 
335 aa  159  8e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.305984  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0321  rhodanese domain-containing protein  38.61 
 
 
288 aa  158  9e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.183819 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4490  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  42.52 
 
 
289 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3652  rhodanese domain-containing protein  42.52 
 
 
289 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.865325  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3875  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  42.52 
 
 
289 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.403807 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1239  Rhodanese domain protein  42.75 
 
 
284 aa  158  1e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.954881  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1496  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  36.54 
 
 
300 aa  158  1e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3055  rhodanese-like protein  40.66 
 
 
279 aa  157  2e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.403851  normal  0.0127336 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7246  rhodanese-related sulfurtransferase  39.31 
 
 
279 aa  157  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0149117  normal  0.617373 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1095  Rhodanese domain protein  36.29 
 
 
271 aa  157  2e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2215  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  41.92 
 
 
289 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.255157  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3772  rhodanese domain-containing protein  39.13 
 
 
289 aa  155  6e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0206148 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3278  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  37.83 
 
 
330 aa  155  9e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0420  rhodanese-like domain protein  40.29 
 
 
285 aa  155  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3646  Rhodanese domain protein  39.02 
 
 
276 aa  154  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4756  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  40.6 
 
 
284 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0846963 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5343  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  39.85 
 
 
284 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4099  putative 3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  41.53 
 
 
284 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2010  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  37.3 
 
 
299 aa  152  5e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0121868  hitchhiker  0.0031153 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1846  Rhodanese domain protein  34.49 
 
 
274 aa  152  7e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0885  thiosulfate sulfurtransferase, rhodanese-like  41.06 
 
 
282 aa  152  8.999999999999999e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2544  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  41.06 
 
 
282 aa  152  8.999999999999999e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3485  rhodanese domain-containing protein  35.11 
 
 
278 aa  151  1e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4678  rhodanese domain-containing protein  38.38 
 
 
284 aa  151  1e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1872  Rhodanese domain protein  34.15 
 
 
274 aa  151  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.494935  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>