More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1860 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_1860  Rhodanese domain protein  100 
 
 
282 aa  531  1e-150  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0293763  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1631  Rhodanese domain protein  63.77 
 
 
291 aa  300  2e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00167409  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27500  rhodanese-related sulfurtransferase  58.16 
 
 
280 aa  300  2e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2381  rhodanese domain-containing protein  59.63 
 
 
275 aa  294  1e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.305388 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2019  ketopantoate reductase ApbA/PanE  58.57 
 
 
627 aa  290  3e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.691708  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1417  thiosulfate sulfurtransferase  55.96 
 
 
289 aa  289  4e-77  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1421  rhodanese domain-containing protein  60.78 
 
 
288 aa  285  4e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.692836  decreased coverage  0.00000340615 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7064  thiosulfate sulfurtransferase  60.51 
 
 
270 aa  285  7e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.508402  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1466  Rhodanese domain protein  58.6 
 
 
282 aa  282  5.000000000000001e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0394652  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1460  rhodanese domain-containing protein  59.01 
 
 
288 aa  280  3e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.058733  normal  0.145252 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2415  ketopantoate reductase ApbA/PanE-like  55.9 
 
 
687 aa  271  1e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.427729  normal  0.379727 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5604  Rhodanese domain protein  56.43 
 
 
287 aa  268  5e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4306  Rhodanese domain protein  55.91 
 
 
272 aa  259  3e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.913868  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2635  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  51.25 
 
 
278 aa  256  4e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.273027  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2918  thiosulfate sulfurtransferase  53.09 
 
 
276 aa  255  7e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4550  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  55.71 
 
 
419 aa  254  1.0000000000000001e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.757162 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0631  Rhodanese domain protein  47.72 
 
 
305 aa  252  5.000000000000001e-66  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0797433  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2596  Rhodanese domain protein  54.74 
 
 
282 aa  244  9e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.126951  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29210  rhodanese-related sulfurtransferase  52.17 
 
 
297 aa  244  9.999999999999999e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0677  Rhodanese domain protein  53.26 
 
 
299 aa  242  6e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07810  rhodanese-related sulfurtransferase  51.7 
 
 
375 aa  240  2e-62  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5322  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  49.82 
 
 
281 aa  238  8e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.710111 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2636  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  51.21 
 
 
292 aa  235  6e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.488566  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3069  Rhodanese domain protein  53.76 
 
 
277 aa  234  2.0000000000000002e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.597651 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1776  Rhodanese domain protein  52.26 
 
 
301 aa  234  2.0000000000000002e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1769  rhodanese domain-containing protein  51.41 
 
 
284 aa  228  8e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000405789  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4824  rhodanese domain-containing protein  48.24 
 
 
289 aa  227  2e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0196782  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0952  Rhodanese domain protein  47.18 
 
 
284 aa  225  6e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.63885  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47500  putative 3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  50.35 
 
 
284 aa  225  7e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3367  rhodanese domain-containing protein  50.7 
 
 
312 aa  224  1e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4149  Rhodanese domain protein  50.18 
 
 
283 aa  224  1e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4099  putative 3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  50.35 
 
 
284 aa  223  2e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3246  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  47.18 
 
 
289 aa  223  4e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0068458 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4806  thiosulfate sulfurtransferase  52.31 
 
 
279 aa  222  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.404932  normal  0.290903 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2226  thiosulfate sulfurtransferase protein  46.74 
 
 
296 aa  222  7e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1452  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  51.77 
 
 
282 aa  221  7e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4756  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  50 
 
 
284 aa  221  9e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0846963 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3212  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  47.94 
 
 
299 aa  220  1.9999999999999999e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.389078  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6785  Rhodanese domain protein  46.13 
 
 
289 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0412413  hitchhiker  0.0000256266 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0420  rhodanese-like domain protein  48.88 
 
 
285 aa  218  1e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2489  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  45.2 
 
 
282 aa  218  1e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06480  rhodanese-related sulfurtransferase  49.26 
 
 
310 aa  217  2e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3772  rhodanese domain-containing protein  46.13 
 
 
289 aa  217  2e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0206148 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4720  thiosulfate sulfurtransferase  52.17 
 
 
270 aa  217  2e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.190744  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0610  rhodanese domain-containing protein  46.34 
 
 
289 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32980  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase protein  53.38 
 
 
284 aa  216  2.9999999999999998e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2831  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  46.13 
 
 
289 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2370  Rhodanese domain protein  51.43 
 
 
298 aa  216  2.9999999999999998e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000188451 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5343  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  49.48 
 
 
284 aa  215  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2397  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  46.15 
 
 
289 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0325  rhodanese domain-containing protein  46.15 
 
 
289 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0847  rhodanese domain-containing protein  46.15 
 
 
289 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.641684  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0359  rhodanese domain-containing protein  46.15 
 
 
289 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1507  rhodanese domain-containing protein  46.15 
 
 
289 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1701  rhodanese domain-containing protein  46.15 
 
 
289 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2539  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  46.15 
 
 
289 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.920072  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0877  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  48.53 
 
 
287 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4490  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  46.48 
 
 
289 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3875  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  46.48 
 
 
289 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.403807 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12314  thiosulfate sulfurtransferase sseB  47 
 
 
284 aa  213  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0321  rhodanese domain-containing protein  46.29 
 
 
288 aa  213  2.9999999999999995e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.183819 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3652  rhodanese domain-containing protein  46.48 
 
 
289 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.865325  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0347  rhodanese domain-containing protein  48.76 
 
 
284 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.772652  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0177  Rhodanese domain-containing protein  47.89 
 
 
278 aa  212  7e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000691288  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2038  Rhodanese domain protein  44.03 
 
 
295 aa  211  9e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5105  thiosulfate sulfurtransferase  52.17 
 
 
269 aa  210  2e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.384708  normal  0.247578 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2431  Rhodanese domain protein  44.03 
 
 
295 aa  209  3e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3952  rhodanese domain-containing protein  46.9 
 
 
290 aa  209  5e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2427  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  45.94 
 
 
280 aa  208  7e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.244086 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0305  Rhodanese domain protein  42.4 
 
 
285 aa  208  9e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3789  Rhodanese domain protein  48.32 
 
 
301 aa  207  1e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0279123  normal  0.459796 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1048  Rhodanese domain protein  47.64 
 
 
281 aa  207  1e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.11236 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0726  rhodanese domain-containing protein  46.04 
 
 
291 aa  208  1e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.893447  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0593  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  44.01 
 
 
285 aa  207  2e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2237  rhodanese domain-containing protein  44.19 
 
 
304 aa  206  3e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.814145  normal  0.0284823 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2215  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  46.13 
 
 
289 aa  206  5e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.255157  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0188  Rhodanese domain protein  47.47 
 
 
285 aa  206  5e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2620  rhodanese-like protein  45.8 
 
 
285 aa  205  7e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.632482 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1239  Rhodanese domain protein  48.31 
 
 
284 aa  202  3e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.954881  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1326  Rhodanese domain protein  47.17 
 
 
283 aa  202  7e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0377463  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5118  rhodanese domain protein  46.5 
 
 
284 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4992  rhodanese domain-containing protein  46.34 
 
 
284 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5168  rhodanese domain-containing protein  46.1 
 
 
284 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1742  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  42.14 
 
 
300 aa  196  3e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.782779 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1566  Rhodanese domain protein  41.78 
 
 
302 aa  196  3e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1776  Rhodanese domain protein  46.67 
 
 
335 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.305984  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3055  rhodanese-like protein  42.96 
 
 
279 aa  189  4e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.403851  normal  0.0127336 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2880  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  41.32 
 
 
289 aa  189  4e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.518579  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1033  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  42.43 
 
 
310 aa  189  5e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0667917 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1892  Rhodanese domain protein  41.26 
 
 
278 aa  188  7e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.474796  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0951  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  42.43 
 
 
299 aa  188  8e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3278  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  44.26 
 
 
330 aa  188  9e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2010  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  42.09 
 
 
299 aa  187  1e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0121868  hitchhiker  0.0031153 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1496  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  40.94 
 
 
300 aa  187  2e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0159  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  45.02 
 
 
292 aa  185  9e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1846  Rhodanese domain protein  39.49 
 
 
274 aa  182  5.0000000000000004e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00777  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  49.61 
 
 
290 aa  182  5.0000000000000004e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0224116  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1705  rhodanese-like domain-containing protein  36.75 
 
 
277 aa  181  1e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0165982  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1872  Rhodanese domain protein  39.13 
 
 
274 aa  181  1e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.494935  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1745  rhodanese-like domain protein  36.75 
 
 
277 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000561696  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>