More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_3952 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_3952  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 
290 aa  591  1e-168  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2831  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  82.07 
 
 
289 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6785  Rhodanese domain protein  82.41 
 
 
289 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0412413  hitchhiker  0.0000256266 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0610  rhodanese domain-containing protein  77.24 
 
 
289 aa  464  9.999999999999999e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0325  rhodanese domain-containing protein  76.55 
 
 
289 aa  464  1e-129  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0847  rhodanese domain-containing protein  76.55 
 
 
289 aa  464  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.641684  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0359  rhodanese domain-containing protein  76.55 
 
 
289 aa  464  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1701  rhodanese domain-containing protein  76.55 
 
 
289 aa  464  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2397  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  76.55 
 
 
289 aa  464  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2539  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  76.55 
 
 
289 aa  464  1e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.920072  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1507  rhodanese domain-containing protein  76.55 
 
 
289 aa  464  1e-129  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4824  rhodanese domain-containing protein  77.24 
 
 
289 aa  457  9.999999999999999e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0196782  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3246  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  74.83 
 
 
289 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0068458 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3652  rhodanese domain-containing protein  76.9 
 
 
289 aa  442  1e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.865325  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4490  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  76.9 
 
 
289 aa  442  1e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3875  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  76.9 
 
 
289 aa  442  1e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.403807 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3772  rhodanese domain-containing protein  75.17 
 
 
289 aa  437  1e-121  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0206148 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2215  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  77.93 
 
 
289 aa  434  1e-120  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.255157  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2038  Rhodanese domain protein  62.2 
 
 
295 aa  359  3e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2431  Rhodanese domain protein  61.51 
 
 
295 aa  354  6.999999999999999e-97  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2226  thiosulfate sulfurtransferase protein  59.45 
 
 
296 aa  337  9.999999999999999e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0877  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  61.28 
 
 
287 aa  336  1.9999999999999998e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3212  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  60.07 
 
 
299 aa  330  2e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.389078  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2620  rhodanese-like protein  58.3 
 
 
285 aa  323  2e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.632482 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1239  Rhodanese domain protein  56.89 
 
 
284 aa  301  1e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.954881  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3055  rhodanese-like protein  54.77 
 
 
279 aa  291  6e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.403851  normal  0.0127336 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2636  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  54.04 
 
 
292 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.488566  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3367  rhodanese domain-containing protein  53.33 
 
 
312 aa  268  1e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1708  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  50 
 
 
276 aa  265  5e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0593  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  48.23 
 
 
285 aa  263  3e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1566  Rhodanese domain protein  49.18 
 
 
302 aa  261  8.999999999999999e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2489  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  46.98 
 
 
282 aa  256  4e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0347  rhodanese domain-containing protein  49.11 
 
 
284 aa  254  9e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.772652  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3278  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  49.17 
 
 
330 aa  253  3e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1426  Rhodanese domain protein  46.4 
 
 
276 aa  252  5.000000000000001e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.630889  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5118  rhodanese domain protein  49.11 
 
 
284 aa  250  1e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4992  rhodanese domain-containing protein  49.47 
 
 
284 aa  251  1e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1769  rhodanese domain-containing protein  49.11 
 
 
284 aa  250  2e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000405789  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4099  putative 3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  49.47 
 
 
284 aa  250  2e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5168  rhodanese domain-containing protein  49.82 
 
 
284 aa  248  1e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2010  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  47.33 
 
 
299 aa  248  1e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0121868  hitchhiker  0.0031153 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2237  rhodanese domain-containing protein  46.18 
 
 
304 aa  247  2e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.814145  normal  0.0284823 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32980  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase protein  49.65 
 
 
284 aa  247  2e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1496  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  46.84 
 
 
300 aa  244  9.999999999999999e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1742  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  47.16 
 
 
300 aa  243  3e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.782779 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5343  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  48.04 
 
 
284 aa  241  1e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0305  Rhodanese domain protein  47.54 
 
 
285 aa  241  1e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47500  putative 3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  46.98 
 
 
284 aa  241  1e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0188  Rhodanese domain protein  47.2 
 
 
285 aa  240  2e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0951  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  46.18 
 
 
299 aa  240  2e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1033  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  45.72 
 
 
310 aa  238  5.999999999999999e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0667917 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2880  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  44.83 
 
 
289 aa  235  7e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.518579  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4756  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  47.69 
 
 
284 aa  233  3e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0846963 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0177  Rhodanese domain-containing protein  49.31 
 
 
278 aa  232  5e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000691288  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1048  Rhodanese domain protein  48.22 
 
 
281 aa  229  5e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.11236 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0420  rhodanese-like domain protein  47.33 
 
 
285 aa  228  9e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0952  Rhodanese domain protein  44.33 
 
 
284 aa  221  9.999999999999999e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.63885  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1326  Rhodanese domain protein  45.8 
 
 
283 aa  218  7e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0377463  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1892  Rhodanese domain protein  41.22 
 
 
278 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.474796  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0321  rhodanese domain-containing protein  44.88 
 
 
288 aa  213  3.9999999999999995e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.183819 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1319  Rhodanese domain protein  43.62 
 
 
300 aa  212  4.9999999999999996e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.147779  normal  0.429606 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1455  thiosulfate sulfurtransferase  40.84 
 
 
277 aa  212  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2427  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  44.32 
 
 
280 aa  211  7.999999999999999e-54  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.244086 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1455  thiosulfate sulfurtransferase  40.46 
 
 
277 aa  210  3e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1669  rhodanese-like domain protein  40.46 
 
 
277 aa  209  3e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1483  rhodanese-like domain-containing protein  40.46 
 
 
277 aa  209  5e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1779  rhodanese-like protein  41.73 
 
 
272 aa  209  5e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0268693  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1599  rhodanese-like domain-containing protein  40.46 
 
 
277 aa  209  5e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.317702  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1860  Rhodanese domain protein  46.34 
 
 
282 aa  207  1e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0293763  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1872  Rhodanese domain protein  40.94 
 
 
274 aa  208  1e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.494935  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1846  Rhodanese domain protein  40.94 
 
 
274 aa  207  1e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1634  rhodanese-like domain protein  40.84 
 
 
277 aa  207  2e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0494002  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2918  thiosulfate sulfurtransferase  45.36 
 
 
276 aa  206  3e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0764  Rhodanese domain protein  42.96 
 
 
281 aa  205  6e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1705  rhodanese-like domain-containing protein  40.08 
 
 
277 aa  204  1e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0165982  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2346  rhodanese domain-containing protein  41.73 
 
 
272 aa  204  2e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00777  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  43.75 
 
 
290 aa  204  2e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0224116  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1745  rhodanese-like domain protein  40.08 
 
 
277 aa  203  3e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000561696  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1310  rhodanese domain-containing protein  38.08 
 
 
276 aa  202  5e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.965267  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3711  rhodanese-like domain protein  39.31 
 
 
277 aa  201  9e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.584837  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2019  ketopantoate reductase ApbA/PanE  45.42 
 
 
627 aa  201  9.999999999999999e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.691708  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3646  Rhodanese domain protein  42.75 
 
 
276 aa  199  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3485  rhodanese domain-containing protein  41.99 
 
 
278 aa  199  5e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5604  Rhodanese domain protein  43.25 
 
 
287 aa  199  6e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1421  rhodanese domain-containing protein  44.88 
 
 
288 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.692836  decreased coverage  0.00000340615 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1776  Rhodanese domain protein  45.59 
 
 
335 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.305984  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06480  rhodanese-related sulfurtransferase  44.04 
 
 
310 aa  196  3e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1631  Rhodanese domain protein  45.61 
 
 
291 aa  196  3e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00167409  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2415  ketopantoate reductase ApbA/PanE-like  45.62 
 
 
687 aa  195  6e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.427729  normal  0.379727 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2381  rhodanese domain-containing protein  44.95 
 
 
275 aa  195  9e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.305388 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0726  rhodanese domain-containing protein  43.13 
 
 
291 aa  195  9e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.893447  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07810  rhodanese-related sulfurtransferase  43.01 
 
 
375 aa  194  1e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27500  rhodanese-related sulfurtransferase  43.75 
 
 
280 aa  194  2e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1498  rhodanese domain-containing protein  38.78 
 
 
277 aa  191  2e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.125768  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0556  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  38.71 
 
 
276 aa  189  4e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.593662 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1460  rhodanese domain-containing protein  44.32 
 
 
288 aa  187  1e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.058733  normal  0.145252 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0354  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  43.62 
 
 
285 aa  187  2e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7064  thiosulfate sulfurtransferase  42.61 
 
 
270 aa  186  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.508402  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2395  Rhodanese domain protein  40.77 
 
 
282 aa  186  4e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1417  thiosulfate sulfurtransferase  41.07 
 
 
289 aa  185  6e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>